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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-11-05 |
SPP1 as a key modulator of M2 macrophage polarization promotes endometriosis progression via activation of the FAK/PI3K/AKT pathway: A bioinformatics and experimental study
2025-Dec-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115563
PMID:40967048
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证发现SPP1通过调控M2巨噬细胞极化促进子宫内膜异位症进展 | 首次揭示SPP1作为M2巨噬细胞极化的关键调节因子,并通过FAK/PI3K/AKT信号通路促进子宫内膜异位症发展 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索子宫内膜异位症中巨噬细胞极化的关键调控基因及其作用机制 | 子宫内膜异位症患者组织样本和人子宫内膜基质细胞(ihESCs) | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | LASSO,SVM-RFE,Random Forest | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GSE6364数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2025-11-05 |
Multi-omics analysis of the potential association between ageing and rheumatoid arthritis and screening of potential therapeutic targets
2025-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2025.2582448
PMID:41185125
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研究论文 | 通过多组学方法探索衰老与类风湿关节炎之间的关联并筛选潜在治疗靶点 | 首次通过整合基因组数据库、转录组数据和单细胞RNA测序系统揭示衰老与RA的分子联系 | 分子机制研究仍需进一步实验验证 | 探索衰老与类风湿关节炎的关联机制并识别治疗靶点 | 类风湿关节炎患者与衰老相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 多组学分析,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习算法 | 转录组数据,基因组数据 | 基于GBD数据库1990-2021年55岁及以上人群数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-11-05 |
Oral Multi-Enzymatic Manganese-Carbon Dots Alleviate Sepsis-Associated Lung Injury via the Gut-Lung Axis
2025-Nov-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c10625
PMID:41128412
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研究论文 | 本研究开发了口服锰掺杂碳点通过调节肠道菌群平衡和靶向肠肺轴来缓解脓毒症相关肺损伤 | 首次设计具有多酶模拟活性的锰掺杂碳点,通过肠肺轴机制调控巨噬细胞功能缓解脓毒症肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体验证;具体分子机制仍需进一步阐明 | 探索通过调节肠道菌群稳态治疗脓毒症相关肺损伤的新策略 | 脓毒症小鼠模型、巨噬细胞、肠道菌群 | 生物医学工程 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序、宏基因组学、代谢组学、转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据、代谢物数据、微生物组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | NA |
| 284 | 2025-11-05 |
Single-Cell Analysis, Spatial Transcriptomics and Molecular Docking Unveil Potential Therapeutic Targets for Carotid Atherosclerosis
2025-Nov-04, Balkan medical journal
IF:1.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、空间转录组学和分子对接技术揭示颈动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次整合单细胞测序、空间转录组学和分子对接技术系统解析颈动脉粥样硬化的细胞亚群特征和潜在治疗靶点 | 数据来源于公共数据库,缺乏实验验证 | 解析颈动脉粥样硬化的细胞亚群特征并发现潜在治疗靶点 | 颈动脉粥样硬化斑块中的细胞亚群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 空间转录组学, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 285 | 2025-11-05 |
Research on the mechanism of compound mylabris capsules regulating ferroptosis in lung adenocarcinoma based on bioinformatics and experimental validation
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003735
PMID:41186509
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡抑制肺腺癌的作用机制 | 首次报道复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡缓解肺腺癌,并鉴定出CA9、EZH2、NQO1和TERT等关键基因 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊调控肺腺癌细胞铁死亡的分子机制 | 肺腺癌细胞系A549和H1650 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,Lasso回归,Boruta算法,RFE算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中肺腺癌相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2025-11-05 |
The joint impact of elevated homocysteine and type 2 diabetes on non-healing wounds and all-cause mortality: integrated clinical and multi-omics analyses
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003715
PMID:41186525
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研究论文 | 本研究探讨高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病对难愈合伤口和全因死亡率的联合影响及其机制 | 首次揭示HHcy和T2D对难愈合伤口的协同作用,发现Hcy通过MIF-CD74/CXCR4轴驱动免疫代谢重编程 | 观察性研究设计无法确定因果关系,样本代表性可能受限 | 探究HHcy和T2D对难愈合伤口和死亡风险的联合影响及分子机制 | 8406名NHANES参与者(1999-2004)及糖尿病足溃疡患者 | 多组学分析 | 糖尿病足溃疡 | 批量转录组测序,单细胞测序,限制性立方样条,中介分析 | 加权逻辑回归,Cox比例风险模型 | 临床数据,转录组数据,单细胞数据 | 8406名NHANES参与者 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 287 | 2025-11-05 |
Unveiling gastric stem cell dynamics in gastric atrophy and carcinogenesis: revisiting mechanisms and advancing experimental models - a narrative review
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003733
PMID:41186567
|
综述 | 全面评估胃干细胞在萎缩性胃炎和癌前病变中的动态作用,重新审视胃干细胞耗竭与扩张的竞争范式 | 提出胃干细胞在慢性炎症中持续存在并发生克隆扩张的新观点,建立区域癌化效应的概念框架 | 依赖多化学致癌物模型的转化相关性有限,他莫昔芬依赖性谱系追踪系统存在混杂效应 | 阐明胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的动态机制 | 胃干细胞 | 病理学 | 胃癌 | 谱系追踪,空间转录组学,类器官系统 | NA | 实验数据,文献资料 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 288 | 2025-11-05 |
Immune cell quantification of in situ inflammation partitions human lupus nephritis into mechanistic subtypes
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192669
PMID:40906524
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研究论文 | 通过免疫细胞定量分析将人类狼疮性肾炎划分为机制亚型 | 使用高维共聚焦显微镜、空间转录组学和计算机视觉技术量化免疫细胞群体,首次发现狼疮性肾炎和肾移植排斥反应中免疫细胞亚群形成相同的独特生态位 | 样本量相对有限(54例活检组织),研究结果需要更大规模验证 | 解析人类狼疮性肾炎的炎症机制和异质性 | 狼疮性肾炎和肾移植排斥反应的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 高维共聚焦显微镜, 空间转录组学, 计算机视觉 | 计算机视觉技术 | 图像, 空间转录组数据 | 54例去标识化肾脏活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 289 | 2025-11-05 |
Protoplast technology in woody plants: Current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Nov-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
|
综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 系统总结了木本植物原生质体分离方法和应用前景,突出了其在基因编辑和单细胞测序等新兴领域的潜力 | NA | 探讨木本植物原生质体技术在生物技术和遗传改良中的应用价值 | 木本植物原生质体 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 290 | 2025-11-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2025-Nov-03, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了芳香烃受体激活通过调节肺免疫和上皮细胞的多条通路来减轻急性呼吸窘迫综合征 | 首次在单细胞水平系统揭示AhR激活通过调节多种细胞类型和信号通路来缓解ARDS的机制 | 研究基于小鼠模型,结果需在人类中验证;仅使用LPS诱导的ARDS模型 | 探究芳香烃受体激活对急性呼吸窘迫综合征的保护作用机制 | LPS诱导的ARDS小鼠模型中的肺组织细胞 | 单细胞生物学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 291 | 2025-11-05 |
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12054
PMID:41183169
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 | 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件,并开发了ToxAtlas网络工具 | 仅观察12小时后的急性炎症反应,未评估长期慢性炎症效应 | 研究碳基纳米材料如何驱动急性肺部炎症反应 | 小鼠肺部细胞 | 单细胞测序分析 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2025-11-05 |
Identification of novel differentiation trajectories and gene network associations with ectopic pregnancy in fallopian tube epithelium
2025-Nov-03, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf200
PMID:41183511
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据网络建模识别输卵管上皮细胞分化轨迹及其与异位妊娠的基因网络关联 | 发现新型OVGP1+上皮祖细胞及其双向分化轨迹,通过因果网络模型揭示输卵管与子宫内膜分泌细胞的功能差异 | 育龄妇女样本量有限,未进行候选基因的体外或体内验证 | 识别输卵管上皮细胞发育轨迹及其与异位妊娠的分子机制 | 输卵管上皮细胞和子宫内膜上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 异位妊娠 | 单细胞RNA测序, RNA速度分析, 网络建模, 表达数量性状位点分析 | 超图网络模型 | 单细胞转录组数据 | 13名女性的输卵管scRNA-seq样本和13名女性的子宫内膜scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 293 | 2025-11-05 |
[Neural regulation mechanism in bone regeneration]
2025-Nov-03, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文系统阐述了神经系统在骨再生过程中的调控机制,重点关注神经肽和神经递质的关键作用 | 提出'神经-骨骼'调控轴概念,系统梳理交感与副交感神经系统在骨再生中的相反调控作用 | 神经肽之间的相互作用网络尚未完全阐明,需要更先进的研究模型和技术支持 | 探讨骨再生过程中的神经调控机制 | 骨骼系统与神经系统的相互作用机制 | 骨再生医学 | 退行性骨病、创伤性骨损伤 | 单细胞测序、三维生物打印骨模型、类器官技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2025-11-05 |
Effector Functions of Conventional and Unconventional Mycobacterium tuberculosis (Mtb)-Specific T Cells
2025-Nov-03, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041829
PMID:41184129
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综述 | 本文综述了结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能及其在免疫防御中的作用 | 整合单细胞和空间转录组学最新发现,揭示T细胞亚群的异质性、功能可塑性和空间区隔化 | NA | 探讨T细胞在结核分枝杆菌免疫防御中的效应功能和免疫病理作用 | 结核分枝杆菌特异性T细胞(包括常规和非常规T细胞) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 295 | 2025-11-05 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
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研究论文 | 提出了一种名为STORIES的新计算方法,利用最优传输从空间转录组数据中学习细胞命运景观 | 将最优传输扩展到空间转录组数据分析,能够学习空间信息化的细胞分化潜能 | NA | 从多个时间点的空间转录组数据推断细胞命运轨迹 | 空间转录组数据中的细胞分化过程 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输,神经网络 | 空间转录组数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 296 | 2025-11-05 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
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研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff,用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 通过连续去噪和语义特征整合,学习瞬态细胞状态并预测时间和条件下高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的响应,促进细胞命运决定调控原理的理解 | 细胞分化、基因扰动、药物响应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子响应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 297 | 2025-11-05 |
Spatiotemporal dynamics of the cardioimmune niche during lesion repair
2025-Nov-03, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00739-6
PMID:41184578
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,重建了小鼠心脏损伤后纤维化微环境的时空动态变化 | 首次揭示了Trem2巨噬细胞通过沉默成纤维细胞增殖来防止过度纤维化的新机制,并发现了一群罕见的祖细胞样心肌细胞 | 研究仅限于小鼠模型,人类心脏组织的验证仍需进一步研究 | 探索心脏损伤修复过程中的细胞和分子调控机制 | 成年小鼠心脏组织和人心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠心脏损伤模型和人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2025-11-05 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Nov-03, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了海鞘心脏咽部祖细胞在细胞周期进程中转录组成熟的动态过程及其对多谱系分化能力的影响 | 首次提出'转录组成熟'概念,发现细胞周期驱动转录组动态变化赋予祖细胞多谱系分化能力,并鉴定出关键调控基因Depdc1b | 研究基于海鞘模型,在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究心脏咽部祖细胞在发育过程中如何获得多谱系分化能力 | 海鞘心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转基因样本条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2025-11-05 |
MYEOV Is a Novel Marker of Differentiated Corneal Epithelium
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.7
PMID:41186354
|
研究论文 | 本研究揭示了MYEOV作为角膜上皮分化特异性标志物的表达特征和调控机制 | 首次发现MYEOV在KRT12阳性角膜上皮细胞中特异性高表达,且受PAX6和KLF4调控 | 研究主要基于体外细胞实验和免疫染色,缺乏体内功能验证 | 表征MYEOV在人类眼表组织中的表达和调控机制 | 人类角膜上皮细胞、结膜上皮细胞及其他表面外胚层来源上皮 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、免疫染色、基因敲低、Western blot、集落形成实验、EdU细胞增殖检测 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞增殖数据 | 人类角膜组织及体外培养的角膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-11-05 |
DISSyphilis and the Risk of HIV Infection: A Mendelian Randomization Study
2025-Nov, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析评估梅毒对HIV感染的因果效应 | 首次使用孟德尔随机化方法证实梅毒与HIV感染之间的直接因果关系,并发现RPAIN基因变异在疾病进展中的关键作用 | 研究依赖于公开数据库的基因组数据,样本特征和人群异质性可能影响结果推广 | 评估梅毒对HIV感染的因果效应及潜在分子机制 | 梅毒和HIV感染相关的基因组数据及基因表达数据 | 生物信息学 | HIV感染/梅毒 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 基因组关联分析 | 加权中位数, MR Egger, 逆方差加权 | 基因组数据, 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库和基因组关联研究获取的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组关联分析 | NA | NA |