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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 3001 - 3020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3001 | 2026-02-25 |
Multi-omics dissection of high TWAS-active endothelial pathogenesis in pulmonary arterial hypertension: bridging single-cell heterogeneity, machine learning-driven biomarkers, and developmental reprogramming
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003601
PMID:41065575
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研究论文 | 本研究通过整合转录组范围关联研究（TWAS）和单细胞RNA测序（scRNA-seq），系统性地揭示了肺动脉高压（PAH）中内皮细胞的异质性，并识别出高TWAS活性状态（HTS）的内皮细胞亚群及其在疾病进展中的关键作用 | 首次系统性地将TWAS与scRNA-seq整合，在单细胞分辨率下解析PAH的发病机制，识别出高TWAS活性的内皮细胞亚群（HTS），并利用机器学习算法鉴定了三个特征基因（KLF2、RASIP1、DEPP1）作为内皮功能障碍的潜在驱动因子 | 未明确说明样本来源的具体细节（如人类或动物模型），且验证仅限于免疫组织化学和qRT-PCR，可能缺乏更广泛的体内功能验证 | 解析肺动脉高压（PAH）的发病机制，特别是在单细胞水平上理解内皮细胞的异质性和功能 | 肺动脉高压（PAH）患者的内皮细胞，通过单细胞RNA测序数据进行分析 | 机器学习和单细胞组学 | 肺动脉高压（心血管疾病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组范围关联研究（TWAS）、机器学习算法（如随机森林）、免疫组织化学、定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR） | 随机森林模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及PAH和对照肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3002 | 2026-02-25 |
Inositol metabolism shapes tumor aggressiveness and immune evasion in lower-grade glioma: an integrative analysis of bulk, single-cell, and spatial transcriptomics
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003604
PMID:41085666
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk、单细胞和空间转录组数据，揭示了肌醇代谢在低级别胶质瘤中的预后价值及其与肿瘤侵袭性和免疫逃逸的关联 | 开发了基于转录组的肌醇相关基因评分（INScore），并首次通过多组学框架（包括单细胞和空间转录组学）系统阐明了肌醇代谢在LGG中的生物学意义和免疫微环境作用 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要前瞻性临床研究进一步验证INScore的预后价值 | 探究肌醇代谢在低级别胶质瘤中的预后意义及其与肿瘤生物学行为的关联 | 低级别胶质瘤患者及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因组分析 | 非负矩阵分解, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 基因组数据, 临床数据 | 1659名低级别胶质瘤患者来自六个独立数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3003 | 2026-02-25 |
The immunological paradox of CD4⁺ T cells in traumatic brain injury
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003689
PMID:41092449
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤后CD4⁺ T细胞在神经炎症过程中的双重作用及其调控机制 | 聚焦于CD4⁺ T细胞亚群在TBI中的时空动态、表型可塑性及治疗潜力，并整合了单细胞RNA测序技术提供的新见解 | 未深入探讨所有免疫细胞类型或神经炎症的其他方面，这些在TBI中也可能发挥重要作用 | 阐明创伤性脑损伤后CD4⁺ T细胞的免疫调节作用及其治疗靶向潜力 | 创伤性脑损伤后的CD4⁺ T细胞亚群（Th1, Th2, Th17, Tregs） | NA | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3004 | 2026-02-25 |
Decoding hepatocellular carcinoma prognosis: a machine learning-derived methylation signature integrating transcriptomic and tumor microenvironment insights
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003942
PMID:41731861
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研究论文 | 本研究通过整合转录组、甲基化组和临床数据，利用机器学习算法开发了一个包含10个甲基化相关差异表达基因的多维预后特征，用于预测肝细胞癌患者的总体生存 | 结合了转录组、甲基化组和肿瘤微环境信息，并应用数百种机器学习算法的系统组合来开发预后特征，同时在单细胞RNA测序和空间转录组学分析中揭示了这些基因与免疫细胞和代谢途径的关联 | NA | 开发一个可靠的预后生物标志物，用于肝细胞癌患者的精确分层和个性化治疗 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 转录组学、甲基化组学、定量实时PCR、蛋白质印迹、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法 | 转录组数据、甲基化数据、临床数据 | 来自癌症基因组图谱的数据集以及一个独立队列中的10对肝细胞癌肿瘤和邻近非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3005 | 2026-02-25 |
A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis
2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241873
PMID:40900124
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析、空间转录组学和功能研究，比较了四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞，识别了保守的疾病相关巨噬细胞 | 首次通过跨物种分析识别了狼疮性肾炎中保守的疾病相关单核细胞和巨噬细胞，并验证了小鼠模型在理解人类疾病中的适用性 | 研究主要基于观察性数据，功能机制验证可能有限，且样本量虽大但可能未覆盖所有疾病亚型 | 探索狼疮性肾炎中肾内髓系细胞的改变，并评估小鼠模型在治疗开发中的适用性 | 四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞分析，空间转录组学，功能研究 | NA | 单细胞数据，空间转录组数据 | 155名狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3006 | 2026-02-25 |
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002903
PMID:40607924
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研究论文 | 本研究通过泛癌多组学分析揭示了MS4A2在肺腺癌中的功能景观，特别关注其在四种生存指标中的预后层次 | 首次在肺腺癌中系统评估MS4A2在OS、DSS、PFI、DFI四种生存指标中的预后价值，并发现其通过双向趋化因子调控塑造免疫抑制微环境 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证；单细胞分析样本量有限，可能未完全捕捉肿瘤异质性 | 阐明MS4A2在肺腺癌中的预后意义和功能机制 | 肺腺癌患者样本和肿瘤相关肥大细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 肺腺癌 | RNA-seq、单细胞转录组学、甲基化表观遗传分析、药物敏感性评估 | Cox回归模型、Kaplan-Meier模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、甲基化数据、药物反应数据 | TCGA/GTEx数据库的33种癌症样本及NSCLC队列的单细胞数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 3007 | 2026-02-25 |
Multi-omic profiling reveals age-specific blood biomarkers and aging-driven B cell remodeling in osteoarthritis
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003076
PMID:40696927
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，揭示了骨关节炎（OA）中年龄特异性的血液生物标志物及衰老驱动的B细胞重塑机制 | 识别了五个外周血生物标志物（MAPK1、MAP3K8、ING1、LDLR、NUP153），并建立了基于年龄特异性标志物的优化预测模型，首次揭示了衰老驱动的B细胞重塑在老年OA发病中的关键作用 | 研究样本量有限，且主要聚焦于膝关节OA，未来需在更大队列和其他关节类型中验证 | 开发骨关节炎的非侵入性诊断工具并探索其发病机制，特别是年龄相关的免疫失调 | 骨关节炎患者（包括年轻和老年）的关节组织（四种OA受累关节组织）和外周血样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞数据 | 217,983个关节细胞进行单细胞RNA测序，具体患者样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3008 | 2026-02-25 |
Unraveling molecular characteristics and functional exploration of panoptosis for prognosis stratification in lung adenocarcinoma: a tumor marker prognostic study
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002968
PMID:40844260
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，揭示了PANoptosis在肺腺癌中的分子特征，并开发了一个预后分层模型 | 首次将PANoptosis与肺腺癌预后关联，并识别出YWHAG-vasopressin-PANoptosis轴作为潜在治疗靶点 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性验证；体外和体内实验样本量有限 | 探索PANoptosis在肺腺癌中的分子机制并建立预后预测模型 | 肺腺癌患者活检样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 机器学习组合算法 | 转录组数据、单细胞数据 | 超过1500个肺腺癌及其他癌症活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3009 | 2026-02-25 |
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation: Microglial diversity and response in assembloids
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657874
PMID:40501840
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研究论文 | 本研究通过构建包含人类小胶质细胞的区域特异性脑类器官和组装体，揭示了小胶质细胞在人类大脑不同区域的多样性及其对神经元过度兴奋的响应机制 | 首次在人类脑类器官和组装体中整合小胶质细胞，系统揭示了其区域特异性亚型多样性，并建立了研究神经免疫相互作用的先进平台 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本规模相对有限 | 探究人类大脑不同区域小胶质细胞的特性及其在神经回路发育和功能中的作用 | 人类小胶质细胞、区域特异性脑类器官（皮质、纹状体、中脑）以及中脑-纹状体组装体 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、钙成像、化学遗传学 | 脑类器官模型、组装体模型 | 单细胞转录组数据、钙信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3010 | 2026-02-25 |
sciLaMA: A Single-Cell Representation Learning Framework to Leverage Prior Knowledge from Large Language Models
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.28.635153
PMID:40501921
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研究论文 | 提出了一种名为sciLaMA的新型单细胞表示学习框架，通过整合多模态大语言模型的静态基因嵌入与单细胞RNA测序数据，以提升下游任务性能 | 首创性地将多模态大语言模型的基因嵌入与单细胞RNA测序数据通过配对变分自编码器架构相结合，生成上下文感知的细胞和基因表示 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据分析中整合外部生物知识、计算效率和可解释性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器，大语言模型 | 基因表达表格数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3011 | 2026-02-25 |
Peptide Driven Identification of TCRs (PDI-TCR) reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2025-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652535
PMID:40654739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PDI-TCR的新方法，用于从人类血液中识别抗原特异性T细胞受体，并应用于结核病研究 | 开发了PDI-TCR方法，通过比较非重叠肽池的响应，能够区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | NA | 识别和监测抗原特异性T细胞，以研究结核病中CD4 T细胞的动态和表型 | 结核病患者、结核分枝杆菌致敏的健康个体（IGRA+）的血液样本 | 免疫学 | 结核病 | 肽池扩增、批量TCR测序、单细胞RNA测序 | NA | 序列数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3012 | 2026-02-25 |
A novel biomarker of COVID-19: MMP8 emerged by integrated bulk RNAseq and single-cell sequencing
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82227-8
PMID:39730651
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞测序数据，发现MMP8是COVID-19的一个新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞测序和药理学数据库，鉴定出MMP8作为COVID-19的关键生物标志物，并揭示其在髓系细胞中的异质性表达及细胞间相互作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本量未明确说明；未涉及机制的功能性验证 | 阐明COVID-19的病理进展和分子改变，寻找诊断和治疗靶点 | 健康供体、非重症和重症COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3013 | 2026-02-25 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微孔微针与CAR-TREM2-巨噬细胞的策略，通过调节纤维化微环境来管理疤痕 | 首次将靶向DPP4成纤维细胞并调节内皮细胞亚型的CAR-TREM2-巨噬细胞与微孔微针递送系统相结合，用于多因子调控疤痕微环境 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序分析，缺乏大规模动物模型或临床验证 | 开发一种通过调控疤痕微环境来有效预防和治疗皮肤创伤后疤痕形成的新策略 | 皮肤疤痕微环境中的DPP4阳性成纤维细胞、异质性血管内皮细胞和TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3014 | 2026-02-25 |
A Single-Cell RNA Sequencing Guided Multienzymatic Hydrogel Design for Self-Regenerative Repair in Diabetic Mandibular Defects
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410962
PMID:39436107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术指导设计了一种多酶水凝胶支架，用于促进糖尿病下颌骨缺损的自再生修复 | 首次结合单细胞RNA测序分析揭示糖尿病环境下NO和ROS阻碍巨噬细胞重极化的关键机制，并据此设计具有双功能（NO清除和ROS清除）的多酶水凝胶支架 | 研究主要针对糖尿病下颌骨缺损模型，尚未验证在其他骨缺损类型或更广泛糖尿病并发症中的适用性 | 开发能够恢复糖尿病环境下生理性骨重塑功能的骨组织工程材料 | 糖尿病下颌骨缺损模型中的巨噬细胞、骨髓间充质干细胞和内皮细胞 | 组织工程与再生医学 | 糖尿病骨缺损 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3015 | 2026-02-25 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料，通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸，通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型，从而改变纤维-脂肪祖细胞亚群平衡 | 研究主要针对口面部肌肉纤维化，在其他类型肌肉或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪祖细胞 | 生物医学工程 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3016 | 2026-02-25 |
Role of Neutrophils in the Development of Steatotic Liver Disease
2024-08, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0044-1789207
PMID:39117322
|
综述 | 本文综述了中性粒细胞的生物学特性、其在脂肪变性肝病发展中的作用以及其作为疾病治疗靶点的潜力 | 强调了中性粒细胞在无菌性炎症（脂肪变性肝病发病机制的关键组成部分）中的作用，并指出单细胞RNA测序等技术已揭示中性粒细胞亚群的存在，但不同亚群在疾病发展中的具体差异贡献尚不清楚 | 不同中性粒细胞亚群在脂肪变性肝病发展中的具体差异贡献仍不明确 | 探讨中性粒细胞在脂肪变性肝病发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 中性粒细胞及其在脂肪变性肝病中的功能 | NA | 脂肪变性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3017 | 2026-02-25 |
Emerging Roles of Spatial Transcriptomics in Liver Research
2024-05, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/a-2299-7880
PMID:38574750
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综述 | 本文综述了空间转录组学在肝脏研究中的新兴作用，包括其在揭示肝细胞分区功能、肝脏疾病发病机制及肝癌异质性方面的应用 | 空间转录组学作为一种突破性技术，能够以高精度映射组织复杂结构中的基因表达，特别是在肝脏研究中揭示了肝细胞的分区功能、脂质相关巨噬细胞在脂肪变性中的作用以及肿瘤微环境与免疫系统的相互作用 | NA | 探讨空间转录组学在肝脏研究中的应用，以增强对肝脏疾病的理解和治疗 | 健康与疾病状态下的肝脏组织，包括肝细胞、巨噬细胞、内皮细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3018 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-03-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3019 | 2026-02-25 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation
2022-Dec-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000032558
PMID:36595859
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研究论文 | 本研究基于铁死亡相关长链非编码RNA构建了一个膀胱癌预后风险预测模型，并通过单细胞转录组测序进行验证 | 首次从铁死亡相关lncRNAs的角度构建膀胱癌预后模型，并结合单细胞测序验证其在肿瘤微环境中的特异性表达 | 样本量较小（仅4例单细胞测序样本），且依赖于公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 构建膀胱癌预后风险模型以指导临床预后评估并识别潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者样本（包括TCGA数据库中的批量RNA-seq数据和4例患者单细胞测序数据） | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的膀胱癌样本（具体数量未明确）和4例患者单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3020 | 2026-02-25 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
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研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组数据，阐明了小鼠器官发生过程 | 应用基于图像的单细胞转录组学方法seqFISH，结合空间背景和多路转录测量，揭示了scRNA-seq数据中未显现的细胞分化轴 | 仅检测了387个目标基因的mRNA，可能未覆盖全部相关基因表达 | 研究复杂组织和发育中的细胞命运决定 | 小鼠胚胎组织切片（8-12体节阶段） | 数字病理学 | NA | seqFISH, scRNA-seq | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |