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当前共找到 32476 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-11-10 |
Identification of immunogenic cell death signature genes in hepatocellular carcinoma: from single-cell transcriptomics to in vitro mechanistic validation and comprehensive prognostic modeling with hundreds of machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649618
PMID:41200185
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和多组学数据，识别肝细胞癌中的免疫原性细胞死亡特征基因，并构建预后模型 | 首次在肝细胞癌中系统表征免疫原性细胞死亡特征，整合单细胞和批量转录组数据，并通过数百种机器学习算法优化预后模型 | 研究样本量相对有限，需要前瞻性临床验证 | 开发肝细胞癌免疫治疗的可靠预后生物标志物和精准分层模型 | 肝细胞癌患者样本和HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 机器学习, 功能验证实验 | 多种机器学习算法, ssGSEA, WGCNA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 7个HCC样本(44,461个细胞), 三个独立队列(TCGA-HCC 371例, GSE14520 242例, ICGC 445例) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 282 | 2025-11-10 |
Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663251
PMID:41200203
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示肾移植排斥早期免疫景观并鉴定Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘肾移植急性排斥早期免疫细胞动态变化，发现Isg15+巨噬细胞亚群通过Ccl3-Ccr5轴激活T细胞的关键机制 | 研究基于大鼠模型，临床转化需进一步验证；样本时间点有限（仅0,1,3,7天） | 阐明肾移植急性排斥早期的免疫细胞动态和细胞间通讯网络 | 大鼠肾移植模型中的CD45+免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 治疗干预实验 | 无监督聚类, 细胞轨迹推断, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 大鼠肾移植后第0,1,3,7天的CD45+免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-11-10 |
CD44 and CLDN3 as immune-metabolic regulators in acute pancreatitis: a multi-modal transcriptomics study and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665200
PMID:41200201
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研究论文 | 本研究通过多模态转录组学分析和实验验证，揭示了CD44和CLDN3作为急性胰腺炎中免疫代谢调控关键生物标志物的作用 | 首次发现CD44和CLDN3是胰腺腺泡细胞与免疫细胞间免疫代谢失调的关键生物标志物，并揭示了CLDN3在mRNA和蛋白水平表达不一致的现象 | 研究样本量有限，主要基于公共数据集和动物模型验证，需要进一步临床研究确认 | 探索急性胰腺炎中免疫代谢调控的关键分子机制 | 急性胰腺炎小鼠模型和公共转录组数据集 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序，单细胞RNA测序，机器学习算法，免疫组织化学 | 三种机器学习算法，单样本基因集富集分析 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 多个公共数据集（GSE65146，GSE109227，GSE279876）和动物模型 | NA | 转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 284 | 2025-11-10 |
DOCK3 orchestrates metastasis and immune microenvironment in prostate cancer
2025, Frontiers in urology
DOI:10.3389/fruro.2025.1662692
PMID:41200217
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境重塑中的关键作用 | 首次系统阐明DOCK3在前列腺癌中协调转移和免疫微环境的双重功能，发现其与肿瘤突变负荷和细胞毒性免疫细胞浸润的显著关联 | 研究主要基于计算分析和现有数据库，缺乏实验验证DOCK3功能机制 | 探究DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境中的作用 | 前列腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因组分析 | DESeq2, CIBERSORT, ssGSEA, xCell, WGCNA, Harmony, UMAP | 基因表达数据, 单细胞数据, 基因组数据 | TCGA-PRAD: 499个肿瘤/52个正常样本; GEO单细胞数据: 45,325个细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Potential Mechanism of RUNX3 Reshaping Tumor Microenvironment in Non-small-cell Lung Cancer
2025-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18034-w
PMID:40916017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了RUNX3在非小细胞肺癌中重塑肿瘤微环境的潜在机制 | 首次在单细胞水平上系统分析RUNX3表达状态对非小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探索RUNX3在非小细胞肺癌中调控肿瘤微环境的具体生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织 | 单细胞测序分析 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | Seurat分析流程 | 单细胞转录组数据 | 7例非小细胞肺癌患者，包含3对癌和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2025-11-09 |
Tumor-derived CCL5 recruits CCR1+ macrophages to suppress apoptosis and drive proliferation in duodenal adenocarcinoma
2025-Dec-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218064
PMID:41015267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了十二指肠腺癌中肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞抑制细胞凋亡并促进增殖的机制 | 首次在十二指肠腺癌中发现肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞并抑制凋亡的免疫逃逸机制 | 研究样本量有限且为罕见胃肠道恶性肿瘤 | 阐明十二指肠腺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 | 十二指肠腺癌患者原发肿瘤组织及匹配的癌旁正常组织 | 单细胞测序分析 | 十二指肠腺癌 | 单细胞RNA测序, 患者来源类器官培养, 功能实验, 批量转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 十二指肠腺癌患者原发肿瘤和匹配正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 287 | 2025-11-09 |
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70405
PMID:41204708
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态 | 首次揭示高HBsAg母亲所生新生儿存在持续的先天免疫激活和促炎症状态，即使疫苗接种后产生抗体反应 | 样本量有限，仅比较了高和低HBsAg两组母亲的新生儿 | 研究母体HBsAg水平对新生儿免疫发育和乙肝疫苗接种反应的影响 | 高和低HBsAg母亲所生新生儿的PBMCs | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞多组学测序,免疫表型分析 | Seurat R包 | 单细胞转录组数据,表面标志物表达数据 | 两组新生儿（低HBsAg组和高HBsAg组） | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-11-09 |
Integrative single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies glycosyltransferases-related signature in triple negative breast cancer
2025-Nov-08, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01729-4
PMID:41203941
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq分析识别三阴性乳腺癌中糖基转移酶相关特征 | 首次结合单细胞和bulk RNA-seq数据构建糖基转移酶相关基因特征，并验证其在肿瘤微环境中的作用 | 使用公开数据集，缺乏独立验证队列 | 识别三阴性乳腺癌中糖基转移酶的分子靶点，提高预后准确性和免疫治疗效果 | 三阴性乳腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,CCK-8细胞活力检测,划痕愈合实验,Transwell迁移侵袭实验 | 风险模型,基因特征模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 289 | 2025-11-09 |
LCN2 drives ferroptosis-associated ischemia-reperfusion injury after renal transplantation: integrated machine learning and in vivo validation
2025-Nov-08, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02182-1
PMID:41205031
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和体内验证，揭示了脂质运载蛋白-2(LCN2)在肾移植缺血再灌注损伤中驱动铁死亡的关键作用 | 首次将LCN2确定为移植相关肾缺血再灌注损伤中铁死亡和免疫失调的关键介质，并开发了基于六基因的机器学习预测模型 | 研究主要基于动物模型和有限的人类队列，需要进一步临床验证 | 探索LCN2在肾移植缺血再灌注损伤中的作用机制和潜在治疗价值 | 小鼠缺血再灌注损伤模型和人类肾移植患者队列 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 转录组测序，单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，机器学习算法 | 逻辑回归，随机森林，集成模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 小鼠数据集83个样本，人类队列212个样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 290 | 2025-11-09 |
Interplay of Molecular Subtypes Associated with Butyrate Metabolism Elucidates Clinical Characteristics and Tumor Microenvironment in Prostate Cancer
2025-Nov-08, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05476-x
PMID:41205043
|
研究论文 | 本研究通过分析前列腺癌患者的分子亚型与丁酸盐代谢的相互作用，揭示了其与临床特征和肿瘤微环境的关联 | 首次基于丁酸盐代谢相关基因将前列腺癌分为两个分子亚型，并发现FOS-miR-27b轴在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明丁酸盐代谢在前列腺癌发生发展中的分子机制及其临床意义 | 前列腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析,机器学习,荧光素酶报告实验,qRT-PCR,FISH | RSF+GBM集成学习模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的前列腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2025-11-09 |
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327060
PMID:41090219
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统描绘了心脏衰老过程中的微环境变化，并识别出血管相关细胞生态位作为衰老的关键热点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类心脏组织中验证 | 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 | 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 292 | 2025-11-09 |
Smoking-Induced STC2+ Tumor Cells Drive Tumor-Vascular Crosstalk in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma via Spatial and Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511932
PMID:41203580
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示吸烟相关喉鳞状细胞癌中STC2+肿瘤细胞通过调控血管通透性促进肿瘤进展的机制 | 首次发现STC2在吸烟相关LSCC中的双峰分化特征及其通过TGFBI-ITGA5轴介导肿瘤-血管相互作用的新机制 | 研究样本量有限，机制验证主要依赖体外实验，需要更多临床样本验证 | 探索吸烟相关喉鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性及肿瘤-血管相互作用机制 | 吸烟相关喉鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 293 | 2025-11-09 |
Monod: model-based discovery and integration through fitting stochastic transcriptional dynamics to single-cell sequencing data
2025-Nov-07, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02832-x
PMID:41203866
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研究论文 | 提出了一种基于物理模型的方法Monod，通过拟合随机转录动力学来分析单细胞测序数据 | 利用单细胞RNA测序数据的随机性、规模和 multimodal 特性，在生物物理转录模型下整合新生和成熟RNA计数 | NA | 揭示基础调控过程并区分单细胞测序数据的生物学和技术层面 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机转录动力学模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 294 | 2025-11-09 |
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-Nov-07, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01144-7
PMID:41203872
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了2型糖尿病冠状动脉微循环和心肌组织的转录组特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统分析了2型糖尿病冠状动脉微血管疾病的分子特征和基因表达谱 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病冠状动脉微血管疾病的转录组差异和分子机制 | 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和心肌组织 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 295 | 2025-11-09 |
Single-cell transcriptomics of the myeloid milieu reveals an angiogenic niche in triple-negative breast cancer
2025-Nov-07, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01571-5
PMID:41203997
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据揭示三阴性乳腺癌中髓系细胞异质性及其在血管生成微环境形成中的作用 | 首次系统描绘TNBC髓系细胞图谱，发现VEGFA中性粒细胞和SPP1巨噬细胞亚型在缺氧区域共定位形成血管生成微环境 | NA | 阐明三阴性乳腺癌中髓系细胞微环境的组成和功能 | 三阴性乳腺癌患者的髓系细胞（中性粒细胞和单核吞噬细胞） | 单细胞转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 整合内部和公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 296 | 2025-11-09 |
RGS Proteins: Potential Regulators of Mouse Melanopsin's Signaling Phototransduction Cascade Across ipRGC Subtypes
2025-Nov-07, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.11.006
PMID:41204666
|
研究论文 | 本研究探讨了RGS蛋白如何调节小鼠黑视蛋白在不同ipRGC亚型中的信号转导级联 | 首次发现ipRGC亚型选择性富集特定RGS蛋白，揭示了单个GPCR在不同细胞类型中启动不同信号转导级联的潜在机制 | 研究主要基于异源表达系统和单细胞转录组分析，需要在更多生理条件下验证 | 探索单个GPCR在不同ipRGC亚型中启动不同信号转导级联的分子机制 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs)亚型 | 分子神经生物学 | NA | 单细胞转录组学, RNAscope, 异源表达系统, DREADD技术 | NA | 转录组数据, 图像数据, 电生理数据 | 小鼠视网膜ipRGC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 297 | 2025-11-09 |
Exploring the prognostic value of T cell exhaustion and mitochondrial dysfunction related genes in breast cancer through bioinformatics analysis and RT-qPCR validation
2025-Nov-06, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01888-5
PMID:41193924
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和RT-qPCR验证探索T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因在乳腺癌中的预后价值 | 首次整合T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因构建乳腺癌预后模型，并通过单细胞转录组分析揭示免疫微环境特征 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 识别乳腺癌中与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的预后基因并构建预后模型 | 乳腺癌患者肿瘤组织和正常组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析，RT-qPCR，单细胞转录组分析 | 回归分析，Cox回归分析，风险模型 | 转录组数据，临床数据 | 未明确样本数量，基于公共数据库的肿瘤和正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2025-11-09 |
Spatial and functional dissection of cancer-associated fibroblasts-mediated immune modulation in H. pylori-associated gastric cancer
2025-Nov-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02490-9
PMID:41194113
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA-seq分析，揭示了幽门螺杆菌相关胃癌中癌症相关成纤维细胞的空间分布和免疫调节功能 | 首次系统解析了幽门螺杆菌阳性胃癌中CAF亚型的空间分布特征及其通过WNT5-FZD相互作用和ZFP36介导的FN1 mRNA稳定性调控免疫抑制的新机制 | 研究样本量相对有限（71例GC患者），且主要基于回顾性队列分析 | 阐明癌症相关成纤维细胞在幽门螺杆菌相关胃癌中的空间组织和免疫调节功能 | 胃癌患者的肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,LACE-seq,CIBERSORT-ABS,Kaplan-Meier分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,临床数据 | 71例GC患者肿瘤组织，整合三个独立队列（中国、美国、新加坡）数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2025-11-09 |
Endothelial circadian rhythm genes as prognostic modulators of tumor progression and immune interactions: insights from pan-cancer single-cell rna sequencing
2025-Nov-06, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003848
PMID:41202314
|
研究论文 | 通过泛癌单细胞RNA测序分析内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤进展和免疫相互作用中的预后调控作用 | 首次系统研究内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤微环境中的失调及其临床意义，建立了基于昼夜节律相关基因的预后风险模型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探究内皮细胞昼夜节律基因在多种癌症中的失调及其临床意义 | 多种癌症类型的单细胞RNA测序数据，包括肝细胞癌和乳腺癌 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序，LASSO回归，生存分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据，临床预后数据 | 15个独立数据集，来自Tumor Immune Single-cell Hub数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-11-09 |
Single-cell profiling unveils the immuno-favorable tumor microenvironment remodeling after successful neoadjuvant therapy for advanced gallbladder cancer
2025-Nov-06, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003883
PMID:41202319
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示晚期胆囊癌新辅助治疗后肿瘤微环境的免疫有利重塑 | 首次在晚期胆囊癌中系统揭示新辅助 chemo-immunotherapy 通过促进滤泡辅助T细胞和三级淋巴结构形成重塑肿瘤微环境的机制 | 样本量有限，仅分析了成功降期患者的肿瘤微环境 | 评估新辅助 chemo-immunotherapy 在晚期胆囊癌中的疗效并探究肿瘤微环境变化机制 | 晚期胆囊癌患者 | 单细胞分析 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 成功降期的晚期胆囊癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |