单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-05-22 |
Spatial transcriptomics reveal PI3K-AKT and metabolic alterations in aggressive, treatment-resistant lactotroph pituitary neuroendocrine tumors
2025-May-19, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02025-9
PMID:40390063
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了侵袭性、治疗抵抗性泌乳素垂体神经内分泌肿瘤中PI3K-AKT和代谢通路的改变 | 首次在DA抵抗性泌乳素PitNET中应用空间转录组学技术，揭示了肿瘤内异质性和PI3K/AKT通路及脂质代谢的改变 | 样本量较小（13例患者），且未观察到从部分响应到完全无响应肿瘤的明确分子模式 | 揭示泌乳素垂体神经内分泌肿瘤的分子异质性，并鉴定侵袭性和药物治疗抵抗的生物标志物 | DA抵抗性泌乳素垂体神经内分泌肿瘤（PitNET） | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | Visium空间转录组学（ST）、全转录组测序（WTS）、全外显子组测序（WES） | NA | 空间转录组数据、基因组数据 | 13例DA抵抗性泌乳素PitNET患者（其中4例进行ST+WTS+WES，5例进行WTS+WES，2例进行ST+WES，2例仅进行ST） |
| 282 | 2025-05-22 |
Corrigendum to "Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics"
2025-May-19, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100088
PMID:40393347
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2025-05-22 |
Neutrophils predominate as IL1B-expressing cells in Schnitzler syndrome: Insights from the SCan study to evaluate the efficacy and safety of canakinumab in Japanese patients
2025-May-19, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.04.003
PMID:40393905
|
research paper | 本研究探讨了Schnitzler综合征（SchS）中IL1B表达细胞的主要来源及canakinumab治疗的疗效和安全性 | 首次在SchS患者中通过单细胞RNA测序和空间转录组分析确定IL1B表达细胞主要为中性粒细胞，并揭示了canakinumab通过调节外周血中性粒细胞动态改善临床症状的机制 | 研究样本量较小（仅5名日本患者），且仅对其中2例进行了单细胞RNA测序和空间转录组分析 | 评估canakinumab在SchS患者中的疗效和安全性，并探索IL1B表达细胞的来源 | 5名日本Schnitzler综合征患者 | 临床医学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析 | NA | 血浆细胞因子/趋化因子水平、外周血和皮肤病变组织的转录组数据 | 5名患者（其中2名进行了单细胞RNA测序和空间转录组分析） |
| 284 | 2025-05-22 |
Identification of progression related LncRNAs in colorectal cancer aggressiveness
2025-May-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02096-7
PMID:40383716
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA和单细胞RNA测序数据，识别了与结直肠癌进展相关的关键长链非编码RNA（lncRNA） | 开发了一个评分系统，结合多种进展相关特征、差异表达和生存分析，系统性优先排序lncRNA，并识别了198个关键lncRNA，包括已知和新候选者 | 未提及具体样本量，且实验验证仅限于部分lncRNA | 探索结直肠癌进展的分子机制，并识别潜在的预后生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌（CRC）患者及其相关lncRNA | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组数据分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 285 | 2025-05-22 |
Identification and verification of a polyamine metabolism-related gene signature for predicting prognosis and immune infiltration in osteosarcoma
2025-May-18, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-05716-0
PMID:40383808
|
research paper | 本研究旨在识别与骨肉瘤预后相关的多胺代谢相关基因，并开发预后模型，为骨肉瘤患者的靶向治疗提供新见解 | 首次识别并验证了与骨肉瘤预后相关的多胺代谢相关基因特征，并构建了预测模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探索多胺代谢相关基因在骨肉瘤预后中的作用，并开发预测模型 | 骨肉瘤患者及其相关基因表达数据 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、单变量Cox回归、LASSO回归、单细胞RNA测序、逆转录定量PCR、Western blotting、免疫组化 | 风险模型、列线图模型 | 基因表达数据、临床样本数据 | 96个候选基因，8个预后基因在临床样本中验证 |
| 286 | 2025-05-22 |
Single-cell transcriptomic characterization of microscopic colitis
2025-May-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59648-8
PMID:40383833
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析结肠黏膜组织，构建显微镜下结肠炎的细胞和分子模型 | 揭示了显微镜下结肠炎中CD8 T细胞的显著扩张及其高度细胞毒性和炎症表型的转变，以及CD4 T调节细胞的扩张 | 研究仅限于结肠黏膜组织，未涉及其他可能相关的组织或细胞类型 | 探究显微镜下结肠炎的细胞和分子机制 | 结肠黏膜组织 | 单细胞转录组学 | 显微镜下结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 287 | 2025-05-22 |
ZC3H12D gene expression exhibits dual effects on the development and progression of lung adenocarcinoma
2025-May-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02163-z
PMID:40383849
|
研究论文 | 本研究探讨了ZC3H12D基因在肺腺癌进展和肿瘤微环境调节中的多面作用 | 揭示了ZC3H12D在免疫细胞和恶性细胞中的空间双重作用，挑战了传统生物标志物的范式 | 研究主要基于体外实验和计算生物学分析，需要进一步的体内实验验证 | 探索ZC3H12D在肺腺癌中的生物学功能和临床意义 | 肺腺癌组织和细胞 | 精准肿瘤学 | 肺腺癌 | 多组学分析、单细胞RNA-seq、免疫组化、计算生物学方法 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA-seq数据 | 511个肿瘤样本和59个正常样本（转录组），74个肿瘤样本和69个正常样本（蛋白质组），15个肿瘤样本和11个正常样本（单细胞RNA-seq），51对匹配样本（免疫组化） |
| 288 | 2025-05-22 |
Alcohol consumption and esophageal cancer risk: unveiling DLEU2 as a key immune modulator through Mendelian randomization and transcriptomic analysis
2025-May-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02660-7
PMID:40383861
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了酒精消费与食管癌风险之间的遗传和分子机制，并发现DLEU2作为关键的免疫调节因子 | 首次通过孟德尔随机化分析确认酒精消费与食管癌之间的因果关系，并发现DLEU2作为长链非编码RNA在肿瘤免疫微环境和癌症进展中的关键作用 | 研究样本量未明确说明，且机制研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索酒精消费导致食管癌的遗传和分子机制 | 食管癌患者样本和相关的基因表达数据 | 癌症基因组学 | 食管癌 | 孟德尔随机化分析、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者来源的样本（具体数量未说明） |
| 289 | 2025-05-22 |
Metabolism-associated marker gene-based predictive model for prognosis, targeted therapy, and immune landscape in ovarian cancer: an integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing with spatial transcriptomics
2025-May-17, BMC women's health
DOI:10.1186/s12905-025-03750-y
PMID:40382612
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和空间转录组学数据，构建了一个基于代谢相关标记基因的预后模型，用于卵巢癌的预后预测、靶向治疗和免疫景观分析 | 首次结合四种代谢途径（糖酵解代谢、脂质代谢、胆碱代谢和鞘脂代谢）构建卵巢癌预后模型，并预测了潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，部分实验验证仍需进一步扩大样本量 | 开发有效的卵巢癌预后生物标志物并探索新的治疗靶点 | 卵巢癌患者样本和癌细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, bulk RNAseq, 空间转录组学, RT-qPCR, CCK-8, Transwell实验 | 代谢相关基因预后模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据, 实验数据 | TCGA-OV样本及实验验证样本（数量未明确说明） |
| 290 | 2025-05-22 |
Evaluation of tumour pseudocapsule using computed tomography-based radiomics in pancreatic neuroendocrine tumours to predict prognosis and guide surgical strategy: a cohort study
2025-May-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002511
PMID:40395025
|
研究论文 | 本研究通过基于计算机断层扫描的放射组学评估胰腺神经内分泌肿瘤的假包膜状态，以预测预后并指导手术策略 | 结合放射组学和机器学习术前识别假包膜状态，为小肿瘤患者提供更精准的手术策略 | 研究样本仅来自单一医疗机构，可能存在选择偏倚 | 评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态对手术策略选择和预后预测的价值 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, 放射组学分析 | 机器学习模型 | 影像数据, 临床数据 | 578例接受首次胰腺切除术的患者（最终纳入475例） |
| 291 | 2025-05-22 |
Regulation of RNA polymerase II transcription through re-initiation and bursting
2025-May-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2025.04.011
PMID:40378829
|
review | 本文总结了真核细胞中RNA聚合酶II（RNAPII）爆发性转录的调控策略，重点关注RNAPII的重新启动机制 | 提出了RNAPII重新启动和爆发性转录作为基因调控的常见现象，并探讨了其分子机制和争议 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于已有研究的总结 | 探讨RNAPII转录调控的分子机制及其在健康和疾病中的意义 | RNA聚合酶II（RNAPII）及其转录调控机制 | 分子生物学 | NA | 活细胞成像、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 292 | 2025-05-22 |
IGFBP7: A novel biomarker involved in a positive feedback loop with TGF-β1 in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-May-15, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111867
PMID:40381971
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，发现IGFBP7作为特发性肺纤维化(IPF)的新型生物标志物，并与TGF-β1形成正反馈循环 | 首次鉴定IGFBP7作为IPF的新型生物标志物，并揭示其与TGF-β1的正反馈循环机制 | 研究主要基于公共数据集和体外模型，需要进一步临床验证 | 寻找IPF的诊断和治疗新靶点 | 特发性肺纤维化(IPF)患者样本和细胞模型 | 生物医学研究 | 肺纤维化 | scRNA-seq, 批量RNA测序, 双免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据 | 公共数据集中的IPF样本和体外细胞模型 |
| 293 | 2025-05-22 |
Phenotypic heterogeneity and plasticity in colorectal cancer metastasis
2025-May-15, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100881
PMID:40393458
|
研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌（CRC）中表型异质性和可塑性在肿瘤进展、转移和治疗抵抗中的关键作用 | 揭示了具有再生和炎症表型的癌细胞状态，这些状态与小鼠模型中的转移起始细胞极为相似，并识别了一个具有混合再生和干细胞表型的中间群体 | 调控因素和驱动表型异质性的外在信号仍不明确 | 揭示结直肠癌转移中的表型异质性和可塑性的调控机制 | 结直肠癌（CRC）患者 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞多组学和空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组数据 | 原发性和转移性CRC患者样本 |
| 294 | 2025-05-22 |
Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412159122
PMID:40324076
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了特发性正常压力脑积水（iNPH）患者外周血和脑室脑脊液的细胞图谱，揭示了与认知功能下降相关的免疫失调现象 | 首次构建了iNPH患者的单细胞转录组图谱，发现外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变与认知功能下降相关，并识别了可能代表脑室周围神经胶质细胞脱落的脑脊液细胞群 | 样本量相对有限（140,207个单细胞转录组），且仅针对iNPH患者进行研究 | 探究特发性正常压力脑积水患者外周血和脑脊液的免疫特征及其与认知功能的关系 | 特发性正常压力脑积水（iNPH）患者的外周血和脑室脑脊液样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 140,207个单细胞转录组 |
| 295 | 2025-05-22 |
Hdac1 as an early determinant of intermediate-exhausted CD8+ T cell fate in chronic viral infection
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502256122
PMID:40333757
|
research paper | 该研究揭示了组蛋白去乙酰化酶1（Hdac1）在慢性病毒感染中作为中间耗竭CD8+ T细胞命运早期决定因子的作用 | 首次发现Hdac1对T-int细胞亚群分化的特异性调控作用，并阐明其通过表观遗传机制同时促进T-int细胞命运和抑制耗竭程序过度激活的双重功能 | 研究主要基于小鼠慢性病毒感染模型，在人类疾病中的普适性需要进一步验证 | 探究慢性病毒感染中CD8+ T细胞不同耗竭亚群分化的表观遗传调控机制 | 抗原特异性CD8+ T细胞亚群（Tcf1干细胞样细胞、T-int中间耗竭细胞和终末耗竭细胞） | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞转录组测序、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA（未明确说明具体样本数量） |
| 296 | 2025-05-22 |
Interferon-induced activation of dendritic cells and monocytes by yellow fever vaccination correlates with early antibody responses
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2422236122
PMID:40333758
|
研究论文 | 研究黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的干扰素诱导激活与早期抗体反应的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞亚群的激活状态及其与早期IgM抗体反应的相关性 | 研究仅关注了疫苗接种后的早期免疫反应，未评估长期免疫保护机制 | 阐明黄热病疫苗接种后早期先天免疫事件与快速产生保护性免疫的关系 | 人类血液中的树突状细胞和单核细胞亚群 | 免疫学 | 黄热病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据 | 大量疫苗接种者的血液样本 |
| 297 | 2025-05-22 |
Circadian clock-gated cell renewal controls time-dependent changes in taste sensitivity
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421421122
PMID:40339128
|
研究论文 | 研究探讨了昼夜节律钟调控的细胞周期进程如何影响小鼠舌上皮中味觉敏感性的时间依赖性变化 | 揭示了昼夜节律通过调控干细胞增殖和细胞死亡来影响味觉细胞群体动态变化的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探索昼夜节律如何通过细胞更新调控味觉敏感性的时间依赖性变化 | 小鼠舌上皮细胞和味蕾类器官(TBOs) | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠舌上皮细胞和味蕾类器官 |
| 298 | 2025-05-22 |
Targeting mesenchymal monocyte-derived macrophages to enhance the sensitivity of glioblastoma to temozolomide by inhibiting TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1 axis
2025-May-13, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.032
PMID:40373963
|
研究论文 | 本研究通过识别一种新型的单核细胞衍生巨噬细胞亚型MES-MDM，揭示了其在促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药性中的作用机制，并提出了针对MES-MDM的治疗策略 | 首次识别了MES-MDM这一新型MDM亚型，并阐明了其通过TNF-CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1轴促进胶质母细胞瘤对TMZ耐药性的机制 | 研究结果需要在更大规模的临床试验中进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药性的机制并开发新的治疗策略 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其微环境中的单核细胞衍生巨噬细胞(MDM) | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、患者来源的GBM类器官模型、颅内原位GBM模型 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA |
| 299 | 2025-05-22 |
Immune-endothelial cell crosstalk in hepatic endothelial injury of liver fibrotic mice
2025-May-13, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177730
PMID:40374060
|
研究论文 | 本研究探讨了肝纤维化中肝内皮细胞损伤的机制及细胞间通讯的潜在调控途径 | 揭示了肝内皮细胞与免疫细胞间的通讯机制，特别是通过Ptprc-Mrc1和Sell-Podxl信号通路维持细胞间相互作用 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本 | 探索肝纤维化中肝内皮细胞损伤的机制及细胞间通讯的调控途径 | C57BL/6雄性小鼠的肝内皮细胞和免疫细胞 | 肝脏病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、扫描电子显微镜（SEM）、PCR技术 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 24,534个细胞 |
| 300 | 2025-05-22 |
Spatial multi-omics reveals the potential involvement of SPP1+ fibroblasts in determining metabolic heterogeneity and promoting metastatic growth of colorectal cancer liver metastasis
2025-May-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.004
PMID:40340245
|
研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌肝转移（CRLM）中关键微观区域的作用，重点关注癌症相关成纤维细胞（CAFs）在促进肿瘤进展中的关键作用，并利用多组学技术为其诊断和治疗提供分子和代谢水平的见解 | 发现了SPP1+成纤维细胞在CRLM中的代谢异质性和促进转移性生长中的潜在作用，并通过空间多组学技术揭示了其与肿瘤细胞的相互作用 | 样本量较小（仅2名未治疗CRLM患者的12个新鲜手术样本），可能限制结果的普遍性 | 研究CRLM中关键微观区域的作用，特别是CAFs在肿瘤进展中的作用，为诊断和治疗提供分子和代谢水平的见解 | 结直肠癌肝转移（CRLM）患者的手术样本和冷冻组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学（ST）、空间代谢组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、RT-qPCR、非靶向代谢组学 | NA | 空间转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA测序数据 | 12个新鲜手术样本（来自2名患者），92个冷冻组织样本（来自40名患者） |