单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38610 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-04-19
Parvimonas micra exacerbates periodontitis by infiltrating host cells through TmpC and circumventing lysosomal elimination via AppA
2026-Mar, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究揭示了小单胞菌通过TmpC蛋白侵入宿主细胞,并利用AppA蛋白逃逸溶酶体清除,从而加剧牙周炎的分子机制 首次系统阐明了小单胞菌在牙周炎发病中的关键作用,并发现了其通过表面黏附素TmpC结合宿主细胞受体以及利用AppA蛋白逃逸自噬清除的两种新机制 研究主要在动物模型和体外实验中进行,人体内的直接验证尚需进一步研究 探究小单胞菌在牙周炎发病过程中的具体作用机制 小单胞菌、牙周韧带干细胞、大鼠实验模型 微生物学与细胞生物学 牙周炎 16S rRNA测序、单细胞RNA测序、His pull-down assay、LC-MS/MS、micro-CT NA 测序数据、质谱数据、影像数据 人类龈沟液样本及实验大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
282 2026-04-19
DuaST: an integrated deep learning framework for spatial transcriptomics with cross-branch interaction
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了DuaST,一个集成的双分支深度学习框架,用于空间转录组学数据分析,通过结合空间和非空间信息来提升生物表征学习 DuaST设计了空间感知分支和非空间分支来分别建模邻域依赖和拓扑无关特征,并采用局部-全局对比学习、对抗对齐和基于注意力的融合机制来整合这些互补表示,从而强化跨分支交互并学习有生物学意义的表征 NA 开发一个通用的计算框架,以整合空间转录组学中的空间和非空间信息,用于空间域识别、空间可变基因检测和多组学分析 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 深度学习框架(双分支架构) 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
283 2026-04-19
Uncovering causal relationships in single-cell omic studies with causarray
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为causarray的因果推断框架,用于在单细胞组学研究中处理未测量混杂因素并揭示因果关系 causarray整合了广义混杂调整方法和半参数推断,结合灵活的机器学习技术,能在伪批量及单细胞水平上稳健估计处理效应 NA 解决单细胞组学数据中因选择偏差和未测量混杂因素导致的因果推断挑战 单细胞组学数据,包括自闭症风险基因的Perturb-seq研究和阿尔茨海默病的病例对照转录组数据集 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞测序,CRISPR技术 机器学习技术 基因组数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
284 2026-04-19
STING activation induces polarized cytokine secretion of IFN-β and IL-17A promoting photoreceptor death and choroidal disruption in age-related macular degeneration
2026-Feb-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)中作为免疫介导视网膜变性的调控者,通过双相、阶段依赖性功能,在健康组织中提供细胞保护,但在早期AMD进展中驱动致病性炎症 发现STING通路在AMD中作为主调控因子,通过空间组织化的炎症同时控制多种病理过程,从保护性监视转变为致病驱动因子,并确定了统一的治疗靶点 NA 探究STING通路在年龄相关性黄斑变性(AMD)发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 人类眼睛组织、患者来源的诱导多能干细胞-视网膜色素上皮细胞(iPSC-RPE)、人类视网膜类器官、Cryba1条件性敲除(cKO)AMD样小鼠模型、Il17a敲入小鼠、Cryba1/Sting双杂合(dhet)小鼠 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 免疫组织化学分析、单细胞转录组学、AAV2介导的IFN-β过表达 NA 图像、文本(转录组数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
285 2026-04-19
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2026-Feb-24, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了Ets1调控的内皮细胞分泌因子在致密心肌发育中的关键作用,并提出了心室致密化不全的潜在治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序揭示了心室致密化不全中异常的心肌细胞和内皮细胞状态,并明确了Ets1在内膜和冠状动脉内皮中通过不同信号通路调控致密心肌生长的具体机制 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类疾病中的适用性仍需进一步验证;治疗性ECM蛋白和Nrg1的体内疗效和安全性尚未评估 探究致密心肌变薄的机制,并鉴定治疗性内皮分泌因子,以阐明心室致密化不全的病理机制 小鼠心脏内皮细胞(心内膜和冠状动脉内皮)及致密心肌细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
286 2026-04-19
CD14 Plays a Critical Role in Pain and Inflammation Across Multiple Models of Post-traumatic Osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多模型小鼠中验证了CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 首次在多严重程度、多进展速率的创伤后骨关节炎模型中系统验证CD14的致病作用,并采用单细胞转录组学和空间蛋白质组学揭示其调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本关联分析相对有限,临床转化效果需进一步验证 验证CD14抑制能否减轻骨关节炎进展过程中的滑膜炎症和相关疼痛 人类骨关节炎滑液样本、多种严重程度的小鼠创伤后骨关节炎模型(包括手术和非手术模型) 数字病理学 骨关节炎 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、高维转录组和蛋白质组分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、行为学数据、组织病理学数据 人类滑液样本及多组小鼠模型(包含不同性别、肥胖等风险因素) NA 单细胞转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
287 2026-04-19
Multi-omics analysis reveals that CAPG positive macrophages are key immunosuppressive drivers and prognostic determinants in the ferroptosis landscape of hepatocellular carcinoma
2026-Feb-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析揭示了CAPG阳性巨噬细胞在肝细胞癌铁死亡景观中是关键的免疫抑制驱动因素和预后决定因素 首次整合多组学数据系统描绘了HCC中铁死亡-免疫网络的组成与功能,并识别出CAPG阳性巨噬细胞作为核心免疫抑制驱动因素 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证CAPG阳性巨噬细胞的具体功能机制 探究肝细胞癌中铁死亡与免疫微环境的相互作用及其对肿瘤进展和免疫治疗的影响 肝细胞癌患者样本中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群 生物信息学与计算生物学 肝细胞癌 多组学分析、加权基因共表达网络分析、单细胞转录组测序、空间转录组学 预后模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 基于TCGA数据库的HCC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
288 2026-04-19
Lactylation-related genes contribute to neurological injury and prognosis of acute ischemic stroke based on transcriptome and single-cell sequencing analysis
2026-Feb-22, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过转录组和单细胞测序分析,探讨了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中神经损伤和预后中的作用 首次结合转录组和单细胞测序,揭示了乳酰化相关基因在急性缺血性卒中患者中的分子亚型分类及其通过NK&T细胞与神经细胞间通讯调节神经损伤的机制 样本量相对较小(60例患者和60例对照),且研究主要基于外周血单核细胞,可能未能完全反映脑内局部变化 阐明高乳酸诱导的乳酰化在调节急性缺血性卒中神经损伤和预后中的病理生理机制 急性缺血性卒中患者和健康对照的外周血单核细胞 数字病理学 急性缺血性卒中 转录组测序, 单细胞测序分析 LASSO回归 转录组数据, 单细胞数据 60例急性缺血性卒中患者和60例健康对照 Illumina 转录组测序, 单细胞测序分析 Illumina测序平台 NA
289 2026-04-19
Milk fat globule-EGF factor 8 enhances the proliferation and migration of thyroid carcinoma cells through epithelial-mesenchymal transition and PI3K/AKT signaling pathway
2026-Feb-21, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 本研究探讨了MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及其通过调控EMT和PI3K/AKT信号通路促进癌细胞增殖与迁移的机制 首次揭示了MFG-E8在甲状腺癌(特别是高细胞亚型)中的关键作用,并阐明了其通过MFG-E8-PI3K/AKT-EMT轴驱动肿瘤进展和免疫抑制微环境形成的机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证;临床样本的异质性可能影响结果的普适性 探究MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及其分子机制 甲状腺癌组织、甲状腺癌细胞系 癌症生物学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、转录组测序、质谱分析、免疫组化、Western blotting、RT-PCR、生物信息学分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 NA NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
290 2026-04-19
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过空间多组学方法揭示了肝细胞癌中不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的免疫代谢特征 首次整合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和飞行时间质谱流式细胞术,精确绘制了不可逆电穿孔诱导的炎症边缘的空间图谱,并发现了类似脂质相关巨噬细胞的Ly6CPD-L1细胞浸润及其免疫抑制表型 研究基于雄性C57BL/6小鼠原位肝细胞癌模型,可能无法完全反映人类肝细胞癌的复杂性 探究不可逆电穿孔治疗肝细胞癌时炎症边缘的免疫和代谢变化 雄性C57BL/6小鼠原位肝细胞癌模型 数字病理学 肝细胞癌 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术 NA 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 NA NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA NA
291 2026-04-19
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-Feb-20, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习,识别出ATAD3A作为稳定线粒体-内质网膜的关键基因,促进膀胱癌进展 首次将线粒体相关内质网膜(MAM)与膀胱癌化疗耐药性联系起来,并利用机器学习识别出ATAD3A作为关键预测基因 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内验证,临床样本验证和机制深入探索可能有限 探究MAM在膀胱癌中的作用,识别与化疗耐药相关的关键基因 膀胱癌患者样本、细胞模型和动物模型 数字病理学 膀胱癌 RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、机器学习、电子显微镜、荧光共聚焦显微镜 随机森林、LASSO-Cox回归 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及广泛RNA测序和单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
292 2026-04-19
TWIST1 drives endothelial-to-mesenchymal-transition to stabilize atherosclerotic plaques
2026-Feb-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了转录因子TWIST1在动脉粥样硬化斑块中通过驱动内皮-间质转化来促进斑块稳定的作用 挑战了内皮-间质转化仅会破坏斑块稳定的传统观点,提出TWIST1驱动的内皮-间质转化可促进斑块稳定性 NA 研究TWIST1在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其对内皮-间质转化的调控机制 高胆固醇血症小鼠模型和人类主动脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织学图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
293 2026-04-19
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本文通过单细胞测序和功能实验,揭示了GPR35在缺血性中风再灌注损伤中的保护作用及其与Raf1的CR2结构域结合的分子机制 首次发现GPR35通过与Raf1的CR2结构域直接结合,调控Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路,从而减轻缺血性中风后的神经炎症和再灌注损伤 研究主要基于小鼠模型和体外系统,尚未在人类临床样本中进行验证,且药理激活剂zaprinast的特异性和长期安全性需进一步评估 探究GPR35在缺血性中风再灌注损伤中的作用机制,以寻找新的治疗靶点 小鼠脑组织、小胶质细胞、缺血性中风模型 神经科学 缺血性中风 单细胞测序、共免疫沉淀、基因敲低、过表达、药理激活 动物模型(小鼠)、体外氧糖剥夺系统 测序数据、蛋白质相互作用数据、行为学数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型和体外细胞系统 NA 单细胞RNA-seq NA NA
294 2026-04-19
Beyond macrophages: FIPV tropism includes T and B lymphocytes
2026-Feb, Veterinary microbiology IF:2.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)不仅感染单核/巨噬细胞,还能感染T和B淋巴细胞,并能在这些细胞内进行病毒基因组复制 首次在自然感染FIP的猫体内,通过单细胞RNA测序等技术,证实FIPV可感染T和B淋巴细胞并进行病毒基因组复制,修正了现有关于FIPV仅选择性感染单核/巨噬细胞的致病模型 研究样本来源于自然感染的猫,可能存在个体差异;研究主要关注淋巴结组织,其他组织中的病毒感染情况可能不同 探究猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞嗜性范围及免疫细胞入侵机制 自然发生渗出性猫传染性腹膜炎(FIP)的猫的肠系膜淋巴结穿刺液和福尔马林固定石蜡包埋的淋巴结组织 单细胞组学 猫传染性腹膜炎 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 原位杂交 NA RNA序列数据, 图像数据 来自自然感染FIP猫的肠系膜淋巴结穿刺液和淋巴结组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
295 2026-04-19
A mouse organoid platform for modeling cerebral cortex development and cis-regulatory evolution in vitro
2025-Dec-15, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文开发了一种从小鼠外胚层干细胞生成大脑皮层类器官的可重复协议,用于模拟皮层发育和顺式调控进化 首次利用小鼠类器官平台结合单细胞RNA测序,全面绘制了发育中皮层细胞类型的顺式调控变异图谱,揭示了动态等位基因失衡 研究基于体外类器官模型,可能无法完全复制体内环境的复杂性 研究大脑皮层发育的基因调控网络和顺式调控进化机制 小鼠大脑皮层类器官,源自实验室小鼠和四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 类器官模型 单细胞转录组数据 使用来自实验室小鼠(C57BL/6J)与四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞生成的皮层类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
296 2026-04-19
Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
2025-Dec-05, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据,分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和患者预后的影响 首次将PI3K/Akt/mTOR通路基因ACTR3与宫颈癌的肿瘤免疫微环境及预后联系起来,并利用单细胞RNA测序技术解析了表达ACTR3的免疫细胞亚群 研究主要基于生物信息学分析和回顾性数据,需要进一步的实验验证来确认ACTR3的功能机制 探究ACTR3过表达是否影响宫颈癌患者的生存,并阐明其对肿瘤免疫微环境的作用 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC) 生物信息学 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 LASSO Cox回归, 诺模图 基因表达数据, 临床数据 未明确指定具体样本数量,但使用了公共数据库的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
297 2026-04-19
A parabrachial hub for need-state control of enduring pain
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学、神经操控、活动记录和计算建模,揭示了表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元在长期持续性疼痛中的关键作用,并发现饥饿、口渴或捕食者信号能通过释放NPY抑制这些神经元,从而缓解疼痛 首次识别出臂旁核中表达Y1受体的神经元作为内源性镇痛枢纽,并证明其活动能预测功能应对行为,且多种生理需求状态(如饥饿、口渴)能通过NPY释放抑制这些神经元以缓解持续性疼痛 NA 探究慢性疼痛条件下持续性疼痛的中枢机制,特别是组织愈合后疼痛信号的调控 表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元及其在疼痛和生理需求状态下的活动 神经科学 慢性疼痛 空间转录组学、神经操控、活动记录、计算建模 NA 转录组数据、神经活动数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
298 2026-04-19
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
研究论文 本文提出了一个跨平台生成框架ST2HE,用于从高分辨率空间转录组数据合成虚拟H&E图像,以支持组织学注释 ST2HE采用一步扩散模型整合细胞核形态和空间转录坐标,实现了跨组织类型和平台的高保真虚拟组织学图像生成,并支持条件性和组织无关的变体 未明确提及具体的数据集规模限制或模型泛化能力的详细评估 开发一个标准化框架,用于高分辨率空间转录组数据的虚拟组织学注释和表型分类 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤的组织样本 计算病理学 乳腺癌, 非小细胞肺癌, 卡波西肉瘤 空间转录组学 扩散模型 空间转录组数据 NA NA 高分辨率空间转录组学 NA NA
299 2026-04-19
Healing of lytic lesions and restoration of bone health in multiple myeloma through sclerostin inhibition
2025-Aug-22, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了通过抑制硬化素(Scl-ab)来促进多发性骨髓瘤(MM)患者溶骨性病变愈合和恢复骨骼健康的潜力 首次在临床前模型和患者样本中系统评估了Scl-ab对MM骨骼疾病的修复作用,并证实其与抗癌药物联用时的协同抗肿瘤效果 研究包含回顾性临床分析,需要前瞻性临床试验进一步验证;动物模型结果向人类转化的有效性需更多验证 探究硬化素抑制剂(Scl-ab)能否促进MM骨骼修复、增强抗癌疗效并改善患者骨骼健康 多发性骨髓瘤小鼠模型、患者来源样本(包括缓解期患者) NA 多发性骨髓瘤 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、临床回顾性数据 临床前动物模型及患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
300 2026-04-19
Peripheral blood neutrophils contribute to Claudin18.2-specific CAR-T cell treatment resistance in advanced gastric cancer
2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了外周血中性粒细胞在晚期胃癌患者接受Claudin18.2特异性CAR-T细胞治疗中导致耐药的作用 首次将中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)与CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的预后联系起来,并通过单细胞RNA测序鉴定出与疾病进展相关的循环中性粒细胞亚群(NE-3)及其促肿瘤机制 需要进一步验证,并探索减轻中性粒细胞诱导的免疫抑制的策略 研究CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗在晚期胃癌中疗效差异的机制,特别是中性粒细胞介导的耐药作用 接受CLDN18.2特异性CAR-T细胞治疗的晚期胃癌患者及其外周血样本 肿瘤免疫学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞RNA测序数据 未明确指定患者数量,但涉及接受CAR-T治疗的胃癌患者队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部