单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28977 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-06-19 |
Analysis of Hyperexpanded T Cell Clones in SARS-CoV-2 Vaccine-Associated Liver Injury by Spatial Proteomics and Transcriptomics
2025-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70172
PMID:40522253
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research paper | 通过空间蛋白质组学和转录组学分析SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤中的超扩增T细胞克隆 | 使用新型组合多重免疫荧光(mIF)-RNA原位杂交(RISH)方法和单细胞空间转录组学技术，在单细胞水平定位和表征超扩增CD8+ T细胞克隆 | 研究仅基于一名严重SVALI患者的肝脏样本，样本量有限 | 表征SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤(SVALI)中的免疫浸润特征 | 一名严重SVALI患者的肝脏样本中的T细胞克隆 | digital pathology | liver injury | T cell receptor sequencing, multiplex immunofluorescence (mIF)-RNA in situ hybridisation (RISH), single cell spatial transcriptomics (Xenium in situ platform) | NA | spatial proteomics and transcriptomics data | 1名患者的肝脏样本 |
| 282 | 2025-06-19 |
Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes
2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426339122
PMID:40526717
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研究论文 | 该研究揭示了Sp140L作为一种疱疹病毒限制因子，通过抑制病毒转录和激活干扰素刺激基因来发挥作用 | 首次发现Sp140L作为一种限制因子，能够连接病毒DNA的感知和转录抑制，与干扰素无关的先天免疫反应相关 | 研究主要关注EBV病毒，对其他疱疹病毒的普遍性需要进一步验证 | 探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制，特别是EBNA-LP蛋白在其中的作用 | EBV病毒感染的B细胞 | 病毒学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | EBNA-LP敲除（LPKO）感染的B细胞 |
| 283 | 2025-06-19 |
[Integrating single-cell analysis and epharmalib reverse virtual screening to predict novel vascular endothelial cell targets of dapagliflozin in treating diabetic cardiomyopathy]
2025-Jun-24, Zhonghua xin xue guan bing za zhi
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和ePharmaLib反向虚拟筛选技术，预测达格列净在治疗糖尿病心肌病中的血管内皮细胞新靶点 | 结合单细胞RNA测序和反向虚拟筛选技术，首次系统性地探索了达格列净在糖尿病心肌病中对内皮细胞异质性的影响及其潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究糖尿病心肌病中内皮细胞异质性并鉴定达格列净在心脏血管内皮细胞中的潜在治疗靶点 | 糖尿病心肌病小鼠模型和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ePharmaLib反向虚拟筛选、微阵列芯片分析、Western blot、实时逆转录聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 野生型小鼠和db/db小鼠（糖尿病心肌病模型）的单细胞RNA测序数据，高脂饮食并接受达格列净治疗的小鼠心脏组织芯片数据，人脐静脉内皮细胞体外实验 |
| 284 | 2025-06-19 |
Ginsenoside Compound K Mitigates Mitochondrial Fission Through Bile Acid Receptors/YAP Signaling to Counteract Podocyte Injury in Lupus Nephritis
2025-Jun-18, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.8492
PMID:40528637
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研究论文 | 本研究探讨了人参皂苷化合物K（CK）通过胆汁酸受体/YAP信号通路减轻线粒体分裂，从而对抗狼疮性肾炎中的足细胞损伤 | 揭示了CK通过调节胆汁酸受体-YAP轴来抑制线粒体过度分裂的新机制，为狼疮性肾炎提供了潜在的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证 | 探究CK在狼疮性肾炎中保护足细胞的分子机制 | MRL/lpr小鼠和体外培养的足细胞 | 分子生物学与肾脏病学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、代谢组学分析、体外实验 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | MRL/lpr小鼠（具体数量未明确说明）和体外培养的足细胞 |
| 285 | 2025-06-19 |
Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属性巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的关键作用 | 首次证明脾脏CD169+Tim4+边缘金属性巨噬细胞对心肌梗死后促消退和修复反应的必要性，并展示了其治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅涉及循环单核细胞的观察 | 探究心肌梗死后伤口愈合的细胞机制 | 脾脏CD169+Tim4+边缘金属性巨噬细胞及其在心肌梗死后的功能 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、谱系追踪、细胞追踪、脾切除术、联体共生、细胞过继转移 | 小鼠心肌梗死模型 | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据、功能表征数据 | 小鼠模型和人类ST段抬高型心肌梗死患者与稳定型冠心病对照组的血液样本 |
| 286 | 2025-06-19 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Jun-17, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
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研究论文 | 该研究通过单细胞和批量转录组分析，识别了B细胞亚群及其相关的癌症亚型，并揭示了这些亚群在临床和分子特征上的差异 | 整合了14个单细胞RNA测序数据集，识别了8个B细胞亚群，并构建了预测癌症预后和免疫治疗反应的模型 | 研究仅基于转录组数据，未涉及蛋白质水平或其他功能实验验证 | 研究B细胞亚群在泛癌中的临床和分子特征及其对癌症预后和免疫治疗反应的影响 | B细胞亚群及其相关的癌症亚型 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq, 空间转录组分析 | 预测模型 | 转录组数据 | 102,504个细胞来自424名患者，涵盖15种癌症类型 |
| 287 | 2025-06-19 |
Identification of an immunomodulatory lncRNA signature associated with immune cell reprogramming in high-grade glioma
2025-Jun-17, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00919-3
PMID:40527978
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研究论文 | 本研究通过分析两种小鼠模型中的长链非编码RNA（lncRNA），揭示了其在高级别胶质瘤免疫微环境中的调控作用 | 首次鉴定出与高级别胶质瘤免疫抑制和促炎微环境相关的lncRNA特征，并揭示了这些lncRNA在免疫细胞中的空间分布 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证这些发现 | 探索lncRNA在高级别胶质瘤免疫微环境重塑中的作用 | 高级别胶质瘤及其免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | RCAS-PDGFb和RCAS-BRAF V600E小鼠模型 | 转录组数据 | 两种小鼠模型和GBM患者样本 |
| 288 | 2025-06-19 |
Clonal sharing of CD8+ T-cells links skin and joint inflammation in psoriatic arthritis
2025-Jun-17, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43286
PMID:40528683
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，探讨了银屑病关节炎（PsA）患者皮肤和关节炎症中CD8+ T细胞的表型和克隆性联系 | 首次揭示了皮肤和关节炎症中CD8+ T细胞的克隆共享现象，并发现这些细胞在两个部位具有相似的细胞毒性和组织驻留表型 | 样本量较小（仅6例皮肤样本和5例配对滑膜组织/滑液样本），且空间转录组学数据仅来自1例配对样本 | 验证银屑病关节炎患者皮肤和关节炎症在CD8+ T细胞表型和克隆性方面存在联系的假设 | 银屑病关节炎患者的皮肤和关节组织中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 银屑病关节炎 | scRNAseq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 6例皮肤样本，5例配对滑膜组织/滑液样本，1例配对皮肤和滑膜活检样本，4例非配对活检样本 |
| 289 | 2025-06-19 |
Targeting the cholinergic-astrocyte axis: A novel strategy for brain metastasis prevention in lung adenocarcinoma
2025-Jun-16, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217870
PMID:40516905
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研究论文 | 本研究探讨了胆碱能代谢在肺腺癌脑转移中的作用，并提出了针对胆碱能-星形胶质细胞轴的新预防策略 | 首次揭示了胆碱能代谢通过双重促转移机制（免疫抑制和血脑屏障破坏）促进脑转移，并发现AChE抑制剂多奈哌齐具有显著的预防效果 | 研究样本量相对有限（875例RNA测序数据和280例组织微阵列验证），且机制研究主要基于体外实验 | 探索肺腺癌脑转移的发病机制并开发预防策略 | 肺腺癌患者及其脑转移病灶 | 肿瘤学 | 肺腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、组织微阵列 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 875例RNA测序病例和280例组织微阵列验证病例，以及26个脑转移灶和8个正常脑样本的单细胞RNA测序 |
| 290 | 2025-06-19 |
Single-cell multi-omics reveals that FABP1 + renal cell carcinoma drive tumor angiogenesis through the PLG-PLAT axis under fatty acid reprogramming
2025-Jun-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02377-9
PMID:40518526
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research paper | 该研究通过单细胞多组学分析揭示了FABP1+肾细胞癌通过PLG-PLAT轴在脂肪酸重编程下驱动肿瘤血管生成的机制 | 发现了FABP1+肿瘤亚群通过PLG-PLAT功能轴促进血管生成的新机制，并提出了靶向该轴可能增强酪氨酸激酶抑制剂治疗敏感性的潜在策略 | 研究结果主要基于单细胞和空间转录组学分析，需要更多体内外实验验证 | 探究肾细胞癌中脂肪酸代谢重编程与肿瘤血管生成的关系 | FABP1+肾细胞癌亚群及其与内皮细胞的相互作用 | 肿瘤生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞多组学分析、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量，涉及肾细胞癌患者样本和临床前模型 |
| 291 | 2025-06-19 |
Role of local complement activation in kidney fibrosis and repair
2025-Jun-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188345
PMID:40519169
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review | 本文综述了局部补体激活在肾脏纤维化和修复中的作用 | 强调了局部补体激活在肾脏疾病中的致病作用及其作为治疗靶点的潜力 | 主要基于动物模型研究，人类临床数据有限 | 探讨局部补体激活在肾脏纤维化和修复中的作用 | 肾脏疾病（肾小球和肾小管间质疾病） | NA | 慢性肾脏病（CKD） | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | 动物模型和人类肾脏活检样本 |
| 292 | 2025-06-19 |
From inserts to chips: microfluidic culture and 3D astrocyte co-culture drive functional and transcriptomic changes in hiPSC-derived endothelial cells
2025-Jun-16, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-025-00672-7
PMID:40524169
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research paper | 该研究探讨了不同培养平台如何改变hiPSC衍生的内皮细胞（ECs）的功能和转录组表型 | 使用微流控BBB芯片平台（AKITA plate）和hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养系统，研究了其对ECs功能和转录组的影响 | 需要进一步研究这些复杂细胞培养系统的特性 | 改进疾病模型和药物开发平台 | hiPSC衍生的内皮细胞（ECs）和星形胶质细胞 | 生物医学工程 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 微流控BBB芯片平台（AKITA plate） | 转录组数据 | NA |
| 293 | 2025-06-19 |
Exploring T-cell metabolism in tuberculosis: development of a diagnostic model using metabolic genes
2025-Jun-16, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02768-0
PMID:40524207
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结核病患者外周血单个核细胞，开发基于代谢基因的诊断模型 | 首次利用T细胞相关代谢差异表达基因构建结核病诊断模型，并揭示免疫代谢重编程在结核病进展中的关键作用 | 样本量较小（仅7人），需要更大规模验证 | 阐明活动性结核与潜伏感染免疫调控机制，开发新型诊断方法 | 结核病患者外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理 | 结核病 | scRNA-seq | XGBoost, SVM-RFE, Boruta | RNA测序数据 | 7人（2健康对照+2潜伏感染+3活动性结核） |
| 294 | 2025-06-19 |
Cancer-associated fibroblasts promote drug resistance in ALK-driven lung adenocarcinoma cells by upregulating lipid biosynthesis
2025-Jun-16, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-025-00400-7
PMID:40524253
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research paper | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过上调脂质生物合成促进ALK驱动的肺腺癌细胞对药物产生耐药的机制 | 揭示了CAFs通过重编程脂质代谢促进ALK-TKIs耐药的分子网络，并提出通过靶向脂质代谢或诱导铁死亡来克服耐药的新治疗策略 | 研究主要基于3D球体共培养模型，尚未在体内模型或临床样本中验证 | 探究CAFs驱动的分子网络如何影响ALK驱动肺腺癌细胞的治疗敏感性 | ALK重排肺腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 肿瘤微环境 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，3D球体共培养 | 3D球体共培养模型 | 基因表达数据 | NA |
| 295 | 2025-06-19 |
Macrophages Atp6v0d2 regulates XBP1-mediated cholesterol metabolism to suppress metabolic dysfunction-associated steatohepatitis progression
2025-Jun-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115088
PMID:40526981
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research paper | 本研究揭示了巨噬细胞中Atp6v0d2通过调节XBP1介导的胆固醇代谢抑制代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）进展的关键作用 | 首次发现巨噬细胞特异性基因Atp6v0d2通过XBP1/内质网应激通路调控胆固醇代谢和巨噬细胞表型转换，并阐明了其通过Trem2+巨噬细胞胞葬作用影响MASH进展的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 阐明Atp6v0d2在MASH发病中的功能机制并探索其作为治疗靶点的潜力 | 骨髓源性巨噬细胞和MASH肝脏组织 | 分子病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型 | Atp6v0d2基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、病理学数据 | 多种基因工程小鼠模型（Atp6v0d2fl/fl;Lyz2-cre、Atp6v0d2-/-等）在两种饮食诱导肥胖模型（GAN和CDAHFD）中的研究 |
| 296 | 2025-06-19 |
Tissue-origin transcriptomic interactions as indicators of inflammatory aging and aging gene discovery
2025-Jun-16, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110534
PMID:40527241
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研究论文 | 该研究通过将单细胞RNA测序数据转换为语义上有意义的图像表示（称为“基因组图谱”），揭示了与衰老相关的基因互作模式变化，并构建了高精度的组织特异性炎症衰老时钟 | 提出了一种新的方法，通过空间编码转录组互作将scRNA-seq数据转换为图像表示，从而揭示衰老相关的基因互作模式变化，而非仅关注基因表达谱的变化 | NA | 识别精确的免疫遗传衰老标志物，并构建高精度的组织特异性炎症衰老时钟 | 衰老过程中的基因互作模式 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 297 | 2025-06-19 |
Elevated CD14 in B cells associates with reduced ovarian cancer risk via CD80 + dendritic cell interaction: a multi-omics study
2025-Jun-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02956-8
PMID:40517355
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研究论文 | 通过多组学研究探讨B细胞中CD14升高通过CD80+树突状细胞相互作用降低卵巢癌风险的机制 | 首次揭示了CD14在B细胞中的表达与卵巢癌风险降低的关联，并发现CD80在髓系树突状细胞中作为中介分子 | 研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步实验验证 | 探究B细胞及免疫分子对卵巢癌风险的影响机制 | 卵巢癌患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析、中介分析 | NA | 单细胞转录组数据、eQTL和pQTL数据库数据 | NA |
| 298 | 2025-06-19 |
A Prognostic Lysine Crotonylation Signature Shapes the Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过分析赖氨酸巴豆酰化相关基因（CRGs）在肝细胞癌（HCC）中的表达，建立了一个8基因风险评分模型，用于预测HCC患者的预后和免疫微环境特征 | 首次揭示了CRGs在HCC中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的关联，并开发了一个结合风险评分和列线图的预测模型 | 需要开发标准化的巴豆酰化测量方法，并在不同病因的HCC中进行验证，同时需要进一步研究巴豆酰化调节剂的功能影响 | 探索CRGs在HCC中的预后和治疗相关性 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 肿瘤学 | 肝细胞癌 | 转录组分析、单细胞测序、CIBERSORT、OncoPredict | Cox和LASSO回归分析 | 转录组和临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的HCC患者数据 |
| 299 | 2025-06-19 |
Systematic Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic and Immunological Function of Stanniocalcin-1 (STC1)
2025-Jun-13, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，系统性分析了STC1在泛癌中的致癌和免疫学功能 | 首次系统性揭示了STC1作为新型泛癌因子的双重作用：既通过EMT和干性调控促进肿瘤进展，又参与免疫微环境重塑 | 实验验证部分仅针对胃腺癌(STAD)进行了组织芯片和细胞系验证，其他癌症类型的实验证据不足 | 确立STC1的泛癌预后意义并阐明其与免疫特征的关联 | 33种癌症类型(TCGA泛癌数据集)和胃腺癌(STAD)组织样本 | 癌症基因组学 | 泛癌研究(重点关注胃腺癌) | 多组学分析(UALCAN/cBioPortal/HPA/GTA)、多重荧光染色、Western blot、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、组织芯片图像数据 | TCGA泛癌数据集+30例STAD组织芯片+STAD细胞系 |
| 300 | 2025-06-19 |
DNA damage repair (DDR) related prognostic risk model in multiple myeloma based on single-cell and bulk sequencing
2025-Jun-13, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2025.103857
PMID:40527059
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研究论文 | 基于单细胞和批量测序数据，构建了多发性骨髓瘤中DNA损伤修复相关基因的预后风险模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据筛选DDR基因，并构建了多发性骨髓瘤的预后模型，发现了关键的DDR相关基因 | 研究结果需要进一步实验验证，样本量可能有限 | 研究多发性骨髓瘤中DNA损伤修复基因的作用及其对疾病预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 差异表达分析 | 预后风险模型 | RNA测序数据 | 训练和验证队列中的多发性骨髓瘤患者样本 |