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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-05-09 |
GEfetch2R: fetching single-cell/bulk RNA-seq data from public repositories to R and benchmarking the subsequent format conversion tools
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag039
PMID:41964930
|
研究论文 | GEfetch2R是一个R包,用于从多个公共数据库获取单细胞/批量RNA-seq数据,并基准测试后续格式转换工具 | 首个能够同时下载多种单细胞RNA-seq数据类型(原始数据、计数矩阵、处理对象)、流程化加载到R环境、进行对象格式转换并基准测试转换工具的综合工具 | 未明确指出局限性 | 开发一个整合数据下载、处理和格式转换功能的R包,方便研究人员访问和探索公共基因表达数据 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2026-05-09 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
|
综述 | 综述脂肪组织生物学的最新进展及其在健康与疾病中的关键作用 | 强调脂肪组织作为人体生理中心调节器的新认识,以及单细胞RNA测序等新技术在揭示脂肪库特异性机制中的应用潜力 | 未明确提及局限性,但综述本身可能受限于现有研究范围和发表时间 | 阐述脂肪组织在健康和疾病中的重要角色的科学进展 | 脂肪组织和脂肪细胞 | 计算生物学 | 肥胖相关疾病, 2型糖尿病, 心血管疾病, 肝脏疾病, 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 探讨人工智能在细胞生物学中的应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率细胞图像分析、复杂生物模式识别及细胞行为建模方面的最新进展 | 涉及数据质量要求、模型可解释性以及AI工具在生物领域普及化的挑战 | 概述AI在细胞生物学发现中的变革性作用,展望未来基础研究和治疗应用方向 | 细胞生物学中的AI应用场景,包括显微镜图像、转录组数据和蛋白质结构 | 机器学习 | NA | NA | 深度学习 | 图像, 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2026-05-09 |
Microneedle Delivery of Small Extracellular Vesicles From Young Blood to Treat Endothelial Senescence
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418352
PMID:40765122
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研究论文 | 利用微针递送来自年轻血液的小细胞外囊泡治疗内皮的衰老 | 首次将微针递送技术与年轻血液来源的小细胞外囊泡结合,用于延缓内皮细胞衰老并减轻炎症,并通过单细胞RNA测序揭示其作用机制 | 未提及具体局限性 | 评估源自年轻血液的小细胞外囊泡在调节内皮细胞衰老中的作用,并探索其通过微针递送的可行性 | 脐带血浆中的小细胞外囊泡与老年人血浆中的小细胞外囊泡,以及老龄小鼠的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分离自脐带血浆(年轻)和老年人血浆(>70岁)的小细胞外囊泡,以及22-24个月大的老龄小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和分子治疗策略 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接分析,首次系统性揭示多发性骨髓瘤微环境中免疫相关信号通路及关键基因的因果作用 | 未提及具体样本来源和样本量,可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用,发现新治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接分析 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2026-05-09 |
Host biological sex directs immune control of the Plasmodium parasite liver stage in mice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1734587
PMID:41846936
|
研究论文 | 探究宿主生物性别和雄激素如何调控疟原虫肝脏期感染的免疫控制 | 首次揭示雄激素通过减少寄生虫感染肝细胞的清除来增加寄生虫存活率,并阐明性别差异在肝脏先天性免疫细胞组成和免疫反应中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需在人类中验证性别差异的关联性;未深入探讨雄激素作用的具体分子机制 | 分析生物性别和雄激素对疟原虫肝脏期宿主-寄生虫相互作用的调节作用 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的BALB/cJ小鼠,感染伯氏疟原虫子孢子 | 机器学习 | 疟疾 | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的小鼠样本,具体数量未说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析肝脏组织中的基因表达 |
| 287 | 2026-05-09 |
GSK3β as a potential regulator in AML: A pan-cancer multi-omics analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344994
PMID:41915675
|
研究论文 | 通过泛癌多组学分析揭示GSK3β在急性髓系白血病中的潜在调控作用 | 首次在31种癌症中系统比较GSK3α/β亚型的差异表达和功能,发现GSK3β在AML中具有独立的预后价值,并揭示了亚型特异性的免疫微环境调控机制 | 未涉及具体分子机制的深入验证,且THP-1细胞系的体外实验无法完全代表AML患者体内的复杂微环境 | 探究GSK3α/β亚型在多种癌症中的表达模式、预后价值和免疫调控作用 | 31种癌症的TCGA、GTEx和单细胞RNA-seq多组学数据,以及AML THP-1细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、肝癌、急性髓系白血病等 | 多组学整合分析、单细胞RNA-seq、Cox回归、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 31种癌症的泛癌样本,包含TCGA和GTEx数据库的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 288 | 2026-05-09 |
B cells in anti-tRNA synthetase syndrome patients show an activated, interferon-responsive signature
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1770291
PMID:42023216
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析抗tRNA合成酶综合征患者B细胞的激活及干扰素响应特征 | 首次在单细胞水平揭示抗tRNA合成酶综合征患者活化与记忆B细胞中干扰素和应激通路上调,并发现FKBP5和MYADM基因表达变化与细胞骨架重排、代谢及抗原呈递通路相关 | 发现需进一步验证,未来需探究其作为新靶点减少组织损伤的实用性 | 识别抗tRNA合成酶综合征中的失调通路作为新型治疗靶点 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者的外周血单个核细胞中的CD19+B细胞 | 数字病理学 | 抗tRNA合成酶综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者,样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 对流式分选的CD19+细胞进行单细胞RNA测序 |
| 289 | 2026-05-09 |
Emodin Inhibitsg Hepatocellular Carcinoma Invasion and Migration by Regulating the HDAC4/NF-κB (p65)/CXCL12 Signaling Axis and Suppressing M2 Macrophage Polarization
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500369
PMID:42036631
|
研究论文 | 研究大黄素通过调控HDAC4/NF-κB(p65)/CXCL12信号轴抑制肝细胞癌侵袭迁移及M2型巨噬细胞极化 | 首次揭示大黄素通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并抑制肝细胞癌进展的新机制 | NA | 探究大黄素如何通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并影响肝细胞癌进展 | HepG2肝癌细胞、巨噬细胞、肝细胞癌模型 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、表面等离子体共振、Western blot | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2026-05-09 |
Molecular regulation of spermatogenesis: Insights from spatial transcriptomics
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.01.004
PMID:42097820
|
综述 | 通过空间转录组学揭示精子发生的分子调控机制 | 首次系统综述空间转录组学技术在睾丸细胞空间组织、不同生精细胞群和体细胞区室相互作用中的应用,提供了对精子发生过程中基因表达模式的新见解 | 主要聚焦于当前空间转录组学技术的应用,未深入讨论技术本身的局限性(如分辨率、通量等) | 探讨从原始生殖细胞发育到精原干细胞过程中的关键调控因子、体细胞与生殖细胞的相互作用,以及空间转录组技术在干细胞研究中的应用 | 睾丸生精细胞(包括精原细胞、精母细胞、精子细胞)和睾丸体细胞(如支持细胞、间质细胞等) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2026-05-09 |
Unraveling spermatogenesis: A single-cell genomics perspective
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.03.003
PMID:42097818
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综述 | 本文从单细胞基因组学角度综述了精子发生过程的技术演变、关键生物学争议及未来研究方向 | 系统整合了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和单细胞DNA甲基化等技术在精子发生研究中的应用,并提出了多组学与空间转录组学的未来前景 | 未提及具体实验验证或定量比较不同技术的性能差异 | 综述单细胞基因组学技术对雄性生殖细胞研究带来的变革,并展望临床转化潜力 | 精子发生过程,包括精原干细胞、生殖细胞分化及表观遗传调控 | 单细胞基因组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 292 | 2026-05-09 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data reveals RGS4 as a functional driver in a proliferative subgroup of SF-1 lineage PitNETs
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1815682
PMID:42099385
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序数据揭示RGS4是SF-1谱系PitNETs增殖亚组的功能驱动因子 | 首次识别出一个高表达RGS4的SF-1谱系PitNETs亚组,并阐明RGS4通过促进p53泛素化降解驱动肿瘤增殖的机制 | 未提及具体局限性 | 探索SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤异质性和增殖行为的分子决定因素 | SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤 | 机器学习 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 293 | 2026-05-09 |
CD146+ CAFs mediate immunosuppression in gastric cancer via COL4A1: potential therapeutic targets
2025-Dec-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013577
PMID:41423274
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定胃癌中CD146+癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示其通过COL4A1介导免疫抑制的机制,为靶向治疗提供新靶点 | 首次发现CD146+ CAFs亚群在胃癌中的免疫抑制作用,并阐明JAG1-NOTCH3/PI3K/AKT信号轴调控COL4A1分泌及M2型巨噬细胞极化的分子机制,提出CD146和COL4A1作为潜在治疗靶点 | 未提及具体限制 | 识别胃癌特异性癌症相关成纤维细胞亚群,阐明其免疫抑制作用的分子机制 | 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞和匹配的正常成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9对患者肿瘤及相邻正常组织样本,共8,322个高质量成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2026-05-09 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型,发现PRMT5缺失导致基底角质细胞样异常细胞群出现和表皮分层缺陷 | 首次揭示PRMT5通过抑制Cdkn1a表达来阻止基底角质细胞衰老,为先天性皮肤病的表观遗传调控提供新见解 | NA | 探究PRMT5在体内维持角质细胞干细胞表型的作用及其机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠表皮 | 机器学习 | 先天性皮肤病 | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 条件性敲除Prmt5小鼠及其对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | NA |
| 295 | 2026-05-09 |
High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70715
PMID:41457305
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研究论文 | 本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达,激活YAP/β-catenin通路促进PDGF-BB分泌,进而诱导血管平滑肌细胞表型转化并促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次阐明内皮Piezo1通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路介导高剪切应力与颅内动脉瘤形成的机械生物学耦合机制 | 未提及具体局限性 | 探究高剪切应力下内皮Piezo1调控颅内动脉瘤形成的机械生物学机制 | 人类颅内动脉瘤标本、内皮细胞、血管平滑肌细胞、Piezo1基因敲除小鼠颅内动脉瘤模型 | 机器学习和数字病理学未涉及,属于基础医学研究 | 颅内动脉瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 人类颅内动脉瘤样本、小鼠模型(8周龄雄性Piezo1flox/flox小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2026-05-09 |
Single Cell and Spatial Transcriptomics Identify Novel Immune-Stromal Interactions in Cardiac Allograft Vasculopathy
2025-Nov-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7812112/v1
PMID:41333445
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,表征心脏同种异体移植血管病变(CAV)中独特的免疫-基质细胞相互作用,并发现潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,全面解析CAV新生内膜微环境中调节性血管平滑肌细胞和巨噬细胞亚群的相互作用,并确定干扰素信号通路为关键致病机制 | 未说明具体局限性,但可能包括动物模型与人体研究的差异、样本量有限等 | 阐明心脏同种异体移植血管病变(CAV)的细胞和分子机制,寻找新的治疗靶点 | 人类冠状动脉组织(CAV vs 动脉粥样硬化性冠状动脉疾病 vs 非疾病对照)及小鼠CAV模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 人类冠状动脉样本(具体数量未明确)和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression |
| 297 | 2026-05-09 |
Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration
2025-11, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001
PMID:41046113
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综述 | 本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生中的最新进展和新兴策略,重点讨论了其形成机制、工程策略和临床应用,并分析了大规模生产和免疫安全等关键挑战 | 系统总结了三维细胞球体技术在软骨再生中的优势,包括模拟体内微环境、增强细胞间相互作用、促进细胞外基质生成,同时提出结合智能生物材料和机器学习等新兴解决方案以实现个性化标准化生产 | 临床转化受限于细胞球体的长期稳定性有限、大规模生产困难和体内植入后的免疫排斥反应 | 总结三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新发展和未来方向,促进临床转化应用 | 三维细胞球体技术及其在软骨损伤修复、骨关节炎模型构建、药物筛选平台开发中的应用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 三维细胞球体技术、单细胞RNA测序 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 298 | 2026-05-09 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts identifies perivascular neurons resilient to glaucoma
2025-Oct-15, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.07.025
PMID:40840447
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研究论文 | 优化了基于成像的空间转录组学(MERFISH)与免疫染色的工作流程,分析了视网膜平铺片上神经节细胞的空间分布,发现血管周围神经元对青光眼具有抵抗力 | 首次在视网膜平铺片上结合MERFISH和免疫染色,创建了全面的RGC类型空间图谱,揭示了血管周围微环境在神经保护中的作用 | 未提及 | 研究小鼠视网膜神经节细胞的空间分布及其局部微环境对功能的影响,探索青光眼模型中神经元的差异脆弱性 | 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs) | 数字病理学 | 青光眼 | MERFISH, 免疫染色 | NA | 图像 | 小鼠视网膜平铺片(具体样本数未提及) | NA | 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | MERFISH | 成像型空间转录组学结合免疫染色 |
| 299 | 2026-05-09 |
A multimodal atlas of COVID-19 severity identifies hallmarks of dysregulated immunity
2025-Sep-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.19.25334095
PMID:41332837
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research paper | 利用多模式单细胞图谱研究COVID-19严重程度的免疫失调特征 | 首次在单细胞分辨率下整合多数据类型(单细胞RNA-seq、CITE-seq、TCR和BCR测序、病毒载量、中和试验、75种自身抗体、HLA基因型和1463种血清蛋白组学)并纳入托珠单抗治疗和康复期样本,提供对COVID-19严重程度免疫特征的最全面视图 | 未明确说明局限性(文中未提及) | 研究COVID-19严重程度相关的免疫失调标志物,包括托珠单抗治疗和康复期的影响 | 428名患者的2.5百万循环免疫细胞(840份PBMC样本),涵盖急性感染(5个WHO严重度等级)、托珠单抗治疗和康复期(感染后3个月) | machine learning | COVID-19 | 单细胞RNA-seq, CITE-seq, TCR测序, BCR测序, 血清蛋白质组学 | 线性建模 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 病毒载量数据, 自身抗体数据, HLA基因型数据 | 428名患者,840份PBMC样本(2.5百万细胞) | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 300 | 2026-05-09 |
Selective Depletion of CCR8+Treg Cells Enhances the Antitumor Immunity of Cytotoxic T Cells in Lung Cancer by Dendritic Cells
2025-08, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2025.02.029
PMID:40056978
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研究论文 | 该研究探讨了在非小细胞肺癌中通过选择性清除CCR8+调节性T细胞增强细胞毒性T细胞的抗肿瘤免疫作用 | 首次揭示抗CCR8疗法与PD1抑制剂联用通过破坏CCR8+Treg-CCL5+树突状细胞相互作用重塑肿瘤微环境,并明确JAK-STAT通路激活诱导IL-12分泌增强CD8+ T细胞杀伤活性的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本量有限且仅观察了晚期非小细胞肺癌患者联合治疗潜力,尚未开展大规模随机临床试验验证安全性与有效性 | 评估抗CCR8单药及联合PD1抑制剂在非小细胞肺癌中的治疗效果及分子机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型及晚期患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、流式细胞术、多色免疫荧光、Luminex检测 | NA | 基因表达数据、免疫表型数据 | 四种非小细胞肺癌小鼠模型及部分晚期非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |