单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
281	2025-09-27	High expression of CCL3/CCL4/CCL5/CCR5 promotes exhausted CD8+ T cells terminal differentiation and is associated with poor prognosis in pediatric B-ALL patients 2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology IF:3.0Q2 DOI:10.1177/03946320251346823 PMID:40522146	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴促进耗竭CD8+T细胞终末分化，并建立多变量Cox回归模型预测儿童B-ALL预后	首次报道CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL中调控终末耗竭CD8+T细胞分化的关键作用	NA	识别B-ALL细胞与耗竭CD8+T细胞间的差异上调配体-受体相互作用，并开发预后预测模型	儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者	生物信息学	白血病	单细胞RNA测序、qRT-PCR、多变量Cox回归	多变量Cox回归模型	单细胞RNA测序数据、转录组数据	221例儿童B-ALL样本及本中心成人B-ALL患者数据
282	2025-09-27	Blood memory CD8 T cell phenotypes in lung cancer patients predict immune checkpoint treatment responses 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1629802 PMID:40989699	研究论文	通过单细胞测序技术分析肺癌患者外周血CD8+ T细胞表型，建立预测免疫检查点治疗反应的机器学习模型	首次在单细胞水平系统鉴定CD8+ T细胞表型特征与免疫治疗反应的关系，发现效应记忆T细胞的预测价值最高	研究样本量有限，需在更大队列中验证模型的普适性	开发预测非小细胞肺癌患者免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物	非小细胞肺癌患者的外周血CD8+ T细胞	生物信息学	肺癌	单细胞测序（scRNA-seq）、TCR谱分析、机器学习	机器学习模型	单细胞转录组数据、表面标志物表达数据、TCR序列数据	包含长期应答者、新治疗应答者和新治疗无应答者三个队列的肺癌患者样本
283	2025-09-27	Identification of Core SASP-Related Genes TGFBI and ANXA6 for Diagnosing Ulcerative Colitis-Related Colorectal Cancer Through Machine Learning 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S538960 PMID:40989757	研究论文	通过机器学习方法鉴定TGFBI和ANXA6作为溃疡性结肠炎相关结直肠癌的核心诊断标志物	首次结合10种机器学习算法的113种组合筛选SASP相关基因，并发现TGFBI和ANXA6在UCRCC诊断中的新作用	研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型	探索衰老相关分泌表型在溃疡性结肠炎相关结直肠癌精准诊断和发病机制中的作用	溃疡性结肠炎和结直肠癌患者数据及小鼠模型	机器学习	结直肠癌	差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、机器学习算法	多种机器学习算法组合	基因表达数据	基于公共数据库的UC和CRC数据集（具体样本数未明确说明）
284	2025-09-27	Multi-omics reveals immune features in immune and non-immune cells, an IFN-γ/IFN-α-B2M positive feedback loop, and targeted metabolic therapy in multiple myeloma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1575079 PMID:40990011	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了多发性骨髓瘤的免疫特征、IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路及靶向代谢治疗策略	首次在单细胞水平鉴定出骨髓瘤激活的造血干细胞和ISG15+B细胞等新型亚群，发现IFN-γ/α-B2M正反馈环路	NA	建立多发性骨髓瘤的多组学图谱，揭示免疫逃逸和疾病进展的细胞亚群与信号通路	多发性骨髓瘤患者样本和骨髓瘤细胞系	生物信息学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序、批量RNA测序、单细胞代谢分析、多重免疫荧光、CCK-8检测、流式细胞术、Western blotting	NA	基因组数据、转录组数据、代谢组数据	NA
285	2025-09-27	FCRLs and atypical transcriptional pattern in tumor infiltrating B cells from lung and renal cancer 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1587088 PMID:40990023	研究论文	通过转录组分析揭示肺癌和肾癌中肿瘤浸润B细胞亚群的FCRL表达异常及其与预后的关联	首次发现sIgA+ B细胞在肺癌中过度表达FCRL4等耗竭标志物，并证实FCRL4/CD20表达比与生存率负相关	研究主要基于转录组数据，缺乏功能性实验验证B细胞亚群的具体免疫调控机制	探究肿瘤浸润B细胞中不同抗体亚型（IgA/IgG）的功能差异及其临床意义	肺癌和肾癌患者的肿瘤浸润B细胞（sIgA+和sIgG+记忆B细胞）	肿瘤免疫学	肺癌、肾癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量转录组分析、TCGA队列分析	NA	转录组数据、临床生存数据	肺癌TCGA队列及公共scRNA-seq数据集（具体样本数未明确说明）
286	2025-09-27	Glycolysis-Driven Immune Evasion in Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: An Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Study 2025, OncoTargets and therapy IF:2.7Q3 DOI:10.2147/OTT.S538018 PMID:40990035	研究论文	通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了MSI-H结直肠癌中糖酵解驱动的免疫逃逸机制	首次在MSI-H结直肠癌中发现糖酵解富集的肿瘤亚群与免疫抑制微空间共定位，阐明乳酸介导的免疫逃逸新机制	样本量有限，需要更大队列验证；机制研究主要基于相关性分析	研究MSI-H结直肠癌肿瘤细胞功能异质性及其在免疫逃逸中的作用	MSI-H结直肠癌患者肿瘤组织	数字病理	结直肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序、拷贝数变异分析	非负矩阵分解	转录组数据	MSI-H结直肠癌患者队列（具体数量未明确说明）
287	2025-09-27	An aberrant immune-epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae 2024-Oct, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07926-8 PMID:39232171	研究论文	本研究通过患者队列和小鼠模型揭示了呼吸道病毒感染后长期后遗症（PASC）中免疫-上皮祖细胞异常微环境驱动肺纤维化的机制	首次发现肺内驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用通过IFNγ/TNF-IL-1β轴导致上皮祖细胞异常和肺纤维化的新机制，并提出后期干预策略	研究主要基于小鼠模型，人类患者样本的验证仍需扩大	阐明新冠病毒等呼吸道病毒感染后长期肺后遗症的发病机制	呼吸道PASC患者队列和病毒感染后肺病小鼠模型	免疫病理学	COVID-19后遗症/病毒性肺病	空间转录组学、成像技术、细胞因子中和疗法	小鼠疾病模型	基因表达数据、影像数据	三个患者队列和相应小鼠模型样本
288	2025-09-27	TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease 2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.16.611061 PMID:39345364	研究论文	本研究通过抑制TRPC3通道改善阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷	首次发现TRPC3在AD兴奋性神经元中特异性上调，并鉴定出新型抑制剂JW-65能通过调节钙信号通路发挥神经保护作用	研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床试验验证	探究TRPC3通道在阿尔茨海默病发病机制中的作用及治疗潜力	AD患者脑组织、AD小鼠模型（急性和慢性）、大鼠海马神经元	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、生物信息学分析、RNA测序	动物疾病模型	基因表达数据、电生理数据、行为学数据	AD患者队列样本、5xFAD转基因小鼠、原代培养的大鼠海马神经元
289	2025-09-27	Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type specific responses in primary human pancreatic islets 2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.23.604861 PMID:39211206	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了柯萨奇病毒B感染在人胰岛不同细胞类型中引发的特异性转录反应	首次在单细胞分辨率水平揭示CVB感染对胰岛不同细胞类型的特异性转录动态响应，并发现长链非编码RNA在病毒感染过程中的新功能	研究基于人类尸体胰岛样本，可能无法完全反映体内真实感染情况；观察时间仅限于48小时内	探究柯萨奇病毒B感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响机制	人类原代胰岛细胞（包括β细胞、α细胞和导管细胞等）	分子生物学	1型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	人类尸体胰岛样本（具体数量未明确说明）
290	2025-09-27	Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration 2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.30.601396 PMID:39005475	研究论文	本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制	首次发现杆状小胶质细胞这一独特亚群在调节运动皮层过度兴奋中的关键作用，并阐明其通过树突相互作用发挥神经保护功能	研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层兴奋性调节中的作用机制	TDP-43神经退行性疾病小鼠模型（rNLS8）的运动皮层回路	神经科学	肌萎缩侧索硬化症（ALS）	多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序	小鼠疾病模型（rNLS8）	电生理记录数据、成像数据、转录组数据	TDP-43神经退行性疾病小鼠模型（具体数量未明确说明）
291	2025-09-26	Technological innovations promote cancer stem cell-based translational research 2025-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217949 PMID:40712971	综述	本文综述了技术创新如何促进基于癌症干细胞（CSCs）的转化研究	综合评述了单细胞测序、器官芯片平台和人工智能等前沿技术在揭示CSC分子调控机制和开发靶向干预策略中的创新应用	NA	探讨技术发展如何推动基于癌症干细胞的治疗策略研究	癌症干细胞（CSCs）及其肿瘤微环境	转化医学	癌症	单细胞测序、功能基因组学、器官芯片平台、人工智能（AI）	NA	NA	NA
292	2025-07-29	Radiotherapy in combination with PD-1 and TIGIT blockade mediate antitumor abscopal effects and immune memory via CD8+ T cells 2025-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217935 PMID:40714064	研究论文	本研究探讨了放疗联合抗PD-1和抗TIGIT抗体（aPD-1/aTIGIT）的协同抗肿瘤效果，重点关注原发性和远隔肿瘤控制、免疫机制及长期免疫记忆	揭示了CD8 T细胞作为远隔效应和长期免疫的核心介质，强调了M1巨噬细胞极化在增强治疗协同作用中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行临床试验验证	探索放疗联合免疫治疗增强抗肿瘤效果的机制	小鼠模型中的LLC、CMT-167、B16-F10、MC38肿瘤	肿瘤免疫治疗	癌症	流式细胞术、多色免疫荧光、单细胞转录组学、Luminex细胞因子分析	小鼠肿瘤模型	细胞和分子数据	多种小鼠肿瘤模型（LLC、CMT-167、B16-F10、MC38）
293	2025-09-26	Inhibition of ACVR1 in Cancer-Associated Fibroblasts Suppresses Colorectal Cancer Cell Growth 2025-Oct, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1245/s10434-025-17765-0 PMID:40745121	研究论文	本研究通过类器官模型揭示ACVR1-BMP7轴是结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的潜在治疗靶点	首次利用二维类器官模型模拟结直肠癌组织特征，发现ACVR1抑制剂可抑制癌症相关成纤维细胞增殖	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证	探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的分子靶向治疗策略	结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、小鼠模型	癌症研究	结直肠癌	单细胞RNA测序、类器官培养、小鼠异种移植模型	二维类器官模型	基因表达数据、生存分析数据	涉及人类结直肠癌样本和小鼠模型
294	2025-09-26	Poor Collateralization in T2DM: Role of SLC4A10+ MAIT Cells 2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322718 PMID:40808651	研究论文	本研究探讨2型糖尿病患者中黏膜相关恒定T细胞对侧支循环不良的调控机制	首次发现MAIT细胞通过CCL3L1-CCR5轴驱动巨噬细胞促炎极化进而抑制侧支形成的新机制	样本量有限，机制研究主要基于动物模型和体外实验	揭示2型糖尿病合并慢性完全闭塞患者侧支循环不良的免疫学机制	2型糖尿病合并慢性完全闭塞患者及糖尿病小鼠模型	免疫学与心血管疾病	2型糖尿病与心血管并发症	单细胞RNA测序、共培养实验、小鼠后肢及心肌缺血模型	动物疾病模型	单细胞转录组数据、临床数据	包含初始队列和独立验证队列的2型糖尿病患者群体
295	2025-09-26	CXCL4-Induced PBMCs Modulate Vascular Extracellular Matrix via Wnt5a-Dependent Matrix Metalloproteinase-7 and Calcifying Extracellular Vesicle Release 2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322067 PMID:40836918	研究论文	本研究揭示了CXCL4诱导的单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴促进血管基质钙化的新机制	首次发现CXCL4诱导的炎症单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴分泌富含MMP7和S100A8的钙化细胞外囊泡	机制研究主要基于体外实验，需要更多体内验证	探究CXCL4诱导的单核细胞在血管炎症反应中促进细胞外基质钙化的分子机制	人外周血单核细胞、血管平滑肌细胞、人颈动脉斑块组织	血管生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序、细胞外囊泡分析、组织学验证	NA	基因表达数据、组织切片图像	人外周血单核细胞样本和人颈动脉斑块组织样本
296	2025-09-26	Genomic Insights at the Maternal-Fetal Interface: Preeclampsia Subtypes and Clinical Implications 2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.125.321710 PMID:40874308	综述	基于单细胞转录组学探讨子痫前期母胎界面的分子特征及临床亚型分类	通过单细胞分辨率揭示母胎界面细胞特异性基因表达变化，首次明确区分胎盘主导型与母体心血管主导型两种子痫前期亚型	未涉及具体样本量及实验验证数据	解析子痫前期的分子病理机制并指导临床分型	母胎界面细胞（合体滋养细胞、基质细胞、免疫细胞）	基因组学	妊娠期高血压疾病	单细胞转录组学	NA	基因组表达数据	NA
297	2025-09-26	Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer 2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202502183R PMID:40960909	研究论文	本研究通过多组学数据分析探讨LAG-3在小细胞肺癌中的表达特征及其临床意义	首次系统评估28种免疫检查点分子在SCLC中的表达谱，发现LAG-3具有最高过表达水平并验证其免疫治疗预测价值	回顾性研究设计，需要前瞻性临床试验进一步验证LAG-3的生物标志物作用	探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的潜在生物标志物	小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织样本	数字病理学	肺癌	RNA-seq、微阵列、scRNA-seq、免疫组化	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	多个公共数据库（CCLE等）和内部数据集，包含细胞系和肿瘤标本数据
298	2025-09-26	Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis 2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry IF:6.8Q1 DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734 PMID:40910702	研究论文	本研究首次发现环状七肽FZ1可作为整合素αvβ3激动剂，通过激活FAK-AKT/ERK1/2信号通路促进VEGFC表达，从而增强血管生成并加速糖尿病皮肤伤口愈合	首次鉴定出靶向整合素αvβ3的肽类激动剂FZ1，并阐明其通过FAK依赖性信号通路促进糖尿病伤口愈合的新机制	NA	开发促进糖尿病伤口愈合的有效治疗剂并阐明其调控机制	环状七肽FZ1及其在糖尿病伤口愈合中的作用机制	生物医学	糖尿病并发症	单细胞RNA测序、RNA干扰、表面等离子共振、分子对接	NA	实验数据	糖尿病伤口模型
299	2025-09-26	Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling 2025-Sep-25, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d5nr03032c PMID:40917009	综述	本文全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用	将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米粒子辅助信号放大技术集成，显著提升了诊断潜力	存在反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战	推动RCA技术在高通量分子诊断、生物标志物发现及空间多组学平台的应用发展	核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞等生物分子	分子诊断技术	癌症	滚环扩增、CRISPR检测、纳米粒子辅助信号放大	NA	核酸序列、基因表达数据	NA
300	2025-09-26	AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer 2025-Sep-25, Cancer investigation IF:1.8Q3 DOI:10.1080/07357907.2025.2559403 PMID:40995659	研究论文	本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重功能	首次整合空间转录组学发现AURKA在肿瘤周边T细胞富集区的免疫调节作用，并验证其作为免疫治疗生物标志物的潜力	研究样本量有限，需要更大规模临床队列验证AURKA的预后价值	阐明AURKA在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫调节机制	结直肠癌患者样本和小鼠模型	肿瘤免疫学	结直肠癌	bulk RNA-seq, scRNA-seq, 10x Visium空间转录组, CIBERSORT/ssGSEA, IHC/HE染色	小鼠模型	基因组学数据、空间转录组数据、临床病理数据	包含临床队列和动物模型的多个数据集