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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3101 | 2025-10-06 |
Construction of a Prognostic Model for Mitochondria and Macrophage Polarization Correlation in Glioma Based on Single-Cell and Transcriptome Sequencing
2024-11, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70083
PMID:39491527
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研究论文 | 基于单细胞和转录组测序构建胶质瘤中线粒体与巨噬细胞极化相关性的预后模型 | 首次整合线粒体相关基因和巨噬细胞极化相关基因构建胶质瘤预后模型,并通过单细胞RNA测序在细胞水平验证基因表达 | 研究基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探讨线粒体相关基因和巨噬细胞极化相关基因与胶质瘤预后的关系 | 胶质瘤患者数据集和组织样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,转录组测序,WGCNA | 风险模型,列线图 | 基因表达数据 | 多个胶质瘤数据集(TCGA-GBMLGG, mRNA-seq-325, mRNA-seq-693, GSE16011, GSE4290, GSE138794) | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
3102 | 2025-10-06 |
Glutaminase inhibition in combination with azacytidine in myelodysplastic syndromes: a phase 1b/2 clinical trial and correlative analyses
2024-Oct, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00811-3
PMID:39300320
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临床研究论文 | 评估telaglenastat(CB-839)联合阿扎胞苷在晚期骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效 | 首次将选择性谷氨酰胺酶抑制剂与去甲基化药物联合应用于MDS治疗,并通过单细胞RNA测序验证疗效机制 | 单臂开放标签研究设计,样本量有限(共30名参与者) | 开发骨髓增生异常综合征的代谢和表观遗传联合治疗方法 | 晚期骨髓增生异常综合征患者 | 临床医学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 30名参与者(6名剂量递增研究,24名剂量扩展研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3103 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals the protective effects of lactate-mediated lactylation of microglia-related proteins on spinal cord injury
2024-09, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70028
PMID:39218784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,揭示了乳酸介导的小胶质细胞蛋白乳酸化对脊髓损伤的保护作用 | 首次发现乳酸通过调节小胶质细胞蛋白乳酸化影响其炎症表型,为脊髓损伤治疗提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明糖酵解来源乳酸通过乳酸化对小胶质细胞功能的调控机制及其在脊髓损伤中的神经保护作用 | 小鼠脊髓损伤模型和小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 成年雄性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
3104 | 2025-10-06 |
Molecular Pathways and Cellular Subsets Associated with Adverse Clinical Outcomes in Overlapping Immune-Related Myocarditis and Myositis
2024-Aug-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0011
PMID:38768394
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析免疫检查点疗法引发的心肌炎和肌炎患者的组织样本,揭示相关的分子通路和免疫细胞亚群 | 首次在活体患者中鉴定出与免疫相关心肌炎和肌炎不良临床结局相关的CD8+ T细胞和髓系细胞亚群,特别是表达FcγRIIIa和IL1B+TNF+的炎症性髓系细胞 | 样本量较小(n=20),仅包含接受免疫检查点治疗的癌症患者,所有活检均在临床表现96小时内获取 | 阐明免疫检查点疗法引发的心肌炎和肌炎的分子机制和免疫细胞基础 | 接受免疫检查点治疗的癌症患者并发心肌炎和/或肌炎的组织样本 | 单细胞组学 | 心肌炎和肌炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 20例患者(10例重叠心肌炎加肌炎,1例单纯心肌炎,9例对照)共58,523个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3105 | 2025-10-06 |
New tools to study renal fibrogenesis
2024-07-01, Current opinion in nephrology and hypertension
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/MNH.0000000000000988
PMID:38587103
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综述 | 本文综述了单细胞和空间多组学技术在研究肾脏纤维化机制中的最新进展和应用前景 | 强调了单细胞RNA测序和空间多组学技术为研究人类肾脏纤维化提供了新的研究途径,特别是在细胞谱系、细胞可塑性和细胞间通讯方面 | 需要精心设计和优化多组学实验以解决肾脏纤维化中的具体科学问题 | 探索肾脏纤维化的发病机制和病理过程 | 人类肾脏组织,包括健康肾脏和慢性肾脏病患者的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间多组学数据 | 健康人类肾脏和慢性肾脏病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间多组学 | NA | NA |
3106 | 2025-10-06 |
Developmental regulation of primitive erythropoiesis
2024-05-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000806
PMID:38415349
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综述 | 本文综述原始红细胞生成的最新研究进展,重点关注其胚胎起源、物种特异性发育调控差异以及终末分化的分子和代谢通路 | 结合单细胞转录组学和先进谱系追踪技术揭示原始红细胞起源,发现转录延伸调控因子和表观遗传修饰剂DOT1L的非经典功能,揭示磷酸戊糖途径等关键代谢通路的激活 | 基于小鼠模型和罕见人类胚胎样本的研究,人类样本数量有限且存在物种差异 | 解析原始红细胞生成的发育调控机制,为体外生成治疗性红细胞提供理论基础 | 小鼠胚胎和人类早期胚胎中的原始红细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,谱系追踪,代谢组学,蛋白质组学 | NA | 转录组数据,表观遗传数据,代谢数据 | 未明确样本数量,使用小鼠胚胎和罕见人类胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3107 | 2025-10-06 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 提出空间特征测度LDDMM算法,用于将空间转录组数据映射到标准图谱的通用坐标系中 | 首次在微分同胚空间中计算测地线的算法系列,扩展了LDDMM算法家族以处理带标记粒子的空间特征作用 | NA | 开发空间转录组数据的跨模态配准算法,实现分子和细胞尺度种群在通用坐标系中的统计平均 | 小鼠脑部空间转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH, 空间转录组学 | LDDMM, 空间特征测度LDDMM | 空间基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 自动化显微镜 | MERFISH | NA |
3108 | 2025-10-06 |
Targeting HIV persistence in the tissue
2024-03-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000836
PMID:38169333
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综述 | 探讨HIV在人体组织中持久存在的机制及靶向清除策略 | 提出针对不同组织微环境的HIV储存库靶向治疗新思路,整合单细胞测序等前沿技术 | 组织特异性潜伏机制复杂,缺乏统一有效的清除策略 | 研究HIV在组织储存库中的持久性机制和清除方法 | HIV感染者的淋巴组织、滤泡辅助T细胞、CD4+T细胞和组织巨噬细胞 | 传染病学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选, mRNA技术, 组织类器官 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3109 | 2025-10-06 |
Single-cell insights into development of the bovine placenta†
2024-01-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad123
PMID:37707543
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究牛胎盘发育过程中的细胞类型和分子机制 | 首次构建了牛胚胎发育过程中胎盘细胞的数字图谱,揭示了滋养层细胞分化的轨迹和关键转录因子 | 样本数量有限(每个时间点3-4个样本),仅分析了特定发育时间点 | 探究牛胎盘发育的细胞和分子调控机制 | 牛胚胎和绒毛膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 第17天牛胚胎和24、30、50天绒毛膜组织,每个时间点3-4个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
3110 | 2025-10-06 |
The many faces of the megakaryocytes and their biological implications
2024-01-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000793
PMID:37910197
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的巨核细胞谱系转录异质性和功能可塑性 | 通过单细胞RNA测序技术首次系统识别巨核细胞的多个功能亚群及其组织分布特征 | NA | 探讨巨核细胞亚群的功能表型可塑性及其在健康与疾病中的作用 | 巨核细胞及其转录亚群 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3111 | 2025-10-06 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
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研究论文 | 本研究深入表征了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型和功能多样性 | 首次系统描绘足月胎盘绒毛组织的免疫景观,并揭示孕前肥胖对绒毛髓系细胞表型和功能的调控作用 | 样本来源仅限于无并发症的足月妊娠,未涵盖病理妊娠状态 | 探究足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型特征和功能状态 | 人类足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质表达数据 | 足月无并发症妊娠的绒毛组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 单细胞ATAC测序 | NA | CITE-seq(细胞表面蛋白与转录组联合测序), snATAC-seq(单核染色质可及性测序) |
3112 | 2025-10-06 |
Mild/asymptomatic COVID-19 in unvaccinated pregnant mothers impairs neonatal immune responses
2023-09-12, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172658
PMID:37698937
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研究论文 | 本研究揭示未接种疫苗孕妇的轻度/无症状COVID-19感染会改变新生儿免疫细胞组成和功能 | 首次系统分析轻度/无症状感染对新生儿免疫系统的影响,发现即使无垂直传播或新生儿症状,胎儿免疫细胞仍出现功能改变 | 研究样本仅限于未接种疫苗孕妇,未评估疫苗接种对观察效应的影响 | 探究轻度/无症状母体SARS-CoV-2感染对新生儿免疫反应的影响 | 未接种疫苗孕妇的新生儿脐带血和绒毛膜绒毛样本 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,TLR激动剂和病原体体外刺激 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,功能反应数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3113 | 2025-10-06 |
An optimized approach for multiplexing single-nuclear ATAC-seq using oligonucleotide-conjugated antibodies
2023-04-28, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-023-00486-7
PMID:37118773
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研究论文 | 开发了一种使用寡核苷酸偶联抗体的单核ATAC-seq多重分析方法 | 首次使用识别核孔复合体蛋白的寡核苷酸偶联抗体进行单核ATAC-seq多重分析 | 仅在2重和4重样本中验证了方法准确性 | 开发单核ATAC-seq样本多重分析技术 | 人和小鼠细胞样本的混合样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单核ATAC-seq, 寡核苷酸偶联抗体技术 | NA | 基因组测序数据 | 2重样本9144个细胞核,4重样本12208个细胞核 | NA | 单核ATAC-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
3114 | 2025-10-06 |
CXCL12 defines lung endothelial heterogeneity and promotes distal vascular growth
2022-11-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200909
PMID:36239312
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肺内皮细胞异质性,发现CXCL12信号对远端血管发育的关键作用 | 首次利用Cxcl12转基因小鼠报告系统结合单细胞测序技术解析肺动脉内皮细胞的功能异质性 | 研究局限于小鼠胚胎发育模型,尚未在人类样本中验证 | 探索肺血管系统在胚胎发育过程中的形态发生和生长机制 | 小鼠肺内皮细胞,特别是Cxcl12-DsRed+动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 儿科肺疾病 | 单细胞RNA测序,转基因报告系统,基因本体分析,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 转基因小鼠肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3115 | 2025-10-06 |
The role of specialized cell cycles during erythroid lineage development: insights from single-cell RNA sequencing
2022-Aug, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-022-03406-9
PMID:35759181
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综述 | 本文综述了红细胞谱系发育过程中特殊细胞周期的作用,重点关注CFU-e向红细胞终末分化的转变机制 | 揭示了CFU-e/ETD转变是一个快速的S期依赖性转录开关,并发现细胞周期速度和S期缩短在细胞命运决定中的新发育作用 | NA | 探讨红细胞谱系发育过程中细胞周期调控的机制 | 红细胞祖细胞(CFU-e)和红细胞终末分化(ETD)过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3116 | 2025-10-06 |
mDrop-Seq: Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq of Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans
2021-Dec-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10010030
PMID:35062691
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研究论文 | 开发了一种名为mDrop-seq的高通量单细胞RNA测序技术,用于酵母菌的转录组分析 | 针对微生物物种开发了首个高通量单细胞RNA测序技术,解决了细胞壁坚硬和RNA量低的技术挑战 | 仅应用于两种酵母菌物种,尚未在其他微生物中验证 | 开发适用于微生物的高通量单细胞RNA测序技术并验证其应用价值 | 酿酒酵母和白色念珠菌 | 单细胞测序技术 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酿酒酵母35,109个细胞,白色念珠菌39,705个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | mDrop-seq | 微生物Drop-seq技术,专门针对酵母菌优化 |
3117 | 2025-10-06 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
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研究论文 | 本研究通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析结直肠癌中γδ T细胞的特征及其预后意义 | 首次在大型结直肠癌队列中系统分析γδ T细胞的预后价值,并发现其与抗原呈递缺陷和错配修复缺陷的关联 | 队列2中γδ T细胞与生存期的关联未达到统计学显著性,样本量相对有限 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌中的特征和临床意义 | 结直肠癌患者组织样本 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA测序 | NA | 组织图像,基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(免疫组化队列)+ 62例患者(单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3118 | 2025-10-06 |
Inhibition of FAK promotes pancreatic cancer immunotherapy by mediating CXCL10 secretion to enhance CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2539442
PMID:40726089
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研究论文 | 本研究探讨FAK抑制通过促进CXCL10分泌增强CD8+ T细胞浸润从而促进胰腺癌免疫治疗的机制 | 首次揭示FAK通过调控CXCL10分泌影响CD8+ T细胞浸润的具体机制,并验证FAK抑制剂与免疫检查点抑制剂的协同抗肿瘤效应 | FAK在胰腺癌免疫微环境中的具体调控机制尚未完全阐明 | 探究FAK在胰腺癌免疫治疗中的作用及机制 | 胰腺癌肿瘤微环境、CD8+ T细胞、患者来源类器官 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、类器官共培养、小鼠模型 | 患者来源类器官模型、小鼠胰腺癌模型、双人源化模型 | 单细胞测序数据、临床标本数据 | 临床标本和实验模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3119 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered immune and stromal landscape in primary and liver metastasis of gastric cancer
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102163
PMID:40727437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胃癌原发灶和肝转移灶中免疫和基质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平系统比较胃癌原发灶与肝转移灶的肿瘤微环境差异 | 样本量有限(7例GC,2例NT,5例LM,3例HL),数据来源于公共数据库 | 识别与胃癌肝转移相关的基质细胞 | 胃癌组织、癌旁正常组织、肝转移灶和健康肝组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,RNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据,RNA-Seq数据,临床数据 | 107,875个细胞(来自7例GC,2例NT,5例LM,3例HL样本),448个RNA-Seq文件 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
3120 | 2025-10-06 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
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研究论文 | 本研究通过分析B细胞和T细胞受体序列,阐明了奥瑞珠单抗治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在奥瑞珠单抗治疗背景下全面分析B细胞和T细胞受体库变化,并发现脑脊液中组织驻留记忆细胞的治疗抵抗现象 | 样本量有限,未来需要更大规模研究验证已识别表型与多发性硬化病理的关系 | 阐明奥瑞珠单抗治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者和健康捐赠者的血液、脑脊液样本 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞受体测序,T细胞受体测序,单细胞转录组测序 | NA | 基因组测序数据,转录组数据 | 35名多发性硬化症患者(奥瑞珠单抗治疗),11名健康捐赠者,14名多发性硬化症患者(那他珠单抗治疗),29名捐赠者的脑脊液和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |