单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 31341 - 31360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 31341 | 2024-08-09 |
Lineage Establishment and Progression within the Inner Cell Mass of the Mouse Blastocyst Requires FGFR1 and FGFR2
2017-06-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.05.003
PMID:28552559
|
研究论文 | 本文研究了在小鼠胚泡的内细胞团（ICM）中，纤维母细胞生长因子受体1（FGFR1）和FGFR2在原始内胚层（PrE）和多能外胚层（EPI）分化中的作用 | 通过单细胞分辨率的定量成像和单细胞转录组学，结合野生型和Fgf受体突变胚胎的研究，揭示了FGFR1和FGFR2在ICM细胞中的独特和加性活动 | NA | 探究FGF4信号在小鼠胚泡ICM细胞中的受体响应机制 | 小鼠胚泡的内细胞团（ICM）中的FGFR1和FGFR2 | NA | NA | 单细胞分辨率定量成像，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 534个单ICM细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31342 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq unveils tumor microenvironment
2017-Jun, BMB reports
IF:2.9Q3
DOI:10.5483/bmbrep.2017.50.6.086
PMID:28539161
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组分析技术揭示肿瘤微环境 | 本文通过单细胞RNA测序技术，深入解析了肿瘤微环境中复杂的细胞类型和亚群 | NA | 研究肿瘤微环境的组成和功能，探索其作为抗癌靶点的潜力 | 肿瘤微环境中的细胞类型和亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31343 | 2024-08-09 |
DTWscore: differential expression and cell clustering analysis for time-series single-cell RNA-seq data
2017-May-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-017-1647-3
PMID:28535748
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研究论文 | 本文介绍了一种基于动态时间规整评分（DTWscore）的算法，用于时间序列单细胞RNA测序数据中的差异表达和细胞聚类分析 | 提出了一种结合动态时间规整评分和时间序列数据的算法，用于检测单细胞RNA测序样本中的基因表达变化并恢复潜在的细胞类型 | 研究仅限于在R框架内实现和可用的方法 | 开发一种新算法，用于分析时间序列单细胞RNA测序数据中的基因表达模式和细胞类型 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 动态时间规整评分 | 时间序列数据 | 多个时间点的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 31344 | 2024-08-09 |
Gene length and detection bias in single cell RNA sequencing protocols
2017, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.11290.1
PMID:28529717
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNA-seq）中基因长度偏差的影响，并探讨了不同测序协议对基因检测率的影响。 | 发现使用UMI的scRNA-seq协议不显示基因长度偏差，而全长转录本协议则显示出与bulk RNA-seq数据类似的基因长度偏差。 | 研究主要集中在小鼠胚胎干细胞（mESCs）的数据集上，可能需要进一步验证其他细胞类型和物种。 | 探讨scRNA-seq技术中的基因长度偏差及其对基因检测率的影响。 | 研究对象包括不同捕获技术、文库准备、细胞类型和物种的scRNA-seq数据集。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 研究涉及四个不同的小鼠胚胎干细胞（mESCs）scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 31345 | 2024-08-09 |
Between a Pod and a Hard Test: The Deep Evolution of Amoebae
2017-09-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msx162
PMID:28505375
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研究论文 | 本文基于广泛的分类单元集，在系统基因组框架下提出了Amoebozoa的稳健系统发育树 | 本研究通过使用基于培养和单细胞转录组学的61个分类单元的样本，揭示了Amoebozoa的两个主要分支，并推翻了之前的研究 | NA | 探讨Amoebozoa的系统发育关系及其进化模式 | Amoebozoa的系统发育和进化 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | 61个分类单元 | NA | NA | NA | NA |
| 31346 | 2024-08-09 |
Computational approaches for interpreting scRNA-seq data
2017-08, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.12684
PMID:28524227
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研究论文 | 本文讨论了利用高维数据挖掘技术对单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据进行分析的方法 | 介绍了针对scRNA-seq数据的聚类、伪时间推断、分支推断和基因水平分析等计算分析方法 | NA | 探索和描述适用于scRNA-seq数据分析的工具和技术 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31347 | 2024-08-09 |
Recruited Monocytes and Type 2 Immunity Promote Lung Regeneration following Pneumonectomy
2017-07-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.03.024
PMID:28506464
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研究论文 | 研究免疫细胞在肺再生的作用，使用单侧肺切除模型促进剩余肺叶中新肺泡的形成 | 揭示了骨髓来源的巨噬细胞通过CCL2-CCR2趋化因子轴迁移至肺部，对肺再生至关重要，并发现2型先天淋巴细胞是IL-13的来源，促进肺再生 | NA | 探讨免疫细胞在肺再生中的作用 | 肺再生过程中的免疫细胞和细胞因子 | NA | NA | 免疫荧光和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 31348 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing: Unraveling the Brain One Cell at a Time
2017-06, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2017.04.006
PMID:28501348
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析中枢神经系统复杂性和动态性方面的应用 | scRNA-seq技术能够分析单个细胞的转录组，为神经系统研究提供了新的视角 | 文章提到了应用scRNA-seq技术面临的挑战，但未具体说明 | 推动对神经系统的理解，并探索神经退行性疾病的治疗新方法 | 中枢神经系统及其在神经退行性疾病中的分子机制 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31349 | 2024-08-09 |
Cell fixation and preservation for droplet-based single-cell transcriptomics
2017-05-19, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-017-0383-5
PMID:28526029
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研究论文 | 本文研究了使用化学固定方法来稳定和保存细胞，以便进行基于液滴的单细胞转录组测序 | 提出了一种简单的细胞固定方法，可以稳定和保存细胞数周，而不影响单细胞RNA测序数据的质量 | 未提及 | 开发一种新的细胞固定和保存方法，以便进行基于液滴的单细胞转录组测序 | 人源和鼠源的细胞，以及果蝇胚胎、小鼠后脑和 cerebellum 细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31350 | 2024-08-09 |
Isolation of the Side Population in Myc-induced T-cell Acute Lymphoblastic Leukemia in Zebrafish
2017-05-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55711
PMID:28518092
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研究论文 | 本文描述了一种在斑马鱼中分离Myc诱导的T细胞急性淋巴母细胞白血病（T-ALL）旁系细胞群的方法 | 首次在斑马鱼T-ALL模型中描述了如何分离旁系细胞群，并提出了通过单细胞转录组学研究这些细胞遗传特征的可能性 | 目前尚无已知的斑马鱼细胞表面标记物来确认这些旁系细胞是否具有癌症干细胞样特性 | 研究斑马鱼T-ALL中的旁系细胞群 | 斑马鱼T-ALL中的旁系细胞群 | NA | T细胞急性淋巴母细胞白血病 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | 多个斑马鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 31351 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing deciphers a convergent evolution of copy number alterations from primary to circulating tumor cells
2017-08, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.216788.116
PMID:28487279
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中的拷贝数变异，揭示了从原发肿瘤到循环肿瘤细胞的拷贝数变异的趋同进化过程 | 首次揭示了原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中拷贝数变异的趋同进化机制，并发现了影响基因和基因的局灶性拷贝数变异在循环肿瘤细胞中的普遍存在 | 研究样本量较小，仅涉及23名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中拷贝数变异的进化机制及其在癌症转移中的作用 | 原发肿瘤细胞和循环肿瘤细胞中的拷贝数变异 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 97个循环肿瘤细胞来自23名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 31352 | 2024-08-09 |
Single-cell template strand sequencing by Strand-seq enables the characterization of individual homologs
2017-Jun, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2017.029
PMID:28492527
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Strand-seq的单细胞测序技术，该技术通过限制序列分析仅限于DNA复制过程中使用的模板链，从而能够在单个细胞中解析同源染色体的个体序列 | Strand-seq技术通过仅测序模板链，保留了每个同源染色体的结构和身份，这是对传统单细胞测序协议的重要改进 | NA | 研究同源染色体在单细胞中的基因组序列，以支持无拷贝数基因组重排（如倒位和易位）、构建染色体长度单体型、改进基因组组装、映射姐妹染色单体交换事件和探索细胞异质性等研究 | 单细胞中的同源染色体基因组序列 | 基因组学 | NA | Strand-seq | NA | DNA序列 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31353 | 2024-08-09 |
Hierarchical Specification of Pruriceptors by Runt-Domain Transcription Factor Runx1
2017-05-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0094-17.2017
PMID:28476948
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研究论文 | 本文研究了Runx1转录因子在背根神经节（DRG）感觉神经元中的作用，特别是其在瘙痒感受器发育中的功能 | 首次揭示了Runx1在瘙痒感受器发育中的双重作用，早期促进NPPB细胞形成，后期转变为基因抑制因子 | NA | 探讨Runx1在瘙痒感受器发育中的作用及其对感觉神经元形成不同感觉模式的控制机制 | 背根神经节中的感觉神经元及其在瘙痒信息传递中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用雌雄两性的小鼠进行行为学研究 | NA | NA | NA | NA |
| 31354 | 2024-08-09 |
Spatially resolved transcriptome profiling in model plant species
2017-May-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/nplants.2017.61
PMID:28481330
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研究论文 | 本文介绍了一种在多种模式植物系统中生成和研究高分辨率空间解析功能轮廓的新方法 | 首次提出了一种适用于广泛模式植物系统的高通量空间转录组分析方法 | NA | 探索复杂生物系统的功能特征，特别是在植物中的空间表达谱 | 模式被子植物和裸子植物的微切片 | NA | NA | 空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 在拟南芥中分析了八个花序组织域中的141个基因和189条通路的表达水平 | NA | NA | NA | NA |
| 31355 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer
2017-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms15081
PMID:28474673
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术对乳腺癌组织进行转录组分析，揭示了肿瘤细胞和免疫细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上全面分析了乳腺癌肿瘤细胞及其周围微环境中的免疫细胞 | 研究样本仅来自11名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨乳腺癌肿瘤细胞及其微环境中免疫细胞的转录组异质性 | 乳腺癌肿瘤细胞及其周围的基质和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 515个细胞来自11名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 31356 | 2024-08-09 |
Single cell RNA sequencing to dissect the molecular heterogeneity in lupus nephritis
2017-May-04, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.93009
PMID:28469080
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检组织，以揭示疾病的分子异质性 | 首次展示了scRNA-seq在常规护理中获取样本的可行性，并揭示了皮肤活检作为肾病标志物的潜力 | NA | 探讨狼疮性肾炎的分子异质性，并寻找新的诊断和治疗标志物 | 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤组织 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类肾和皮肤活检组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31357 | 2024-08-09 |
Pseudotemporal Ordering of Single Cells Reveals Metabolic Control of Postnatal β Cell Proliferation
2017-May-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2017.04.014
PMID:28467932
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了出生后β细胞增殖的代谢调控机制 | 首次提供了出生后β细胞状态变化的高分辨率分子特征，并揭示了氨基酸代谢、线粒体功能及Srf/Jun/Fos转录因子在β细胞增殖中的作用 | NA | 探究出生后β细胞增殖的调控机制，并寻找新的治疗靶点以促进β细胞再生 | 出生后β细胞的转录组动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个出生后时间点的β细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31358 | 2024-08-09 |
Human organomics: a fresh approach to understanding human development using single-cell transcriptomics
2017-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.150458
PMID:28465333
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research paper | 本文总结了利用单细胞转录组学技术在类器官上进行的研究方法，并讨论了将这些技术应用于生成人体发育和疾病的器官水平机制模型的机遇与挑战 | 利用创新的单细胞转录组学技术，从多能干细胞重现人体器官发生过程，解析类器官的组成部分并重建细胞分化过程中的谱系轨迹 | NA | 探索人体发育生物学，生成人体发育和疾病的器官水平机制模型 | 人体器官发育过程及疾病机制 | digital pathology | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31359 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Maps Development of Human Germline Cells and Gonadal Niche Interactions
2017-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.03.007
PMID:28457750
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了超过2,000个人类胚胎的性腺细胞及其性腺微环境细胞，揭示了人类胎儿生殖细胞（FGCs）的发育轨迹和异质性 | 发现了女性FGCs经历四个不同的连续阶段，以及男性FGCs的发育阶段，并观察到FGCs与其性腺微环境细胞之间的相互信号作用 | NA | 探讨人类胎儿生殖细胞的发育轨迹和异质性 | 人类胎儿生殖细胞及其性腺微环境细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 超过2,000个人类胚胎的性腺细胞及其性腺微环境细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31360 | 2024-08-09 |
Prospective isolation of NKX2-1-expressing human lung progenitors derived from pluripotent stem cells
2017-Jun-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI89950
PMID:28463226
|
研究论文 | 本文通过工程化和体外发育分化NKX2-1GFP报告的多能干细胞，生成并分离出表达NKX2-1的人类原始肺前体细胞，这些细胞最初缺乏分化肺谱系标记，并在特定3D培养中展示肺上皮成熟。 | 首次成功分离并追踪NKX2-1表达的人类肺前体细胞，并进行了实时成像和时间序列全局转录组分析，揭示了早期肺发育的进化保守基因签名。 | NA | 验证人类胎儿发育期间肺上皮细胞是否全部源自表达NKX2-1的胚胎内胚层前体细胞的假设。 | 人类肺前体细胞及其在肺发育中的作用。 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |