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当前共找到 38549 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-04-18 |
Tumor infiltration of inactive CD8 + T cells was associated with poor prognosis in Gastric Cancer
2025-03, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01577-4
PMID:39722065
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌组织中CD8⁺ T细胞浸润的异质性及其与患者预后的关系，并通过单细胞RNA测序揭示了高浸润组中CD8⁺ T细胞功能失活和肿瘤免疫微环境的特征 | 首次结合免疫组化与单细胞RNA测序，将胃癌患者按CD8⁺ T细胞浸润程度分组，并系统揭示了高浸润组中CD8⁺ T细胞功能失活、低克隆性及免疫抑制微环境的具体机制 | 样本量相对有限（34例进行scRNA-seq），且为单中心研究；未深入探究导致CD8⁺ T细胞失活的具体上游信号通路 | 探究胃癌复杂肿瘤免疫微环境中不同免疫细胞的功能，特别是CD8⁺ T细胞浸润状态与患者预后的关联 | 胃癌患者组织样本（包括肿瘤和正常组织） | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序 | NA | 图像，单细胞转录组数据 | 157例胃癌患者（免疫组化），其中34例进行了单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2026-04-18 |
Two-Step Positive Selection Method for the Magnetic Isolation of Lymphatic Endothelial Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4706-6_2
PMID:40859071
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研究论文 | 本文介绍了一种基于双抗体标记磁珠分离的两步阳性选择方法，用于从组织中分离淋巴管内皮细胞 | 开发了一种适用于分离稀有细胞群的双抗体标记磁珠分离方法，特别针对淋巴管内皮细胞，提高了细胞纯度和分离效率 | 方法可能依赖于特定抗体标记的可用性和特异性，且未在多种组织或疾病模型中广泛验证 | 开发一种高效分离稀有淋巴管内皮细胞的方法，以支持下游分子生物学研究 | 淋巴管内皮细胞 | 细胞生物学 | NA | 磁珠分离、单细胞RNA测序、RNA测序、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术 | NA | 细胞样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2026-04-18 |
Profiling low-mRNA content cells in complex human tissues using BD Rhapsody single-cell analysis
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103475
PMID:39661509
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研究论文 | 本文介绍了一种使用BD Rhapsody单细胞分析平台高效回收低mRNA含量免疫细胞的协议 | 优化了前列腺、肺和肝组织的组织解离方法，并结合Sample Tag抗体标记和微孔单细胞捕获技术，提高了低mRNA含量细胞的回收效率 | 协议主要针对前列腺、肺和肝组织，可能不适用于其他组织类型；且依赖于特定的BD Rhapsody平台 | 解决单细胞RNA测序中低mRNA含量免疫细胞回收的挑战 | 前列腺、肺和肝组织中的低mRNA含量免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 284 | 2026-04-18 |
Decoding aging in the heart via single cell dual omics of non-cardiomyocytes
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111469
PMID:39735437
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研究论文 | 本研究通过单细胞双组学技术解析小鼠心脏非心肌细胞在衰老过程中的异质性和动态变化 | 首次在单细胞水平上结合scRNA-seq和scATAC-seq技术，系统揭示心脏非心肌细胞衰老的异质性响应和细胞间通讯变化 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量相对有限 | 解析心脏衰老在单细胞水平的分子机制，为衰老相关心脏疾病提供治疗指导 | 年轻、中年和老年小鼠的心脏非心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据，单细胞表观基因组数据 | 多个年龄组（年轻、中年、老年）的小鼠心脏非心肌细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 285 | 2026-04-18 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术，首次在时空维度上详细描绘了人类胚胎肢体的发育过程 | 首次构建了人类胚胎肢体发育的时空细胞图谱，发现了新的细胞群体，揭示了肌肉发育的两波浪潮，并识别出维持肌肉干细胞身份的关键转录抑制因子MSC | 研究主要基于胚胎样本，对更早期或更晚期发育阶段的覆盖可能有限，且跨物种比较仅涉及小鼠 | 深入表征人类胚胎肢体发育的细胞和分子机制 | 人类胚胎肢体组织 | 空间转录组学 | 先天性肢体畸形（如短指症、多并指症） | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 人类胚胎肢体样本（具体数量未明确说明），以及小鼠胚胎肢体样本用于跨物种比较 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Visium | 使用VisiumStitcher工具整合多个解剖学连续的空间转录组样本，以绘制整个胎儿后肢矢状切面的细胞图谱 |
| 286 | 2026-04-18 |
A multi-omic atlas of human embryonic skeletal development
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08189-z
PMID:39567793
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组、表观遗传和空间转录组数据，构建了人类胚胎骨骼发育的多组学图谱，揭示了骨和关节形成中的细胞状态、调控网络和疾病机制 | 首次应用配对转录和表观遗传分析结合空间转录组学，建立了人类胚胎关节和颅骨发育的多组学图谱，并开发了新工具ISS-Patcher和SNP2Cell用于空间定位和疾病关联分析 | 研究仅覆盖受孕后5至11周的胚胎发育阶段，样本时间范围有限，且依赖于计算模拟预测细胞起源和疾病机制，需要实验验证 | 揭示人类胚胎骨骼发育中细胞命运决定的调控机制，并关联多基因性状如骨关节炎 | 人类胚胎骨骼组织，包括关节和颅骨，涉及约336,000个核滴样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | 轨迹分析, 调控网络建模 | 转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 约336,000个核滴样本，覆盖受孕后5至11周的人类胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2026-04-18 |
Network dynamics-based subtyping of Alzheimer's disease with microglial genetic risk factors
2024-10-16, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-024-01583-9
PMID:39415193
|
研究论文 | 本研究利用系统生物学方法，基于小胶质细胞遗传风险因子，通过构建患者特异性分子调控网络模型对阿尔茨海默病进行亚型分类，并识别潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序数据和文献构建患者特异性小胶质细胞分子调控网络模型，通过大规模计算机模拟和动态网络分析识别出九个AD亚型，并解释了先前关于AKT或INPP5D激活与抑制矛盾实验结果的动态机制 | 研究基于现有文献和单细胞RNA测序数据构建网络模型，可能未涵盖所有未知风险因子或通路，且模拟结果需进一步实验验证 | 通过小胶质细胞遗传风险因子对阿尔茨海默病进行亚型分类，以支持精准有效的治疗策略开发 | 阿尔茨海默病患者，聚焦于小胶质细胞及其遗传风险因子 | 系统生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，大规模计算机模拟，动态网络分析 | 分子调控网络模型 | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 288 | 2026-04-18 |
Differential role of glucocorticoid receptor based on its cell type specific expression on tumor cells and infiltrating lymphocytes
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101957
PMID:38643748
|
研究论文 | 本研究探讨了糖皮质激素受体在乳腺癌中基于细胞类型特异性表达的差异作用，并开发了一个独立于雌激素受体状态的GR特征 | 开发了一个独立于ER状态的GR特征，并揭示了GR在肿瘤细胞和浸润淋巴细胞中的细胞类型特异性作用，特别是在三阴性乳腺癌中的预后意义 | NA | 解决关于GR在乳腺癌中预后作用的矛盾报告，并探索其治疗潜力 | 乳腺癌细胞系、公共数据集中的肿瘤样本、独立乳腺癌队列中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2026-04-18 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588111
PMID:38617255
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研究论文 | 本文详细比较了Seurat和Scanpy这两个广泛使用的单细胞RNA测序分析软件包在算法和输出结果上的差异 | 揭示了Seurat和Scanpy在单细胞RNA-seq分析中存在的显著差异，其影响相当于减少5%的测序reads或20%的细胞数量，并强调了软件版本更新对结果的影响 | 研究主要聚焦于Seurat和Scanpy，可能未涵盖所有单细胞分析工具，且差异的生物学意义需进一步验证 | 评估单细胞RNA测序分析中软件包选择和版本控制对结果的影响 | 单细胞RNA测序数据分析软件包（Seurat和Scanpy）及其算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 290 | 2026-04-18 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
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研究论文 | 本研究提出了一种整合空间转录组学与组织病理学图像数据的新型深度学习方法，以更好地捕捉癌症组织中的生物学模式 | 首次将ResNet深度学习模型提取的形态学特征与空间基因表达数据相结合进行聚类分析，实现了图像感知的特征发现 | 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等侵袭性癌症类型，在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 通过整合多模态数据提升空间转录组学分析的生物学洞察力 | 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤, 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学, 组织病理学成像 | ResNet-50, Louvain聚类 | 空间基因表达数据, 高分辨率全切片组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 291 | 2026-04-18 |
Hypercapnia alters stroma-derived Wnt production to limit β-catenin signaling and proliferation in AT2 cells
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159331
PMID:36626234
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研究论文 | 本研究探讨高碳酸血症如何通过改变基质细胞Wnt产生，限制AT2细胞的β-catenin信号传导和增殖，从而影响肺损伤修复 | 首次揭示高碳酸血症通过改变PDGFRα+成纤维细胞的Wnt表达，从促进转向拮抗β-catenin信号，进而限制AT2祖细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养，人类临床数据有限，且高碳酸血症的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究高碳酸血症对肺损伤后修复过程的影响，特别是对肺泡II型细胞增殖和信号通路的调控 | 小鼠模型、肺泡II型细胞、PDGFRα+成纤维细胞、3D类器官培养 | 数字病理学 | 肺疾病 | 空间转录组学、细胞谱系追踪、3D培养 | 小鼠模型 | 转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 292 | 2026-04-18 |
Metagenomic and single-cell RNA-Seq survey of the Helicobacter pylori-infected stomach in asymptomatic individuals
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.161042
PMID:36810249
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序、单细胞RNA测序等技术，深入调查了无症状幽门螺杆菌感染者胃部的宿主-微生物群环境 | 首次结合宏基因组和单细胞RNA测序全面描绘无症状幽门螺杆菌感染者胃黏膜的微生物组和免疫细胞图谱，揭示了人类胃黏膜中ILC3s的主导地位及其与特定微生物类群的相关性 | 研究主要关注无症状个体，可能无法完全反映有症状感染者的病理变化；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 深入表征幽门螺杆菌感染者胃部的宿主-微生物群环境，比较无症状感染者与未感染者的差异 | 人类胃组织样本，包括幽门螺杆菌感染和无症状个体 | 数字病理学 | 幽门螺杆菌感染 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 荧光显微镜 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类胃组织样本 | NA | 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2026-04-18 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为SECANT的生物学引导的半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括：1) 利用表面蛋白数据中识别出的可靠细胞类型标签指导细胞聚类；2) 为每个细胞簇提供可靠的细胞类型通用注释；3) 利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞来提高性能；4) 能够准确预测scRNA-seq数据中的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据分析方法 | 单细胞多组学数据（特别是CITE-seq数据） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 半监督模型 | 单细胞多组学数据 | 公共和内部数据集（来自多个组织） | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 294 | 2026-04-18 |
RAGE Inhibitors as Alternatives to Dexamethasone for Managing Cerebral Edema Following Brain Tumor Surgery
2022-03, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1007/s13311-022-01207-w
PMID:35226341
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研究论文 | 本文研究了RAGE抑制剂作为地塞米松替代方案，用于管理脑肿瘤手术后脑水肿的效果 | 首次证实RAGE抑制剂在减轻神经炎症方面与地塞米松效果相当，且不影响抗PD-1免疫疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化需进一步验证 | 探索替代地塞米松的新方法，以最小化神经外科手术引起的脑水肿 | 小鼠和人类脑肿瘤组织及手术腔液 | 神经科学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, ELISA, Nanostring, 流式细胞术, qPCR, 免疫印迹 | RAGE基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞数据 | 野生型和RAGE敲除小鼠脑组织, 人类肿瘤组织和手术腔液 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 295 | 2026-04-18 |
Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.002
PMID:32810439
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了严重COVID-19患者中非经典单核细胞消失、经典单核细胞积累及钙卫蛋白大量释放等先天免疫异常特征 | 首次结合高维流式细胞术和单细胞RNA测序，系统揭示了COVID-19严重程度与先天免疫细胞亚群及钙卫蛋白水平的关联，并提出了具有潜在预测价值的生物标志物组合 | 研究为观察性分析，需前瞻性研究验证预测价值；样本来源和规模可能限制结论的普适性 | 探究COVID-19严重程度与先天免疫反应差异的关系，并寻找可区分高风险患者的生物标志物 | COVID-19患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | COVID-19患者外周血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2026-04-18 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
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研究论文 | 本文描述了一位由JAK1基因镶嵌性功能获得性突变引起的早发性多器官免疫失调患者，通过单细胞RNA测序揭示突变转录型与基因型的差异，并探索JAK1激酶的功能机制 | 引入突变'转录型'概念，揭示JAK1 S703I突变不仅增强细胞因子信号传导，还赋予非经典信号传导能力，为个性化医疗提供新平台 | 研究基于单个患者案例，样本量有限，可能无法完全代表所有JAK1相关疾病 | 探究JAK1激酶在自身炎症性疾病中的转录和生化功能机制 | 携带JAK1 S703I镶嵌突变的自体炎症性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1位患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制单细胞RNA测序 |
| 297 | 2026-04-18 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
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研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人类CD34+CD90+造血干细胞来优化慢病毒介导的基因治疗策略 | 首次在临床适用性GMP级流式分选协议中直接比较CD90+细胞选择与CD133+或CD38- CD34+细胞选择，证明CD90+富集能显著减少靶细胞数量并提高慢病毒转导效率 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未在人类临床试验中全面验证其安全性和长期疗效 | 优化造血干细胞基因治疗的靶细胞纯化策略以提高治疗效率和安全性 | 人类造血干细胞（HSC），特别是CD34+CD90+细胞亚群 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性肿瘤、感染性疾病 | 流式细胞分选、单细胞RNA测序、慢病毒转导 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类血液制品中的细胞分选比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2026-04-18 |
Microglia Require CD4 T Cells to Complete the Fetal-to-Adult Transition
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.026
PMID:32702313
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研究论文 | 本研究通过成像、单细胞和手术方法，识别了小鼠和人类大脑中的CD69+ CD4 T细胞群体，并探讨了其在脑发育中的作用 | 首次揭示了大脑中CD69+ CD4 T细胞的存在及其通过原位分化形成的过程，并发现这些细胞对微胶质细胞成熟和神经发育至关重要 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证可能有限；具体分子机制和临床相关性需进一步探索 | 探究健康大脑中CD4 T细胞的存在、来源及其在脑发育和免疫-神经系统互作中的功能 | 小鼠和人类大脑中的CD4 T细胞及微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 成像技术、单细胞测序、手术方法 | NA | 图像数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 299 | 2026-04-18 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用，包括理解肿瘤异质性和推动个体化治疗 | 综述了scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的最新应用，强调了其在解析肿瘤异质性和识别治疗靶点方面的创新潜力 | 当前scRNA-seq技术在治疗选择方面的研究有限，且存在技术挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用，以促进个体化治疗 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 300 | 2026-04-18 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型，用于联合聚类单细胞转录组和蛋白质组数据 | 提出了一种新的统计方法，能够同时利用转录组和蛋白质组数据进行细胞聚类，并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发用于分析多模态CITE-Seq数据的统计方法和计算工具 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），CITE-seq | 贝叶斯随机效应混合模型 | 转录组和蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium系统 |