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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3001 | 2026-02-03 |
Integrated transcriptomic and single-cell analysis reveals cell cycle dysregulation and cellular heterogeneity in lung cancer
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04303-3
PMID:41467951
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,揭示了肺癌中细胞周期失调和细胞异质性 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,识别了与临床表型相关的基因模块及细胞周期关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和有限组织样本,未在大型临床队列中进行验证 | 解析肺癌的转录景观和肿瘤微环境中的细胞异质性,以识别潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 肺癌组织、邻近正常样本以及A549和H1299肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | WGCNA, 伪时间轨迹分析 | RNA序列数据 | 肺癌组织与邻近正常样本,以及A549和H1299细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3002 | 2026-02-03 |
CCL20 secreted by KRT15high tumor Cells promotes tertiary lymphoid structure formation and enhances anti-PD-1 therapy response in HPV+HNSCC
2025-Dec-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08359-5
PMID:41462011
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研究论文 | 本研究揭示了HPV阳性头颈鳞状细胞癌中KRT15高表达肿瘤细胞通过分泌CCL20促进三级淋巴结构形成,从而增强抗PD-1疗法疗效的机制 | 首次阐明HPV感染通过KRT15高表达肿瘤细胞分泌CCL20促进三级淋巴结构形成的具体机制,并证实其对抗PD-1疗法疗效的增强作用 | 样本量相对有限(59例患者),且机制研究主要在动物模型中进行,需进一步临床验证 | 探究HPV阳性头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构形成的机制及其对抗PD-1免疫疗法疗效的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本、单细胞测序数据、空间转录组数据及小鼠模型 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq、免疫组织化学、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 59例头颈鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3003 | 2026-02-03 |
Downregulated Expression of the IL7R and BACH2 Genes Is Associated with Immune Memory Loss in Adults Vaccinated Against HBV at Birth
2025-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010047
PMID:41614877
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了出生时接种乙肝疫苗的成年个体中免疫记忆丧失与IL7R和BACH2基因表达下调的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了IL7R和BACH2基因表达下调与乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的关联,为理解免疫记忆机制提供了新视角 | 样本量较小(仅15名参与者),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的分子机制 | 出生时接种乙肝疫苗的成年个体,包括5名无症状HBsAg携带者和10名HBsAg及抗-HBs阴性对照 | 单细胞组学 | 乙肝病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名参与者(5名病例,10名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3004 | 2025-12-29 |
Exploring cellular heterogeneity: single-cell and spatial transcriptomics of Alzheimer's disease brains and iPSC-derived microglia
2025-Dec-28, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01944-y
PMID:41456076
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3005 | 2026-02-03 |
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09420-x
PMID:41449269
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术,识别了肺毛细血管内皮细胞中的五个新亚群,并探讨了它们在血管生成、修复及疾病中的作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示了肺毛细血管内皮细胞中五个分子特征和功能各异的新亚群,包括表达离子转运蛋白的gCaps、有丝分裂活跃的“根”细胞以及Lingo2表达的静脉-毛细血管内皮,这些发现深化了对肺微循环异质性和细胞通讯的理解 | 研究主要基于单细胞转录组学数据,可能未完全捕捉到蛋白质水平或功能活性的变化,且缺氧模型的应用可能限制了结论在更广泛生理或病理条件下的普适性 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能意义 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3006 | 2026-02-03 |
Dynamic neutrophil-keratinocyte communication network centered on IL-36/TNFSF15 responses characterizes inflammatory responses in generalized pustular psoriasis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67917-9
PMID:41436466
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了泛发性脓疱型银屑病(GPP)病变中中性粒细胞与角质形成细胞之间的动态通讯网络,特别是IL-36/TNFSF15信号通路在炎症反应中的核心作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合空间转录组学,系统描绘了GPP病变中的免疫微环境,识别了中性粒细胞从炎症前状态向促炎状态转变的关键特征,并发现了以成纤维细胞和毛细血管内皮细胞为中心的动态受体-配体相互作用网络 | 样本量相对有限(GPP病变皮肤13例,健康皮肤4例),且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 | 探究泛发性脓疱型银屑病(GPP)病变中免疫微环境的特征,特别是中性粒细胞与角质形成细胞之间的通讯机制 | GPP患者的病变皮肤样本(13例)和健康成人皮肤样本(4例) | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 13例GPP病变皮肤样本,4例健康皮肤样本,总计约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3007 | 2026-02-03 |
Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114028
PMID:41399517
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研究论文 | 本研究通过联合抑制HIF-1α和GSK-3β,逆转了辐射诱导的肺纤维化,揭示了其通过调控内皮-间质转化、DNA修复和染色质重塑的机制 | 首次提出联合靶向HIF-1α和GSK-3β(使用2-ME和CHIR99021)来逆转肺纤维化,并通过单细胞RNA测序和谱系追踪证实了其在恢复内皮细胞特性和抑制间质转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者成纤维细胞,尚未在人体临床试验中验证,且具体信号通路细节需进一步探索 | 研究旨在开发逆转辐射诱导肺纤维化的治疗策略 | 小鼠辐射诱导肺纤维化模型、患者特发性肺纤维化成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和患者成纤维细胞样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3008 | 2026-02-03 |
Development and application of a barcoded rabies viral tracing method for mapping brain-wide inputs to single neurons
2025-Dec-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101244
PMID:41338190
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研究论文 | 本研究开发了一种条形码狂犬病毒示踪方法,用于在单细胞水平上绘制全脑对单个神经元的输入连接图谱 | 将逆行病毒示踪与单细胞RNA测序相结合,创建了条形码狂犬病毒示踪方法,首次实现了在单细胞分辨率下对转录组定义的神经元进行局部和长程输入连接的同时绘制 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够绘制单个神经元输入连接图谱的方法,以构建细胞分辨率的大脑介观连接组 | 小鼠内侧前额叶皮层神经元 | 神经科学 | NA | 逆行病毒示踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,连接数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3009 | 2026-02-03 |
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04131-5
PMID:41396398
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 | 首次在口腔癌中通过单细胞RNA测序分析炎症性肠病相关基因的表达,揭示了NFKBIA与趋化因子介导信号通路的关联 | 样本来源和数量未在摘要中明确说明,可能限制结果的普遍性 | 研究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的作用,以识别潜在治疗靶点 | 口腔癌组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP, t-SNE | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3010 | 2026-02-03 |
Decoding osteosarcoma from heterogeneity to precision therapy
2025-Dec-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04256-7
PMID:41379383
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综述 | 本文综述了骨肉瘤的分子亚型研究进展,强调了亚型特异性致癌驱动因素及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨了基于分子谱的精准医学策略潜力 | 整合了多组学数据(包括单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱)来解码骨肉瘤的异质性,并识别了新的生物标志物 | NA | 解码骨肉瘤的异质性,并探索针对其分子亚型的精准治疗策略 | 骨肉瘤(OS),一种青少年中最常见的恶性骨肿瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 多组学研究,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间分析, 表观遗传图谱 | NA | NA |
| 3011 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco flavored e-cigarette exposed mouse lungs
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638715
PMID:40027777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了小鼠肺部在急性暴露于不同口味电子烟气溶胶后,免疫细胞(特别是髓系和淋巴系细胞)的动态变化及风味依赖性影响 | 首次利用单细胞转录组学全面解析了不同口味电子烟暴露下小鼠肺部的细胞特异性免疫变化,并发现了烟草口味电子烟导致的嗜中性粒细胞动态改变和T细胞毒性增强 | 研究仅基于小鼠模型,样本量较小(每组2只/性别),且为急性暴露实验,长期效应尚不明确 | 探究不同口味电子烟气溶胶急性暴露对小鼠肺部免疫景观的影响 | C57BL/6J小鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据 | 71,725个细胞,来自对照组和处理组(每组每性别2只小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3012 | 2026-02-03 |
A molecular, spatial and regulatory atlas of the Hydra vulgaris nervous system
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204983
PMID:41071669
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,对Hydra vulgaris神经系统进行了全面的分子和空间图谱绘制 | 首次提供了Hydra vulgaris神经系统最全面的分子和空间特征,识别了8种神经元类型和15种转录亚型,并整合了基因调控网络分析 | 研究主要基于单细胞测序数据,可能未完全覆盖所有神经元功能或动态变化 | 揭示Hydra vulgaris神经系统的发育、稳态、再生和功能的分子机制 | Hydra vulgaris的神经系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3013 | 2026-02-03 |
Multi-scaled transcriptomics of chronically inflamed nasal epithelium reveals immune-epithelial dynamics and tissue remodeling in nasal polyp formation
2025-Oct-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.009
PMID:40945518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了慢性鼻窦炎中免疫细胞与上皮细胞之间的相互作用及组织重塑机制,特别是在鼻息肉形成过程中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统解析了慢性鼻窦炎中免疫-上皮细胞互作网络,并识别了与鼻息肉形成相关的基底细胞轨迹 | 研究主要基于人类组织样本,可能受样本异质性影响,且机制验证仍需进一步功能实验 | 探究慢性鼻窦炎的病理生理机制,特别是免疫-上皮细胞相互作用在疾病进展和组织重塑中的作用 | 慢性鼻窦炎患者(伴或不伴鼻息肉)及对照个体的鼻窦组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过100名慢性鼻窦炎患者及对照个体的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3014 | 2026-02-03 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文报道了乳腺癌中肿瘤细胞通过去分化程序表达白细胞表面受体蛋白,称为“免疫拟态”,并探讨其与肿瘤进展和治疗抵抗的关系 | 首次提出乳腺癌细胞通过“免疫拟态”表达白细胞表面受体蛋白,并证明这赋予肿瘤细胞增殖优势,促进早期肿瘤生长 | 需要更多乳腺癌队列验证其预后价值,并评估与远端转移、生存期和治疗反应的相关性 | 研究乳腺癌细胞去分化程序中的免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理学标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺癌症模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据、图像、细胞系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3015 | 2026-02-03 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析,揭示了AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征和功能改变 | 首次在治疗初治的AL淀粉样变性患者中,结合单细胞RNA测序和定量蛋白质组学,系统描绘了克隆性浆细胞及其骨髓微环境的转录景观,并识别出与蛋白质稳态相关的关键基因表达变化 | 研究样本量有限,且为横断面研究,未能追踪疾病进展或治疗后的动态变化 | 阐明AL淀粉样变性中克隆性浆细胞的功能特性及其与骨髓微环境的相互作用 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5' 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者(具体人数未在摘要中明确给出) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |
| 3016 | 2026-02-03 |
A novel multislice framework for precision 3D spatial domain reconstruction and disease pathology analysis
2025-Aug-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280281.124
PMID:40659497
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研究论文 | 本文提出了一种名为STMSC的多切片联合分析框架,用于精确三维空间域重建和疾病病理分析 | STMSC框架引入了预校正机制,通过结合H&E成像数据增强切片对齐精度,利用图注意力自编码器平衡不同层次的生物信息,从而精确识别复杂空间域并深入解析癌症环境 | NA | 开发一个多切片联合分析框架,以实现精确的三维空间域重建和疾病病理分析 | 连续组织切片和病理数据集 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3017 | 2026-02-03 |
A replication study of novel fetal hemoglobin-associated genetic variants in sickle cell disease-only cohorts
2025-Apr-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf015
PMID:39886999
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研究论文 | 本研究验证了在镰状细胞病(SCD)患者中,胎儿血红蛋白(HbF)水平与五个新基因位点(ASB3、BACH2、PFAS、ZBTB7A和KLF1)的遗传变异之间的关联,并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术探索了这些非编码变异在调控β-珠蛋白基因表达中的功能 | 首次在独立的SCD队列中复制了先前GWAS发现的20个HbF相关新变异中的五个,并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术验证了BACH2和KLF1位点非编码变异的功能性作用 | 未能通过全外显子组测序在SCD患者中鉴定出对HbF水平有显著影响的罕见遗传变异 | 验证镰状细胞病(SCD)患者中胎儿血红蛋白(HbF)水平与新基因位点的遗传关联,并探索这些变异的功能机制 | 镰状细胞病(SCD)患者,具体包括3740名SCD患者用于遗传关联验证,以及1354名SCD患者用于全外显子组分析,同时使用红细胞系HUDEP-2细胞进行功能研究 | 遗传学 | 镰状细胞病 | 全基因组关联研究(GWAS)、CRISPR抑制、单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | 遗传变异数据、转录组数据、外显子组序列数据 | 3740名SCD患者用于遗传关联验证,1354名SCD患者用于全外显子组分析 | NA | 单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | NA |
| 3018 | 2026-02-03 |
Single-Cell RNA Profiling of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma Reveals a Complex Tumor Microenvironment and Identifies New Biomarkers
2025-Feb, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.10.001
PMID:39393421
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了眼附件皮脂腺癌的转录组特征,揭示了其复杂的肿瘤微环境,并鉴定了CALML5作为敏感的诊断标志物 | 首次在单细胞分辨率下对眼附件皮脂腺癌进行转录组分析,揭示了肿瘤微环境的细胞组成和分子通路变化,并发现CALML5作为新的生物标志物 | 样本量较小(仅6例患者标本),且为回顾性观察性病例系列研究,可能限制结果的普遍性 | 探究眼附件皮脂腺癌的肿瘤组成、转录特征及潜在治疗靶点,以推动医疗进展 | 眼附件皮脂腺癌患者标本(包括原发性肿瘤、Paget样扩散肿瘤及正常组织) | 数字病理学 | 眼附件皮脂腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,免疫组织化学图像数据 | 6例患者标本(3例原发性肿瘤,2例Paget样扩散肿瘤,1例正常组织),共29,219个细胞;另加存档队列(28例OaSC,25例鳞状细胞癌和OSSN,12例基底细胞癌) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3019 | 2026-02-03 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用 | 揭示了STING作为内质网应激的上游激活因子,并发现STING与PERK的物理相互作用,以及STING激动剂诱导PERK激活的新机制 | 内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制仍不完全清楚 | 研究内质网应激在肾脏疾病中的激活机制及其在肾脏纤维化中的作用 | 慢性肾脏病患者、小鼠急性及慢性肾损伤模型(顺铂、单侧输尿管梗阻、叶酸和TFAM敲除小鼠) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 转录组学分析、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 慢性肾脏病患者及多种小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3020 | 2026-02-03 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术,识别了小鼠主动脉平滑肌细胞中第二心场和心脏神经嵴谱系特异性基因的差异表达 | 首次在对照主动脉中探索了两种谱系来源的平滑肌细胞之间的转录组差异,并识别了谱系特异性上调基因 | 研究仅基于14周龄雄性小鼠,样本量有限,且未涉及疾病模型 | 探究主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, RNA原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间表达数据 | 14只14周龄雄性小鼠(SHF追踪和CNC追踪各半) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |