单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2981	2025-04-11	HMOX1-LDHB interaction promotes ferroptosis by inducing mitochondrial dysfunction in foamy macrophages during advanced atherosclerosis 2025-Apr-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.011 PMID:39731912	研究论文	本研究揭示了高级动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞铁死亡的细胞和分子机制，并提出了潜在的治疗策略	发现了HMOX1-LDHB相互作用通过诱导线粒体功能障碍促进泡沫巨噬细胞铁死亡的新机制	研究主要基于RNA测序数据，缺乏直接的体内实验验证	探究高级动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞死亡的机制	泡沫巨噬细胞	分子生物学	心血管疾病	bulk和单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
2982	2025-04-11	Comprehensive bioinformatics analysis identified HMGB3 as a promising immunotherapy target for glioblastoma multiforme 2025-Apr-07, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02235-6 PMID:40192954	研究论文	通过综合生物信息学分析，确定HMGB3作为多形性胶质母细胞瘤（GBM）的潜在免疫治疗靶点	首次将HMGB3识别为GBM中具有异质性和免疫抑制特性的分子，并探讨其作为精准治疗靶点的潜力	研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证	探索GBM发展的分子机制并寻找相关预后生物标志物	多形性胶质母细胞瘤（GBM）	生物信息学	多形性胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序，批量RNA-seq	NA	RNA测序数据	NA
2983	2025-04-11	Integrating multi-omics data reveals the antitumor role and clinical benefits of gamma-delta T cells in triple-negative breast cancer 2025-Apr-07, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-14029-8 PMID:40197136	research paper	该研究通过整合多组学数据，揭示了γδ T细胞在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤作用及其临床益处	首次全面评估γδ T细胞在乳腺癌中的作用，并建立了基于MRI的放射组学模型来预测γδ T细胞丰度	研究结果主要针对三阴性乳腺癌，对其他乳腺癌亚型的适用性尚不明确	探究γδ T细胞在乳腺癌中的作用及其临床价值	三阴性乳腺癌患者及其γδ T细胞	digital pathology	breast cancer	bulk and single-cell sequencing, radiomics, MRI, genomic analysis, immunohistochemistry	radiomic model	genomic data, imaging data, clinical data	未明确提及具体样本数量
2984	2025-04-11	Mitochondrial genetic landscape and its correlation with immune cell infiltration in preeclampsia: Insights from bioinformatics 2025-Apr-05, Journal of reproductive immunology IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.jri.2025.104527 PMID:40203595	研究论文	本研究通过生物信息学方法识别了与线粒体相关的基因（MRGs）及其在子痫前期（PE）中的可能调控机制，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关联	发现了五个关键的MRGs（MOCS1、CYP11A1、GATM、SFXN3和BCL2L11），这些基因对PE具有高诊断准确性，并与免疫细胞浸润相关，其中CYP11A1可能是HELLP综合征的潜在生物标志物	研究依赖于公开的基因表达数据集，可能受到样本量和数据质量的限制，且需要进一步的实验验证	探讨线粒体相关基因在子痫前期中的调控机制及其与免疫微环境的相互作用	子痫前期（PE）患者及其胎盘组织	生物信息学	子痫前期	LASSO回归分析、基因集富集分析（GSEA）、单细胞测序分析、免疫荧光染色	NA	基因表达数据	多个GEO数据集（GSE114691、GSE190971、GSE75010、GSE25906）
2985	2025-04-11	CXCL12/CXCR4 axis mediates CD8 + T cell overactivation in the progression of viral myocarditis 2025-Apr-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06394-6 PMID:40186195	研究论文	本研究探讨了CXCL12/CXCR4轴在病毒性心肌炎中如何介导CD8+T细胞的过度激活	揭示了CXCL12/CXCR4轴在驱动CD8+T细胞反应中的新作用，并提出了该轴作为心肌炎治疗的新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化需进一步验证	探究病毒性心肌炎中CD8+T细胞过度激活的分子机制	儿童外周血单个核细胞及病毒性心肌炎小鼠模型	免疫学	心肌炎	单细胞RNA测序、细胞删除与过继转移、CXCR4阻断	病毒性心肌炎小鼠模型	RNA测序数据、细胞功能实验数据	未明确说明样本数量，涉及儿童外周血单个核细胞及小鼠模型
2986	2025-04-11	NAALAD2 mutations disrupt the fate of photoreceptor cells and retinal pigment epithelial cells during early retinal development 2025-Apr-02, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2025.107724 PMID:40185296	研究论文	本文通过识别NAALAD2基因突变并利用小鼠模型，探讨了该突变与病理性近视发展的潜在联系	首次报道了NAALAD2基因突变与病理性近视的关联，并通过单细胞RNA测序揭示了突变对视网膜细胞组成和转录谱的影响	研究仅基于一个小鼠模型和一个中国家族，样本量有限	探讨NAALAD2基因突变与病理性近视发展的关系	NAALAD2基因突变小鼠模型和病理性近视患者家族	遗传学	近视	单细胞RNA测序	点突变敲入小鼠模型	基因表达数据	一个中国家族和相应的小鼠模型
2987	2025-04-11	S100A8/A9 innate immune signaling as a distinct mechanism driving progression of smoking-related breast cancers 2025-Apr, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03276-5 PMID:39856330	research paper	该研究揭示了S100A8/A9先天免疫信号作为吸烟相关乳腺癌进展的独特分子机制	发现了α7 nAChR-S100A8/A9-Syntaphilin免疫信号模块驱动尼古丁诱导的肿瘤进展，并将吸烟相关乳腺癌识别为一种独特的侵袭性亚型	研究主要关注吸烟相关乳腺癌，未涉及其他环境因素或遗传因素对乳腺癌进展的影响	探索吸烟如何通过先天免疫信号促进乳腺癌进展的分子机制	吸烟相关的乳腺癌细胞和患者样本	肿瘤免疫学	乳腺癌	scRNA-seq	NA	基因表达数据	未明确说明样本数量，但包括乳腺癌细胞和患者样本
2988	2025-04-11	MiR-146a engineered extracellular vesicles derived from mesenchymal stromal cells more potently attenuate ischaemia-reperfusion injury in lung transplantation 2025-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70298 PMID:40195092	研究论文	研究通过雾化递送工程化的人脐带间充质干细胞来源的细胞外囊泡（hucMSC-EVs）来减轻大鼠肺移植模型中的缺血再灌注损伤（IRI）	使用miR-146a修饰的hucMSC-EVs通过抑制NLRP3炎症小体激活来减轻IRI，并通过雾化递送实现非侵入性治疗	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人体中验证其效果	探索减轻肺移植中缺血再灌注损伤的新方法	大鼠肺移植模型和细胞冷保存再灌注模型	数字病理	肺移植相关疾病	Bulk-RNA测序、单细胞测序分析、免疫荧光和Western blot	大鼠原位肺移植模型	基因表达数据和蛋白质数据	NA
2989	2025-04-11	Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status 2025-Mar-27, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513 PMID:40203764	研究论文	该研究比较了单独使用pembrolizumab或与低剂量化疗联合使用对非小细胞肺癌（NSCLC）且身体状况较差患者的疗效	首次在身体状况较差的NSCLC患者中比较了pembrolizumab单独使用与联合低剂量化疗的疗效，并提供了长期生存数据	样本量较小（43名患者），且仅20名患者可评估反应，可能影响统计效力	评估pembrolizumab单独或联合低剂量化疗在身体状况较差的晚期NSCLC患者中的疗效和安全性	晚期非小细胞肺癌且ECOG评分为2的患者	肿瘤学	非小细胞肺癌	流式细胞术和单细胞测序	随机对照试验	临床数据和生物标志物数据	43名患者（每组20名可评估反应）
2990	2025-04-11	A Krüppel-like factor establishes cellular heterogeneity during schistosome tegumental maintenance 2025-Mar, PLoS pathogens IF:5.5Q1 DOI:10.1371/journal.ppat.1013002 PMID:40153400	研究论文	本研究探讨了Krüppel样因子4（klf4）在血吸虫皮层细胞异质性建立中的作用	首次揭示了klf4在血吸虫皮层相关细胞谱系（TRL）维持中的关键作用，及其对皮层细胞分子特性的精细调控	未完全阐明klf4下游调控网络的具体机制	解析血吸虫长期存活于宿主血液中的分子机制	曼氏血吸虫的皮层细胞及其前体细胞	寄生虫学	血吸虫病	RNA干扰（RNAi）、单细胞RNA测序（scRNAseq）和批量RNA测序（bulk RNAseq）	NA	RNA测序数据	NA
2991	2025-04-11	Modulation of cell fate by shock wave therapy in ischaemic heart disease 2025-Mar, European heart journal open DOI:10.1093/ehjopen/oeaf011 PMID:40201592	研究论文	研究探讨了心脏冲击波疗法（SWT）通过激活Toll样受体3（TLR3）促进心脏成纤维细胞向内皮细胞转分化，从而改善缺血性心肌病患者的左心室功能	首次揭示了SWT通过机械刺激激活TLR3信号通路，促进成纤维细胞向内皮细胞的转分化，并改善了心肌灌注和功能	研究主要基于体外实验和转基因小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究SWT如何通过TLR3激活改善缺血性心肌病的心功能	人类心脏成纤维细胞和转基因小鼠模型	心血管疾病	缺血性心肌病	单细胞RNA测序、RNA轨迹分析、染色质可及性测序（ATAC-seq）	转基因小鼠模型（Fsp1-Cre/LacZ）	RNA测序数据、染色质可及性数据	人类心脏成纤维细胞和转基因小鼠模型
2992	2025-04-11	Integrating mitochondrial and lysosomal gene analysis for breast cancer prognosis using machine learning 2025-01-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86970-4 PMID:39865118	research paper	该研究通过整合线粒体和溶酶体基因分析，利用机器学习开发预测模型，以改善乳腺癌患者的预后分层和个性化干预	首次结合线粒体和溶酶体共调控因子构建机器学习模型，并发现B细胞免疫浸润减少与mlMSGs活性增加是影响预后的关键因素	研究样本量未明确说明，且模型需进一步临床验证	开发乳腺癌预后预测模型并探索免疫微环境特征	乳腺癌患者及其相关基因数据	machine learning	breast cancer	scRNA-seq, CNV分析, SNPs分析, WGCNA, Cox回归	coxboost + Survivor-SVM	基因表达数据, 单细胞RNA测序数据	NA
2993	2025-04-11	The Role of Zuo Jin Wan in Modulating the Tumor Microenvironment of Colorectal Cancer 2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3 DOI:10.2174/0113862073281374231228041841 PMID:38284730	研究论文	探讨左金丸在调节结直肠癌肿瘤微环境中的作用	首次研究左金丸在结直肠癌免疫调节中的作用，揭示其通过调节多种细胞类型及下调TIMP1和MTDH表达来影响肿瘤微环境	研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证	探索左金丸对结直肠癌免疫微环境的调节作用	结直肠癌细胞、免疫细胞（T细胞、B细胞、肥大细胞等）及基质细胞	肿瘤免疫学	结直肠癌	单细胞RNA测序、RT-qPCR	NA	基因表达数据	基于已发表研究的单细胞RNA测序数据（PMID: 32451460, 32103181, 32561858）
2994	2025-04-11	Novel insights into Cntnap4 in Alzheimer's disease: Intestinal flora interaction 2025-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138508 PMID:39647729	研究论文	本研究探讨了Cntnap4基因在阿尔茨海默病中的作用及其与肠道菌群的相互作用	揭示了Cntnap4缺陷如何通过影响Tau蛋白磷酸化、淀粉样斑块积累和神经元损失加剧AD，并首次提出肠道菌群与AD进展的潜在联系	研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证	阐明Cntnap4在AD发病机制中的作用及肠道菌群的可能参与	AD模型小鼠及其肠道菌群	神经退行性疾病研究	阿尔茨海默病	scRNA-seq、高通量转录组测序、16s rRNA测序	动物模型	基因表达数据、微生物组数据	未明确说明数量的AD模型小鼠
2995	2025-04-11	Glucocorticoid receptor inhibits Th2 immune responses by down-regulating Pparg and Gata3 in schistosomiasis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1518586 PMID:40196108	研究论文	研究糖皮质激素受体（GR）激活对血吸虫病中Th2免疫反应的影响	揭示了GR激活通过下调Gata3和Pparg抑制Th2免疫反应的新机制	需要进一步研究靶向GR激活治疗血吸虫病的可行性和安全性	探究GR激活对血吸虫病中Th2免疫反应的潜在影响	血吸虫感染的小鼠和体外培养的Th2细胞	免疫学	血吸虫病	RNA测序和单细胞测序	NA	基因表达数据	血吸虫感染的小鼠和体外培养的Th2细胞
2996	2025-04-11	A tumor-infiltrating B lymphocytes -related index based on machine-learning predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1524120 PMID:40196113	研究论文	本研究基于机器学习方法开发了一个与肿瘤浸润B淋巴细胞相关的指数（BRI），用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应	首次系统地描述了肺腺癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的特征，并利用十种不同算法开发了BRI指数	研究结果需要更多独立队列验证，且BRI与CD8+ T细胞浸润的负相关机制尚不明确	开发预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物	肺腺癌患者和肿瘤微环境中的免疫细胞	数字病理	肺癌	单细胞RNA测序	机器学习（十种算法组合）	基因表达数据	TCGA、GSE31210、GSE72094等多个数据集
2997	2025-04-11	Immune cells differentiation in osteoarthritic cartilage damage: friends or foes? 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1545284 PMID:40201177	综述	本文综述了骨关节炎(OA)中免疫细胞分化的复杂作用及其在疾病进展中的双重角色	深入分析了OA中免疫细胞亚群的组成、分布和功能异质性，并比较了OA与类风湿关节炎(RA)在诊断和免疫治疗上的异同	未涉及具体实验验证，主要基于现有文献分析	阐明OA关节中免疫细胞的动态变化和相互作用，为未来临床精准靶向干预提供理论基础	骨关节炎(OA)中的免疫细胞亚群	免疫学	骨关节炎	单细胞测序和免疫组学技术	NA	NA	NA
2998	2025-04-11	Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1549206 PMID:40201184	研究论文	本研究通过免疫组织化学、批量RNA测序和单细胞RNA测序等方法，探讨了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征及其对传播和病理的影响	揭示了表皮TLR通过MYD88感知对梅毒感染宿主反应的贡献，突出了梅毒螺旋体在皮肤中逃避免疫反应的机制	研究主要基于皮肤活检样本，可能无法全面反映全身免疫反应	研究二期梅毒的免疫浸润特征及其对传播和病理的影响	二期梅毒患者的皮肤活检样本、健康个体的PBMCs以及原代或MyD88敲除的角质形成细胞	免疫学	梅毒	免疫组织化学(IHC)、批量RNA测序、单细胞RNA测序	NA	组织样本、RNA测序数据	二期梅毒患者的皮肤活检样本、健康个体的PBMCs
2999	2025-04-11	Single-cell RNA sequencing advances in revealing the development and progression of MASH: the identifications and interactions of non-parenchymal cells 2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2025.1513993 PMID:40201243	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示代谢相关脂肪性肝炎（MASH）发展和进展中的作用，特别是非实质细胞（NPCs）的鉴定和相互作用	利用单细胞转录组测序技术深入理解非实质细胞在MASH中的异质性和细胞间相互作用，为疾病机制和潜在药物靶点提供新见解	综述性质，未涉及具体实验数据或新发现	探讨单细胞RNA测序技术在MASH研究中的应用，揭示非实质细胞的作用	代谢相关脂肪性肝炎（MASH）中的非实质细胞（如Kupffer细胞、肝星状细胞和肝窦内皮细胞）	数字病理学	代谢相关脂肪性肝炎	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
3000	2025-04-11	Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal the evolution of glucose metabolism in hepatocellular carcinoma and identify G6PD as a potential therapeutic target 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1553722 PMID:40201344	研究论文	本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演变，并验证了G6PD作为潜在治疗靶点	首次从时空角度解析肝细胞癌中葡萄糖代谢的变化，并实验验证G6PD在调控癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用	样本量相对较小（7例单细胞测序样本和4例空间转录组样本）	探索肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演变并寻找潜在治疗靶点	肝细胞癌组织及癌旁组织	数字病理学	肝细胞癌	单细胞测序、空间转录组学(ST)、高通量测序、伤口愈合实验、CCK-8实验、transwell实验	NA	单细胞测序数据、空间转录组数据	7例HCC及癌旁组织的单细胞测序数据，4例HCC组织的空间转录组数据