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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2981 | 2025-10-06 |
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-May, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09897-2
PMID:37796367
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研究论文 | 本研究探讨Notch配体在类风湿关节炎滑膜组织中的表达特征及其作为抗TNF治疗反应生物标志物的潜力 | 首次发现RA骨髓Notch配体可作为抗TNF治疗反应的标志物,并揭示其在FLS和内皮细胞中的转激活作用 | 研究样本量未明确说明,且主要基于转录组分析,缺乏蛋白质水平验证 | 阐明Notch通路在RA滑膜组织细胞中的功能意义及RA治疗对其表达的影响 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞,包括巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞和内皮细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,形态学研究,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2982 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Immune Landscape of CD4+ T Cells in Coronary Culprit Plaques With Acute Coronary Syndrome in Humans-Brief Report
2024-05, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320409
PMID:38572648
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性冠脉综合征患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的免疫景观特征 | 首次在单细胞水平揭示了ACS患者冠状动脉斑块中CD4+ T细胞的特性,发现了中央记忆CD4+ T细胞在ACS斑块中的比例升高及其分化轨迹 | 样本量较小(7例患者),仅分析了冠状动脉斑块中的免疫细胞 | 表征ACS患者冠状动脉斑块中T细胞的单细胞水平特征,评估T细胞克隆扩增,寻找预防ACS的治疗靶点 | 急性冠脉综合征和慢性冠脉综合征患者的冠状动脉斑块样本 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 7例患者(4例慢性冠脉综合征,3例急性冠脉综合征)的冠状动脉斑块样本,另加3例ACS斑块样本用于TCR分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
2983 | 2025-10-06 |
CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis
2024-Apr-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094865
PMID:38732082
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综述 | 本文聚焦中枢神经系统常驻先天免疫细胞在维持稳态及参与神经炎症和神经退行性疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序等先进技术区分了常驻与浸润免疫细胞,特别是边界相关巨噬细胞的表型谱系 | NA | 探讨中枢神经系统常驻先天免疫细胞在生理稳态和病理状态下的功能 | 中枢神经系统实质和非实质组织(脑膜、血管周隙、脉络丛)中的常驻免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,多参数流式细胞术,质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多参数流式细胞术,质谱流式细胞术 | NA | NA |
2984 | 2025-10-06 |
Multi-omics and immunogenomics analysis revealed PFKFB3 as a targetable hallmark and mediates sunitinib resistance in papillary renal cell carcinoma: in silico study with laboratory verification
2024-Apr-15, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01808-5
PMID:38622715
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研究论文 | 通过多组学和免疫基因组学分析揭示PFKFB3作为乳头状肾细胞癌的可靶向特征并介导舒尼替尼耐药性 | 构建了糖酵解-免疫预后指数(GIRPI)特征,首次发现PFKFB3在pRCC中的关键调控作用及其介导舒尼替尼耐药的机制 | 主要为计算机模拟研究,实验室验证有限,需要更多临床样本验证 | 阐明糖酵解特征在乳头状肾细胞癌中的调控功能及治疗抵抗机制 | 乳头状肾细胞癌细胞系和患者数据 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | WGCNA, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, siRNA, 细胞增殖和迁移实验 | 糖酵解-免疫预后指数(GIRPI)模型 | 基因组数据, 转录组数据, 实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
2985 | 2025-10-06 |
A Path to Persistence after EGFR Inhibition
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0274
PMID:38616658
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研究论文 | 本研究通过患者来源异种移植模型和单细胞RNA测序,揭示了EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼产生耐受性的机制 | 首次发现神经内分泌谱系转录因子ASCL1介导的药物耐受持久细胞转录簇,并揭示其通过触发上皮-间质转化程序促进药物耐受 | 表型可塑性机制尚未完全阐明,缺乏体内持久性模型 | 研究EGFR突变非小细胞肺癌对酪氨酸激酶抑制剂产生耐受性的分子机制 | EGFR突变非小细胞肺癌患者来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2986 | 2025-10-06 |
Identification of the role of DAB2 and CXCL8 in uterine spiral artery remodeling in early-onset preeclampsia
2024-Apr-13, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05212-4
PMID:38613672
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现DAB2和CXCL8在早发型子痫前期子宫螺旋动脉重塑中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示DAB2通过CXCL8/PI3K/AKT通路调控绒毛外滋养细胞与蜕膜血管平滑肌细胞间的通讯机制 | 研究主要基于体外细胞模型和胎盘-蜕膜共培养模型,需要进一步体内实验验证 | 探究早发型子痫前期中子宫螺旋动脉异常重塑的分子机制 | 早发型子痫前期患者和对照组的胎盘组织、HTR-8/SVneo细胞、人血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序、细胞培养、胎盘-蜕膜共培养模型 | 细胞模型、共培养模型 | 单细胞RNA测序数据、细胞表型数据 | 早发型子痫前期患者和对照组胎盘组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2987 | 2025-10-06 |
Single cell lineage tracing reveals clonal dynamics of anti-EGFR therapy resistance in triple negative breast cancer
2024-04-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01327-2
PMID:38605363
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研究论文 | 通过单细胞谱系追踪揭示三阴性乳腺癌对抗EGFR治疗耐药性的克隆动态 | 整合细胞条形码和单细胞转录组学重建EGFR扩增TNBC细胞的亚克隆动态,发现罕见的预存耐药亚群 | NA | 阐明三阴性乳腺癌对EGFR靶向治疗反应不一致的机制 | EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 细胞条形码, 深度学习 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2988 | 2025-10-06 |
Sorafenib inhibits ossification of the posterior longitudinal ligament by blocking LOXL2-mediated vascularization
2024-Apr-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00327-7
PMID:38594260
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示后纵韧带骨化的分子机制,发现LOXL2通过HIF1A通路调控韧带细胞的内皮样分化,并证实索拉非尼可有效抑制LOXL2介导的血管生成从而阻断骨化进程 | 首次在单细胞分辨率阐明OPLL的细胞演化过程,发现韧带干细胞具有内皮细胞样表型转化能力,并鉴定LOXL2为非酶活性依赖的新型调控因子 | 动物模型结果向临床转化的有效性仍需验证,LOXL2具体作用机制细节需进一步阐明 | 探索后纵韧带骨化的分子机制并寻找潜在治疗策略 | 后纵韧带组织样本、韧带干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 后纵韧带骨化 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 临床样本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2989 | 2025-10-06 |
Drug repositioning for immunotherapy in breast cancer using single-cell analysis
2024-Apr-08, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00359-z
PMID:38589404
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荟萃分析 | 本研究通过单细胞分析探索乳腺癌免疫治疗中的药物重定位策略 | 整合单细胞RNA测序数据与药物重定位方法,提出针对免疫调节肽的精准调控策略 | NA | 开发针对乳腺癌的免疫治疗新策略 | 人类乳腺上皮细胞(恶性与正常) | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 蛋白质水平检测 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
2990 | 2025-10-06 |
Itraconazole inhibits tumor growth via CEBPB-mediated glycolysis in colorectal cancer
2024-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16082
PMID:38278779
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研究论文 | 本研究揭示抗真菌药物伊曲康唑通过CEBPB介导的糖酵解途径抑制结直肠癌肿瘤生长 | 首次发现伊曲康唑通过CEBPB-ENO1轴调控糖酵解抑制结直肠癌生长,并鉴定CEBPB为伊曲康唑的新靶点 | 研究样本量较小(仅4只小鼠),临床验证数据有限 | 探究伊曲康唑对结直肠癌的抗肿瘤作用机制 | 结直肠癌细胞系、荷瘤小鼠模型和临床患者样本 | 癌症代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、靶向类器官测序 | 细胞系来源异种移植模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 4只小鼠肿瘤样本(治疗组与对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2991 | 2025-10-06 |
Calcified apoptotic vesicles from PROCR+ fibroblasts initiate heterotopic ossification
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12425
PMID:38594791
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研究论文 | 本研究首次发现PROCR+成纤维细胞分泌的钙化凋亡囊泡是异位骨化的起始因子 | 首次鉴定钙化凋亡囊泡作为异位骨化的起始因子,并阐明其通过钙富集和胶原结合导致肌腱钙化硬化的机制 | NA | 探究异位骨化的起始因素及其分子机制 | 异位骨化过程中的细胞群体和细胞外基质 | 单细胞转录组学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2992 | 2025-10-06 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cell activity during biofilm infection is regulated by a glycolysis/HIF1a axis
2024-Feb-29, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174051
PMID:38421730
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和代谢分析揭示了糖酵解/HIF1α轴在金黄色葡萄球菌生物膜感染中调控粒细胞性髓源抑制细胞免疫抑制功能的作用机制 | 首次发现糖酵解/HIF1α信号轴通过调控G-MDSCs代谢状态影响生物膜感染的慢性化进程 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩大 | 探究G-MDSCs代谢特征与金黄色葡萄球菌假体关节感染慢性化的关联机制 | 粒细胞性髓源抑制细胞(G-MDSCs)和金黄色葡萄球菌生物膜感染模型 | 免疫代谢学 | 假体关节感染 | 单细胞RNA测序, 生物信息学代谢算法, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | PJI患者粒细胞样本和小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2993 | 2025-10-06 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究通过基因组比对和计算结构建模系统分析了果蝇谱系特异性从头基因的起源、进化和蛋白质结构演化 | 首次结合高质量全基因组比对和计算结构建模方法,系统研究果蝇谱系特异性从头基因的蛋白质结构演化规律 | 研究主要基于计算预测和序列分析,缺乏实验验证蛋白质结构和功能 | 探究果蝇中从头基因的起源和结构演化机制 | 黑腹果蝇及其近缘种中的555个从头基因候选 | 基因组学 | NA | 全基因组比对,计算结构建模,单细胞RNA-seq,祖先序列重建 | 计算结构模型 | 基因组序列,转录组数据 | 555个从头基因候选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2994 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和多种机器学习模型揭示了树突状细胞在银屑病中的细胞相互作用,并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 首次发现树突状细胞通过CD70/CD27信号通路调控T细胞在银屑病炎症反应中的作用,并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索银屑病的发病机制并识别有价值的生物标志物 | 银屑病皮肤组织、树突状细胞、T细胞、HaCaT细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞测序, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 多种机器学习模型 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2995 | 2025-10-06 |
Deconvolution of synovial myeloid cell subsets across pathotypes and role of COL3A1+ macrophages in rheumatoid arthritis remission
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1307748
PMID:38601143
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,鉴定滑膜髓系细胞亚群并发现COL3A1+巨噬细胞在类风湿关节炎缓解中的潜在作用 | 首次发现COL3A1+巨噬细胞这一成纤维细胞样M2亚型在髓系病理型中富集,并揭示其通过表达抗炎因子、增强黏附和形成物理屏障缓解关节炎的机制 | 研究样本量有限(81例患者),且部分功能验证仍需进一步实验确认 | 探究单核/巨噬细胞亚群在类风湿关节炎活动中的作用及特定亚型在疾病缓解中的生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和髓系细胞亚群 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 多色免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化染色, 黏附实验, RT-qPCR | Liger整合算法, 反卷积分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 流式细胞数据, 图像数据 | 81例早期关节炎队列患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2996 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了肺腺癌免疫微环境图谱,并基于耗竭CD8+ T细胞建立预后模型 | 首次整合单细胞分析揭示肺腺癌免疫细胞动态特征,基于CD8_Tex-LAYN基因建立预后模型,并发现GALNT2作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(19例患者),需要在更大队列中验证模型的普适性 | 阐明肺腺癌免疫微环境特征并建立有效的预后预测模型 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞(CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、髓系细胞等) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,RT-PCR,细胞实验 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 19例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2997 | 2025-10-06 |
Analysis of cardiac single-cell RNA-sequencing data can be improved by the use of artificial-intelligence-based tools
2023-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32293-1
PMID:37100826
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研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的单细胞RNA测序数据分析工具包,用于改善心肌再生研究中的细胞类型识别和信号通路分析 | 将三种AI技术(自动编码、稀疏建模和半监督学习)整合到scRNAseq数据分析中,相比传统方法能发现更多生物学差异 | 研究仅使用了来自公共数据库的三个数据集,需要更多独立验证 | 提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和深度,以更好地理解心肌再生机制 | 小鼠和猪的心脏细胞,特别是心肌细胞亚群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 自动编码器, 稀疏建模, 半监督学习 | 基因表达数据 | 三个来自GEO数据库的scRNAseq数据集(包含小鼠和猪心脏细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2998 | 2025-10-06 |
Ensembles of endothelial and mural cells promote angiogenesis in prenatal human brain
2022-09-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.09.004
PMID:36179668
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研究论文 | 本研究揭示了产前人类大脑中内皮细胞和周细胞协同促进血管生成的新机制 | 首次在人类产前大脑中发现内皮细胞和周细胞亚型组成的功能性集合体,并揭示其通过胶原蛋白、层粘连蛋白和中动蛋白等信号机制促进血管成熟 | 研究主要聚焦于妊娠中期的发育阶段,缺乏对其他发育时期的比较分析 | 探索产前人类大脑血管细胞成熟阶段的分子机制和细胞相互作用 | 产前人类大脑血管系统中的内皮细胞和周细胞 | 单细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选, 单细胞转录组学, 组织学分析, 超微结构分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 妊娠中期人类大脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2999 | 2025-10-06 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析鉴定结直肠癌干细胞景观并发现干细胞相关基因ENY2 | 首次通过整合多组单细胞数据系统描绘结直肠癌干细胞景观,并发现ENY2作为新的干细胞相关生物标志物 | 样本量较小(仅9个原发结直肠癌样本),ENY2在结直肠癌中的研究有限 | 阐明结直肠癌干细胞异质性及其潜在机制 | 结直肠癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 9个原发结直肠癌样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
3000 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |