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当前共找到 39702 篇文献，本页显示第 3001 - 3020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3001 | 2026-04-23 |
Multi-Omics Analysis Reveals m7G Methylation-Related Genes May Be Involved in TGF-β Signaling-Mediated Anti-PD-L1 Response in Bladder Cancer
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S583577
PMID:42016541
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析，揭示了m7G甲基化相关基因可能通过调控TGF-β信号通路参与膀胱癌抗PD-L1免疫治疗的耐药过程 | 首次整合bulk、单细胞和空间转录组数据，结合机器学习，系统研究了m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的作用，并鉴定出关键基因NUDT10 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证仅限于体外细胞模型，缺乏体内实验和更大规模的临床队列验证 | 探究m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的潜在作用机制 | 膀胱癌 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学分析（转录组学、甲基化分析）、机器学习、siRNA转染、qRT-PCR、Western blot、免疫组化、CCK-8、伤口愈合实验 | 机器学习模型 | 转录组数据（bulk、单细胞、空间）、甲基化数据 | 来自多个公共数据库（TCGA、GEO、IMvigor210）的膀胱癌队列数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3002 | 2026-04-23 |
Long-Read Sequencing Reveals RNA Splicing Complexity in Human Diseases
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0052
PMID:42017050
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综述 | 本文综述了长读长RNA测序技术在揭示人类疾病中RNA剪接复杂性方面的应用与优势 | 强调了长读长RNA测序在无需转录本组装的情况下，精确解析外显子-内含子结构、可变剪接模式及非经典RNA加工事件的能力，并探讨了其与单细胞和空间转录组学的整合趋势 | 作为一篇综述文章，未涉及具体实验数据或样本量的局限性分析 | 概述长读长RNA测序的工作原理、技术创新及其在疾病研究中的应用，以推动疾病诊断和精准医学 | 人类疾病相关的转录组，特别是RNA剪接复杂性 | 自然语言处理 | NA | 长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 长读长RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3003 | 2026-04-23 |
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000967
PMID:41563281
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术方法，揭示了细胞外基质刚度在急性肾损伤修复中的关键作用，并识别出Mfap2作为通过非经典Hippo通路调控酮体生成的重要修复介质 | 首次系统描绘了AKI肾脏基质支架的蛋白质组图谱，发现成纤维细胞/周细胞来源的Mfap2通过LATS1介导的非经典Hippo通路调控代谢重编程，提出了Mfap2-Esr2-Hmgcs2轴作为潜在药物靶点 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证；机制研究集中在特定信号通路，可能存在其他未被发现的调控网络 | 阐明细胞外基质如何通过机械代谢信号通路调控急性肾损伤修复过程 | 急性肾损伤动物模型、肾脏细胞外基质、成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 数据非依赖性采集蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程学 | NA | 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3004 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 | 首次在斑马鱼视网膜再生中系统解析了Müller胶质细胞的两种静止亚型及其向激活状态或杆状前体细胞的转化，并鉴定了小胶质细胞的三种亚型及其动态变化，同时揭示了炎症通过Jak1-Stat3信号通路调控胶质细胞重编程的机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物视网膜再生的直接转化仍需进一步验证 | 探究炎症在视网膜再生过程中如何调控Müller胶质细胞重编程 | 斑马鱼视网膜中的免疫细胞（特别是小胶质细胞）和Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜损伤与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及未损伤和损伤后的斑马鱼视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3005 | 2026-04-23 |
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063
PMID:39101644
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞在动态发育过程中的不同演化路径和功能差异 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统解析了脊髓损伤后小胶质细胞与巨噬细胞的差异化演化轨迹，并识别了巨噬细胞中与促炎效应（整合素β2）和神经保护效应（制瘤素M通路）相关的关键分子机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床样本中得到验证；空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析细胞间相互作用的微观空间结构 | 阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞与巨噬细胞的动态变化及其在炎症反应中的不同作用 | 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3006 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a peripheral monocyte subpopulation and its interaction with atrial macrophages via the CCL3-CCR1 axis during atrial remodeling
2025-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3023-9
PMID:40833709
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3007 | 2026-04-23 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISEE的新算法，用于建模单细胞数据集中的扰动响应，并应用于斑马鱼胚胎中ERK信号通路的研究 | 开发了DAISEE算法，能更有效地在复杂实验设计中分离单细胞扰动响应与混杂变异，并揭示了过激活信号通路在发育胚胎中诱导新基因表达状态的能力 | NA | 研究发育信号通路扰动对单细胞转录状态的影响 | 斑马鱼胚胎中的细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解框架 | 单细胞转录组数据 | 5小时龄斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3008 | 2026-04-23 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除疼痛感知外的调控功能，并利用化学遗传学方法验证了TrkA抑制对肉瘤生长和转移的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限，且干预策略的长期效果和临床转化需进一步评估 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 | 小鼠骨肉瘤模型和人类骨肉瘤骨样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多模态多组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3009 | 2026-04-23 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
|
研究论文 | 本研究揭示了急性髓系白血病（AML）微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能，导致免疫抑制和感染易感性增加 | 首次在非照射的宿主中使用中性粒细胞报告小鼠模型，结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选，系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路重塑中性粒细胞的表观遗传和功能 | 研究主要基于小鼠模型，虽然患者样本验证了类似生物学现象，但人类AML的异质性可能带来更复杂的调控机制 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响及其分子机制 | AML暴露的中性粒细胞（来自小鼠模型和AML患者） | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学、染色质重塑分析、基序发现、体外细胞因子筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据 | 临床前AML小鼠模型及AML患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3010 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
|
研究论文 | 本研究系统性地评估了整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）数据以改善批量RNA测序（bulk RNA-seq）反卷积性能的策略 | 首次系统性地比较了多种整合scRNA-seq和snRNA-seq数据的方法，并提出了针对不同场景的明确指导原则，包括基因过滤和条件变分自编码器（scVI）的应用 | 研究仅在四种组织类型中进行了验证，对于更广泛或更特殊的组织类型，方法的普适性有待进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性，特别是在缺乏完整scRNA-seq参考数据的情况下 | 批量RNA测序数据的细胞类型组成反卷积 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 条件变分自编码器（scVI），非条件变分自编码器，主成分分析 | RNA测序数据 | 四种不同的组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3011 | 2026-04-23 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞的功能及其通过非经典Wnt信号调控增殖状态的动态过程 | 首次在Lgr5表达干细胞出现之前鉴定出Bmi1细胞作为功能性干细胞，并发现其通过非经典Wnt信号调控增殖状态向慢周期状态的转变 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道发育中的类似机制仍需验证 | 探究肠道上皮发育过程中干细胞亚群的动态调控机制 | 小鼠肠道发育早期的Bmi1表达干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3012 | 2026-04-23 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4和FABP5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，系统阐明了内皮细胞FABP4/5在肺动脉高压发病中的关键角色，特别是其通过调控糖酵解和动脉编程促进血管重塑的机制 | 研究主要基于动物模型和有限的患者样本，需要更大规模的人群研究验证；机制研究尚未完全揭示FABP4/5下游的具体信号通路 | 探究内皮细胞FABP4和FABP5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺组织、患者血浆样本、Egln1Tie2Cre基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 血浆蛋白质组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 包括特发性肺动脉高压患者样本、肺动脉高压大鼠模型、Egln1Tie2Cre小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3013 | 2026-04-23 |
A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660779
PMID:40666883
|
研究论文 | 本研究构建了一个绝经前女性的单细胞图谱（PreMeno Atlas），用于卵巢生物学研究和药物靶点发现 | 首次创建了专注于绝经前女性的多组织单细胞图谱，并系统比较了卵巢细胞类型的转录组特征，识别了潜在的卵巢特异性药物靶点 | 样本来源和数量可能有限，未涵盖所有绝经前年龄段或病理状态 | 构建绝经前女性单细胞图谱以促进卵巢生物学理解和药物靶点发现 | 绝经前女性的卵巢及其他13种组织 | 单细胞组学 | 生育管理 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 511,365个细胞，来自14种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3014 | 2026-04-23 |
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849
PMID:40233746
|
研究论文 | 本文介绍了首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱RIRA，通过对比转录组谱与免疫谱系，揭示了无监督聚类在解释免疫细胞表型和功能时的局限性 | 首次构建猕猴免疫单细胞多组织图谱，并利用表面蛋白和标记基因作为基准，系统评估转录组谱与免疫谱系的对齐情况，识别了具有高判别价值的基因程序 | 无监督聚类在T细胞和NK细胞等功能性亚群中可能导致系统性混合，因为这些亚群缺乏明确的标记基因且共享强烈的表达程序（如细胞毒性） | 提高通过单细胞RNA测序数据解释免疫细胞表型和功能的准确性 | 猕猴的免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3015 | 2026-04-23 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2025-May-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027884
PMID:40014797
|
研究论文 | 本研究揭示了成人肺中存在功能性造血祖细胞，这些细胞具有增殖和移植潜力，并可能支持人类造血功能 | 首次在成人肺中鉴定出功能性造血祖细胞，其频率与骨髓相似，并具有独特的基因特征和空间定位 | 研究主要基于小鼠移植实验和基因表达分析，人类体内功能验证有限 | 探索成人肺中造血祖细胞的存在、功能和潜在作用 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间定位数据 | 人类肺组织样本和血液样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3016 | 2026-04-23 |
Latent epigenetic programs in Müller glia contribute to stress and disease response in the retina
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.014
PMID:39753128
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了人类和小鼠视网膜发育过程中细胞类型特异性的染色质结构变化，并发现了Müller胶质细胞中的“可塑性基因”程序 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，识别出Müller胶质细胞中转录沉默但染色质可及的“可塑性基因”，这些基因在视网膜应激和疾病响应中起关键作用 | 研究主要基于发育过程，对成年或疾病状态下的可塑性基因功能验证可能不足，且样本量未明确说明 | 探究视网膜发育过程中细胞类型特异性的染色质结构变化及其在应激和疾病响应中的作用 | 人类和小鼠的视网膜细胞，特别是Müller胶质细胞 | 表观遗传学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq），批量测序 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3017 | 2026-04-23 |
Genome-coverage single-cell histone modifications for embryo lineage tracing
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08656-1
PMID:40011786
|
研究论文 | 本研究开发了TACIT方法，用于在小鼠早期胚胎中进行基因组覆盖的单细胞组蛋白修饰分析，并结合单细胞RNA测序数据，揭示了胚胎发育中的表观遗传重编程和细胞命运决定机制 | 开发了TACIT方法，首次实现了小鼠早期胚胎中七种组蛋白修饰的基因组覆盖单细胞分析，并结合机器学习识别了全能性基因调控网络 | 研究仅针对小鼠模型，未涉及人类或其他物种，且方法可能受技术限制影响覆盖深度或准确性 | 探究小鼠早期胚胎发育中的单细胞表观遗传重编程和细胞异质性形成机制 | 小鼠早期胚胎（从受精到囊胚形成阶段） | 发育生物学 | NA | 靶向染色质索引和标签化（TACIT）、单细胞RNA测序、CRISPR激活 | 机器学习模型 | 表观遗传数据（组蛋白修饰）、转录组数据（RNA-seq） | 未明确指定样本数量，但涉及小鼠早期胚胎的多阶段分析 | NA | 单细胞组蛋白修饰分析、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3018 | 2026-04-23 |
Mathematical Modeling Predicts Optimal Immune Checkpoint Inhibitor and Radiotherapy Combinations and Timing of Administration
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0610
PMID:39666379
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，结合数学模型，预测了放疗联合免疫检查点抑制剂的最佳组合与给药时机 | 首次通过单细胞和空间转录组技术动态解析食管癌患者放疗期间淋巴细胞介导的分子相互作用变化，并构建数学模型预测五种ICI在四个不同时间点给药的效果 | 研究基于食管癌患者样本，模型预测结果需在临床试验中进一步验证 | 探索放疗联合免疫检查点抑制剂的最佳治疗方案与给药时机 | 食管癌患者的组织样本 | 计算生物学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 数学建模 | 数学模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 食管癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3019 | 2026-04-23 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学元分析，开发了一种细胞类型无关的转录组特征模型，用于统一比较神经发育过程 | 提出了一种细胞类型无关的模型，能够跨细胞类型、数据集和物种（如人类和小鼠）准确预测发育年龄，并成功应用于神经类器官和疾病模型 | 模型主要基于转录组数据，可能未涵盖其他生物学层面（如表观遗传或蛋白质组）的发育信息，且样本来源和预处理差异可能影响泛化能力 | 开发一个统一框架，以比较不同背景、模型系统和物种中的神经发育过程 | 人类和小鼠的发育中大脑细胞，以及人类神经类器官 | 单细胞转录组学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA-seq | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3020 | 2026-04-23 |
An immune-focused supplemental alignment pipeline captures information missed from dominant single-cell RNA-seq analyses, including allele-specific MHC-I regulation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596760
PMID:40861433
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为nimble的补充对齐工具，用于增强标准RNA-seq分析流程，特别关注免疫相关基因数据的捕获 | 开发了nimble工具，通过自定义基因空间和可定制的评分标准，补充标准RNA-seq分析，有效恢复因遗传多态性或基因组注释不准确而丢失的免疫基因数据 | 未明确提及具体的技术限制或样本量不足等问题 | 提高RNA-seq数据分析的准确性和完整性，特别是在免疫学研究中捕获标准分析可能遗漏的信息 | RNA-seq数据，包括bulk和单细胞RNA-seq数据，重点关注免疫相关基因如MHC和KIR | 自然语言处理 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |