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当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 3021 - 3040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3021 | 2026-02-03 |
Opportunities and challenges in the application of single-cell transcriptomics in plant tissue research
2025-Feb, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01558-6
PMID:40070535
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物组织研究中的应用、挑战及整合多源单细胞多模态数据的方法 | 总结了整合多源单细胞RNA测序和单细胞多模态数据的方法，以构建全面的细胞图谱并探索跨模态的因果关系和基因调控机制 | 单细胞RNA测序实验通常无法全面捕获所有细胞和基因，且单模态数据不足以解释细胞状态和系统变化 | 探讨单细胞转录组学在植物组织研究中的机遇与挑战，以及整合方法在揭示生物变化中的应用和价值 | 植物组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多模态 | NA | NA |
| 3022 | 2026-02-03 |
A regularized Bayesian Dirichlet-multinomial regression model for integrating single-cell-level omics and patient-level clinical study data
2025-Jan-07, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf005
PMID:39887052
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归框架，用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据，以探究细胞类型丰度与临床变量之间的关系 | 引入新型分层树结构以识别不同细胞类型水平上的关联，并首次将正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归应用于单细胞与临床数据的整合分析 | 未明确说明模型对数据规模和质量的敏感性，且仅在三类疾病中验证，普适性有待进一步验证 | 开发一种整合单细胞组学数据与患者临床数据的方法，以揭示细胞类型丰度与临床变量之间的关联 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者的单细胞RNA测序数据及临床数据 | 单细胞组学 | 肺纤维化, COVID-19, 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3023 | 2026-02-03 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、单细胞转录组学和体外验证，系统鉴定了与骨质疏松症中赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探讨了其在代谢-免疫调控轴中的潜在作用 | 首次将乳酰化修饰与骨质疏松症的代谢-免疫调控轴联系起来，并通过多组学整合、单细胞转录组学和体外实验验证，揭示了AKR1A1基因在疾病中的关键作用及其通过SPP1-CD44信号通路介导免疫细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，体外实验仅使用了RAW264.7巨噬细胞系，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 系统识别骨质疏松症中与赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探索其在疾病发病机制中的代谢和免疫调控作用 | 骨质疏松症相关的基因表达数据、乳酰化相关基因、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀 | 机器学习模型（113种组合） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 五个骨质疏松症相关基因表达微阵列数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3024 | 2026-02-03 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
|
研究论文 | 本文提出了一种从前列腺癌患者临床样本中，从手术室到实验台进行单细胞处理的方案，并比较了人类转移性前列腺脊柱肿瘤的微环境 | 针对脊柱肿瘤组织异质性高、难以处理的特点，开发了从手术室到实验台的单细胞处理方案，用于骨性脊柱转移瘤的研究 | NA | 开发用于临床样本单细胞组学研究的方案，以识别预后标志物和治疗靶点 | 前列腺癌患者的脊柱转移瘤临床样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3025 | 2026-02-03 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
|
研究论文 | 本文提出了一种名为动态批处理对抗自编码器（DB-AAE）的深度神经网络生成框架，用于有效去噪和排序单细胞RNA测序数据 | DB-AAE直接捕获输入数据中的最优特征，增强特征保留能力，包括细胞类型特异性基因表达模式，并在去噪准确性和生物信号保留方面优于其他方法 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的去噪质量和下游分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3026 | 2026-02-03 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
|
研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活内皮SCD1酶来催化保护性脂质代谢物，从而改善血管健康 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学（如减少主动脉弓小弯处的血流再循环）并激活内皮SCD1酶，催化产生抗炎脂质代谢物（油酸和棕榈油酸），为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；且SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转换器SCD1介导血管保护作用，并阐明其与血流动力学变化的关联 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食小鼠以及主动脉内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、血流动力学模拟数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3027 | 2026-02-03 |
Benchmarking algorithms for joint integration of unpaired and paired single-cell RNA-seq and ATAC-seq data
2023-10-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03073-x
PMID:37875977
|
研究论文 | 本文对九种单细胞多组学数据整合方法进行了基准测试，评估了多组学数据在分析单模态数据中的指导作用以及从单模态数据中揭示峰-基因关联的能力 | 首次系统性地比较了现有单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据方面的性能，并强调了多组学数据中足够细胞核数量对准确细胞类型注释的重要性 | 研究仅基于现有九种方法进行基准测试，可能未涵盖所有新兴整合方法；同时，结论可能受特定数据集和评估指标的限制 | 评估单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据时的性能，以提供全面的细胞复杂性视图 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据、单核ATAC测序（snATAC-seq）数据以及配对的多组学数据 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC-seq）、多组学测序 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3028 | 2026-02-03 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探索了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的遗传调控机制及其与免疫疾病风险变异的关联 | 首次在单细胞水平上系统性地绘制了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的动态遗传调控图谱，并揭示了免疫疾病风险变异如何调控激活过程中的基因表达变化 | 研究仅针对健康个体，未直接验证疾病状态下的调控机制；样本量相对有限（119人），可能影响罕见变异的检测 | 探究遗传变异如何调控CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化，以解释免疫疾病的遗传易感性机制 | CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3029 | 2026-02-02 |
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Mar-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111892
PMID:41519218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化，并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 | 研究仅基于斑马鱼模型，结果外推至哺乳动物或人类需谨慎；未探讨长期暴露后的恢复潜力 | 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 | 斑马鱼（Danio rerio） | 单细胞组学 | 造血功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3030 | 2026-02-02 |
Single-cell sequencing: accurate disease detection
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04007-8
PMID:40819160
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在疾病检测中的应用，特别是在神经系统疾病早期诊断中的潜力 | 突破了传统测序的局限，能在单细胞水平分析基因组和转录组，清晰展示细胞间异质性 | 面临数据处理复杂和检测成本高的挑战 | 探讨单细胞测序技术如何实现疾病的早期和准确检测 | 神经系统疾病中的神经细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3031 | 2026-02-02 |
Multi-omics characterization of cachexia-related genes reveals prognostic signatures and immune landscape in breast cancer
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04025-6
PMID:40880013
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了恶病质相关基因在乳腺癌中的预后和免疫学意义，并构建了一个基于11个基因的预后模型 | 首次构建了一个基于恶病质相关基因的乳腺癌预后风险评分模型（CRSBC），并通过单细胞RNA-seq分析揭示了HCCS基因在乳腺癌细胞和巨噬细胞招募中的关键作用 | 研究主要基于TCGA等公共数据库数据，缺乏外部实验验证，且样本来源和临床特征可能存在异质性 | 探究恶病质相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者及其相关的恶病质相关基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 差异表达分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），LASSO-Cox回归，单细胞RNA-seq分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA-BRCA队列数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3032 | 2026-02-02 |
Immunomodulatory Mechanism of Baiyaojian Decoction on Periodontitis: Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2026-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71034
PMID:41605874
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接，探讨了白药煎剂治疗牙周炎的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，系统揭示白药煎剂治疗牙周炎的多成分、多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内动物模型或临床试验的进一步验证 | 探究白药煎剂治疗牙周炎的分子机制和免疫调节作用 | 牙周炎患者组织样本（来自GEO数据库的RNA-seq数据）及白药煎剂的活性成分 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、分子对接、qRT-PCR、流式细胞术、ELISA | 网络药理学分析、细胞间通讯网络分析（CellChat）、细胞分化轨迹分析（monocle3） | 基因表达数据、分子结构数据 | 包含GSE16134（批量RNA-seq）、GSE152042和GSE171213（单细胞RNA-seq）等多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3033 | 2026-02-02 |
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Jan-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517028
PMID:41619261
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研究论文 | 本研究开发了一种葡萄糖响应型智能抗菌产氧水凝胶CF-CPGaMPN，用于促进糖尿病感染伤口的愈合 | 通过结合PVP@CaO纳米颗粒、过氧化氢酶和GaMPN纳米颗粒，实现了葡萄糖触发的按需药物释放，并利用单细胞RNA测序分析了伤口周围的多细胞生态系统 | NA | 开发一种智能水凝胶以促进糖尿病感染伤口的愈合 | 糖尿病感染伤口及其周围的多细胞生态系统 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3034 | 2026-02-02 |
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcag033
PMID:41619759
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法，鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物，并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 | 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合，系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1，并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 | 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据，缺乏体内实验验证；候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 | 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 | 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组学，分子对接 | Elastic Net | 基因表达数据 | 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3035 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2026-Jan-31, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03466-x
PMID:41620578
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，探讨了多氯联苯（PCBs）暴露对成年小鼠大脑功能和认知的影响 | 首次结合空间转录组学分析，揭示了PCBs暴露在小鼠多个大脑区域（如海马体、新皮层）的分子特征及其与血脑屏障完整性的关联 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别差异；暴露时间为七周，长期效应未评估；样本量未明确说明 | 评估PCBs暴露对大脑功能和认知的分子机制影响 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经毒性相关认知障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3036 | 2026-02-02 |
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Jan-30, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.11.018
PMID:41619726
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研究论文 | 本研究揭示了Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组，影响人类和啮齿类动物的阿片类镇痛效果和戒断反应 | 首次将Runx1确定为阿片类镇痛反应和戒断的遗传决定因素，并通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序揭示了其在小胶质细胞中的独特调控机制 | 研究主要基于动物模型，人类关联分析可能需要更大样本验证，且未详细探讨Runx1在其他细胞类型中的作用 | 探究Runx1转录因子在阿片类镇痛和戒断反应个体差异中的作用机制 | 小鼠模型和人类个体 | 神经科学 | 疼痛管理 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3037 | 2026-02-02 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor require actomyosin forces
2026-Jan-29, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的精确时间，揭示了肌动球蛋白网络在维持干细胞未分化状态中的作用 | 首次发现表达Sox2的干细胞样群体在功能生态位形成之前就已存在，并揭示了肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制干细胞位置和维持其干性中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类或其他物种中的普适性尚不明确，且对肌动球蛋白网络的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的时间关系及其调控机制 | 小鼠胚胎切牙的牙上皮组织 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 遗传谱系数据，单细胞RNA测序数据 | 不同发育阶段的小鼠胚胎切牙样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3038 | 2026-02-02 |
Resolving clonal evolution and selection of extrachromosomal DNA at single-cell resolution
2026-Jan-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03933-2
PMID:41606654
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研究论文 | 本研究提出了一种名为ecSingle的计算方法，利用单细胞RNA测序数据解析肿瘤中染色体外DNA的异质性和克隆进化 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据解析染色体外DNA异质性的新计算方法，并首次在单细胞水平上揭示了ecDNA的克隆选择和转录状态关联 | 方法依赖于标准单细胞RNA测序数据，可能受限于测序深度和覆盖范围，且需要基因组测序验证 | 研究肿瘤中染色体外DNA的克隆进化和选择机制 | 肿瘤样本中的染色体外DNA | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，单分子长读长测序，基因组测序 | 计算方法（ecSingle） | 单细胞RNA测序数据，基因组测序数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单分子长读长测序 | NA | NA |
| 3039 | 2026-02-02 |
Injured epithelial cell states impact kidney allograft survival after T-cell-mediated rejection
2026-Jan-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68397-1
PMID:41605921
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了T细胞介导的排斥反应（TCMR）诱导的肾脏上皮细胞损伤状态及其对移植生存的影响 | 首次在跨物种（小鼠和人类）水平上，结合单核RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，系统性地识别了TCMR中上皮细胞损伤状态作为移植结果的决定因素，并发现这些状态在TCMR缓解后仍持续存在 | 研究主要基于实验模型和有限的人类样本数据，可能无法完全反映所有临床情境的复杂性，且空间转录组学的分辨率限制可能影响细胞互作的精确解析 | 探究T细胞介导的排斥反应（TCMR）在肾脏移植中的分子机制及其对移植生存的临床影响 | 小鼠肾脏移植模型和人类肾脏移植活检样本，特别是近端小管和厚升支的上皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏移植排斥 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学、免疫荧光、单细胞反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像数据 | 小鼠模型和人类TCMR及稳定移植样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3040 | 2026-02-02 |
Generation of thymus-reconstituting T cell progenitors from human pluripotent stem cells
2026-Jan-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101272
PMID:41512861
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研究论文 | 本文描述了从人类多能干细胞生成能够直接并长期重建胸腺的T细胞祖细胞的方法 | 首次在体外从人类多能干细胞工程化出具有胸腺重建能力的T细胞祖细胞，为研究T细胞发育机制和CAR-T细胞疗法提供了新模型 | 未明确提及实验的局限性，可能包括体内功能验证的深度或长期安全性评估 | 旨在生成大量能够重建受体免疫系统的T细胞祖细胞，以推进癌症免疫治疗 | 人类多能干细胞（hPSC）及其衍生的T细胞祖细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |