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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3041 | 2026-05-09 |
Profiling cell dynamic changes of goat peripheral blood mononuclear cells after Pasteurella multocida infection with single-cell transcriptomics and histopathology
2026-May-05, Veterinary research
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s13567-025-01661-2
PMID:42087228
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研究论文 | 利用单细胞转录组学和组织病理学,分析山羊感染多杀性巴氏杆菌后外周血单个核细胞的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析山羊感染多杀性巴氏杆菌后外周血单个核细胞的动态免疫反应,鉴定关键基因和免疫通路 | 未提及具体局限性 | 研究山羊感染多杀性巴氏杆菌后外周血单个核细胞的免疫反应机制 | 山羊外周血单个核细胞及感染后多组织样本 | 数字病理学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序、重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条、组织病理学 | NA | 基因表达数据 | 42,615个细胞,来自山羊感染前后的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条 | NA | NA |
| 3042 | 2026-05-09 |
Analytical approaches for the isolation and characterisation of circulating tumour cells in clinical practice
2026-May-05, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.121055
PMID:42097193
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综述 | 本文综述了循环肿瘤细胞(CTC)的分离与表征分析方法及其在临床实践中的应用 | 综合评估CTC分离平台的性能指标,如捕获效率、富集度、纯度、通量、回收率和细胞活力,并探讨微流控、单细胞测序和人工智能驱动分析等新技术如何增强CTC检测的敏感性和特异性 | CTC极低频率和表型异质性使分离和分析具有挑战性;基于细胞系验证可能高估在真实患者样本中的性能 | 评估CTC分离与表征技术在精准肿瘤学中的应用,并讨论其作为预后和预测生物标志物的潜力 | 循环肿瘤细胞(CTC) | 机器学习 | 肿瘤 | NA | CNN | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3043 | 2026-05-09 |
ROS, identified as a driver for fibroblast activation, can be counteracted by glucocorticoid in LINC00605-dependent GMD machinery
2026-May-05, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,以增生性瘢痕为模型,揭示了活性氧(ROS)驱动成纤维细胞活化为肌成纤维细胞,并通过LINC00605依赖的糖皮质激素受体介导的mRNA降解机制抑制ROS生成,从而为治疗增生性瘢痕提供新策略 | 首次证明ROS是成纤维细胞活化的驱动因子,并发现糖皮质激素通过非经典糖皮质激素受体途径的LINC00605依赖的mRNA降解机制下调NOXA1表达,从而抑制ROS生成,逆转成纤维细胞表型转变 | 研究中未提及具体局限性,但可能包括模型系统在体内验证的不足或翻译到临床的潜在挑战 | 阐明ROS在成纤维细胞活化中的作用机制及糖皮质激素的调控途径 | 增生性瘢痕来源的成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 增生性瘢痕 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3044 | 2026-05-09 |
A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.020
PMID:40975650
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综述 | 基于1000多个样本的空间转录组学实践指南,涵盖实验设计、样本处理、测序和计算分析 | 总结了跨平台大规模空间转录组学实验的实操经验,特别强调临床样本的注意事项 | 主要基于作者团队经验,可能未涵盖所有平台或新兴技术 | 提供空间转录组学实验的实用指南,支持可重复的标准化工作流程 | 空间转录组学实验的实践流程和最佳实践 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 超过1000个空间样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 涉及多个空间转录组学平台 |
| 3045 | 2026-05-09 |
In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations
2026-May, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70153
PMID:41146557
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研究论文 | 开发了一种共培养模型,利用原代癌症相关成纤维细胞和永生化肿瘤细胞系,可靠地再现肿瘤中观察到的CAF表型,并通过单细胞转录组学表征CAF亚型异质性及CRISPR扰动的影响 | 首次通过共培养模型系统性地验证了CAF模型的可转化性,并利用永生化CAF细胞系进行单细胞CRISPR扰动,揭示了亚型特异性效应 | 未明确说明局限性,但隐含了对胰腺肿瘤CAF异质性知识的缺乏以及模型可转化性评估不足 | 研究癌症相关成纤维细胞的亚型异质性及其在CRISPR扰动下的亚型特异性效应 | 从胰腺癌患者分离的原代CAFs、永生化CAF细胞系、肿瘤细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 胰腺癌患者来源的CAFs及永生化CAF细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3046 | 2026-05-09 |
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01738-2025
PMID:41412718
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研究论文 | 探索成纤维细胞活化蛋白作为慢性肺同种异体移植功能障碍早期生物标志物的潜力 | 首次系统评估FAP在CLAD中的表达模式及其作为早期诊断标记物的可行性,结合小鼠模型和临床队列进行验证 | FAP的鉴别能力中等(AUC 0.78),需要在多中心队列中进行前瞻性验证 | 验证FAP表达是否在CLAD中升高以及能否作为早期诊断标志物 | 小鼠肺移植模型和人类CLAD患者肺组织及支气管活检标本 | 数字病理学 | 慢性肺同种异体移植功能障碍 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 2个小鼠模型(各不同品系组合)+ 5例对照和5例CLAD患者的人肺组织 + 240例肺移植受者活检(62例CLAD,178例无CLAD) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3047 | 2026-05-09 |
B-cell lymphocytosis and reprogramming due to biallelic CARD11 mutations
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.991
PMID:41456721
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研究论文 | 通过全外显子测序和单细胞RNA测序等实验,揭示了由CARD11基因双等位突变R331P引起的新型常染色体隐性BENTA病,其特征为B细胞大量扩增和异常转录程序 | 首次发现CARD11基因纯合R331P突变导致常染色体隐性BENTA病,与常规单等位突变相比,其B细胞淋巴细胞增多现象更严重,并揭示了突变对NF-κB信号通路的激活机制 | 未明确说明 | 鉴定BENTA病的遗传基础,并表征患者免疫细胞表型和功能 | 一名疑似BENTA病患者及其同胞 | 数字病理学 | BENTA病(伴NF-κB和T细胞无反应的B细胞扩增) | 全外显子测序、流式细胞术、质谱流式细胞术、全血mRNA分析、体外T细胞增殖与B细胞分化实验、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 一名患者及其同胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3048 | 2026-05-09 |
Endometrial Epithelial Lactate Deficiency Drives CD8+ T-Cells Dysregulation in Unexplained Recurrent Implantation Failure
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524090
PMID:41758694
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序发现不明原因反复种植失败患者子宫内膜上皮细胞乳酸生成不足导致CD8+ T细胞功能失调,影响胚胎着床 | 首次揭示了不明原因RIF中子宫内膜糖酵解异常和乳酸缺乏与CD8+ T细胞功能紊乱之间的因果关系,并通过小鼠模型和体外实验验证了乳酸补充对胚胎着床的改善作用 | 未明确提及具体局限性,但样本量较小且仅在动物和体外模型中验证,临床应用需进一步验证 | 探索不明原因反复种植失败的分子机制 | 不明原因RIF患者子宫内膜组织及小鼠模型 | 机器学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3049 | 2026-05-09 |
TIMP1 and PKM drive immunosuppression and metabolic remodeling to promote colorectal cancer progression through integrated multi-omics analysis
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151944
PMID:41966374
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示TIMP1和PKM驱动结直肠癌免疫抑制和代谢重塑的机制 | 首次通过整合多组学分析发现TIMP1和PKM协同驱动结直肠癌的免疫抑制和代谢重塑,并利用AlphaFold3预测PKM-LDHA复合体结构 | 未在更大样本队列或动物模型中进一步验证所发现的靶点和机制 | 鉴定结直肠癌免疫逃逸的关键靶点及其分子机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织样本及单细胞数据 | 生物信息学、多组学分析 | 结直肠癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、T细胞杀伤实验、Co-IP、AlphaFold3结构预测 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 3050 | 2026-05-09 |
Cytokine networks driving eosinophil functional heterogeneity
2026-May-01, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.100347
PMID:42070631
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综述 | 综述细胞因子网络如何驱动嗜酸性粒细胞的功能异质性 | 利用单细胞转录组学的最新进展,重新审视嗜酸性粒细胞的传统观点,揭示其在多种免疫环境下的发育和功能异质性 | 未提及具体局限 | 总结嗜酸性粒细胞的发育程序,并研究细胞因子网络如何塑造其在1型、2型和17型免疫中的反应 | 嗜酸性粒细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3051 | 2026-05-09 |
Tenofovir Alafenamide in the Treatment of Chronic Hepatitis B Virus Infection in the High-Replicative Low-Inflammatory Phase: A 48-Week Randomized Controlled Trial
2026-May, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70960
PMID:42095461
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研究论文 | 评估替诺福韦艾拉酚胺治疗慢性乙型肝炎病毒高复制低炎症期患者的疗效和安全性,并进行外周免疫特征分析 | 首次在高复制低炎症期慢性HBV感染患者中进行TAF抗病毒治疗的随机对照试验,并结合单细胞RNA测序分析免疫细胞亚群与治疗反应的关系 | 48周随访期内完全病毒学抑制率仍不理想,样本量较小(尤其scRNA-seq仅6例),可能限制结果的普适性 | 评估TAF在HBV高复制低炎症期患者中的安全性和疗效,并分析外周免疫特征与治疗反应的相关性 | HBeAg阳性、ALT正常且HBV DNA升高的慢性HBV感染患者 | 机器学习 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 59例患者(治疗组30例,对照组29例);其中6例患者进行scRNA-seq(病毒学应答组3例,低水平病毒血症组3例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3052 | 2026-05-09 |
Comprehensive single-cell transcriptomic profiling of the scalp from patients with moderate-to-severe alopecia areata
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.014
PMID:41740930
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对中重度斑秃患者头皮进行全面的转录组图谱分析 | 首次在单细胞水平系统描绘了中重度斑秃头皮中免疫与非免疫细胞之间的通讯网络,揭示了可能破坏毛囊免疫特权并驱动疾病进展的细胞通路 | 未提及具体局限性 | 表征斑秃头皮相对于健康对照的单细胞转录组景观 | 13名中重度斑秃患者(5名全秃/普秃)的皮损和非皮损头皮活检样本及11名健康对照 | 数字病理学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名斑秃患者和11名健康对照的头皮活检样本,共41,067个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3053 | 2026-05-09 |
Variants in KLHL15, encoding a regulator of protein ubiquitination, linked to focal epilepsy with neurodevelopmental disorders
2026-May-01, Seizure
DOI:10.1016/j.seizure.2026.04.029
PMID:42097059
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研究论文 | 研究KLHL15基因变异与局灶性癫痫及神经发育障碍的关联 | 首次发现KLHL15基因错义变异与局灶性癫痫及神经发育障碍相关,并通过时空表达谱和功能网络分析揭示其致病机制 | 样本量较小,仅涉及四例无关患者,可能限制变异谱的全面性;功能验证主要依赖计算预测和网络分析,缺乏体内实验验证 | 探讨KLHL15基因与癫痫的关联 | 非获得性局灶性癫痫患者 | 机器学习 | 癫痫, 神经发育障碍 | 全外显子组测序, 单细胞分析, 网络扩散分析 | NA | 基因测序数据, 单细胞测序数据 | 4例无关局灶性癫痫伴神经发育障碍病例 | Illumina | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 3054 | 2026-05-09 |
LILRB2+ monocytes reshape the immune activation landscape in immunotherapy with non-small cell lung cancer: Evidence from real-world cohorts and single-cell analyses
2026-Apr-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152331
PMID:42069195
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研究论文 | 本研究利用真实世界队列和单细胞分析,揭示LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中重塑免疫激活景观的作用 | 首次在单细胞水平解析LILRB2+单核细胞亚群对PD-1/PD-L1免疫治疗的影响,并建立LILRB2/S100A8单核细胞比值作为新的疗效预测指标 | 未充分探索LILRB2+单核细胞与其他免疫细胞的相互作用机制,且样本量有限,需进一步验证 | 探究LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中的作用及其预测价值 | 非小细胞肺癌患者的转录组数据和临床数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自OAK、POPLAR和ORIENT-11临床试验的NSCLC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3055 | 2026-05-09 |
Exogenous pyruvate restores mitochondrial bioenergetics by synergizing with the AMPK-mTOR-SIRT3 pathway to alleviate sepsis-associated acute kidney injury
2026-Apr-22, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112089
PMID:42031090
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研究论文 | 本研究揭示外源性丙酮酸乙酯通过AMPK-mTOR-SIRT3信号通路协同恢复线粒体生物能量学,从而减轻脓毒症相关急性肾损伤 | 首次阐明外源性代谢底物丙酮酸乙酯与AMPK激活剂协同作用,通过AMPK-mTOR-SIRT3通路恢复线粒体功能,为脓毒症相关急性肾损伤的代谢靶向治疗提供新机制 | 实验仅基于小鼠模型和细胞系,缺乏临床验证;SIRT3下游机制有待进一步探索 | 研究外源性丙酮酸乙酯通过调节线粒体生物能量学减轻脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | 盲肠结扎穿刺诱导的SA-AKI小鼠模型和LPS刺激的HK-2细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和HK-2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3056 | 2026-05-09 |
A high-resolution spatial map of cilia-associated proteins in the human fallopian tube
2026-04-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71692-6
PMID:42010243
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研究论文 | 利用整合转录组学和蛋白质组学方法,在人输卵管中创建了纤毛相关蛋白的高分辨率空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下整合转录组学和蛋白质组学,绘制输卵管中纤毛相关蛋白的空间分布图,并验证了11个此前仅在转录水平研究的蛋白质 | 仅对一名输卵管积水患者进行了分析,样本量有限,且未提供其他疾病或正常组织的充分比较 | 揭示输卵管中纤毛相关蛋白的分子景观,以帮助理解不孕症和纤毛特异性相关疾病的通路 | 人输卵管及其他具有运动纤毛的组织 | 数字病理学 | 不孕症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱分析 | NA | 文本数据(转录组和蛋白质组数据) | 1名输卵管积水患者及其他健康样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 3057 | 2026-05-09 |
SpaTRACE: Spatiotemporal recurrent auto-encoder for reconstructing signaling and regulatory networks from spatiotemporal transcriptomics data
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689569
PMID:42039614
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研究论文 | 提出SpaTRACE框架,从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络 | 利用时空递归自编码器同时重建转录因子-靶基因调控网络、配体-受体-靶基因信号通路及配体-受体结合关系,无需预定义配体-受体数据库 | 依赖伪时间轨迹采样,可能无法完全捕捉真实时间动态;模型复杂度高,需要较大数据集进行训练 | 从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络,捕捉发育和再生过程中的动态调控机制 | 小鼠中脑发育和蝾螈脑再生过程中的空间转录组数据 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 自编码器, 注意力机制 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3058 | 2026-05-09 |
A Mouthful of Genomic Data: Single-Cell Insights into Salivary Gland Biology and Disease
2026-Apr-18, Biology
DOI:10.3390/biology15080641
PMID:42041920
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综述 | 综述单细胞RNA测序在唾液腺生物学与疾病研究中的应用,总结主要发现、局限性及方法学考虑 | 系统整合了唾液腺scRNA-seq研究的最新进展,聚焦于细胞类型发现、分子机制及数据质量问题 | 数据处理不一致和实验方法报告不完整影响可重复性,限制高质量数据集的识别 | 总结scRNA-seq在唾液腺研究中的发现,指导未来研究 | 唾液腺(大唾液腺和小唾液腺) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3059 | 2026-05-09 |
Histotripsy-Initiated Immune Response Synergizes with Chemotherapy in a Neuroblastoma Murine Model
2026-Apr-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081249
PMID:42073574
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研究论文 | 本研究探讨了组织切除术在神经母细胞瘤小鼠模型中诱导的免疫反应如何与化疗协同作用 | 首次展示了无创聚焦超声组织切除术通过机械性气泡云作用诱导系统性抗肿瘤免疫反应,增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效 | 未提供具体局限性信息 | 验证组织切除术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧胁部接种Neuro-2a细胞建立神经母细胞瘤模型 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 组织切除术,单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只小鼠双侧肿瘤(单侧治疗),每组5-7天后评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置信息 |
| 3060 | 2026-05-09 |
Benchmarking scRNA-seq Copy Number Inference: A Comprehensive Evaluation and Practitioner's Guide
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.718050
PMID:42039587
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研究论文 | 对12种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的方法在28个真实数据集和多种合成数据集上进行了全面基准测试,提供实践指南 | 首次对12种CNV推断方法进行大规模系统基准测试,覆盖超过10万个细胞,建立了基于恶性细胞分类准确性、CNV推断准确性、可扩展性和鲁棒性的综合评估框架,并提供标准化CNV档案公共资源库 | 基准测试主要依赖现有数据集和合成数据,可能未完全涵盖所有实际应用场景;部分方法的性能高度依赖于原始测序数据可用性和等位基因推断质量 | 系统评估单细胞RNA测序数据的拷贝数变异推断方法,为研究人员提供实践决策指南 | 12种CNV推断方法(包括Numbat、Clonalscope、CopyKAT、inferCNV、SCEVAN等) | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、等位基因数据 | 28个真实数据集(超过10万个细胞)及多种合成数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |