单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 3061 - 3080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3061 | 2026-04-14 |
Integrated Plasma Proteomics and Functional Analyses Reveal Hepatic CDHR2 as a Potential Therapeutic Target in MASLD
2026-May, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70623
PMID:41804813
|
研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质组学与功能分析，发现肝细胞中的CDHR2是MASLD发展的新型调控因子和潜在治疗靶点 | 首次通过整合多源数据（包括孟德尔随机化分析）识别并功能验证了CDHR2在MASLD中的因果作用 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步的体内实验和临床验证 | 识别和验证与代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）相关的蛋白质治疗靶点 | MASLD患者、肝细胞（原代肝细胞、HepG2和AML12细胞系） | 生物信息学与功能基因组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 血浆蛋白质组学、孟德尔随机化分析、RNA-seq、免疫染色、基因沉默与过表达 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据、临床数据 | UK Biobank中具有影像学cT1和血浆蛋白质组数据的MASLD参与者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3062 | 2026-04-14 |
Chronic psychological stress disrupts liver homeostasis by dysregulating oxidative phosphorylation via the PI3K/AKT/FoxO3a axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115389
PMID:41971987
|
研究论文 | 本研究通过慢性束缚应激小鼠模型，揭示了慢性心理应激通过PI3K/AKT/FoxO3a轴抑制氧化磷酸化，从而破坏肝脏稳态的机制 | 首次在单细胞水平上识别FoxO3a作为关键转录因子，介导心理应激诱导的氧化磷酸化抑制，并发现FoxO3a驱动的表观遗传沉默作用 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；机制细节如FoxO3a具体靶基因有待深入探索 | 探究慢性心理应激导致慢性肝病的分子机制 | 慢性束缚应激小鼠模型中的肝细胞，特别是门静脉周围肝细胞（区域1） | 单细胞组学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化分析，电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织图像，生化指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3063 | 2026-04-14 |
SpaHE-Infil: A spatial heterogeneity framework for decoding TME infiltration from H&E-stained slides
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115155
PMID:41971992
|
研究论文 | 开发了一个名为SpaHE-Infil的多模态计算框架，通过整合空间转录组学和全切片图像，从H&E染色切片中解码肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 | 结合空间转录组学和全切片图像，利用随机森林模型提取形态、纹理和密度特征，动态校准临床样本中的免疫细胞比例偏差，实现高精度的空间细胞分布预测 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于图像质量和样本可用性 | 解码肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布，以预测免疫治疗反应和患者生存 | 肿瘤微环境中的12种核心细胞类型，包括免疫细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学，全切片图像分析 | 随机森林 | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3064 | 2026-04-14 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Apr-13, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
|
研究论文 | 本文研究了PEPITEM在早期、未治疗类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态及其在临床前模型中的治疗效果 | 揭示了PEPITEM通过抑制COX-2和NF-κB信号通路，改变关节内白细胞亚群组成，从而减轻关节炎严重性 | 研究主要基于临床前动物模型，尚未在人类患者中进行大规模临床试验验证 | 探究PEPITEM在免疫介导的炎症性关节炎中的调控作用及治疗潜力 | 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞，以及三种不同的炎症性关节炎动物模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、Western blot、单细胞RNA测序、多重分析 | NA | 流式细胞数据、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 临床疑似关节痛和疑似炎症性关节炎患者的外周血样本，以及三种动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3065 | 2026-04-14 |
CKAP4 Regulates ERS-Induced Apoptosis in Osteoclasts Through FOXO3 in Periodontitis
2026-Apr-13, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70208
PMID:41969105
|
研究论文 | 本研究揭示了CKAP4通过FOXO3调控内质网应激诱导的破骨细胞凋亡在牙周炎中的作用机制 | 首次发现CKAP4在牙周炎破骨细胞凋亡中的调控作用，并阐明其通过FOXO3介导的内质网应激通路 | 研究主要基于动物模型和测序数据分析，临床样本验证相对有限 | 探究牙周炎中破骨细胞凋亡失调的分子机制 | 破骨细胞（Osteoclasts） | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GEO数据库中的牙周炎患者组织样本数据及Ckap4基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3066 | 2026-04-14 |
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521844
PMID:41969226
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他（SAHA）在免疫富集型胰腺癌中增强化疗免疫疗法效果的机制 | 通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测，首次识别出SAHA作为IE-PDAC中化疗免疫疗法的有效增敏剂，并揭示了其通过抑制FASN和PARP9破坏肿瘤微环境中代谢陷阱的新机制 | 研究主要基于临床前模型（如患者来源的异种移植模型和类器官共培养），尚未进行大规模临床试验验证 | 探究免疫富集型胰腺癌（IE-PDAC）的潜在机制并寻找有效疗法 | 胰腺导管腺癌（PDAC），特别是免疫富集型亚型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），体外药物筛选，计算机敏感性预测，患者来源的异种移植模型 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3067 | 2026-04-14 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个整合放射组学和计算病理学的模型，用于预测胰腺导管腺癌的早期复发，并揭示了其与肿瘤微环境中细胞外基质重塑相关的生物学机制 | 首次整合放射组学和计算病理学特征构建预测模型，并结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证了预测结果与肿瘤微环境中成纤维细胞和胰腺星状细胞富集以及细胞外基质通路失调的关联 | 研究为回顾性设计，样本量有限（225例患者），且模型在外部验证中的性能略有下降 | 预测胰腺导管腺癌根治性切除后的早期复发，并阐明其生物学基础 | 胰腺导管腺癌患者 | 计算病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型（11种） | CT图像, 全切片图像 | 225例胰腺导管腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3068 | 2026-04-14 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment dynamics in colorectal cancer
2026-Apr-12, The International journal of biological markers
DOI:10.1177/03936155261441324
PMID:41968056
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了结直肠癌中的细胞异质性和免疫微环境动态，重点关注CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞与免疫治疗反应的关联 | 识别并注释了结直肠癌中的多种T细胞亚型，构建了CCT T细胞及其前体细胞的伪时间轨迹，揭示了PD-1免疫治疗组中CCT T细胞前体与其他细胞间增强的相互作用，并开发了一个包含15个基因特征的预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能限制结果的普适性；对免疫治疗反应的预测仍需临床数据进一步确认 | 通过研究结直肠癌微环境中的CCT T细胞及其前体细胞，识别新的治疗靶点和潜在生物标志物，并探索它们与免疫治疗反应的关联 | 结直肠癌患者样本中的T细胞，特别是CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型（基于基因特征） | 单细胞测序数据，转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但使用了单细胞测序数据和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3069 | 2026-04-14 |
Senescence Programs Shape the Chronic Wound Microenvironment
2026-Apr-12, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918261441046
PMID:41968061
|
综述 | 本文综述了细胞衰老在慢性伤口微环境中的作用及其对愈合过程的影响 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示慢性伤口中衰老细胞的异质性及其空间分布，为靶向治疗提供新见解 | 依赖非特异性衰老标志物（如p21或SA-β-gal）导致结果解释复杂化，且衰老细胞在慢性伤口中的身份、丰度和定位仍不明确 | 探讨细胞衰老如何影响慢性伤口的愈合过程，并评估靶向衰老细胞的治疗策略 | 慢性伤口（如糖尿病足溃疡、静脉性腿部溃疡和压力性溃疡）中的衰老细胞，特别是成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性伤口 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3070 | 2026-04-14 |
Mapping the immune landscape of PCa: From tumor microenvironment to therapeutics
2026-Apr-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189586
PMID:41956336
|
综述 | 本文综述了前列腺癌免疫景观的时空异质性，并探讨了从肿瘤微环境到治疗策略的生态编辑路线图 | 整合单细胞和空间转录组学数据，提出并强调了“神经-免疫-微生物组”轴这一被低估的三角调控网络，并引入了“生态编辑”作为精准肿瘤学的未来方向 | NA | 解码前列腺癌生态系统的时空异质性，并评估治疗策略如何重塑免疫景观，以提出精准肿瘤学路线图 | 前列腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3071 | 2026-04-14 |
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100996
PMID:41690302
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病（COPD）通过重塑非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤微环境，特别是通过诱导上皮细胞重塑和建立CXCL14-CXCR4信号轴来招募巨噬细胞，从而增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 首次通过整合多组学分析和功能验证，阐明了COPD作为共病通过诱导特定的基底样肿瘤细胞群和建立肿瘤-巨噬细胞招募回路来增强NSCLC对PD-1阻断剂反应的分子机制 | 研究主要基于手术切除的新鲜肿瘤样本，样本量可能有限，且机制验证主要在体外进行，需要进一步的体内模型验证 | 探究COPD如何影响NSCLC的肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者，特别是伴有COPD共病的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，免疫荧光图像 | 三个临床队列的新鲜手术肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3072 | 2026-04-14 |
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261437925
PMID:41958358
|
评论 | 本文评论了单细胞转录组学在人类缺血性卒中血栓研究中的应用，强调了血栓作为免疫活性微环境的重要性 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了卒中血栓并非惰性栓塞物质，而是具有结构化、免疫活性且受卒中病因塑造的微环境 | NA | 探讨单细胞转录组学如何提升对卒中血栓细胞和分子特征的理解 | 人类缺血性卒中血栓 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3073 | 2026-04-14 |
Pan-cancer macrophage atlas uncovers that MHC-IIhigh TAMs induce Treg activation through physical interactions
2026-Apr-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117230
PMID:41966824
|
研究论文 | 本研究通过整合10种癌症类型的单细胞RNA-seq数据，揭示了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤微环境中通过MHC-II介导抗原呈递并激活调节性T细胞（Tregs）的新机制 | 首次在泛癌层面系统描绘了巨噬细胞的抗原呈递功能，挑战了树突状细胞是肿瘤微环境中主要抗原呈递细胞的传统观点，并发现MHC-II高表达的TAMs通过物理接触直接激活Tregs | 研究主要基于单细胞转录组数据，功能验证主要在肺癌小鼠模型中进行，其他癌症类型的体内验证尚不充分 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的抗原呈递功能及其对免疫调节的影响 | 10种癌症类型的肿瘤样本、肺癌小鼠模型、接受免疫治疗的临床患者数据集 | 肿瘤免疫学 | 泛癌研究（包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌等10种癌症） | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 10种癌症类型的多中心样本集合 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3074 | 2026-04-14 |
Psoriatic arthritis monocyte DNA methylomes bridge joint and skin inflammatory pathways across rheumatoid arthritis and psoriasis
2026-Apr-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.018
PMID:41966858
|
研究论文 | 本研究通过分析类风湿关节炎、银屑病关节炎和银屑病患者的单核细胞DNA甲基化组，揭示了这些免疫介导炎症性疾病之间共享和特异的表观遗传特征 | 首次系统比较了RA-PsA-PsO谱系中单核细胞的DNA甲基化特征，并整合单细胞转录组数据验证表观遗传发现，揭示了PsA作为连接关节和皮肤炎症的双重分子状态 | 研究主要基于外周血单核细胞，可能未完全反映组织局部免疫环境；样本量未明确说明 | 探究免疫介导炎症性疾病（特别是RA、PsA和PsO）共享和疾病特异性的表观遗传驱动因素 | 类风湿关节炎、银屑病关节炎、银屑病、未分化关节炎患者及健康对照者的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 类风湿关节炎、银屑病关节炎、银屑病 | 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3075 | 2026-04-14 |
RA and PsA synovial tissue single-cell analysis demonstrates differential fibroblast populations with distinct phenotypes and functional capacities
2026-Apr-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.010
PMID:41966860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，揭示了类风湿关节炎和银屑病关节炎中成纤维样滑膜细胞的不同亚群及其功能特性 | 首次在单细胞水平上系统比较了RA和PsA中FLS的异质性，并识别出与疾病特异性相关的功能亚群，特别是通过Hippo信号通路分析揭示了RA的潜在致病机制 | 研究样本量相对有限，且主要基于体外分析，需要进一步在体实验验证这些亚群的功能 | 比较类风湿关节炎和银屑病关节炎中成纤维样滑膜细胞的表型和功能差异 | 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜组织细胞 | 单细胞组学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, ELISA, qPCR, 代谢分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确样本数量，但涉及RA和PsA患者的滑膜细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3076 | 2026-04-14 |
Circadian-driven transcriptional programs govern metastatic progression
2026-Apr-10, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
综述 | 本文综述了昼夜节律如何通过调控肿瘤微环境（TME）成分来影响转移进程 | 整合了单细胞RNA-seq和活体成像数据，揭示了昼夜节律扰动（如时差反应或CRY1敲除）如何改变TME中的细胞因子网络、缺氧反应和代谢共生，从而识别了时间治疗靶点 | 关于TME分子机制的细节尚未完全阐明 | 探讨昼夜节律在肿瘤转移进程中的作用机制 | 肿瘤微环境（TME）成分，包括细胞外基质、基质细胞（如癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞）和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 活体成像 | NA | 转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3077 | 2026-04-14 |
A simple cell-cycle control system in Marchantia polymorpha provides a framework for understanding plant cell proliferation
2026-Apr-09, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag103
PMID:41967031
|
研究论文 | 本研究通过系统发育分析和单细胞RNA测序，揭示了地钱（Marchantia polymorpha）中简单且非冗余的细胞周期控制系统，为理解植物细胞增殖及其进化提供了框架 | 首次在非种子植物（地钱）中揭示了简化的细胞周期基因系统，证明了种子植物中的复杂性是衍生特征，并通过活体成像和功能研究明确了核心周期蛋白在细胞周期各阶段的具体作用 | 研究主要聚焦于地钱的营养配子体阶段，对孢子体或其他植物类群的细胞周期控制系统的普适性验证尚不充分 | 探究早期陆生植物祖先的细胞周期控制系统，理解植物细胞增殖的进化机制 | 地钱（Marchantia polymorpha）的细胞周期基因及其调控机制 | 植物生物学 | NA | 系统发育分析，单细胞RNA-seq，活体成像 | NA | 基因序列数据，单细胞转录组数据，荧光成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3078 | 2026-04-14 |
Identification of immune cell type-specific susceptibility genes in multiple cancers using transcriptome-wide association studies
2026-Apr-09, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djag108
PMID:41967136
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和GWAS汇总统计，通过细胞类型特异性转录组范围关联研究（TWAS）方法，识别了多种癌症中免疫细胞类型特异性的易感基因 | 开发了一个整合跨细胞类型共享基因表达效应的建模框架，提高了预测准确性，并首次在多种癌症中系统性地进行了细胞类型特异性TWAS分析 | 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据，可能受到样本异质性和人群特异性的影响；单细胞数据主要来自OneK1K队列，细胞类型覆盖可能不完全 | 通过细胞类型特异性TWAS增强癌症易感基因的识别能力，并解析癌症病因中的免疫景观 | 七种癌症（乳腺癌、前列腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、弥漫性大B细胞淋巴瘤）的易感基因 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组范围关联研究（TWAS）、全基因组关联研究（GWAS） | 细胞类型特异性预测模型 | 基因表达数据、GWAS汇总统计数据 | OneK1K队列（127万个细胞，14种免疫细胞类型）；七种癌症GWAS数据（总计超过29万病例）；肺癌验证数据（113个个体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3079 | 2026-04-14 |
Investigating the potential risk of nicotine exposure on glioblastoma: Integrating Mendelian randomization and network toxicology analysis
2026-Apr-09, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学分析，探讨尼古丁暴露对胶质母细胞瘤的潜在风险 | 首次结合孟德尔随机化与网络毒理学方法，系统评估血清可替宁（尼古丁代谢物）与胶质母细胞瘤的因果关系，并识别核心靶点基因 | 研究依赖于公开数据库数据，可能存在样本选择偏倚；未进行实验验证核心靶点的功能机制 | 探究尼古丁暴露与胶质母细胞瘤风险之间的关联 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者数据及尼古丁相关靶点基因 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 孟德尔随机化、网络毒理学分析、机器学习、分子对接、结构动力学分析 | 机器学习（未指定具体模型） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | CNGB | 单细胞测序 | NA | CNGB单细胞测序数据库 |
| 3080 | 2026-04-14 |
Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs
2026-Apr-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101105
PMID:41421360
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SSpMosaic的计算框架，该框架利用可解释的基因程序作为通用锚点，实现了单细胞和空间组学数据的稳健整合与注释 | 提出了以元程序（跨数据集对齐的高阶基因程序表示）作为生物学状态表示的通用锚点，实现了跨批次、模态和物种的一致且准确的整合，并支持无需参考数据的空间特征描述 | NA | 开发一个计算框架，以解决单细胞和空间组学数据整合与注释中的挑战，并实现跨尺度的空间转录组学解卷积 | 单细胞和空间组学数据，包括单核转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | 基于元程序的迁移学习框架 | 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | 10x Visium, CosMx, Visium HD | 10x Visium（spot级）, CosMx/Visium HD（亚细胞级） |