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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3001 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与骨肉瘤肺转移密切相关的C1肿瘤细胞亚群,并发现SEC16B基因的下调在肺转移中起关键作用 | 样本量相对有限(6个原发肿瘤样本,2个肺转移样本,4个正常骨组织样本) | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并识别关键调控基因 | 骨肉瘤患者组织样本(原发肿瘤、肺转移灶)和正常骨组织 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Transwell实验 | hdWGCNA, CytoTRACE, Scissor, CellphoneDB, CSOmap | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 12个单细胞RNA测序样本(6原发+2转移+4正常)+ 8个批量RNA测序样本(4原发+4转移) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
3002 | 2025-10-06 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
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研究论文 | 本研究探讨cGAS-STING表达水平与头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效的关联 | 首次在头颈鳞癌患者中证实cGAS-STING表达与NACI疗效的正相关性,并揭示其通过增强T细胞活化和肿瘤-T细胞相互作用发挥作用的机制 | 样本量较小(38例患者),需更大规模研究验证 | 评估cGAS和STING表达作为头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效预测生物标志物的潜力 | 头颈鳞癌患者 | 癌症免疫学 | 头颈鳞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞数据 | 38例头颈鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
3003 | 2025-10-06 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PM2.5暴露对幼年小鼠肺部不同细胞类型的特异性转录组影响 | 首次在幼年动物模型中系统揭示PM2.5对肺部不同细胞类型的特异性转录调控机制 | 研究仅基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 探究PM2.5对幼年肺部细胞类型特异性分子机制的影响 | 幼年小鼠肺部细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因本体论分析,KEGG通路分析,苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 幼年小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3004 | 2025-10-06 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
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研究论文 | 本研究通过分析扩张型心肌病中双硫死亡相关基因的表达特征,建立了诊断模型并验证了核心基因的病理作用 | 首次将双硫死亡机制与扩张型心肌病关联,发现19个差异表达基因并建立高精度诊断模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索双硫死亡相关基因在扩张型心肌病中的生物标志物和治疗靶点价值 | 扩张型心肌病患者和健康对照的基因表达数据,DCM小鼠模型 | 生物信息学 | 扩张型心肌病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 多个GEO数据集,包含DCM患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
3005 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3006 | 2025-10-06 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5/PI3K/AKT轴在结直肠癌新辅助化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统解析结直肠癌化疗耐药机制,并建立KLF5调控网络风险评分模型用于预后预测 | NA | 探索结直肠癌新辅助化疗耐药机制并寻找有效治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, InferCNV, 差异表达基因分析, 通路富集分析, 细胞通讯分析, SCENIC, 高通量药物筛选 | 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3007 | 2025-10-06 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
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研究论文 | 开发了一种在相同组织切片上整合空间转录组学和空间蛋白质组学分析的实验与计算框架 | 首次在相同组织切片上实现空间转录组和空间蛋白质组的整合分析,确保组织形态和空间背景的一致性 | 仅在人肺癌样本中进行了验证,尚未在其他疾病类型中测试 | 开发空间多组学整合分析方法,研究肿瘤免疫微环境 | 人肺癌组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, H&E染色 | Weave软件 | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
3008 | 2025-10-06 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
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研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的生长中牛卵母细胞收集和文库制备的详细实验方案 | 提供了针对牛卵母细胞的单细胞RNA测序标准化实验流程 | NA | 建立牛卵母细胞单细胞RNA测序的实验方法 | 生长中的牛卵母细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3009 | 2025-10-06 |
PD-1 regulates tumor-infiltrating CD8+ T cells in both a cell-intrinsic and a cell-extrinsic fashion
2025-Oct-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230542
PMID:40705010
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研究论文 | 本研究通过诱导性PD-1敲除模型揭示了PD-1在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞的双重调控机制 | 首次证明PD-1缺失不仅对敲除细胞自身产生细胞自主效应,还能通过非细胞自主机制增强表达PD-1的CD8+ T细胞功能 | 研究仅使用MC38肿瘤模型,未验证其他肿瘤类型 | 探究PD-1缺失如何影响肿瘤微环境中CD8+ T细胞的功能 | CD8+ T细胞和MC38肿瘤模型 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | 诱导性基因敲除模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3010 | 2025-10-06 |
Pollutant distribution in vertebrates across scales: Organs, cells, and organelles
2025-Oct-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.126680
PMID:40532810
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综述 | 系统评述脊椎动物中环境污染物在器官、细胞和亚细胞水平的多尺度分布研究进展 | 首次系统整合污染物在器官-细胞-细胞器多尺度分布的研究框架,特别强调纳米材料与传统污染物的分布差异 | 细胞群体和亚细胞水平的污染物分布研究有限,现有研究主要集中在血液、肠道、肝脏和鳃/肺等少数器官 | 建立污染物多尺度分布与毒性机制之间的联系,推进环境健康风险评估和靶向干预 | 脊椎动物(包括人类) | 环境毒理学 | NA | 单细胞测序、跨尺度成像技术、计算预测模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3011 | 2025-10-06 |
Novel insights in the regulation of intercalated cell differentiation
2025-Sep-01, Current opinion in nephrology and hypertension
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/MNH.0000000000001095
PMID:40466010
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综述 | 本文综述了肾脏闰细胞分化的分子调控机制及其在维持酸碱平衡中的关键作用 | 新发现Foxp1及其下游转录因子Dmrt2和Hmx2在闰细胞分化中的关键作用,并结合单细胞测序技术揭示了过渡细胞的存在 | NA | 阐明闰细胞分化的分子调控机制及其在酸碱平衡调节中的功能 | 肾脏闰细胞及其分化过程 | NA | 代谢性酸中毒/碱中毒 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3012 | 2025-10-06 |
Enhancing ovarian cancer prognosis with an artificial intelligence-derived model: Multi-omics integration and therapeutic implications
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102439
PMID:40580871
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研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的卵巢癌预后指数模型,整合多组学数据并探索其治疗意义 | 首次构建了人工智能衍生的预后指数模型,整合了单细胞和批量RNA测序数据,并发现MFAP4基因作为潜在治疗靶点 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发精准的卵巢癌预后预测模型并探索其治疗应用 | 卵巢癌患者及其相关分子数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | Cox回归, 机器学习集成算法 | 转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的多数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3013 | 2025-10-06 |
Identification and validation of synergistic drug strategies targeting macrophage polarization in triple-negative breast cancer via single-cell transcriptomics and deep learning
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102457
PMID:40580873
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和深度学习识别并验证针对三阴性乳腺癌中巨噬细胞极化的协同药物策略 | 开发了基于巨噬细胞分化的分类器MMDCSS,并通过计算药理学发现非那雄胺可作为ZBTB20调节剂逆转肿瘤诱导的M2巨噬细胞极化 | 研究样本量相对有限(24例TNBC患者),需要进一步临床验证 | 开发针对三阴性乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者和巨噬细胞极化过程 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,深度学习,计算药理学 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3014 | 2025-10-06 |
Machine learning-guided single-cell multiomics uncovers GDF15-driven immunosuppressive niches in NSCLC: A translational framework for overcoming anti-PD-1 resistance
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102459
PMID:40582068
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研究论文 | 通过机器学习引导的单细胞多组学分析揭示GDF15驱动的免疫抑制微环境在非小细胞肺癌中的作用,并建立克服抗PD-1耐药性的转化框架 | 开发了加速斜向随机生存森林模型,在预测准确性上优于传统Cox回归和深度学习方法;首次通过单细胞多组学分析发现GDF15是调控免疫抑制肿瘤微环境的关键枢纽 | 功能研究显示GDF15敲低对肿瘤细胞固有增殖无显著影响,样本量相对有限(n=156) | 系统识别免疫检查点阻断疗效的决定因素,建立预测ICB耐药性的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者队列(n=156)和黑色素瘤队列(GSE91061),Lewis肺癌细胞系 | 机器学习, 单细胞多组学 | 非小细胞肺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法比较, 功能验证实验 | 加速斜向随机生存森林, Cox回归, 深度学习 | 单细胞RNA测序数据, 临床生存数据 | 4个NSCLC队列共156例患者,外部验证使用黑色素瘤队列GSE91061 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3015 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of heat shock protein 90AA1 in Müller cell proliferation via the Necroptosis/MAPK pathway in diabetic retinopathy
2025-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110508
PMID:40617280
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了热休克蛋白90AA1通过坏死性凋亡/MAPK通路调控糖尿病视网膜病变中Müller细胞增殖的作用机制 | 首次在糖尿病视网膜病变中鉴定HSP90AA1作为关键枢纽基因,并阐明其通过坏死性凋亡和MAPK信号通路调控Müller细胞增殖的新机制 | 样本量较小(4例糖尿病患者和2例非糖尿病患者),需要更大规模研究验证 | 探究HSP90AA1在糖尿病视网膜病变中Müller细胞增殖的作用机制 | 糖尿病患者视网膜样本、体内外糖尿病视网膜病变模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4例糖尿病患者和2例非糖尿病患者的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3016 | 2025-10-06 |
In-depth patient-specific analysis of tumor heterogeneity in melanoma brain metastasis: Insights from spatial transcriptomics and multi-region bulk sequencing
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102468
PMID:40669378
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和多区域批量测序,对黑色素瘤脑转移瘤的肿瘤异质性进行深入分析 | 首次将空间转录组学与多区域批量外显子组、蛋白质组和转录组分析相结合,在患者个体水平上解析黑色素瘤脑转移的肿瘤异质性 | 样本量较小(仅4例患者样本),需要更大规模研究验证发现 | 深入分析黑色素瘤脑转移瘤的肿瘤异质性及其分子特征 | 黑色素瘤脑转移患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 批量外显子组测序, 蛋白质组分析, 转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 外显子组数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 4例黑色素瘤脑转移患者样本 | NA | 空间转录组学, 批量外显子组测序, 蛋白质组分析, 转录组分析 | NA | NA |
3017 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal FAS+ T cell and autophagy-related signatures predicting chemoimmunotherapy response in diffuse large B-cell lymphoma patients
2025-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2849-2
PMID:40374987
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了FAS阳性T细胞和自噬相关特征在预测弥漫大B细胞淋巴瘤患者化疗免疫治疗反应中的作用 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术,识别了FAS阳性T细胞作为DLBCL预后生物标志物,并构建了自噬相关预后模型 | 样本量相对有限,特别是单细胞测序仅包含4例DLBCL患者,需要更大规模验证 | 研究自噬相关基因在弥漫大B细胞淋巴瘤中的预后价值 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者和健康对照 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 抗体芯片 | 预后风险模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 1,409例DLBCL患者, 531例健康对照, 4例单细胞测序, 10例空间转录组学, 110例本地队列蛋白质组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
3018 | 2025-10-06 |
Embryonic mast cells arise from the Cpa3-expressing precursors but not granulocyte-monocyte progenitors
2025-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2891-1
PMID:40419842
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传命运示踪模型揭示了胚胎皮肤肥大细胞的独特发育路径 | 首次鉴定出表达Cpa3的胚胎肥大细胞前体群体,并证明其发育路径独立于粒细胞-单核细胞祖细胞 | 研究主要关注胚胎期发育,成年期肥大细胞的维持和更新机制仍需进一步探索 | 阐明胚胎来源肥大细胞的发育起源和个体发生过程 | 小鼠胚胎 yolk sac、胎儿肝脏和外周组织中的肥大细胞及其前体 | 发育免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传命运示踪, 体外分化实验, 体内移植实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期11.5至14.5天的小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3019 | 2025-10-06 |
CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract
2025-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2920-y
PMID:40459692
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研究论文 | 本研究通过谱系示踪和单细胞分析揭示了呼吸道驻留记忆T细胞通过CCR5介导的肺向引流淋巴结逆行迁移机制维持动态平衡 | 首次发现肺向引流淋巴结的T细胞逆行迁移现象,并鉴定CCR5-CCL5轴在这一过程中的关键作用 | 研究主要聚焦于流感感染模型,在其他病原体或组织中的普适性需要进一步验证 | 探究呼吸道驻留记忆T细胞的维持机制 | 病毒特异性CD8+T细胞 | 免疫学 | 流感感染 | 谱系示踪,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3020 | 2025-10-06 |
Combined angiogenic and hypertrophic gene therapy enhances skeletal muscle growth
2025-Aug-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00966.2024
PMID:40622896
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研究论文 | 本研究通过联合使用肌生成抑制素原肽和血管内皮生长因子B基因疗法,探索促进骨骼肌生理性生长和改善肌肉功能的新策略 | 首次将血管生成和肌肉肥大的基因疗法相结合,克服了单一促肌肉生长疗法导致的毛细血管稀疏等副作用 | 研究主要在健康和小鼠糖尿病模型中进行,尚未在更多疾病模型或大型动物中验证 | 开发能够同时促进肌肉生长和血管生成的联合基因疗法,以克服当前肌肉肥大治疗的局限性 | 健康小鼠和糖尿病小鼠的骨骼肌组织 | 基因治疗 | 肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序,腺相关病毒载体基因递送 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 健康小鼠和糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |