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当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-06-04 |
Spatial FBA reveals heterogeneous Warburg niches in renal tumors and lactate consumption in colorectal cancer
2026-Jan-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00654-x
PMID:41593100
|
研究论文 | 提出空间通量平衡分析（spFBA）框架，揭示肾癌中异质性Warburg生态位和结直肠癌中的乳酸消耗 | 首次将空间通量平衡分析（spFBA）框架应用于空间转录组学数据，以相对估计代谢通量，从而揭示空间约束对癌症代谢的影响 | 未明确提及局限性 | 研究空间约束如何塑造癌症代谢，并验证spFBA框架的生物学有效性 | 配对的原发性结直肠肿瘤和肝转移样本，以及肾癌公共数据集 | 数字病理学 | 结直肠癌，肾癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 新生成的高分辨率配对原发结直肠癌和肝转移数据集，以及独立公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 282 | 2026-06-04 |
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03904-z
PMID:41593733
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，构建了葡萄叶片在霜霉病菌感染下的首个单细胞转录组图谱，揭示了早期防御反应的动态变化 | 首次在单细胞水平解析葡萄对霜霉病菌的防御反应动态，发现病菌通过重编程保卫细胞转录组影响气孔运动以促进侵染 | 仅关注感染早期阶段的细胞动态，缺乏对后续时间点及整体组织水平的综合验证 | 揭示葡萄在单细胞水平上对霜霉病菌感染的早期防御反应机制 | 葡萄叶片在霜霉病菌感染早期的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 葡萄霜霉病 | 单细胞RNA测序、空间RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约100,000个单个细胞（约89,000个来自单细胞RNA测序，约11,000个来自空间RNA测序） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 283 | 2026-06-04 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
|
研究论文 | 介绍SCITO-seq2，一种超高通量单细胞转录组与表位测序技术 | 结合探针基础RNA检测与超高通量蛋白分析，共享池条形码策略确保多液滴分子图谱精准匹配 | 未在摘要中明确提及 | 开发可扩展、高效、经济的下一代单细胞多组学工作流程 | 自身免疫疾病患者样本，包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，表位测序 | NA | 单细胞转录组及蛋白数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞多组学 | SCITO-seq2 | SCITO-seq2技术，整合探针RNA检测和超高通量蛋白分析，使用共享池条形码策略 |
| 284 | 2026-06-04 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 通过单细胞和转录组分析解析骨肉瘤基质细胞相互作用，发现CDKN2A和MMP14作为新型诊断和治疗生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和转录组数据，利用高维WGCNA和CellChat分析解析骨肉瘤基质细胞网络，并筛选出CDKN2A和MMP14作为潜在诊断和治疗靶点，同时预测白藜芦醇能稳定结合MMP14 | 依赖公开数据集，缺乏大规模临床样本验证；体外实验限于细胞系，未进行体内动物模型验证 | 揭示骨肉瘤基质细胞相互作用网络，识别新型诊断标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤基质细胞、巨噬细胞等其他细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | Seurat, CellChat, hdWGCNA, DESeq2 | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 公开数据集的样本量未具体说明，但包含来自GEO的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2026-06-04 |
omnideconv: a unifying framework for using and benchmarking single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2026-Jan-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03955-w
PMID:41582216
|
研究论文 | 提出omnideconv框架，用于使用和基准测试基于单细胞信息的大规模RNA-seq数据解卷积方法 | 首次全面基准测试第二代解卷积工具，区分不同变异和偏差来源 | 未提及具体限制 | 评估和优化基于单细胞RNA-seq数据的细胞类型解卷积方法 | 多种第二代解卷积工具 | 机器学习和生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 使用真实和模拟数据构成的多样本面板 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2026-06-04 |
Spatially resolved molecular signatures of Lewy body dementia
2026-Jan-26, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02981-z
PMID:41588135
|
研究论文 | 通过空间转录组学解析路易体痴呆中SNCA基因剂量和APOE4基因型对脑区特异性分子病理的影响 | 首次将空间转录组学应用于具有SNCA三倍体或不同APOE基因型的LBD患者脑组织，揭示了灰质第5层作为易感区域及其与APOE4相关的加重效应，并发现Reelin信号通路是跨皮层的核心路易体相关通路 | 研究样本量有限，且主要基于死后脑组织，可能无法完全反映疾病动态变化 | 阐明SNCA基因剂量和APOE4基因型如何通过空间和细胞类型特异性机制影响LBD病理 | 具有SNCA三倍体或不同APOE基因型的LBD患者死后颞叶皮层组织，以及年龄和性别匹配的对照 | 空间转录组学 | 路易体痴呆 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | LBD病例（包括SNCA三倍体或不同APOE基因型）及年龄和性别匹配的对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2026-06-04 |
Identification and characterization of fibroblast-related biomarkers and pro-inflammatory subpopulations in periodontitis by integrated transcriptomic and single-cell analysis
2026-Jan-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37385-2
PMID:41588193
|
研究论文 | 通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据，鉴定牙周炎中成纤维细胞相关生物标志物和促炎性亚群 | 首次通过整合批量转录组和单细胞RNA测序数据，利用LASSO回归鉴定出六个成纤维细胞相关基因（FRGs）并构建诊断模型，同时发现CXCL13⁺成纤维细胞为促炎性亚群 | 未提及 | 探索牙周炎中成纤维细胞相关生物标志物和促炎性成纤维细胞亚群，为诊断和治疗提供新策略 | 牙周炎组织样本中的成纤维细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化, 荧光原位杂交, LASSO回归 | LASSO回归, 诊断模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 三个数据集（GSE10334, GSE16134, GSE173078） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2026-06-04 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
|
研究论文 | 研究发现乳腺癌细胞通过外泌体传递RAB10至巨噬细胞，结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路，阻碍M1极化并促进M2极化，从而促进肿瘤免疫逃逸 | 首次揭示外泌体RAB10通过结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路调控巨噬细胞极化的新机制，并发现联合靶向RAB10与PD-L1可协同抑制肿瘤生长 | 未提及 | 探究外泌体RAB10对巨噬细胞极化和肿瘤生长的影响及机制 | 乳腺癌细胞系、巨噬细胞、单细胞RNA测序数据、荷瘤小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 乳腺癌细胞系及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2026-06-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Crosstalk Between MuSCs and FAPs in Ruminant Skeletal Muscle Development
2026-Jan-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020206
PMID:41597280
|
研究论文 | 首次构建山羊骨骼肌发育全过程的单细胞转录组图谱，揭示肌肉干细胞与纤维脂肪祖细胞间的互动机制 | 首次创建涵盖从胚胎30天至出生后11年共14个发育阶段的山羊骨骼肌单细胞RNA测序图谱，鉴定出胚胎早期特有的MuSCs__high亚群和衰老相关的MuSCs__high亚群，并发现DLK1-NOTCH3配体-受体对在调控细胞互作中的关键作用 | 未提及具体局限性，但作为单细胞图谱研究，可能受限于样本数量、测序深度及功能验证实验的缺乏 | 揭示山羊骨骼肌发育过程中肌肉干细胞与纤维脂肪祖细胞的细胞异质性及互作机制 | 山羊背最长肌组织中的肌肉干细胞和纤维脂肪祖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 120,944个细胞，覆盖14个发育阶段（胚胎第30天至出生后11年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2026-06-04 |
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol33010059
PMID:41590379
|
综述 | 该论文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗和生存的影响 | 结合单细胞测序和空间转录组学新技术，深入分析了CAFs和TAMs的亚型多样性及其在靶向治疗中的潜力 | 作为综述，其结论依赖于已有研究，未提供新的实验数据；CAFs和TAMs的异质性可能使靶向策略复杂化 | 探讨CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用，并评估靶向这些细胞改善治疗效果的可能性 | 卵巢癌中的癌相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 291 | 2026-06-04 |
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205047
PMID:41582829
|
研究论文 | 通过斑马鱼胚胎头部结缔组织的单细胞RNA测序，揭示肌腱细胞和韧带细胞在发育过程中的异质性，并发现Wnt信号在肌腱附着中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出发育中肌腱细胞和韧带细胞的不同亚群，揭示了肌腱细胞在空间和功能上的异质性，并明确了经典Wnt信号通路在肌腱附着模式形成中的新作用 | 主要基于斑马鱼模型，可能无法完全代表人类肌腱发育；仅聚焦于胚胎阶段，未涉及成年或老化过程 | 探究肌腱和韧带发育过程中细胞异质性的遗传机制，以及Wnt信号在肌腱附着中的作用 | 斑马鱼胚胎头部的结缔组织，包括发育中的肌腱细胞和韧带细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤及年龄相关退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 292 | 2026-06-04 |
Network Hypoactivity in ALG13-CDG: Disrupted Developmental Pathways and E/I Imbalance as Early Drivers of Neurological Features in CDG
2026-Jan-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020147
PMID:41597222
|
研究论文 | 通过人多能干细胞来源的皮质类器官研究ALG13-CDG导致的脑特异性低糖基化对神经发育和网络功能的影响 | 首次整合多组学分析和MEA电生理记录，揭示ALG13-CDG中早期网络低活跃性、神经元成熟时序错乱及E/I失衡随疾病进展向补偿性过度兴奋转变的机制 | 未明确说明 | 探究ALG13功能异常对人类大脑糖基化和神经发育的影响，以及皮质网络功能障碍的机制 | ALG13-CDG患者来源的iPSC分化的人皮质类器官 | 数字病理学 | 先天性糖基化障碍 | RNA-seq, 蛋白质组学, 糖蛋白质组学, N-糖成像, 脂质组学, 代谢组学 | NA | 图像, 文本 | ALG13-CDG个体来源的iPSC和hCO样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 糖组学 | NA | NA |
| 293 | 2026-06-04 |
Integrative Network Analysis of Single-Cell RNA Findings and a Priori Knowledge Highlights Gene Regulators in Multiple Myeloma Progression
2026-Jan-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020793
PMID:41596441
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序发现与先验知识网络分析，揭示多发性骨髓瘤进展中的关键基因调控因子 | 通过将单细胞RNA测序数据与多发性骨髓瘤先验知识整合，构建合成基因网络图谱，并利用综合影响力指标识别跨疾病阶段的关键调控因子 | 未提及具体限制 | 揭示多发性骨髓瘤从癌前阶段进展为活动性疾病过程中的关键调控因子 | 多发性骨髓瘤患者CD138阳性浆细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2026-06-04 |
Integrated Analyses Identify CDH2 as a Hub Gene Associated with Cisplatin Resistance and Prognosis in Ovarian Cancer
2026-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020713
PMID:41596365
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研究论文 | 通过整合分析识别CDH2为卵巢癌顺铂耐药和预后相关的关键基因 | 首次通过加权基因共表达网络和单细胞RNA-seq数据整合分析，鉴定CDH2为卵巢癌顺铂耐药的核心枢纽基因，并探讨其与免疫细胞浸润的关联 | 研究主要基于公开数据集和体外实验验证，缺乏大规模前瞻性临床队列的外部验证 | 识别与卵巢癌顺铂耐药相关的关键基因并探究其临床意义 | 卵巢癌顺铂耐药的分子机制和生物标志物 | 机器学习 | 卵巢癌 | 转录组测序, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫组化 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE73935数据集（具体样本量未说明）, GSE211956单细胞RNA-seq数据（具体样本量未说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2026-06-04 |
Spatial Imbalance of Innate-like T-Cell Niches Underlies Clinical Trajectories in Psoriasis
2026-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020715
PMID:41596369
|
研究论文 | 利用空间转录组学和CITE-seq技术，揭示银屑病中γδT细胞和MAIT细胞的空间失衡与临床轨迹的关系 | 首次通过独立队列的空间转录组学描绘银屑病皮肤中γδT和MAIT细胞生态位的层特异性分布，并揭示其与临床严重性的相反动态 | NA | 探究银屑病炎症中先天样T细胞的空间组织及其与临床病程的联系 | 银屑病患者皮肤组织和外周血中的γδT细胞和MAIT细胞 | 自然语言处理 | 银屑病 | 空间转录组学，CITE-seq | NA | 基因表达数据 | 独立队列中的多份银屑病皮肤样本和外周血样本 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x 空间转录组，10x Chromium | 10x空间转录组技术用于皮肤组织，10x Chromium单细胞CITE-seq用于外周血 |
| 296 | 2026-06-04 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Cervical Cancer Cell Lines Before and After Chemoradiotherapy
2026-Jan-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020115
PMID:41597190
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌细胞系在放化疗前后的转录组景观，揭示化疗耐药机制 | 首次建立来自同一宫颈癌患者在放疗前后的等基因原代细胞系对(AdMer35和AdMer43)，并进行单细胞转录组比较分析，揭示了多层面细胞适应性在化疗耐药中的作用 | 仅基于一对患者来源的细胞系，样本量有限，需在更多样本和临床队列中验证 | 阐明宫颈癌化疗耐药的细胞和分子机制 | 一对等基因的原代宫颈癌细胞系(AdMer35和AdMer43)，分别来自同一鳞状细胞癌患者放疗前后的组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 一对细胞系(AdMer35和AdMer43)，来自一名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2026-06-04 |
Insights into Cardiomyocyte Regeneration from Screening and Transcriptomics Approaches
2026-Jan-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020601
PMID:41596256
|
综述 | 通过高通量筛选和转录组学方法揭示心肌细胞再生的机制 | 整合多种高通量筛选策略与单核RNA测序、空间转录组学等组学技术，系统比较不同模型（如斑马鱼胚胎、啮齿动物心肌细胞、iPSC-CMs和心脏类器官）的优缺点，为发现促心肌细胞增殖靶点提供新框架 | 仍需进一步工作以确定可转化为临床应用的、能诱导功能性心肌细胞扩增的安全靶点 | 综述用于鉴定心肌细胞增殖新靶点的高通量筛选策略及转录组学方法，推动心脏再生研究 | 心肌细胞、斑马鱼胚胎、啮齿动物心肌细胞、iPSC-CMs、心脏类器官 | 机器学习 | 心血管疾病 | 高通量筛选、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2026-06-04 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Conserved Cellular Communication Mechanisms Governing Ocular Lineage Specification from Human iPS Cells
2026-Jan-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020104
PMID:41597181
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析人类iPS细胞分化形成眼类器官过程中的细胞通讯机制 | 首次在人类iPS细胞来源的眼类器官模型中系统揭示保守的细胞通讯网络，并鉴定出指导多能性向眼谱系转变的关键信号介质和转录效应器 | NA | 研究人类iPS细胞自我组织分化为二维眼类器官过程中细胞通讯网络的动态机制 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）来源的二维眼类器官 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2026-06-04 |
Plant bZIPs in Root Environmental Adaptation: From Single-Cell Expression Atlas to Functional Insights
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020568
PMID:41596219
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综述 | 本文综述了植物bZIP转录因子在根系环境适应中的作用，从单细胞表达图谱到功能见解，探讨了bZIP如何通过整合单细胞组学与功能遗传学来协调转录重编程以适应复杂环境 | 从组织整体分析转向单细胞RNA测序，创建了高分辨率的根bZIPs表达图谱，揭示了bZIP在单个细胞类型中的具体功能，并整合了光照、激素、营养和胁迫信号的调控模块 | 主要基于现有研究总结，可能缺乏新实验数据验证；对bZIP在作物中的同源基因功能理解尚有限 | 阐明bZIP转录因子在植物根系环境适应中的调控机制，并为其在培育气候适应性作物中的应用提供理论依据 | 植物bZIP转录因子家族成员及其在根系细胞中的表达调控 | 数字病理学、自然语言处理 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞组学、功能遗传学 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 300 | 2026-06-04 |
Chronic Kidney Disease in Metabolic Disease: Regulation of SGLT2 and Transcriptomic-Epigenetic Effects of Its Pharmacological Inhibition
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020589
PMID:41596241
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综述 | 综述SGLT2在代谢疾病相关慢性肾病中的表达调控及其抑制剂转录组-表观遗传效应 | 聚焦SGLT2抑制剂的分子机制，特别是转录组和表观遗传层面的影响，并首次整合人类单细胞转录组数据揭示SGLT2抑制剂对肾脏代谢重编程的作用 | 人类单细胞RNA测序数据仅有单一研究来源，缺乏大规模验证；分子机制在临床转化中仍需进一步确认 | 探讨SGLT2在健康与代谢疾病中的表达调控及其药理学抑制的转录组-表观遗传机制 | 肾近端小管细胞，代谢疾病相关慢性肾病模型 | 转录组学，表观遗传学 | 慢性肾病，代谢疾病（2型糖尿病） | 单细胞RNA测序，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类单细胞RNA测序数据集（样本量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |