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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-06-18 |
High-resolution single-cell sequencing of trans-spliced mRNA
2026-Jun-16, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-026-01373-7
PMID:42303775
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2026-06-18 |
Construction of a diagnostic model for nasopharyngeal carcinoma using a consensus machine learning approach and study of immune infiltration characteristics
2026-Jun-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05443-w
PMID:42303913
|
研究论文 | 通过共识机器学习方法构建鼻咽癌诊断模型并研究免疫浸润特征 | 整合单细胞转录组与批量转录组数据,结合四种机器学习算法筛选核心基因,构建高精度诊断模型,并探索免疫微环境与潜在治疗药物 | 模型验证基于公共数据集,缺乏临床前瞻性队列的外部验证;药物治疗预测仅停留在计算模拟和分子对接,缺乏实验验证 | 开发鼻咽癌可靠诊断生物标志物,揭示肿瘤微环境免疫浸润特征及潜在治疗靶点 | 鼻咽癌组织和对照组织 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 机器学习(机器学习算法), 分子对接 | LASSO, SVM-RFE, Boruta, XGBoost | 单细胞转录组数据, 批量转录组表达数据 | 单细胞数据:67,535个细胞;验证集和外部独立验证集的样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2026-06-18 |
SpatialCell AI achieves reference-free single-cell resolution from spot-based spatial transcriptomics through morphology-guided enhancement
2026-Jun-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55246-w
PMID:42304094
|
研究论文 | 提出SpatialCell AI框架,实现无需参考、无需训练的基于形态学引导的空间转录组学单细胞分辨率增强 | 首个结合免训练操作、免参考表达整合和逐细胞输出粒度的空间转录组学框架,无需外部scRNA-seq参考或每数据集模型训练 | 未提及具体限制,但未说明在其他平台或更大规模数据上的泛化性能,且仅在一个样本上验证 | 开发一种免训练、免参考的方法,将斑点级空间转录组数据提升至单细胞分辨率 | 匹配的结直肠癌样本(通过Visium 55 μm、Visium HD 8 μm和16 μm以及Xenium单细胞金标准分析) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 图像、空间转录组表达数据 | 一个匹配的结直肠癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Visium HD, 10x Xenium | 10x Visium(55 μm斑点间距),10x Visium HD(8 μm和16 μm),10x Xenium(单细胞金标准) |
| 284 | 2026-06-18 |
Microglial dysregulation and spatiotemporal dynamics of inflammation in multiple sclerosis white matter: an integrative transcriptomic analysis
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08360-2
PMID:42304359
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析多发性硬化症白质中小胶质细胞失调和炎症的时空动态变化 | 首次整合单细胞核RNA测序和空间转录组学,揭示多发性硬化症白质中小胶质细胞异质性和IKZF1转录调节因子的作用,并识别病变边缘为炎症热点区域 | 未提供明确的局限性信息 | 通过整合单细胞和空间转录组学,研究多发性硬化症白质中细胞特异性变化和空间异质性,指导潜在临床干预 | 多发性硬化症白质组织样本 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 285 | 2026-06-18 |
An integrative framework combining Mendelian randomization, single-cell profiling, and experimental validation identifies FTMT as a mitochondrial-immune regulator in non-small cell lung cancer
2026-Jun-16, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04387-z
PMID:42304365
|
研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、单细胞分析和实验验证,发现FTMT作为线粒体-免疫调节因子在非小细胞肺癌中发挥保护作用 | 首次将孟德尔随机化、单细胞转录组学和体外实验相结合,揭示FTMT通过MICB介导的线粒体-免疫轴降低非小细胞肺癌风险 | 血液基因代理与肿瘤细胞实验结果的差异表明存在情境依赖性调节,且MICB信号的介导作用仅占FTMT效应的一小部分 | 探究FTMT与非小细胞肺癌风险之间的因果关系及其潜在机制 | 非小细胞肺癌患者及其肿瘤微环境 | 机器学 | 肺癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、qPCR、Western blotting | NA | 基因型数据、表达数据 | 血浆蛋白质组pQTL汇总统计(UK Biobank Pharma Proteomics Project)和NSCLC GWAS汇总统计(FinnGen R12) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2026-06-18 |
Single-cell and spatial transcriptomes reveal oligodendrocyte remodeling fatty acid metabolism microenvironment of lung cancer brain metastases
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08447-w
PMID:42304367
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学分析肺腺癌脑转移中少突胶质细胞的脂质代谢重编程及其对肿瘤增殖和免疫抑制的促进作用 | 首次揭示少突胶质细胞在肺腺癌脑转移中经历脂肪酸代谢重编程,其分泌的脂肪酸促进肿瘤细胞增殖并诱导巨噬细胞向免疫抑制表型极化,并鉴定出Mac_FABP4巨噬细胞亚群作为脂质驱动免疫抑制的候选介质 | 研究主要基于公开数据集和体外共培养模型,缺乏体内功能性验证;未探讨其他胶质细胞类型的潜在协同作用 | 探究肺腺癌脑转移中少突胶质细胞的脂质代谢重编程及其对肿瘤增殖和免疫调节的功能性影响 | 肺腺癌脑转移中的少突胶质细胞、肿瘤细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 脂质组学, 脂质示踪技术, Western blot, qPCR, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 脂质组数据, 图像 | 独立单细胞RNA测序数据集(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2026-06-18 |
Single-cell multi-omics dissection of RevitalAge Markers uncovers age-dependent immunotherapy resistance and druggable targets in melanoma
2026-Jun-16, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00860-x
PMID:42304383
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析构建RevitalAge标记物图谱,揭示年龄依赖性免疫治疗耐药性及黑色素瘤中的可成药靶点 | 首次利用MOFA算法整合多组学数据识别年龄驱动因子,发现Factor6(RevitalAge Marker)与年龄负相关且具有保护作用,并基于机器学习鉴定了五个核心免疫治疗响应预测特征 | 未提及具体局限性 | 探索年龄相关分子重编程对黑色素瘤进展和治疗敏感性的影响机制 | 黑色素瘤细胞、内皮细胞、成纤维细胞等肿瘤微环境细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | MOFA、机器学习模型 | 基因组、转录组、甲基化、拷贝数变异数据 | 整合了三个单细胞RNA测序数据集,包含4796个RAM+细胞和7229个RAM-细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2026-06-18 |
Identifying NOTCH signaling-specialized hematopoietic supportive subpopulation from mesenchymal stem cells
2026-Jun-16, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05095-1
PMID:42304412
|
研究论文 | 鉴定间充质干细胞中具有NOTCH信号特化的造血支持功能亚群 | 首次发现MLPH和LPXN作为标志物可分离具有高NOTCH信号活性、增强造血支持和免疫抑制能力的人脐带间充质干细胞亚群 | 未明确提及,但样本仅来自两个供体,需进一步验证 | 探究体外扩增过程中人脐带间充质干细胞的细胞异质性,并鉴定具有最佳临床功能的特定亚群 | 人脐带间充质干细胞及其在体外扩增过程中的不同亚群 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 两个胎儿脐带,共78,178个细胞和14个亚群 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 289 | 2026-06-18 |
DISCERN: inferring drug sensitivity from single-cell transcriptomes using cell-type-specific genetic interaction networks
2026-Jun-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01688-w
PMID:42304445
|
研究论文 | 基于单细胞转录组数据构建细胞类型特异性遗传相互作用网络,开发推断药物敏感性的新计算框架DISCERN | 首次构建覆盖14种人类癌症的细胞类型特异性合成致死和合成存活网络图谱,并开发了基于恶性细胞特异性遗传相互作用推断单细胞药物敏感性的计算方法 | 未在摘要中明确说明局限性 | 利用细胞类型特异性遗传相互作用网络推断单细胞药物敏感性,助力癌症治疗研究 | 14种人类癌症的细胞类型(包括恶性细胞和T细胞) | 计算生物学 | 肺癌,乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14种人类癌症的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2026-06-18 |
Integrative spatiotemporal transcriptomics identifies a liver metastasis-related initial cell population associated with the SEMA3A-NRP1 axis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08451-0
PMID:42304476
|
研究论文 | 整合时空转录组学分析,鉴定了与胰腺导管腺癌肝转移相关的初始细胞群及其SEMA3A-NRP1信号轴 | 首次利用单细胞和空间转录组学数据识别出与肝转移相关的初始细胞群(LMIC),并揭示了CAF-SEMA3A-NRP1轴在空间微环境中的调控作用 | 需要进一步体外和体内实验验证LMIC的转移机制以及SEMA3A-NRP1轴的治疗靶点潜力 | 阐明胰腺导管腺癌肝转移相关的初始细胞群的转录特征及其与微环境的空间交互作用 | 胰腺导管腺癌肿瘤样本、癌症相关成纤维细胞、恶性上皮细胞亚群 | 机器学习, 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 10x空间转录组学, 免疫组化 | VECTOR, scTour, Monocle2, CellChat, CellPhoneDB, RCTD, MISTy | 转录组数据 | 多个临床队列的转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 291 | 2026-06-18 |
H4K12 lactylation drives TREM2high macrophages differentiation in liver fibrosis
2026-Jun-16, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001808
PMID:42307631
|
研究论文 | 本文通过多组学分析发现H4K12乳酰化驱动TREM2高表达巨噬细胞分化,促进肝纤维化 | 首次揭示H4K12乳酰化在TREM2高表达巨噬细胞分化中的关键作用,并阐明TREM2/LDHA/H4K12la正反馈环路 | 未提及具体局限性 | 探究TREM2高表达巨噬细胞在肝纤维化中的分化机制及其促纤维化功能 | 人和小鼠的纤维化肝脏组织以及单核细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 转录组学、4D蛋白质组学、CUT&Tag、WGCNA、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组蛋白修饰数据 | 人和小鼠纤维化肝脏样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2026-06-18 |
Divergent macrophage-regulated T cell states determine response to Bacillus Calmette-Guérin vaccine in high-risk bladder cancer
2026-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200442
PMID:42081487
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BCG治疗高风险膀胱癌的免疫应答差异,发现巨噬细胞调控的T细胞状态决定治疗反应 | 首次揭示BCG应答者与非应答者中Th17样Th1细胞与CD8+ T细胞耗竭的差异机制,并利用机器学习识别预测性细胞因子 | 未描述具体限制 | 探究BCG疗法对高风险膀胱癌的免疫激活机制,比较应答者与非应答者的局部及全身免疫反应 | BCG治疗的高风险膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 细胞表达数据 | BCG应答者与非应答者的膀胱免疫细胞及循环免疫细胞样本 | 10x Genomics(假设,基于单细胞RNA测序技术) | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium(假设) | NA |
| 293 | 2026-06-18 |
Aging reprograms microglia toward an inflammasome-linked response to traumatic brain injury
2026-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI207022
PMID:42294901
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研究论文 | 该研究结合单细胞转录组学、代谢组学和染色质分析,揭示了衰老如何重新编程小胶质细胞,使其在创伤性脑损伤后转向炎症小体相关反应 | 首次将年龄从临床风险因素转化为一组可药物干预的小胶质细胞靶点,并证实了NLRP3炎症小体主导、ELF1驱动转录和糖酵解重编程与保护性Lyz2+反应丧失之间的关联 | 信息不足 | 探究衰老导致创伤性脑损伤后易感性增加的生物学机制 | 小鼠模型及人类创伤性脑损伤组织中的小胶质细胞 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞转录组学、代谢组学、染色质分析 | 信息不足 | 转录组、代谢组、染色质数据 | 小鼠模型及人类组织样本 | 信息不足 | 单细胞转录组学 | 信息不足 | 信息不足 |
| 294 | 2026-06-18 |
Stepwise single-cell-resolved deep immunophenotyping pipeline to characterise immune heterogeneity and functionality in health and disease
2026-Jun-13, Journal of immunological methods
IF:1.6Q4
DOI:10.1016/j.jim.2026.114076
PMID:42288331
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研究论文 | 提出一种逐步单细胞分辨率的深度免疫表型分析流程,用于表征健康和疾病中的免疫异质性与功能 | 整合了严格的预分析措施和第一步细胞术分析,以合理引导后续高效、无偏的单细胞RNA测序表征,避免了试错法并降低了成本 | 主要基于临床研究中的CD8 T细胞亚群示例,可能在其他疾病背景下的通用性需进一步验证 | 开发一种能够实现高维度免疫组成和功能表征以及无偏基因组水平分子谱分析的逐步单细胞分辨率深度免疫表型分析流程 | 健康和疾病状态下的免疫细胞,特别是CD8 T细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞术数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 295 | 2026-06-18 |
Early-life manganese overexposure induces dysfunction in energy metabolism conversion that leads to disrupted hippocampal neurogenesis in mouse offspring via METTL3-mediated Cdc25b m6A modification
2026-Jun-13, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142703
PMID:42302365
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研究论文 | 早期锰过量暴露通过METTL3介导的Cdc25b m6A修饰,干扰能量代谢转换,导致小鼠后代海马神经发生异常 | 首次揭示早期锰暴露通过能量代谢转换障碍和METTL3介导的Cdc25b mRNA m6A修饰,导致神经干细胞分化受阻的分子机制 | 未明确能量代谢转换障碍与METTL3修饰之间的直接上下游关系,且仅在动物模型和原代细胞中验证 | 探究早期锰暴露引起海马神经发生异常的分子机制,特别是能量代谢转换与Cdc25b mRNA衰变的关系 | C57BL/6小鼠后代及其原代神经干细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠后代(具体数量未给出)及原代神经干细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 296 | 2026-06-18 |
Testosterone disrupts trophoblast function and immune homeostasis via PTGER4/cAMP/RAP1 and ANXA1-FPR1 signaling in PCOS-complicated preeclampsia
2026-Jun-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112672
PMID:42285193
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research paper | 该研究揭示了睾酮通过PTGER4/cAMP/RAP1和ANXA1-FPR1信号通路破坏滋养层功能及免疫稳态,从而在多囊卵巢综合征并发子痫前期中发挥作用 | 首次阐明睾酮介导的PTGER4/cAMP/RAP1轴抑制和ANXA1-FPR1信号受损共同驱动PCOS相关PE的分子机制 | 体外细胞模型可能无法完全模拟体内复杂的母胎界面微环境 | 探讨PCOS与PE共有的分子机制,重点关注睾酮诱导的胎盘功能障碍和免疫失调 | PCOS和PE患者的转录组数据及人滋养层HTR-8/SVneo细胞系 | machine learning | 多囊卵巢综合征、子痫前期 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2026-06-18 |
RRBP1 promotes osimertinib resistance by activating fatty acid oxidation-dependent metabolic and immune reprogramming in EGFR-Mutant lung adenocarcinoma
2026-Jun-12, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118158
PMID:42285369
|
研究论文 | 该研究揭示了RRBP1通过激活脂肪酸氧化依赖的代谢和免疫重编程促进EGFR突变肺腺癌奥希替尼耐药性的机制 | 首次发现RRBP1通过SREBP1-CPT1A-FAO通路驱动脂质代谢重编程并调控M2巨噬细胞极化,建立代谢-免疫串扰与奥希替尼耐药的新关联 | 未明确RRBP1调控脂肪酸氧化的具体分子机制细节,且主要基于体外和生物信息学分析,缺乏体内模型验证 | 探究奥希替尼耐药肺腺癌中脂质代谢重编程的分子机制及免疫调控角色 | EGFR突变肺腺癌肿瘤细胞及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序, 孟德尔随机化分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | 未明确说明具体样本量,涉及单细胞测序和全基因组测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 298 | 2026-06-18 |
Identification of potential targets of kaempferol for the treatment of intervertebral disc degeneration based on network pharmacology and multi-omics analysis
2026-Jun-12, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05567-4
PMID:42283840
|
研究论文 | 基于网络药理学与多组学分析,鉴定山奈酚治疗椎间盘退变的潜在靶点 | 首次综合运用网络药理学、分子对接、批量及单细胞转录组学与实验验证,系统揭示山奈酚治疗椎间盘退变的多靶点机制 | 未在体内动物模型验证靶点功能,且网络药理学预测存在一定假阳性 | 鉴定山奈酚治疗椎间盘退变的分子靶点 | 椎间盘退变组织、IL-1β诱导的髓核细胞 | 机器学习 | 椎间盘退变 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 分子对接 | 基因表达数据 | 两个批量RNA-seq数据集(GSE70362及GSE147383)、一个单细胞RNA-seq数据集(GSE251686),以及体外细胞实验 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2026-06-18 |
Cellular Heterogeneity in Erectile Dysfunction: An In-silico Analysis Revealing PER1, BHLHE40, NFIL3, and KLF10 as Circadian Rhythm Genes
2026-Jun-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示器质性勃起功能障碍患者海绵体中细胞异质性和昼夜节律基因PER1、BHLHE40、NFIL3和KLF10的作用 | 首次在单细胞水平表征器质性ED患者海绵体中昼夜节律基因的细胞类型特异性表达和动态变化,并鉴定NFIL3为可药物靶点 | 基于公共数据集GSE206528,样本量有限;分子对接为计算机模拟,需实验验证 | 阐明器质性勃起功能障碍中细胞异质性和昼夜节律基因的调控机制 | 人类海绵体组织及其细胞类型(成纤维细胞、内皮细胞、周细胞等) | 计算机视觉 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Monocle 2, CellChat, AUCell, Enrichr, AutoDock 4 | 单细胞基因表达数据 | 来自健康对照和器质性ED患者的海绵体组织样本(数据集GSE206528) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 300 | 2026-06-18 |
Sinomenine alleviates ulcerative colitis by targeting FXR to regulate arachidonic acid metabolism and Th17/Treg homeostasis
2026-Jun-11, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.178976
PMID:42269904
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研究论文 | 本研究探讨了青藤碱通过靶向FXR调节花生四烯酸代谢和Th17/Treg稳态来缓解溃疡性结肠炎的分子机制 | 首次揭示青藤碱通过直接靶向FXR受体调节脂质代谢和免疫平衡的分子机制,并联合单细胞RNA测序和网络药理学等多组学方法进行系统性验证 | 仍需进一步在人类样品中验证青藤碱-FXR相互作用的临床相关性 | 阐明青藤碱缓解溃疡性结肠炎的分子靶点和作用机制 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型及结肠组织样本 | 机器学习和生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、分子对接、细胞热转变分析 | 加权基因共表达网络分析、机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |