单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 38102 篇文献,本页显示第 3081 - 3100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3081 2026-02-23
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 研究主要基于转录组数据,功能验证仅限于细胞系实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 肝内胆管癌恶性细胞 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3082 2026-02-23
Pancancer Fine-Mapping of Mutational Intolerance Identifies CHEK1 as an Immunosuppressive Driver in Lung Adenocarcinoma
2026-Feb-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了miDriver计算框架,通过泛癌-正常组织突变对比识别了1,020个突变不耐受基因,并揭示了CHEK1作为肺腺癌中免疫抑制驱动因子的作用机制 提出了基于泛癌-正常组织突变对比的计算框架miDriver,首次系统识别了1,020个突变不耐受基因,并发现CHEK1通过调控MIF表达驱动M2样巨噬细胞极化的新机制 研究基于13种癌症类型的8,096个肿瘤样本,可能未覆盖所有癌症类型;体内实验的临床转化潜力需进一步验证 识别癌症中突变不耐受基因的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 13种癌症类型的8,096个肿瘤样本,重点关注肺腺癌中的CHEK1基因 计算生物学 肺腺癌 CRISPR筛选、单细胞转录组学、多重免疫荧光 计算框架miDriver 基因组突变数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像数据 8,096个肿瘤样本(涵盖13种癌症类型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3083 2026-02-23
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群中Parvimonas micra的富集及其通过代谢产物p-甲酚促进调节性T细胞分化,从而驱动肿瘤生长的机制 首次在ESCC中系统揭示了肿瘤内微生物Parvimonas micra通过代谢产物p-甲酚调控肿瘤免疫微环境(诱导Treg分化)的具体分子机制,建立了微生物-代谢物-免疫抑制-肿瘤生长的完整因果链条 样本量相对有限(119对肿瘤-正常组织),且机制研究主要基于细胞和动物实验,在人体内的直接验证尚需进一步研究 探究食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群的组成、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用机制 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的肿瘤组织及配对正常组织 肿瘤微生物组学 食管鳞状细胞癌 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 119对肿瘤-正常组织用于宏基因组测序;45个样本用于单细胞RNA测序 NA 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq NA NA
3084 2026-02-23
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-Feb-19, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究开发了一个名为SCMO的深度学习模型,通过整合单细胞分辨率下的肿瘤微环境生态系统特征和多组学数据,用于结直肠癌患者的生存预测 首次将单细胞分辨率下的肿瘤微环境生态系统特征与多组学数据整合到一个深度学习模型中,用于生存预测,并利用集成梯度算法和空间转录组数据增强模型可解释性 模型在测试集中的1年预测AUC相对较低(0.639),且样本量(213个单细胞样本)可能限制其泛化能力 提高结直肠癌患者生存预测的准确性,并识别潜在的药物靶点 结直肠癌患者 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 自归一化神经网络 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,临床数据,基因组数据,转录组数据,微生物数据 213个结直肠癌单细胞RNA测序样本(包含339,060个细胞),以及来自TCGA-CRC队列的批量RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq NA NA
3085 2026-02-23
CD68 Identified as a Regulator of Human Melanocyte Development and Function
2026-Feb-19, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了传统巨噬细胞标记物CD68在人类黑素细胞发育和功能调控中的新作用 首次将CD68确立为黑素细胞生物学的调控因子,超越了其作为免疫细胞标记物的传统认知 研究基于人类胚胎干细胞分化模型,可能无法完全反映体内黑素细胞发育的复杂性 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3086 2026-02-23
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究首次绘制了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)的碱基分辨率转录组图谱,揭示了m5C通过稳定SERPINB5 mRNA促进宫颈癌进展和化疗耐药的机制 首次在宫颈癌中生成碱基分辨率的m5C转录组图谱,并结合空间转录组学和单细胞RNA-seq技术,鉴定出SERPINB5作为m5C调控的新型致癌效应因子 NA 阐明m5C在宫颈癌中的功能机制和治疗相关性 宫颈癌 数字病理学 宫颈癌 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
3087 2026-02-23
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular and Molecular Differences Between Myxofibrosarcoma and Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-Feb-10, Medical sciences (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的细胞与分子差异 首次在单细胞水平上揭示了这两种肉瘤亚型在细胞组成、通路活性和细胞间配体-受体相互作用方面的差异 样本量较小(仅5个肿瘤样本),需要进一步验证 阐明黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤之间的细胞和转录组差异,以改善其鉴别诊断 黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的肿瘤样本 单细胞组学 肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 5个肿瘤样本(包含两种亚型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3088 2026-02-23
Single-cell Transcriptomic Profiling Reveals Diagnostic of T Cell-platelet Aggregates in Peripheral Blood for Coronary Vulnerable Plaques
2026-Feb-04, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了外周血中T细胞-血小板聚集体在冠状动脉易损斑块诊断中的作用,并利用机器学习筛选出五个潜在的非侵入性生物标志物 首次在单细胞水平上发现并验证了循环T细胞-血小板聚集体与易损斑块的相关性,并利用机器学习方法从高维数据中筛选出具有诊断价值的生物标志物组合 样本量相对有限,且为横断面研究,需要更大规模的前瞻性队列验证生物标志物的临床实用性 开发非侵入性生物标志物用于冠状动脉易损斑块的诊断 冠状动脉疾病患者的外周血单核细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 Boruta, LASSO回归, SVM-RFE 单细胞转录组数据 冠状动脉疾病患者与对照者的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3089 2026-02-05
Single-cell transcriptomics identifies fibroblast associated immune heterogeneity and prognostic signatures in bladder cancer
2026-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3090 2026-02-05
Integrative analysis of transcriptome and single-cell sequencing combined with experimental validation identifies biomarkers associated with T cell and senescence in sepsis
2026-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3091 2026-02-23
Interpretable inflammation landscape of circulating immune cells
2026-Feb, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,描绘了感染、免疫介导炎症性疾病和癌症中循环免疫细胞的炎症过程,构建了一个包含超过650万个外周血单个核细胞的单细胞图谱 通过大规模单细胞图谱学习循环免疫细胞的全面炎症模型,并利用无监督和可解释机器学习开发疾病分类框架 研究主要基于外周血单个核细胞,可能未完全涵盖组织特异性炎症反应 全面理解循环免疫细胞的炎症过程,开发炎症性疾病的分类框架 循环免疫细胞,特别是外周血单个核细胞 单细胞转录组学 感染、免疫介导炎症性疾病、癌症 单细胞转录组学 无监督机器学习、可解释机器学习 单细胞RNA-seq数据 1,047名患者(56%女性,43%男性),超过650万个外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3092 2026-02-23
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合公共可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的综合图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性、细胞组成以及癌症相关成纤维细胞亚型的显著差异 首次通过整合大规模公共单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中肿瘤微环境的异质性,并明确了两种亚型中占主导地位的癌症相关成纤维细胞亚型及其与预后的不同关联 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;研究结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;共培养实验在体外进行,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 探究非小细胞肺癌中肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的差异及其与预后的关系 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了公共可用的大规模单细胞RNA测序数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3093 2026-02-23
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新,包括内容扩展、功能增强和社区协作,以支持FAIR原则下的基因和蛋白质表达数据 新增了批量基线实验的标记基因分析模块,整合了单细胞RNA-seq数据集如Tabula Sapiens和GTEx单核图谱,并计划提供AI就绪数据格式 未明确提及具体的技术或数据局限性,主要关注资源更新和未来方向 通过社区协作和集成,实现FAIR和开放的表达数据,支持基础和转化研究 基因和蛋白质表达数据,涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 超过4500项研究,涉及67个物种,包括数百个单细胞RNA-seq实验 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
3094 2026-02-23
Molecular interplay of ASNS and the PI3K-AKT-mTOR pathway in CMV and HIV co-infections: Therapeutic implications
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究揭示了天冬酰胺合成酶(ASNS)在CMV/HIV共感染中作为关键的代谢信号枢纽,并与PI3K-AKT-mTOR通路相互作用,为开发宿主导向的治疗策略提供了新靶点 首次将ASNS确定为CMV/HIV共感染发病机制中的关键代谢信号枢纽,并通过分子对接和动力学模拟发现抗病毒药物西多福韦能高亲和力结合ASNS,提出了靶向ASNS特定残基(VAL-51和ASN-74)的新型宿主导向治疗策略 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,需要进一步的实验验证来确认ASNS作为治疗靶点的有效性和安全性 阐明CMV/HIV共感染的分子机制,并寻找新的治疗靶点以改善患者预后 CMV和HIV共感染的分子相互作用网络,特别是ASNS与PI3K-AKT-mTOR通路的关系 生物信息学 HIV感染 转录组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、分子对接、分子动力学模拟 机器学习模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3095 2026-02-23
Coronary Artery Calcification: Decoding Mechanisms, Innovations, and Translational Strategies from Bench to Bedside
2025-Dec-26, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
综述 本文综述了冠状动脉钙化(CAC)的病理机制、技术创新及临床管理策略,强调其从被动标志物向主动调控过程的转变 整合了30年研究,通过单细胞测序识别了内膜与中膜钙化亚型,并强调了AI在影像分割(99.2%准确率)和血管内碎石术(IVL,≥98%成功率)等创新技术的应用 他汀类药物对钙化的双重效应、亚型诊断缺口以及先进工具(如IVL在>70%资源有限设施中不可用)的可及性有限 总结CAC的病理机制、技术进展和临床证据,推动从被动治疗向主动血管健康优化的转变 冠状动脉钙化(CAC)及其相关的动脉粥样硬化病理 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 AI 影像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3096 2026-02-23
Spatial analysis of IPMNs defines a paradoxical KRT17-positive, low-grade epithelial population harboring malignant features
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学分析,识别了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤中一个表达恶性特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 首次在组织学低级别IPMN中发现了一个表达恶性转录特征(如KRT17、S100A10和CEACAM5)的上皮细胞亚群,该亚群可能代表向高级别不典型增生进展的过渡状态 研究样本数量可能有限,且需要进一步验证该KRT17阳性亚群在更大队列中的临床意义和预测价值 探究IPMN进展过程中的转录变化,以改善患者风险分层和治疗决策 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤患者样本,包括低级别不典型增生、高级别不典型增生和IPMN来源的癌组织 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像 包含IPMN疾病全谱的患者样本,具体数量未明确说明 Nanostring 空间转录组学,单细胞RNA-seq Nanostring GeoMx Nanostring GeoMx空间转录组平台
3097 2026-02-22
Single-cell transcriptomic profiling of platelet-adherent circulating tumor cells using a microcavity-gel manipulation platform
2026-Apr, Journal of bioscience and bioengineering IF:2.3Q3
研究论文 本研究开发了一种结合微腔阵列和凝胶细胞操作技术的单细胞转录组分析平台,用于分析转移性胰腺癌患者的循环肿瘤细胞 开发了一种不依赖标记物的微腔-凝胶操作平台,能够高质量地进行单细胞RNA测序,并首次揭示了胰腺癌CTCs具有血小板驱动的EMT激活特征和G1期细胞周期停滞现象 研究样本量有限,且主要针对胰腺癌,未验证在其他癌症类型中的适用性 开发用于循环肿瘤细胞单细胞转录组分析的新技术平台,并探索胰腺癌转移的生物学机制 转移性胰腺癌患者的循环肿瘤细胞、胰腺癌细胞系 单细胞测序技术 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 患者来源的CTCs(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq 微腔-凝胶操作平台 结合微腔阵列和凝胶细胞操作技术的单细胞分析平台,用于不依赖标记物的细胞回收
3098 2026-02-22
IL-6 drives chemoimmunotherapy resistance in NSCLC by reprogramming myeloid cells and impairing cytotoxic lymphocyte function
2026-Mar-31, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了基线血浆IL-6水平是晚期非小细胞肺癌患者对化疗免疫联合疗法产生原发性耐药和预后不良的独立预测因子,并通过单细胞RNA测序阐明了IL-6通过重塑肿瘤免疫微环境(如诱导巨噬细胞向免疫抑制表型极化、抑制CD8 T细胞功能)驱动耐药的机制 首次将基线血浆IL-6水平确立为晚期NSCLC患者对化疗免疫联合疗法(抗PD-1抑制剂+化疗)原发性耐药和生存期不良的独立预测因子,并利用单细胞RNA测序在体内模型中系统阐明了IL-6通过重编程髓系细胞(巨噬细胞极化)和损害细胞毒性淋巴细胞(CD8 T细胞、NK细胞)功能来驱动耐药的详细机制 研究为回顾性分析,需要前瞻性研究验证;小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤的复杂性;机制研究主要基于小鼠模型,需在人类样本中进一步确认 探究基线血浆IL-6水平对晚期非小细胞肺癌患者化疗免疫联合疗法疗效的预测价值,并阐明IL-6驱动耐药的潜在机制 晚期非小细胞肺癌患者(123例)以及小鼠肺腺癌和鳞状细胞癌模型 肿瘤免疫学 肺癌 ELISA,单细胞RNA测序 NA 临床数据,血浆样本,单细胞RNA测序数据 123名晚期NSCLC患者;小鼠肺腺癌和鳞状细胞癌模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3099 2026-02-22
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Mar-31, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用新辅助治疗前后的胰腺导管腺癌患者来源类器官,揭示了化疗耐药机制并发现了潜在的治疗靶点 建立了匹配的新辅助治疗前后患者来源类器官平台,用于追踪治疗驱动的肿瘤进化,并发现AG化疗通过激活KRAS/MAPK通路诱导耐药 研究样本量有限,需要更大规模的队列验证;类器官模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 揭示胰腺导管腺癌化疗耐药的分子机制并寻找治疗靶点 胰腺导管腺癌患者来源类器官、患者肿瘤样本 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析 患者来源类器官、异种移植模型 转录组数据、单细胞测序数据 患者样本90例(AG治疗30例,未治疗60例),验证队列类器官29个 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3100 2026-02-22
TMEM11 promotes cisplatin resistance by inhibiting BNIP3-mediated mitophagy in bladder cancer
2026-Mar-31, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了跨膜蛋白11(TMEM11)在膀胱癌中介导顺铂耐药的作用机制 揭示了TMEM11通过抑制BNIP3介导的线粒体自噬和凋亡来促进顺铂耐药的新机制,并发现姜黄素可作为TMEM11的高亲和力抑制剂 NA 研究膀胱癌中顺铂耐药的分子机制并探索克服耐药的治疗策略 膀胱癌细胞及肿瘤组织 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, ATAC-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
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