单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32150 篇文献，本页显示第 30581 - 30600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 30581 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of Mesp1-induced skeletal myogenic development
2019-12-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2019.09.140
PMID:31590918
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和其他策略分析了Mesp1诱导的骨骼肌发育过程 | 揭示了Mesp1+衍生物在多能性和中胚层到间充质和骨骼肌发育过程中的异质性 | NA | 探究头和躯干/四肢肌肉发育过程的差异 | Mesp1+骨骼肌衍生物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了多西环素诱导的Mesp1表达的胚胎干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 30582 | 2024-08-09 |
Using single-cell transcriptomics to understand functional states and interactions in microbial eukaryotes
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0098
PMID:31587645
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研究论文 | 本文讨论了如何通过单细胞转录组学分析来揭示原生生物的生物学特性 | 利用单细胞转录组学技术深入研究微生物真核生物的功能状态和相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在理解微生物真核生物生物学特性中的应用 | 微生物真核生物的功能状态、生理状态及与其他生物的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30583 | 2024-08-09 |
Uncovering microbial inter-domain interactions in complex communities
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0087
PMID:31587646
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research paper | 本文讨论了epicPCR技术在揭示复杂微生物群落中真核生物和细菌间相互作用的应用 | epicPCR技术能够以单细胞分辨率恢复给定环境中完整的相互作用网络 | 文章指出epicPCR在操作的微观尺度、高吞吐量和探索性质方面存在挑战和局限 | 揭示微生物群落中的跨域相互作用 | 真核生物和细菌的相互作用 | NA | NA | epicPCR | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30584 | 2024-08-09 |
Combined cultivation and single-cell approaches to the phylogenomics of nucleariid amoebae, close relatives of fungi
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0094
PMID:31587649
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研究论文 | 本文通过传统培养和单细胞基因组（SCG）及单细胞转录组扩增方法，研究了核衣壳阿米巴（Opisthokonta）的系统发育基因组学 | 采用SCG扩增技术识别了可能属于Chlamydiales和Rickettsiales的细菌内共生体，并基于264个保守蛋白质和74个单拷贝蛋白质域的数据集进行了系统发育基因组学分析 | 核衣壳阿米巴的多样性和进化历史仍了解不足 | 旨在克服核衣壳阿米巴多样性和进化历史了解不足的限制 | 核衣壳阿米巴的基因组和转录组数据 | 系统发育学 | NA | 单细胞基因组（SCG）和单细胞转录组扩增方法 | NA | 基因组和转录组数据 | 三个物种的基因组和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 30585 | 2024-08-09 |
Absence of HIF1A Leads to Glycogen Accumulation and an Inflammatory Response That Enables Pancreatic Tumor Growth
2019-11-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2994
PMID:31585939
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研究论文 | 研究HIF1A缺失对胰腺肿瘤生长的影响及其机制 | 发现HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞通过积累糖原和分泌炎症细胞因子，启动替代的细胞因子和树突状细胞驱动的血管生成途径 | 研究仅在异种移植小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究验证 | 探讨HIF1A在胰腺肿瘤血管生成中的作用及其替代途径 | HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞及其在肿瘤生长中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞和小鼠肿瘤基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30586 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Uniparental Embryos Reveals Parent-of-Origin Effects on Human Preimplantation Development
2019-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.09.004
PMID:31588047
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，系统地研究了人类双亲和单亲胚胎从1细胞到桑椹胚阶段的转录组特征，揭示了父母基因组对早期胚胎发育的影响 | 首次系统地分析了单亲胚胎的单细胞转录组，并发现了父母特异性表达基因及其在胚胎发育中的作用 | NA | 探究父母基因组对人类早期胚胎发育的贡献 | 人类双亲和单亲胚胎的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个双亲和单亲胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 30587 | 2024-08-09 |
DC3 is a method for deconvolution and coupled clustering from bulk and single-cell genomics data
2019-10-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12547-1
PMID:31601804
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research paper | 本文介绍了一种名为DC3的方法，用于从批量和单细胞基因组数据中进行解卷积和耦合聚类 | DC3方法能够同时识别不同的亚群，将单细胞分配到这些亚群（即聚类），并将批量数据解卷积为亚群特异性数据 | NA | 解决基因组学中在细胞水平上表征和解释异质混合物的重要问题 | 批量和单细胞基因组数据，如HiChIP、RNA-seq和ATAC-seq | genomics | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, scHi-C, HiChIP | NA | bulk and single-cell genomics data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30588 | 2024-08-09 |
Cell Type Purification by Single-Cell Transcriptome-Trained Sorting
2019-10-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.08.006
PMID:31585086
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研究论文 | 本文提出了一种名为GateID的计算方法，通过结合单细胞转录组学和FACS指数排序，利用细胞的天然属性如细胞大小、粒度和线粒体含量来纯化选择的细胞类型。 | GateID方法无需事先了解细胞类型标记，可以直接利用细胞的天然属性进行细胞类型的纯化。 | NA | 开发一种无需抗体或转基因构建的新方法来纯化细胞类型。 | 细胞类型的纯化方法 | 分子与细胞生物学 | NA | FACS | NA | 转录组 | 多种细胞类型从斑马鱼肾骨髓和人类胰腺中提取 | NA | NA | NA | NA |
| 30589 | 2024-08-09 |
Contribution of adipogenesis to healthy adipose tissue expansion in obesity
2019-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI129191
PMID:31573549
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研究论文 | 本文探讨了脂肪生成在肥胖中健康脂肪组织扩张的作用 | 强调了通过脂肪生成招募新脂肪细胞对健康脂肪组织分布和重塑的重要性，并讨论了单细胞RNA测序分析在识别脂肪组织中组织驻留前体细胞群体方面的最新进展 | NA | 探讨脂肪生成在肥胖中健康脂肪组织扩张的作用，并可能为肥胖与代谢疾病脱钩提供新策略 | 白色脂肪组织（WAT）的扩张和重塑机制 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30590 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Developmental Hierarchy in Langerhans Cell Histiocytosis
2019-Oct, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-0820
PMID:31575563
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的细胞层次结构 | 研究揭示了跨不同临床范围患者中14种细胞亚群的一致组成，表明这些细胞亚群受关键转录调控因子的共同发育层次驱动 | NA | 探索朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的细胞发育层次 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的细胞亚群 | 数字病理学 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 30591 | 2024-08-09 |
X-chromosome upregulation is driven by increased burst frequency
2019-10, Nature structural & molecular biology
IF:12.5Q1
DOI:10.1038/s41594-019-0306-y
PMID:31582851
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了小鼠体细胞和胚胎细胞中X染色体上调的转录动力学，证实了X染色体通过提高爆发频率实现上调的现象。 | 首次详细解析了X染色体上调的机制，特别是通过提高爆发频率来实现这一过程。 | NA | 探究X染色体上调的机制，特别是转录动力学方面的细节。 | 小鼠体细胞和胚胎细胞中的X染色体基因表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠体细胞和胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30592 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals regulatory mechanism for trophoblast cell-fate divergence in human peri-implantation conceptuses
2019-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000187
PMID:31596842
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研究论文 | 本研究通过体外共培养系统模拟人类胚胎植入前发育，分析了476个滋养层细胞的转录组，揭示了调控滋养层细胞发育的遗传网络 | 首次揭示了T-box转录因子3（TBX3）在调控细胞滋养层（CT）向合体滋养层（ST）分化中的关键作用 | NA | 研究人类胚胎植入前发育过程中滋养层细胞发育和分化的调控机制 | 人类胚胎植入前发育过程中的滋养层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 476个滋养层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30593 | 2024-08-09 |
[Progress in single-cell analysis of hematopoiesis]
2019, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.60.1075
PMID:31597830
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research paper | 本文探讨了单细胞分析技术在血液生成机制研究中的进展 | 利用下一代测序技术进行单细胞转录组和表观基因组分析以及基于细胞条形码的谱系追踪，揭示了细胞群体的广泛异质性，并提出了新的连续模型 | NA | 深入理解正常和异常血液生成机制，并开发新的血液疾病治疗方法 | 血液生成过程中的细胞类型和分化阶段 | NA | NA | 下一代测序技术 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30594 | 2024-08-09 |
Topical Application of a Mast Cell Stabilizer Improves Impaired Diabetic Wound Healing
2020-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2019.08.449
PMID:31568772
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研究论文 | 本文研究了一种新型色胺酸-羧酰胺类肥大细胞稳定剂MCS-01在糖尿病伤口愈合中的应用 | 开发了一种新型肥大细胞稳定剂MCS-01，并通过特定设计的海藻酸盐绷带实现长期局部控制释放，加速了糖尿病小鼠的伤口愈合 | NA | 探讨肥大细胞稳定剂在改善糖尿病伤口愈合中的作用 | 糖尿病小鼠的伤口愈合过程 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6,154个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30595 | 2024-08-09 |
scDAPA: detection and visualization of dynamic alternative polyadenylation from single cell RNA-seq data
2020-02-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz701
PMID:31557285
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research paper | 本文介绍了一个名为scDAPA的软件包，用于从单细胞RNA测序数据中检测和可视化动态选择性多聚腺苷酸化（APA） | scDAPA是首个用于从单细胞RNA测序数据中研究APA特征的计算工具 | NA | 提高APA研究的分辨率至单细胞水平 | 单细胞RNA测序数据中的动态APA | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | bam/sam文件 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30596 | 2024-08-09 |
Alterations in the Transcriptional Programs of Myeloma Cells and the Microenvironment during Extramedullary Progression Affect Proliferation and Immune Evasion
2020-02-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-0694
PMID:31558476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了骨髓和胸膜积液或腹水中多发性骨髓瘤细胞及其微环境的转录组变化，揭示了其在髓外进展中的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了多发性骨髓瘤细胞在髓外进展中的转录组变化及其对细胞增殖和免疫逃逸的影响 | 研究样本仅来自15名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨多发性骨髓瘤髓外进展的分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15名患者的骨髓或髓外多发性骨髓瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 30597 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals chemokine self-feeding of myeloma cells promotes extramedullary metastasis
2020-02, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.13623
PMID:31561267
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研究论文 | 本研究旨在探讨多发性骨髓瘤细胞从骨髓转移到外周血的初始机制 | 发现克隆循环浆细胞中异常上调的趋化因子CXCL12可能使这些细胞逃避骨髓保留并转移到血液中 | NA | 确定多发性骨髓瘤细胞从骨髓转移到外周血的机制 | 多发性骨髓瘤细胞和外周血中的克隆循环浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 30598 | 2024-08-09 |
Latent cellular analysis robustly reveals subtle diversity in large-scale single-cell RNA-seq data
2019-12-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz826
PMID:31566233
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的分析流程——潜在细胞分析（LCA），用于处理大规模单细胞RNA测序数据 | LCA结合了余弦相似度测量和基于图的聚类算法，能够在不进行显性基因过滤的情况下，提供对群体数量推断、降维、特征选择和技术变异控制的启发式解决方案 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，如低信噪比、数据稀疏性、批次效应和可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 数十万细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30599 | 2024-08-09 |
Diesel exhaust particles dysregulate multiple immunological pathways in murine macrophages: Lessons from microarray and scRNA-seq technologies
2019-12-15, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2019.108116
PMID:31568751
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研究论文 | 研究柴油废气颗粒（DEP）对小鼠巨噬细胞免疫途径的失调作用，使用微阵列和单细胞RNA测序技术进行分析 | 首次综合使用微阵列和单细胞RNA测序技术，分别在体外和体内研究DEP对巨噬细胞基因表达的影响 | 研究主要集中在巨噬细胞上，未涉及其他细胞类型对DEP的反应 | 探讨柴油废气颗粒如何通过影响巨噬细胞的基因表达，进而影响心血管疾病的发展 | 小鼠的腹膜和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外实验使用C57BL/6J小鼠的腹膜巨噬细胞，体内实验使用C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30600 | 2024-08-09 |
Mass cytometry-based single-cell analysis of human stem cell reprogramming uncovers differential regulation of specific pluripotency markers
2019-12-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.009061
PMID:31570522
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研究论文 | 本文利用质谱流式细胞术分析了人类干细胞重编程过程中多能性标志物和细胞周期标志物的表达 | 首次使用质谱流式细胞术研究人类重编程和多能性，揭示了hiPSC重编程过程中的几个中间细胞簇和标志物表达模式 | NA | 研究人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的重编程过程 | 人类干细胞重编程过程中的多能性标志物和细胞周期标志物 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |