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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-11-14 |
Analysis of the SH3-Domain Kinase Binding Protein 1 Predictive Model for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and CCCTC-Binding Factor Transcriptional Regulatory Study
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2668
PMID:41208840
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研究论文 | 通过多组学整合分析系统评估SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达模式、生物学功能及调控机制 | 首次通过机器学习算法结合多组学数据鉴定SH3KBP1作为胰腺癌关键预测生物标志物,并揭示CTCF转录因子对其的调控机制 | 样本量相对有限(179例肿瘤样本和171例非肿瘤样本),需更大规模验证 | 系统研究SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达特征、生物学功能及转录调控机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织及细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR基因敲除,转录因子结合位点预测 | 支持向量机(SVM),LASSO回归,SHAP分析 | mRNA表达数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 | 179例PDAC肿瘤样本,171例非肿瘤样本(包括4例癌旁组织和167例正常对照),300对PDAC和非肿瘤样本的蛋白质组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 所有分析均在R平台上使用专业软件包完成 |
| 282 | 2025-11-14 |
Bioinformatics driven in gene targeting platform for gold anticancer strategy delivery
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102438
PMID:41209699
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别TNBC中高表达基因SDC1,并构建金纳米簇靶向核酸递送系统抑制肿瘤血管生成 | 首次发现SDC1基因与TNBC预后及依托泊苷耐药性的正相关性,并开发了基于肿瘤微环境响应性的金纳米簇靶向递送系统 | NA | 发现新的靶向基因并开发核酸递送系统用于三阴性乳腺癌治疗 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因芯片数据分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-11-14 |
Probiotics derived sodium benzoate improves social behavior of offspring exposed in the maternal immune activation through regulation of histone lysine benzoylation in astrocytes
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03164-0
PMID:40855005
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研究论文 | 本研究揭示益生菌衍生的苯甲酸钠通过调控星形胶质细胞组蛋白赖氨酸苯甲酰化改善母体免疫激活后代社交行为 | 首次发现益生菌代谢物苯甲酸钠通过组蛋白赖氨酸苯甲酰化表观遗传机制调节星形胶质细胞功能,揭示微生物-肠-脑轴新作用通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探索益生菌代谢物改善自闭症谱系障碍社交行为的分子机制 | 母体免疫激活诱导的自闭症小鼠模型及星形胶质细胞 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,RNA测序,Cut & Tag分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,表观遗传数据 | 自闭症队列人群及MIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,表观遗传分析 | NA | NA |
| 284 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
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研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食行为中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群,并发现其在摄食状态下的激活机制 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型,在成年动物和人类中的保守性需要进一步验证 | 阐明侧下丘脑神经元在食欲调控中的分子和细胞特征及其进化保守性 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,Act-seq方法,整合比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元(饥饿和饱食状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法(活动依赖性转录特征捕获) |
| 285 | 2025-11-14 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
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研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键连接分子,并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 侵袭性乳腺癌基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,图像数据,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2025-11-14 |
Mapping atherogenesis mechanisms in smooth muscle cells by targeting genes linked to coronary artery disease
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113698
PMID:41210961
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研究论文 | 本研究结合冠状动脉疾病GWAS与单细胞RNA测序,识别平滑肌细胞中的风险基因并揭示其在动脉粥样硬化中的调控机制 | 首次将CAD GWAS与动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序整合,通过扰动实验发现不同风险基因共同调控收缩装置、细胞周期等关键通路 | 研究主要聚焦于平滑肌细胞,未全面评估其他血管细胞类型的贡献 | 解析冠状动脉疾病中平滑肌细胞的发病机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及SMC来源的间充质细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 287 | 2025-11-14 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHD7通过SOX5介导的自我激活机制调控心脏神经嵴细胞分化的新机制 | 首次发现CHD7通过与SOX5在上游增强子相互作用实现自我激活,并证明SOX5过表达可恢复CHD7表达和挽救心肌细胞分化 | 研究主要基于体外细胞培养模型,需要进一步体内验证 | 阐明CHARGE综合征相关先天性心脏缺陷的分子机制 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-11-14 |
Early female germline development in Xenopus laevis: Stem cells, nurse cells, and germline cysts
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2522343122
PMID:41213017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术重建了非洲爪蟾早期雌性生殖系发育过程,揭示了生殖细胞囊肿的极性和功能 | 首次在非哺乳动物脊椎动物中识别出独特的生殖干细胞群体,并发现囊肿细胞中形成不对称的类fusome结构,约80%的囊肿细胞具有滋养细胞命运而非形成卵母细胞 | 研究主要聚焦于非洲爪蟾,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究非哺乳动物脊椎动物卵巢中生殖细胞囊肿的极性和功能 | 非洲爪蟾的雌性生殖系发育过程,包括生殖干细胞、囊肿细胞和卵母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2025-11-14 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
|
研究论文 | 本研究揭示DPF2通过调控CACNA1D表达和MAPK通路影响巨噬细胞炎症极化,从而调节肠道损伤与再生过程 | 首次发现DPF2通过表观遗传调控CACNA1D表达影响巨噬细胞极化,并建立了DPF2-CACNA1D-MAPK信号轴在肠道炎症中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症极化的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病患者样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 小鼠模型、患者来源类器官和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2025-11-14 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
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研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化框架结合神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关系及小胶质细胞相关网络的作用机制 | 首次采用双向孟德尔随机化方法系统分析血浆、脑脊液和脑组织蛋白质与AD的因果关系,并结合单细胞转录组数据和神经病理学验证构建了小胶质细胞相关网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,无法完全排除潜在混杂因素的影响,且样本来源主要为死后脑组织 | 阐明外周生物标志物与中枢系统在阿尔茨海默病发生发展中的相互作用机制 | 血浆蛋白质(734种)、脑脊液蛋白质(151种)、脑组织蛋白质(1296种)及AD患者死后脑组织标本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 蛋白质相互作用分析 | 双向孟德尔随机化框架 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 神经病理学图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种脑蛋白及AD死后脑组织标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 291 | 2025-11-14 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中副凋亡相关基因的景观及其与预后和免疫微环境的关联 | 首次系统描绘骨肉瘤中副凋亡相关基因景观,发现TNK2在副凋亡调控中的关键作用 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索骨肉瘤中副凋亡相关基因的预后价值和免疫微环境特征 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 共识聚类, 通路富集分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2025-11-14 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
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综述 | 探讨抗菌药物、双硫仑和二甲双胍通过RNA测序技术在癌症治疗中的再利用潜力 | 系统阐述RNA测序在药物重定位中的作用机制,整合单细胞和空间转录组学提升治疗精准性 | 临床转化结果不一致,存在药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境等挑战 | 通过转录组学指导药物重定位以改善癌症治疗效果 | 抗菌药物(阿奇霉素、克拉霉素等)、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 293 | 2025-11-14 |
XIAP-ULK1-mediated mitophagy modulates carnitine metabolism to mitigate diabetic kidney disease
2025-Nov-13, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2581214
PMID:41139215
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研究论文 | 本研究揭示了XIAP-ULK1介导的线粒体自噬通过调节肉碱代谢缓解糖尿病肾病的分子机制 | 首次发现XIAP通过K48连接的多聚泛素化导致ULK1降解,从而损害线粒体自噬并破坏肉碱代谢的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,需要进一步临床验证 | 探讨XIAP-ULK1介导的线粒体自噬在糖尿病肾病中的作用及治疗潜力 | 糖尿病肾病患者肾活检组织、糖尿病小鼠模型、高糖处理的肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 糖尿病肾病 | 分子对接、免疫组织化学、免疫荧光、液相色谱-质谱联用、单细胞RNA测序、透射电子显微镜 | NA | 分子互作数据、基因表达数据、代谢组学数据、组织病理学数据 | 糖尿病肾病患者肾活检组织、糖尿病小鼠模型、体外培养的肾小管上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2025-11-14 |
Destruction of VISTA by TRIM25 ablation in T cells potentiates cancer immunotherapy
2025-Nov-13, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01186-5
PMID:41225152
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM25通过稳定VISTA蛋白调控T细胞功能的新机制,并证明靶向TRIM25-VISTA可增强癌症免疫治疗效果 | 首次发现TRIM25是VISTA的正向调控因子,阐明了ERK介导的VISTA磷酸化增强其与TRIM25互作的分子机制,并开发了可破坏该互作的磷酸肽抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索VISTA免疫检查点的调控机制并开发增强癌症免疫治疗的新策略 | T细胞中的VISTA蛋白及其调控因子TRIM25 | 免疫学 | 癌症 | CRISPR基因敲除筛选、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 295 | 2025-11-14 |
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2025-Nov-13, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322482
PMID:41230600
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综述 | 本文总结了肺高血压中内皮细胞异质性的最新研究进展,重点关注特定内皮细胞亚群的作用及靶向内皮功能障碍的新型治疗策略 | 整合前沿技术揭示内皮异质性如何塑造肺高血压的疾病轨迹,为未来治疗创新开辟新途径 | NA | 探讨肺高血压中内皮细胞异质性对血管重塑的影响及治疗靶点识别 | 肺内皮细胞及其在肺高血压中的不同亚群 | 单细胞生物学 | 肺高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2025-11-14 |
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0495
PMID:41230722
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研究论文 | 本研究探讨胃癌患者中神经元自身抗体与总体生存期的关联 | 首次在无副肿瘤综合征的胃癌患者中发现神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短和肿瘤免疫抑制微环境的关联 | 单中心队列研究,样本量有限,需要进一步机制研究验证 | 探究胃癌患者神经元自身抗体与临床预后的关系 | 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 免疫荧光,组织基础检测,细胞基础检测,单细胞测序 | NA | 血清学数据,单细胞测序数据,临床预后数据 | 323例胃癌患者(TBA阳性144例,TBA阴性179例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2025-11-14 |
Pan-cancer single-cell RNA sequencing analysis refines multi-origin monocyte and macrophage lineages
2025-Nov-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1255
PMID:41231218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析构建泛癌骨髓细胞图谱,揭示肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型及其与临床预后的关联 | 提出肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型:C1QC+ TAMs来源于组织驻留巨噬细胞,SPP1+和ISG15+ TAMs来源于循环单核细胞 | NA | 解析肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 健康组织和泛癌组织中的骨髓细胞群体 | 单细胞组学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2025-11-14 |
PPARα Activation-Mediated Testosterone Reduction as the Key Adverse Outcome Pathway for Cd-Induced Male Infertility: A Novel Integrated Approach
2025-Nov-13, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c09190
PMID:41231235
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研究论文 | 本研究通过整合多种方法识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 首次系统构建镉诱导男性不育的AOP网络并识别PPARα激活介导睾酮减少为关键通路 | 未明确说明样本规模和研究人群的局限性 | 识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 镉暴露的男性生殖系统 | 环境毒理学 | 男性不育 | 单细胞测序,网络毒理学,分子建模,动物实验 | NA | 单细胞测序数据,NHANES流行病学数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2025-11-14 |
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2025-Nov-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0940
PMID:41231245
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研究论文 | 开发了CanSig基准测试工具,用于评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 开发了首个综合评估单细胞转录组特征发现方法可重复性的基准测试框架 | 仅评估了13种方法在12个数据集上的表现,覆盖的癌症类型和方法数量有限 | 建立标准化框架评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 单细胞RNA测序数据和癌症细胞状态发现方法 | 生物信息学 | 多癌种(胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤、皮肤鳞状细胞癌) | 单细胞RNA测序 | 多种整合方法(包括Harmony、BBKNN、fastMNN等) | 单细胞转录组数据 | 185名患者的174,000个恶性细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-11-14 |
Insulin production is sustained during DNA damage-mediated senescence in adult human beta cells
2025-Nov-13, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06603-3
PMID:41231256
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研究论文 | 本研究探讨DNA损伤介导的衰老对成人胰岛β细胞胰岛素产生的影响 | 首次证明在DNA损伤介导的衰老过程中,成人胰岛β细胞仍能维持胰岛素产生能力 | 研究主要使用体外诱导的衰老模型,体内验证仍需进一步研究 | 阐明DNA损伤相关衰老对胰岛β细胞胰岛素产生的影响机制 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5人β细胞系 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | Western blot, ELISA, 流式细胞术, FACS, 免疫荧光染色 | NA | 蛋白质印迹数据, 酶联免疫数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5细胞系及公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | Humanislets.com蛋白质组学数据库和Human Pancreas Analysis Program单细胞RNA测序数据库 |