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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3021 | 2025-06-11 |
Identification and validation of an immunotherapeutic signature for colon cancer based on the regulatory patterns of ferroptosis and their association with the tumor microenvironment
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119698
PMID:38387508
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研究论文 | 该研究基于铁死亡调控模式及其与肿瘤微环境的关联,识别并验证了结肠癌的免疫治疗特征 | 构建了铁死亡调控基因评分(FRG-score)来量化个体肿瘤中铁死亡改变的模式,并识别了三种不同的铁死亡修饰模式 | 研究样本量较大但仅限于结肠癌,未涉及其他癌症类型 | 探索铁死亡调控模式与结肠癌肿瘤微环境的关联,并开发免疫治疗特征 | 1623个结肠癌样本 | 数字病理学 | 结肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 1623个结肠癌样本 |
3022 | 2025-06-10 |
Genetically supported causality between gut microbiota, prefrontal cortex and depression: insights from multiple Mendelian randomization, multi-omics analysis, and network pharmacology
2025-Oct-01, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2025.119458
PMID:40419156
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研究论文 | 通过多组学分析和网络药理学方法,研究肠道菌群与前额叶皮层及抑郁症之间的遗传支持因果关系 | 首次通过多变量孟德尔随机化分析揭示了肠道菌群通过前额叶皮层结构介导对抑郁症的影响,并鉴定了潜在的治疗靶点和药物 | 研究结果主要基于遗传数据,需要进一步实验验证 | 探究肠道菌群与前额叶皮层及抑郁症之间的因果关系及其生物学机制 | 肠道菌群、前额叶皮层、抑郁症患者 | 多组学分析 | 抑郁症 | GWAS、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序、分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据、转录组数据、影像数据 | 肠道菌群(n=5959)、抑郁症(43,280病例/329,192对照)、脑影像表型(n=33,224) |
3023 | 2025-06-10 |
Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche
2025-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725
PMID:40404122
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research paper | 研究探讨了内皮细胞中Nrf2缺乏如何通过促炎性微环境促进动脉粥样硬化斑块形成 | 揭示了内皮细胞Nrf2缺乏如何通过改变细胞间通讯和促炎性因子分泌促进动脉粥样硬化 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究内皮细胞Nrf2在动脉粥样硬化中的细胞特异性作用和细胞间通讯机制 | 小鼠主动脉内皮细胞和动脉粥样硬化斑块 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织学分析 | Nrf2Cdh5tKO小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学数据 | Nrf2Cdh5tKO小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠 |
3024 | 2025-06-10 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics reveal the potential role of ASRGL1 in metabolic reprogramming and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells
2025-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106788
PMID:40320045
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析,探讨了ASRGL1在鼻咽癌细胞代谢重编程和侵袭中的潜在作用 | 首次揭示了ASRGL1在鼻咽癌中的表达特征及其对细胞代谢和侵袭的影响 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内实验验证 | 探究ASRGL1在鼻咽癌中的功能角色及其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 鼻咽癌细胞系C666-1 | 癌症研究 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、氨基酸代谢组学、GC-MS顶空代谢组学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 公开数据集GSE150430及C666-1细胞系 |
3025 | 2025-06-10 |
Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission
2025-Jul, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16384
PMID:40183401
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制 | 揭示了1型糖尿病部分缓解期未被认识的免疫失调特征,包括单细胞亚群的分子特征和动态变化 | 研究仅基于外周血单个核细胞,未涉及其他免疫细胞或组织 | 探究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制 | 健康对照者、新诊断的1型糖尿病患者和处于部分缓解期的患者 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康对照者、新诊断T1D患者和PR阶段患者的PBMCs样本 |
3026 | 2025-06-10 |
A survey of the methodological process of modeling, inference, and evaluation of gene regulatory networks using scRNA-Seq data
2025-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105464
PMID:40409400
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综述 | 本文综述了利用scRNA-Seq数据建模、推断和评估基因调控网络的方法学过程 | 揭示了scRNA-Seq技术在基因调控网络推断中的技术和方法学挑战,并提出了更稳健的方法学过程建议 | 缺乏关于真实网络的知识以及评估指标的非标准化,导致算法性能比较困难 | 探讨scRNA-Seq数据在基因调控网络推断中的方法学挑战和改进方向 | 基因调控网络(GRNs) | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA |
3027 | 2025-06-10 |
CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500228R
PMID:40488748
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research paper | 本研究探讨了CD44在终末红细胞生成中的作用及其功能机制,发现CD44缺失会导致骨髓红细胞生成异常并加剧苯肼诱导的溶血性贫血 | 揭示了CD44通过调节PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持红细胞生成过程中的氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类红细胞生成中的CD44功能需要进一步验证 | 阐明CD44在终末红细胞生成中的具体作用和分子机制 | CD44敲除小鼠和其红细胞前体细胞 | 分子生物学 | 溶血性贫血 | 单细胞测序分析 | CD44敲除小鼠模型 | 基因表达数据和细胞表型数据 | CD44敲除小鼠及其红细胞前体细胞 |
3028 | 2025-06-10 |
Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403398RRR
PMID:40489010
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研究论文 | 本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病(CKD)中对抗内质网(ER)应激和细胞凋亡的关键保护作用 | 首次发现ARNTL-NRF2轴在肾小管细胞中的保护机制,并证实其可作为CKD治疗的潜在靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未在人体进行临床验证 | 探究CKD中ER应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制 | 慢性肾病患者和小鼠模型的肾小管细胞 | 分子病理学 | 慢性肾病 | 单细胞测序、蛋白质相互作用分析 | HK2细胞系和小鼠CKD模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据 | CKD患者样本和CKD模型小鼠 |
3029 | 2025-06-10 |
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Functional and Spatial Heterogeneity of Atrial and Ventricular Cardiomyocytes in the Heart
2025-Jun-09, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01443-3
PMID:40488964
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了心房和心室心肌细胞在心脏中的功能和空间异质性 | 首次结合scRNA-seq和空间转录组学技术,系统解析了心房和心室心肌细胞的空间分布及细胞间通讯网络 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类心脏中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏中心房和心室心肌细胞的空间分布特征及其细胞间通讯机制 | 心房心肌细胞(aCM)和心室心肌细胞(vCM) | 空间转录组学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学 | t-SNE聚类分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量,使用分离的心脏细胞 |
3030 | 2025-06-10 |
Principles of synaptogenesis: Insights from Caenorhabditiselegans
2025-Jun-07, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103056
PMID:40483740
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review | 本文综述了基于秀丽隐杆线虫模型的突触形成、组织和精细化的当前理解 | 利用秀丽隐杆线虫的基因编辑、显微镜技术、单细胞转录组分析和计算分析等最新进展,深入探索突触形成和调控的机制 | NA | 探讨突触形成的原理及其在神经系统连接中的作用 | 秀丽隐杆线虫的神经系统 | 神经科学 | NA | 基因编辑、显微镜技术、单细胞转录组分析、计算分析 | NA | NA | NA |
3031 | 2025-06-10 |
High-throughput differentiation of human blood vessel organoids reveals overlapping and distinct functions of the cerebral cavernous malformation proteins
2025-Jun-06, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09985-5
PMID:40478324
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research paper | 通过高通量分化人类血管类器官,揭示了脑海绵状血管畸形蛋白的共同和独特功能 | 结合高通量血管类器官分化、单细胞RNA测序和高内涵成像技术,揭示了CCM蛋白在神经元、间充质和内皮细胞群体中的特异性基因表达模式 | 研究主要基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究CCM1、CCM2和CCM3基因突变导致不同临床表型的分子机制 | 人类诱导多能干细胞分化的血管类器官 | 生物医学研究 | 脑海绵状血管畸形 | 高通量类器官分化、单细胞RNA测序、高内涵成像 | 类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | 使用96孔板格式进行高通量实验 |
3032 | 2025-06-10 |
A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment
2025-Jun-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5653
PMID:40479070
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research paper | 本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿后生建立中的空间组织作用 | 发现了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在牙齿发育过程中的空间组织模式及其对牙根形成的调控作用 | 未详细探讨Cd24a+/Pax9+干细胞核心在其他矿化组织中的作用 | 探究牙齿后生建立过程中干细胞的空间组织模式及其调控机制 | 小鼠和人类的牙齿发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), CUT&Tag, 空间定位分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确说明样本数量,但涉及小鼠和人类牙齿组织 |
3033 | 2025-06-10 |
Cathepsin C correlates with M2 macrophage infiltration and regulates the tumor growth and metastasis in non-small cell lung cancer
2025-Jun-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14341-3
PMID:40474091
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研究论文 | 探讨组织蛋白酶C(CTSC)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用及其与M2巨噬细胞浸润的关系 | 首次系统分析了CTSC在NSCLC中的表达及其与M2巨噬细胞浸润的关联,并验证了CTSC对肿瘤生长和转移的调控作用 | 研究主要基于体外和动物实验,临床样本验证仍需进一步扩大 | 阐明CTSC在NSCLC进展和转移中的分子机制及其潜在治疗价值 | 非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系、临床样本及动物模型 | 肿瘤免疫学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学、基因集富集分析(GSEA) | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 临床NSCLC队列(具体数量未明确说明)及体外细胞系实验 |
3034 | 2025-06-10 |
Targeting CD39 boosts PD-1 blockade antitumor therapeutic efficacy via strengthening CD8 + TILs function and recruiting B cells in cervical cancer
2025-Jun-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03500-0
PMID:40462160
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research paper | 该研究探讨了靶向CD39如何通过增强CD8+TILs功能和招募B细胞来提高PD-1阻断在宫颈癌中的抗肿瘤疗效 | 发现CD39在耗竭的CD8+T细胞中高表达,并验证了CD39抑制不仅能增强CD8+TILs的细胞毒性,还能通过增加CXCL13分泌促进B细胞浸润,从而放大PD-1阻断的抗肿瘤免疫 | 样本量较小(仅10名宫颈癌患者),且研究主要基于体外实验和皮下肿瘤模型,未涉及临床试验 | 寻找增强免疫检查点阻断(ICBs)对宫颈癌患者疗效的新型联合治疗策略 | 宫颈癌患者和皮下肿瘤模型 | 肿瘤免疫治疗 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据和临床数据 | 10名宫颈癌患者及TCGA数据库中的队列 |
3035 | 2025-06-10 |
PSMB10 maintains the stemness of chemotherapeutic drug-resistant leukemia cells by inhibiting senescence and cytotoxic T lymphocyte-mediated killing in a ubiquitinated degradation manner
2025-Jun-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03420-9
PMID:40462177
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研究论文 | 本文研究了PSMB10在化疗耐药白血病细胞中通过抑制衰老和细胞毒性T淋巴细胞介导的杀伤作用来维持其干性的机制 | 首次揭示了PSMB10通过泛素化降解方式调控耐药白血病干细胞的干性维持,并提出了PSMB10作为消除耐药白血病干细胞的新靶点 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化应用仍需进一步验证 | 探索耐药白血病干细胞通过衰老和免疫调控维持干性的分子机制 | 急性髓系白血病(AML)患者样本、人AML异种移植模型和PSMB10敲除同源小鼠骨髓移植模型 | 肿瘤生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、流式细胞术、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因检测、多核糖体分析、定量蛋白质组学等 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | AML患者临床样本、人AML细胞系和小鼠模型 |
3036 | 2025-06-10 |
A resource for whole-body gene expression map of human tissues based on integration of single cell and bulk transcriptomics
2025-Jun-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03616-4
PMID:40462185
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和批量转录组学数据,提供了人体各主要组织和器官中蛋白质编码基因的全基因组表达图谱 | 结合单细胞和批量转录组学数据,首次实现了对人体各主要组织和器官中蛋白质编码基因的全基因组表达图谱的扩展分析 | 研究仅关注了蛋白质编码基因,未涉及非编码RNA等其他基因类型 | 构建人体各组织和器官的全基因组基因表达图谱 | 人体31种主要组织和器官 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学、批量转录组学、抗体标记分析 | NA | 转录组数据 | 31种人体组织 |
3037 | 2025-06-10 |
Transcriptional landscape of aniridia-associated keratopathy through single-cell RNA sequencing
2025-Jun-03, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2025.05.008
PMID:40473205
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无虹膜相关角膜病变的转录组景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析无虹膜相关角膜病变患者的角膜上皮细胞基因表达谱 | 研究仅基于一个病例样本,结果可能不具有普遍性 | 阐明无虹膜相关角膜病变的分子机制 | 先天性无虹膜患者的角膜上皮细胞 | 数字病理学 | 角膜病变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 1例48岁女性先天性无虹膜患者的角膜上皮组织 |
3038 | 2025-06-10 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
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research paper | 该研究揭示了表观遗传调节因子CBX5在肺纤维化中的作用,通过调控成纤维细胞的代谢重编程影响纤维化进程 | 首次发现CBX5在肺纤维化中作为连接表观遗传改变与代谢异常的关键调节因子,并证明其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 探究CBX5在肺纤维化发病机制中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 肺成纤维细胞和特发性肺纤维化(IPF)组织 | 分子病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学分析、RNA测序分析 | NA | 基因表达数据、组织样本 | IPF患者肺组织样本和体外培养的成纤维细胞 |
3039 | 2025-06-10 |
Exploring the Molecular Mechanisms of Fisetin in Treating Periodontitis Through Multiomics and Network Pharmacology
2025-Jun, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2024.12.012
PMID:39755534
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research paper | 本研究通过网络药理学分析确定了非瑟酮治疗牙周炎的分子靶点,并在动物模型和体外实验中验证了其治疗效果,同时利用单细胞和空间转录组学技术鉴定了牙周炎中的关键细胞群及其空间分布 | 首次结合网络药理学、动物模型、体外实验以及单细胞和空间转录组学技术,全面探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制 | 研究尚未在临床环境中验证非瑟酮的疗效 | 探索非瑟酮治疗牙周炎的分子机制及其潜在治疗效果 | 牙周炎动物模型和人牙周膜成纤维细胞(PDLFs) | 分子生物学与药理学 | 牙周炎 | 网络药理学分析、单细胞转录组学、空间转录组学 | 动物模型 | 转录组数据 | NA |
3040 | 2025-06-10 |
Genomic determinants of antigen expression hierarchy in African trypanosomes
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08720-w
PMID:40074895
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研究论文 | 本文报道了一种高灵敏度的单细胞RNA测序方法,用于研究非洲锥虫抗原表达层次的基因组决定因素 | 开发了一种高灵敏度的单细胞RNA测序方法,揭示了抗原转换过程中单个细胞内发生的基因组重排 | 研究仅针对模型原生动物寄生虫Trypanosoma brucei,结果可能不适用于其他病原体 | 揭示非洲锥虫抗原表达层次的基因组决定因素 | Trypanosoma brucei寄生虫 | 基因组学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单个细胞水平的研究 |