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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 31281 | 2024-08-09 | 
         Zuo Gui Wan Alters Expression of Energy Metabolism Genes and Prevents Cell Death in High-Glucose Loaded Mouse Embryos 
        
          2018, Evidence-based complementary and alternative medicine : eCAM
          
         
        
          DOI:10.1155/2018/2409471
          PMID:30046334
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了中药方剂左归丸对高糖负荷小鼠胚胎细胞死亡的分子机制 | 左归丸能够逆转高糖对核糖体途径基因的抑制作用,并通过调节线粒体能量代谢来防止胚胎细胞死亡 | NA | 理解左归丸对受损葡萄糖耐量(IGT)的分子机制 | 高糖负荷的2细胞期小鼠胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | 转录组数据 | 高糖负荷的2细胞期小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA | 
| 31282 | 2024-08-09 | 
         Elucidating T Cell Activation-Dependent Mechanisms for Bifurcation of Regulatory and Effector T Cell Differentiation by Multidimensional and Single-Cell Analysis 
        
          2018, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2018.01444
          PMID:30061879
         
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      研究论文 | 本研究通过多维度和单细胞分析方法,探讨了T细胞受体(TCR)信号如何调控调节性T细胞(Treg)和效应T细胞(Teff)的分化机制 | 首次揭示了TCR信号在Treg和Teff分化中的作用机制,并利用单细胞组合CCA方法分析了肿瘤浸润T细胞的未注释单细胞RNA-seq数据 | NA | 阐明TCR信号下游的激活机制,以及其如何调控Treg和Teff的分化及成熟过程 | T细胞亚群的转录组 | 免疫学 | NA | 多维度分析方法(CCA)和单细胞组合CCA | NA | RNA-seq数据 | 来自独立数据集的各种T细胞亚群 | NA | NA | NA | NA | 
| 31283 | 2024-08-09 | 
         Single-cell RNA sequencing reveals distinct gene expression patterns in glucose metabolism of human preimplantation embryos 
        
          2019-Jan, Reproduction, fertility, and development
          
         
        
          DOI:10.1071/RD18178
          PMID:30017025
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达模式 | 首次在单细胞分辨率下研究了胚胎植入前阶段葡萄糖代谢的动态基因表达谱 | NA | 探究人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达调控机制 | 人类胚胎植入前阶段的葡萄糖代谢相关基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 人类胚胎植入前阶段的多个细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 31284 | 2024-08-09 | 
         Advancing insights into stem cell niche complexities with next-generation technologies 
        
          2018-12, Current opinion in cell biology
          
          IF:6.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.ceb.2018.06.012
          PMID:30031324
         
       | 
      
      综述 | 本文综述了利用下一代技术,如单细胞转录组分析、3D体外培养和4D体内显微镜技术,对成体组织特异性干细胞及其微环境的复杂相互作用的理解进展 | 利用先进的单细胞转录组分析、3D体外培养和4D体内显微镜技术,深入研究干细胞与其微环境的复杂相互作用 | NA | 探讨干细胞与其微环境的复杂相互作用,以更好地理解干细胞在组织维持和再生中的作用 | 成体组织特异性干细胞及其微环境 | NA | NA | 单细胞转录组分析, 3D体外培养, 4D体内显微镜 | NA | 转录组数据, 显微图像 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 31285 | 2024-08-09 | 
         Atherosclerosis in the single-cell era 
        
          2018-10, Current opinion in lipidology
          
          IF:3.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1097/MOL.0000000000000537
          PMID:30020199
         
       | 
      
      综述 | 本文综述了在单细胞时代下,利用高参数技术如质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序(scRNAseq)分析免疫细胞在动脉粥样硬化发展中的作用 | 介绍了通过CyTOF和scRNAseq技术发现的新免疫细胞亚群及其潜在功能 | 酶消化导致的细胞死亡和scRNAseq转录组深度的限制 | 探讨免疫细胞在动脉粥样硬化中的作用及新技术在其中的应用 | 动脉粥样硬化的小鼠动脉壁中的免疫细胞 | NA | 心血管疾病 | 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 细胞 | 10-30种免疫细胞亚群 | NA | NA | NA | NA | 
| 31286 | 2024-08-09 | 
         Gene Signature of Proliferating Human Pancreatic α Cells 
        
          2018-09-01, Endocrinology
          
          IF:3.8Q2
          
         
        
          DOI:10.1210/en.2018-00469
          PMID:30010845
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序结合伪时间排序,对人类胰腺α细胞进行了特征描述,并识别出两个主要亚群和一个较小的增殖α细胞群 | 首次详细描述了人类胰腺α细胞的增殖特征,并识别出与细胞周期调控相关的基因表达模式 | NA | 揭示人类胰腺α细胞的增殖机制及其基因表达特征 | 人类胰腺α细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模单细胞样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 31287 | 2024-08-09 | 
         Optimal Hypoxia Regulates Human iPSC-Derived Liver Bud Differentiation through Intercellular TGFB Signaling 
        
          2018-08-14, Stem cell reports
          
          IF:5.9Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.stemcr.2018.06.015
          PMID:30033085
         
       | 
      
      研究论文 | 研究探讨了在人诱导多能干细胞衍生的肝芽模型中,通过细胞间TGFB信号传导,最佳低氧条件对肝细胞分化的影响 | 首次揭示了低氧通过调节TGFB1和TGFB3的表达,影响肝细胞和胆管细胞标记物的表达,从而促进肝细胞分化 | NA | 探究低氧条件对肝细胞分化的影响及其机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肝芽 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 31288 | 2024-08-09 | 
         Toward Minimal Residual Disease-Directed Therapy in Melanoma 
        
          2018-08-09, Cell
          
          IF:45.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.cell.2018.06.025
          PMID:30017245
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了BRAF突变患者来源的异种移植黑色素瘤细胞在接受RAF/MEK抑制剂治疗后的残留疾病生物学特性 | 本文首次识别出药物耐受的转录状态,并发现神经嵴干细胞(NCSC)转录程序在残留疾病中的作用,以及RXR拮抗剂在延缓耐药发展中的潜力 | NA | 探讨残留疾病的生物学特性及其在黑色素瘤治疗中的潜在应用 | BRAF突变患者来源的异种移植黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个患者来源的异种移植模型和治疗中的患者活检样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 31289 | 2024-08-09 | 
         Single-Cell RNA Sequencing: A New Window into Cell Scale Dynamics 
        
          2018-08-07, Biophysical journal
          
          IF:3.2Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.bpj.2018.07.003
          PMID:30033145
         
       | 
      
      研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在多细胞系统中的应用及其对细胞类型和状态研究的贡献 | 介绍了高吞吐量的单细胞RNA测序技术,能够同时量化复杂组织中成千上万个细胞内数千个基因的表达水平 | NA | 研究细胞类型的粒度、细胞状态的定义以及细胞类型沿发育轨迹的转变 | 单细胞RNA测序技术及其在多细胞系统中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成千上万个细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 31290 | 2024-08-09 | 
         Unbiased classification of mosquito blood cells by single-cell genomics and high-content imaging 
        
          2018-08-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
          
          IF:9.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1073/pnas.1803062115
          PMID:30038005
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、高内涵成像流式细胞术和单分子RNA杂交技术,对疟蚊血细胞进行了深入分析 | 本文首次展示了血细胞表达了近半的蚊子转录组,提供了前所未有的转录程序视图,并揭示了细胞间标记物的主动转移 | NA | 研究蚊子血细胞的生物学特性及其在控制病原体感染中的作用 | 疟蚊血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、高内涵成像流式细胞术、单分子RNA杂交 | NA | RNA | 特定子集的血细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 31291 | 2024-08-09 | 
         PBMC fixation and processing for Chromium single-cell RNA sequencing 
        
          2018-07-17, Journal of translational medicine
          
          IF:6.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12967-018-1578-4
          PMID:30016977
         
       | 
      
      研究论文 | 本文介绍了一种使用甲醇固定和新的处理方法来保存人外周血单个核细胞(PBMCs)进行单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析的方法。 | 本文首次提出使用甲醇固定PBMCs并成功应用于10× Chromium单细胞RNA测序平台,解决了传统使用活细胞进行单细胞测序时细胞应激和复杂研究设计受限的问题。 | NA | 开发一种新的细胞固定和处理方法,以提高单细胞实验设计的复杂性和有效性。 | 人外周血单个核细胞(PBMCs)及其他固定原代细胞类型和细胞系。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA | 
| 31292 | 2024-08-09 | 
         Single cell transcriptome profiling of retinal ganglion cells identifies cellular subtypes 
        
          2018-07-17, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41467-018-05134-3
          PMID:30018341
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了6225个视网膜神经节细胞,并使用聚类算法将其分为40个亚型 | 发现了额外的亚型和标记物,并预测了转录因子在指定RGC亚型中的合作 | NA | 识别视网膜神经节细胞的细胞亚型 | 视网膜神经节细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 6225个视网膜神经节细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 31293 | 2024-08-09 | 
         Differences in Cell Cycle Status Underlie Transcriptional Heterogeneity in the HSC Compartment 
        
          2018-07-17, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.celrep.2018.06.057
          PMID:30021172
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过特征化视黄酸(RA)报告鼠系,进一步解析造血干细胞(HSC)隔室,发现RA-CFP-dim HSCs主要为非增殖状态,并具有更优的植入潜能 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了细胞周期活动是HSC转录异质性的主要驱动因素,并展示了RA-CFP报告鼠系在分离优质HSC中的应用 | NA | 解析HSC隔室的异质性 | 造血干细胞(HSCs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 超过1,200个HSCs | NA | NA | NA | NA | 
| 31294 | 2024-08-09 | 
         Single Cell RNA Sequencing of Rare Immune Cell Populations 
        
          2018, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2018.01553
          PMID:30022984
         
       | 
      
      研究论文 | 本文描述了采用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)技术研究罕见免疫细胞在其微解剖生态位中的经验 | scRNA-Seq技术的发展使得能够识别和表征以往在群体分析中常被忽视的罕见细胞类型,揭示了免疫系统的异质性和可塑性 | NA | 探索和表征罕见免疫细胞类型及其在免疫系统中的作用 | 罕见免疫细胞及其微解剖生态位 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA | 
| 31295 | 2024-08-09 | 
         netSmooth: Network-smoothing based imputation for single cell RNA-seq 
        
          2018, F1000Research
          
         
        
          DOI:10.12688/f1000research.13511.3
          PMID:29511531
         
       | 
      
      研究论文 | 本文介绍了一种基于网络扩散的方法netSmooth,用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)实验中的基因表达值平滑处理 | netSmooth利用基因表达谱的协方差结构先验知识,改善了scRNA-seq实验的聚类结果 | NA | 旨在解决scRNA-seq实验中的技术偏差问题,如丢失值和高方差 | 单细胞RNA测序实验中的基因表达数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 网络扩散模型 | 基因表达数据 | 涉及不同细胞群体、时间序列实验和癌症基因组学的scRNA-seq实验 | NA | NA | NA | NA | 
| 31296 | 2024-08-09 | 
         Comparison of Computational Methods for Imputing Single-Cell RNA-Sequencing Data 
        
          2020 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
          
         
        
          DOI:10.1109/TCBB.2018.2848633
          PMID:29994128
         
       | 
      
      研究论文 | 本文比较了八种单细胞RNA测序数据插补方法,评估了它们恢复原始真实数据的能力,并分析了它们在细胞类型聚类、差异表达基因检测和谱系轨迹重建中的效果。 | 本文首次对多种单细胞RNA测序数据插补方法进行了大规模比较和评估。 | 文中指出没有一种方法在所有情况下都表现最佳,且存在可扩展性、鲁棒性和某些情况下的不可用性等缺陷。 | 比较和评估不同的单细胞RNA测序数据插补方法。 | 单细胞RNA测序数据插补方法。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了模拟数据集和真实数据集进行分析 | NA | NA | NA | NA | 
| 31297 | 2024-08-09 | 
         iS-CellR: a user-friendly tool for analyzing and visualizing single-cell RNA sequencing data 
        
          2018-12-15, Bioinformatics (Oxford, England)
          
         
        
          DOI:10.1093/bioinformatics/bty517
          PMID:29982379
         
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      研究论文 | iS-CellR是一个基于网络的Shiny应用程序,旨在为用户提供友好的单细胞RNA测序数据综合分析平台 | iS-CellR通过提供一个易于访问的图形用户界面,使用户无需编程技能即可进行复杂的单细胞RNA测序分析 | NA | 开发一个用户友好的工具,用于分析和可视化单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Shiny应用程序 | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 31298 | 2024-08-09 | 
         NeuroSystematics and Periodic System of Neurons: Model vs Reference Species at Single-Cell Resolution 
        
          2018-08-15, ACS chemical neuroscience
          
          IF:4.1Q2
          
         
        
          DOI:10.1021/acschemneuro.8b00100
          PMID:29989789
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过结合现代系统发生基因组学、单细胞测序(scRNA-seq)、机器学习、单细胞蛋白质组学和代谢组学,重建了神经元的进化历史,并提出了神经元系统学的概念。 | 本文首次提出了神经元系统学(NeuroSystematics)的概念,类似于化学元素周期表,具有预测神经元表型和可塑性的潜力。 | NA | 研究神经元的进化历史,并提出神经元系统学的概念。 | 神经元的进化历史和神经元系统学。 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 涉及34个门类的动物 | NA | NA | NA | NA | 
| 31299 | 2024-08-09 | 
         Single-Cell Transcriptomics of a Human Kidney Allograft Biopsy Specimen Defines a Diverse Inflammatory Response 
        
          2018-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
          
          IF:10.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1681/ASN.2018020125
          PMID:29980650
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人肾移植活检标本,揭示了复杂的炎症反应。 | 首次使用单细胞转录组学技术分析肾移植活检标本,识别了多种细胞类型及其状态,并建立了可搜索的在线基因表达数据库。 | 仅限于单个活检标本的研究,可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 验证单细胞RNA测序技术在肾移植活检标本中的应用,并探索其在诊断和治疗中的潜力。 | 人肾移植活检标本中的细胞类型和状态。 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 8746个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA | 
| 31300 | 2024-08-09 | 
         Single-Cell Sequencing the Glomerulus, Unraveling the Molecular Programs of Glomerular Filtration, One Cell at a Time 
        
          2018-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
          
          IF:10.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1681/ASN.2018060626
          PMID:30002221
         
       | 
      
      NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |