单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 30261 - 30280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 30261 | 2024-08-09 |
Exploring inflammatory signatures in arthritic joint biopsies with Spatial Transcriptomics
2019-12-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-55441-y
PMID:31831833
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析类风湿关节炎和脊柱关节炎患者的滑膜活检，以探索炎症部位的无偏 mRNA 研究 | 利用空间转录组学技术，结合高分辨率组织学图像，实现对特定细胞类型的数字化描绘，从而深入理解慢性炎症疾病中的细胞机制和多样性 | NA | 探索慢性炎症疾病中炎症部位的转录组特征 | 类风湿关节炎和脊柱关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿关节炎, 脊柱关节炎 | 空间转录组学 (ST) | NA | 转录组数据 | 受影响的关节滑膜组织活检 | NA | NA | NA | NA |
| 30262 | 2024-08-09 |
A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart
2019-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.11.025
PMID:31835037
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研究论文 | 本文通过分子方法揭示了胚胎心脏在三个发育阶段中细胞类型的全面转录景观，并将细胞类型特异性基因表达映射到特定的解剖域 | 本文利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，首次详细描绘了人类胚胎心脏发育过程中的基因表达和细胞类型分布 | NA | 深入探索人类心脏形态发生过程中器官范围的基因表达协调 | 人类胚胎心脏在三个发育阶段的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 三个发育阶段的人类胚胎心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 30263 | 2024-08-09 |
Accuracy, robustness and scalability of dimensionality reduction methods for single-cell RNA-seq analysis
2019-12-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1898-6
PMID:31823809
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research paper | 本文比较了18种常用的降维方法在30个公开的单细胞RNA测序数据集上的性能 | 本文填补了单细胞RNA测序降维方法比较研究的空白 | NA | 评估不同降维方法在单细胞RNA测序数据分析中的有效性 | 18种降维方法在30个单细胞RNA测序数据集上的性能 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 30个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 30264 | 2024-08-09 |
A Galaxy-based training resource for single-cell RNA-sequencing quality control and analyses
2019-12-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giz144
PMID:31825480
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研究论文 | 本文开发了一系列实用的脚本及其相应的Galaxy包装器，使之前对scRNA-seq分析感到畏惧的研究人员能够进行scRNA-seq培训和质量控制 | 本文通过简单的命令行工具实现了“可视化-过滤-可视化”范式，并使用Loom格式在工具之间交换数据，使得scRNA-seq数据分析更加直观和易于操作 | NA | 开发易于使用的工具和培训材料，帮助研究人员掌握scRNA-seq数据的质量控制和后续分析 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析工具和培训资源 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 短读序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30265 | 2024-08-09 |
Semblance: An empirical similarity kernel on probability spaces
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aau9630
PMID:31840051
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研究论文 | 本文提出了一种新的相似性度量方法Semblance，该方法利用特征的经验分布来计算观测值之间的成对相似性 | Semblance是一种无分布假设的相似性度量方法，能够更重视数据分布边缘的观测对之间的相似性 | NA | 研究如何在没有明确数据概率分布的情况下，更有效地计算观测值之间的相似性 | 观测值之间的相似性度量方法 | 机器学习 | NA | NA | Mercer核 | 多种数据类型 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30266 | 2024-08-09 |
Advancements in Single-cell Sequencing and the Prospect of Its Forensic Application
2019-Oct, Fa yi xue za zhi
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研究论文 | 本文总结了单细胞测序技术的最新进展及其在法医学应用的前景 | 单细胞测序的超高分辨率为生命科学多个领域，包括法医基因组学，提供了新的视角和前沿 | NA | 探讨单细胞测序技术在法医学中的应用前景 | 单细胞测序技术及其在法医学中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA和RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30267 | 2024-08-09 |
Siglecs, Novel Immunotherapy Targets, Potentially Enhance The Effectiveness of Existing Immune Checkpoint Inhibitors in Glioma Immunotherapy
2019, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S223406
PMID:31819511
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研究论文 | 本文研究了Siglec家族成员在胶质瘤免疫抑制中的作用，并探讨了它们与现有免疫检查点抑制剂联合使用的可能性 | 首次揭示了Siglec-5、-7、-9和-16在胶质瘤中的免疫抑制作用，并提出了与免疫检查点抑制剂联合使用的新策略 | NA | 研究Siglec家族成员在胶质瘤免疫治疗中的作用 | Siglec家族成员及其在胶质瘤免疫抑制中的作用 | NA | 胶质瘤 | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 1024个胶质瘤样本和1551个胶质瘤单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30268 | 2024-08-09 |
Dissecting the human immune system with single cell RNA sequencing technology
2020-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5MR1019-179R
PMID:31803960
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析人类免疫系统中的最新进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术能够分析单个细胞的转录组，特别适合解析免疫细胞的异质性 | 文章提到了单细胞RNA测序技术在免疫学应用中需要克服的潜在障碍 | 促进对人类免疫学的理解 | 人类免疫系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30269 | 2024-08-09 |
SpaCell: integrating tissue morphology and spatial gene expression to predict disease cells
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz914
PMID:31808789
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaCell的用户友好型深度学习软件，该软件能够整合组织形态学和空间基因表达数据，以预测疾病细胞 | SpaCell软件创新地整合了数百万像素强度值与数千个基因表达测量数据，提高了细胞类型识别和组织图像标签预测的分辨率和准确性 | NA | 开发一种能够整合组织形态学和空间基因表达数据以预测疾病细胞的深度学习软件 | 组织形态学和空间基因表达数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学(ST) | 深度学习模型 | 图像和基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30270 | 2024-08-09 |
FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1440
PMID:31796518
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研究论文 | 研究FLASH照射对肺祖细胞的保护作用及其减少放射诱导衰老的效果 | FLASH照射技术能特异性地保护正常组织免受晚期放射诱导毒性的影响，减少DNA损伤和复制性衰老的风险 | FLASH照射的有益效果在缺乏端粒酶活性的Terc-/-小鼠中消失，表明其效果依赖于正常的端粒酶功能 | 探讨FLASH照射与传统放射治疗相比，在减少正常细胞DNA损伤和保护肺祖细胞方面的效果 | 使用C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠以及人肺细胞进行体外研究 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | RNA | C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠，以及人肺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30271 | 2024-08-09 |
Functional genomic approaches to elucidate the role of enhancers during development
2020-03, Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine
DOI:10.1002/wsbm.1467
PMID:31808313
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研究论文 | 本文讨论了利用功能基因组学方法阐明增强子在发育中的作用 | 介绍了大规模并行报告分析技术用于大规模验证增强子功能，并回顾了CRISPR基因编辑工具和单细胞转录组学在研究发育过程中基因调控的最新进展 | 功能性验证大规模增强子序列仍是一个基本挑战 | 理解增强子序列中哪些序列对功能至关重要 | 增强子在发育中的作用及其功能 | 遗传/基因组方法 | NA | 测序技术，CRISPR，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30272 | 2024-08-09 |
Continuous and Discrete Neuron Types of the Adult Murine Striatum
2020-02-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.11.004
PMID:31813651
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和定量RNA原位杂交技术，探讨了成年小鼠纹状体中刺突投射神经元（SPN）的分子和解剖多样性 | 本研究首次通过计算方法区分了单细胞RNA测序数据中的离散和连续异质性，并发现了纹状体中SPN的四种主要离散类型，以及这些类型内的连续异质性 | NA | 旨在定义成年小鼠纹状体中刺突投射神经元的分子和解剖多样性 | 成年小鼠纹状体中的刺突投射神经元（SPN） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量RNA原位杂交（ISH） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30273 | 2024-08-09 |
Allele-specific single-cell RNA sequencing reveals different architectures of intrinsic and extrinsic gene expression noises
2020-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz1134
PMID:31799601
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研究论文 | 本文利用等位特异性单细胞RNA测序技术，在老鼠成纤维细胞中评估了3975个基因的内在和外在表达噪声成分 | 首次揭示了内在和外在基因表达噪声的不同架构，并验证了TATA盒和微小RNA靶向等因素对这些噪声的影响 | NA | 探究内在和外在基因表达噪声的架构及其影响因素 | 老鼠成纤维细胞中的3975个基因 | 基因组学 | NA | 等位特异性单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 3975个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 30274 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Renal Endothelium Heterogeneity and Metabolic Adaptation to Water Deprivation
2020-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080832
PMID:31818909
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾脏内皮细胞的异质性和对缺水的代谢适应 | 首次揭示了肾脏内皮细胞在缺水和高渗环境下对氧化磷酸化的代谢适应的新角色 | NA | 研究肾脏内皮细胞在不同微环境条件下的异质性和对缺水的代谢适应 | 肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过40,000个鼠肾脏内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30275 | 2024-08-09 |
CD4+ T Cell Help Is Required for the Formation of a Cytolytic CD8+ T Cell Subset that Protects against Chronic Infection and Cancer
2019-12-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.10.009
PMID:31810883
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了CD4 T细胞在慢性感染期间调控CD8 T细胞分化的机制，特别是发现了一个表达CXCR1的具有强效细胞溶解功能的CD8 T细胞亚群。 | 本研究首次揭示了CD4 T细胞通过IL-21帮助形成具有强效细胞溶解功能的CXCR1表达CD8 T细胞亚群，这一发现为免疫治疗中增强CD8 T细胞的杀伤功能提供了新的分子机制。 | NA | 研究CD4 T细胞在慢性感染期间如何调控CD8 T细胞的分化，并探索其在免疫治疗中的应用。 | CD4 T细胞和CD8 T细胞在慢性感染和癌症中的相互作用。 | 免疫学 | 慢性感染和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 30276 | 2024-08-09 |
Discovery of specialized NK cell populations infiltrating human melanoma metastases
2019-12-05, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.133103
PMID:31801909
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序分析了从人类黑色素瘤转移病灶中分离的自然杀伤（NK）细胞，揭示了肿瘤浸润NK细胞的转录程序与循环NK细胞的主要差异 | 首次详细描述了肿瘤浸润NK细胞的独特基因表达模式，包括细胞毒性和趋化因子合成程序 | NA | 研究人类实体瘤中NK细胞的功能状态 | 人类黑色素瘤转移病灶中的NK细胞 | digital pathology | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多个患者的肿瘤浸润NK细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30277 | 2024-08-09 |
Hic1 Defines Quiescent Mesenchymal Progenitor Subpopulations with Distinct Functions and Fates in Skeletal Muscle Regeneration
2019-Dec-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.11.004
PMID:31809738
|
研究论文 | 本文研究了骨骼肌再生过程中组织驻留间充质前体细胞（MPs）的功能和命运，并确定了Hic1作为MPs的标记物。 | 首次揭示了Hic1在骨骼肌再生中调控MPs静止状态的作用，并识别出具有不同功能和谱系潜力的MPs亚群。 | NA | 探究骨骼肌再生过程中间充质前体细胞的功能和命运。 | 骨骼肌中的间充质前体细胞及其在再生过程中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | RNA序列，ATAC序列 | 多个骨骼肌中的Hic1 MPs亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 30278 | 2024-08-09 |
From single-cell RNA-seq to transcriptional regulation
2019-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0327-4
PMID:31792409
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30279 | 2024-08-09 |
Spatial EGFR Dynamics and Metastatic Phenotypes Modulated by Upregulated EphB2 and Src Pathways in Advanced Prostate Cancer
2019-Dec-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11121910
PMID:31805710
|
研究论文 | 研究探讨了EphB2和Src信号通路在调节晚期前列腺癌中表皮生长因子受体（EGFR）动态及其激活中的作用 | 首次报道了EphB2和Src信号通路在调节EGFR动态和激活中的作用，并提供了单粒子追踪技术和单细胞RNA测序的数据支持 | 研究主要集中在PC3细胞系和部分DU145细胞上，可能无法完全代表所有晚期前列腺癌的情况 | 探究EphB2和Src信号通路在晚期前列腺癌中对EGFR动态和细胞侵袭性的调节作用 | 晚期前列腺癌细胞系和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单粒子追踪技术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括PC3、LNCaP和DU145细胞系以及来自患者的循环肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30280 | 2024-08-09 |
HeLa-CCL2 cell heterogeneity studied by single-cell DNA and RNA sequencing
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0225466
PMID:31790455
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研究论文 | 本研究使用单细胞DNA和RNA测序技术研究HeLa-CCL2细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上研究HeLa-CCL2细胞的拷贝数变异和转录组异质性，并分析了基因组与转录组在单细胞水平上的关系 | 单细胞测序技术在研究异质性细胞时需要更谨慎和严格的数据分析 | 探讨HeLa-CCL2细胞在单细胞水平上的基因组和转录组异质性 | HeLa-CCL2细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞DNA和RNA测序 | NA | DNA和RNA数据 | 多个HeLa-CCL2细胞 | NA | NA | NA | NA |