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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2981 - 3000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2981 | 2025-10-06 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 开发了一个增强的单细胞RNA测序分析工作流程，用于研究冠状动脉疾病的细胞相互作用和潜在药物靶点 | 整合了自动化细胞标记、伪时序排序、配体-受体评估和药物-基因相互作用分析的用户友好型工作流程，并开发了交互式网络应用PlaqView | 基于已发表的单细胞数据集进行二次分析，需要进一步实验验证 | 开发单细胞RNA测序分析工作流程以研究动脉粥样硬化斑块微环境和发现潜在治疗方法 | 人类冠状动脉单细胞数据集中的细胞类型，特别是平滑肌细胞来源的成纤维样细胞 | 单细胞分析 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析，配体-受体相互作用分析 | 单细胞RNA测序数据 | 基于Wirka等人先前发表的人类冠状动脉单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2982 | 2025-10-06 |
A joint deep learning model enables simultaneous batch effect correction, denoising, and clustering in single-cell transcriptomics
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271874.120
PMID:34035047
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研究论文 | 提出一种联合深度学习模型CarDEC，可同时实现单细胞转录组数据的批次效应校正、去噪和聚类 | 首次在基因表达空间和嵌入空间同时校正批次效应，且能同时进行去噪和聚类分析 | 未提及模型在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 开发单细胞RNA-seq数据分析方法，解决批次效应问题 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2983 | 2025-10-06 |
Generation of Pulmonary Endothelial Progenitor Cells for Cell-based Therapy Using Interspecies Mouse-Rat Chimeras
2021-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0758OC
PMID:33705684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肺内皮祖细胞异质性，并利用种间嵌合体技术从多能干细胞生成功能性内皮祖细胞用于细胞治疗 | 首次鉴定FOXF1cKIT内皮祖细胞亚群，开发通过小鼠-大鼠种间嵌合体从多能干细胞生成功能性内皮祖细胞的新方法 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类患者中进行验证 | 研究肺内皮祖细胞的异质性并开发基于干细胞的细胞治疗方法 | 新生人类和小鼠肺组织、小鼠肺内皮祖细胞、ACDMPV疾病模型小鼠 | 细胞生物学 | 新生儿肺疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 种间嵌合体技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生人类和小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2984 | 2025-10-06 |
Detecting cell-type-specific allelic expression imbalance by integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2021-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009080
PMID:33661921
|
研究论文 | 开发了BSCET方法，通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据检测细胞类型特异性等位基因表达失衡 | 首次提出通过整合少量scRNA-seq数据来从大量bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性AEI的方法 | 依赖外部scRNA-seq数据集的质量和代表性，且需要准确的细胞类型组成推断 | 开发检测细胞类型特异性等位基因表达失衡的计算方法 | 等位基因表达失衡与人类疾病的关系 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计模型 | 基因表达数据 | 两个胰岛bulk RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2985 | 2025-10-06 |
Iterative transfer learning with neural network for clustering and cell type classification in single-cell RNA-seq analysis
2020-Oct, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-020-00233-7
PMID:33817554
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序分析的迭代迁移学习算法ItClust，用于细胞聚类和细胞类型分类 | 结合了监督细胞类型分类算法的思想，同时利用目标数据信息确保对仅存在于目标数据中的细胞具有分类敏感性 | 性能可能仍受源数据质量影响，对新型细胞类型的分类能力未明确说明 | 提高单细胞RNA测序分析中细胞聚类和细胞类型分类的准确性 | 来自不同物种和组织的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自不同物种和组织的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2986 | 2025-10-06 |
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Jul-31, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02557-5
PMID:40742465
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研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析，识别并验证了与糖尿病肾病相关的三羧酸循环诊断生物标志物 | 首次系统性地将TCA循环相关基因与糖尿病肾病诊断联系起来，并通过多组学数据验证了HPGD和G6PC作为诊断标志物的潜力 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的临床实用性 | 开发糖尿病肾病的早期诊断生物标志物 | 糖尿病肾病患者肾脏组织和细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 单样本基因集富集分析, 机器学习 | 诊断预测模型 | 基因表达数据 | 基于GSE131882和GSE30122数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 2987 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling uncovers cellular complexity and microenvironment in gastric tumorigenesis associated with Helicobacter pylori
2025-Aug, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.10.012
PMID:39414226
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示幽门螺杆菌相关胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和微环境特征 | 首次构建了涵盖胃炎、肠上皮化生和胃癌的胃肿瘤发生单细胞图谱，揭示了不同细胞谱系的癌症相关表达特征和细胞间通讯网络 | 样本量相对有限（18例标本），需要在更大队列中验证发现 | 解析幽门螺杆菌驱动的胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和分子机制 | 人类胃组织标本（胃炎、胃肠上皮化生和胃癌） | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，免疫组化，qRT-PCR，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学数据，公共数据库数据 | 18例胃组织标本（胃炎、胃肠上皮化生和胃癌），另有人类胃组织验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2988 | 2025-10-06 |
TIMP1 Mediates Astrocyte-Dependent Local Immunosuppression in Brain Metastasis Acting on Infiltrating CD8+ T Cells
2025-Jan-13, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0134
PMID:39354883
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脑转移中TIMP1介导的星形胶质细胞对CD8+ T细胞的局部免疫抑制作用 | 首次揭示pSTAT3+星形胶质细胞通过分泌TIMP1调控CD63+ CD8+ T细胞功能的免疫抑制机制 | NA | 探究脑转移中星形胶质细胞介导的局部免疫抑制机制及治疗策略 | 脑转移模型中的星形胶质细胞和CD8+ T细胞 | 单细胞测序 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2989 | 2025-10-06 |
Pax3/7 gene function in Oikopleura dioica supports a neuroepithelial-like origin for its house-making Fol territory
2024-12, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.012
PMID:39181419
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9突变株和单细胞RNA测序分析，探讨了Oikopleura dioica中pax37A和pax37B基因在房室制造滤器区域发育中的功能 | 首次揭示pax37B（而非pax37A）对房室滤器细胞分化的特异性调控作用，并提出滤器区域分泌上皮细胞可能保留或进化了神经上皮特征的新假说 | 研究仅针对特定海洋生物模型，其结论在其他生物中的普适性仍需验证 | 探究Pax3/7基因在尾索动物房室制造上皮发育中的功能机制 | Oikopleura dioica（尾索动物）的房室制造上皮及其滤器细胞 | 发育生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型Oikopleura dioica个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2990 | 2025-10-06 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566719
PMID:38014231
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研究论文 | 本文提出了一种名为Decipher的深度生成模型，用于整合单细胞基因组学数据并表征细胞状态从正常到异常的转变 | 开发了能够联合建模和可视化正常与扰动条件下单细胞RNA-seq数据的深度生成模型，揭示共享和破坏的细胞动态 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征异常细胞状态轨迹 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2991 | 2025-10-06 |
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-Oct-22, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183984
PMID:39436695
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研究论文 | 本研究探讨1型糖尿病年轻成人患者肾脏氧化代谢减弱与糖尿病肾病发展的关系 | 首次在年轻1型糖尿病患者中结合多种先进技术评估肾脏氧化代谢，并通过单细胞RNA测序和空间代谢组学揭示肾小管细胞亚型分布与代谢功能障碍的关联 | 样本量相对较小（T1D组30人，对照组20人），研究结果需要在更大人群中验证 | 研究1型糖尿病患者胰岛素敏感性降低与肾脏氧化代谢改变对糖尿病肾病发展的影响 | 年轻1型糖尿病成人患者（n=30）和健康对照者（n=20） | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 11C-乙酸盐PET, MRI, 高胰岛素-正常血糖钳夹技术, 肾脏活检 | Slingshot算法, 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据, 代谢物数据, 影像数据, 临床数据 | 50人（30例1型糖尿病患者，20例健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 2992 | 2025-10-06 |
Integrative Multiomics in the Lung Reveals a Protective Role of Asporin in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-Oct-15, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 通过整合多组学方法揭示asporin在肺动脉高压中的保护作用 | 发现ASPN基因作为肺动脉高压中的关键枢纽基因，具有保护性作用 | 获取人类肺动脉高压肺样本较为困难 | 解析肺动脉高压的病理生物学机制 | 肺动脉高压患者肺组织样本和Sugen-缺氧大鼠模型 | 多组学整合分析 | 肺动脉高压 | 转录组分析、全基因组关联研究、贝叶斯调控网络、单细胞转录组学、药物转录组学 | 贝叶斯网络 | 转录组数据、临床病理数据 | 96例疾病样本和52例对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组分析 | NA | NA |
| 2993 | 2025-10-06 |
Identification of kidney cell types in scRNA-seq and snRNA-seq data using machine learning algorithms
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38567
PMID:39403515
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研究论文 | 本研究评估五种机器学习算法在肾脏单细胞和单核RNA测序数据中自动注释细胞类型的性能 | 首次系统比较五种监督分类方法在肾脏scRNA-seq和snRNA-seq数据中的细胞类型注释性能，并评估跨平台数据的泛化能力 | 活检样本数量有限，且scRNA-seq训练模型在snRNA-seq数据上表现较差 | 开发自动化的细胞类型注释方法以减少对领域专家知识和人工标注的依赖 | 肾脏细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 支持向量机, 随机森林, 多层感知机, k近邻, 极端梯度提升 | 基因表达数据 | 79个肾脏活检样本中的62,120个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2994 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 通过整合分析批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型并开发了CDR评分系统 | 首次探索膀胱癌中细胞分化相关基因的分子亚型及其预后意义，开发了基于9个基因的CDR评分系统 | 研究基于GEO数据库，样本来源有限，需要进一步临床验证 | 探索膀胱癌中细胞分化相关基因的分子亚型及其临床预后意义 | 膀胱癌患者样本数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, Lasso回归, Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 两个GEO单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2995 | 2025-10-06 |
Molecular pathology, developmental changes and synaptic dysfunction in (pre-) symptomatic human C9ORF72-ALS/FTD cerebral organoids
2024-09-18, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01857-1
PMID:39289761
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研究论文 | 本研究利用iPSC来源的脑类器官模型揭示了C9ORF72基因突变导致的ALS/FTD疾病早期分子病理和突触功能障碍 | 首次在3D人脑类器官模型中系统揭示了C9-ALS/FTD从无症状期到症状期的分子病理发展过程 | 无症状携带者的下游细胞缺陷检测结果存在个体差异 | 探究C9ORF72基因突变导致ALS/FTD疾病的早期病理机制 | C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的iPSC来源脑类器官 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化/额颞叶痴呆 | 单细胞RNA测序,膜片钳电生理学 | 脑类器官模型 | 基因表达数据,电生理数据 | C9-ALS/FTD患者、无症状携带者和对照组的多个人iPSC系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2996 | 2025-10-06 |
SuperFeat: Quantitative Feature Learning from Single-cell RNA-seq Data Facilitates Drug Repurposing
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae036
PMID:39401181
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研究论文 | 开发了一个名为SuperFeat的计算框架，通过单细胞RNA测序数据学习定量特征以促进药物重定位 | 提出了基于人工神经网络的监督特征学习与评分框架，能够评估病理组织中的典型细胞状态/特征并识别靶向这些特征的潜在药物 | NA | 开发计算框架促进药物重定位 | 单细胞RNA测序数据中的细胞特征 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2997 | 2025-10-06 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
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综述 | 本文综述了膀胱癌精准医学领域的新型治疗靶点与治疗策略的最新进展 | 重点关注抗体药物偶联物联合免疫疗法、克服化疗耐药性策略、基因组改变靶向及单细胞RNA测序在肿瘤微环境表征中的应用 | NA | 梳理膀胱癌肿瘤异质性复杂性，改善患者个体化治疗结果 | 膀胱癌患者 | 精准医学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2998 | 2025-10-06 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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综述 | 总结单细胞和空间组学技术在膀胱癌研究中的最新进展及其对治疗策略开发的潜在影响 | 通过单细胞和空间组学技术揭示了膀胱癌肿瘤微环境的复杂性和异质性，发现了多种恶性细胞亚群及其与治疗反应的关系 | 将研究发现转化为临床实践和实施个性化治疗策略仍面临挑战 | 理解膀胱癌生物学特征并开发新型治疗策略 | 膀胱癌肿瘤微环境、细胞异质性和治疗反应 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,空间组学 | NA | 转录组数据,空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2999 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of tumor-associated macrophages and M2 macrophages in CRC: unraveling molecular heterogeneity and developing a novel risk signature
2024-05-27, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01881-z
PMID:38802881
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据，开发了结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞和M2巨噬细胞的新型风险标志物 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据识别TAM-M2巨噬细胞相关基因，并构建了预后风险标志物TAMM2RS | 需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 发现结直肠癌中TAM-M2巨噬细胞相关的新型生物标志物并解析分子异质性 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, WGCNA, LASSO Cox分析, qPCR | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3000 | 2025-10-06 |
scRNA+TCR+BCR-seq revealed the proportions and gene expression patterns of dual receptor T and B lymphocytes in NPC and NLH
2024-05-21, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.149820
PMID:38547605
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研究论文 | 通过单细胞多组学测序揭示鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中双受体淋巴细胞的组成、克隆扩增及基因表达特征 | 首次在鼻咽癌和鼻咽淋巴增生中发现双受体淋巴细胞的存在，并证实其克隆扩增及谱系特征 | 样本量较小（7例NPC和3例NLH），需要更大规模研究验证 | 探究肿瘤微环境中双受体淋巴细胞的生物学特性和功能 | 鼻咽癌患者和鼻咽淋巴增生患者的淋巴细胞 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，TCR测序，BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 7例鼻咽癌患者和3例鼻咽淋巴增生患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞免疫组库测序 | NA | scRNA+TCR+BCR-seq技术 |