单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30333 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-08-02 |
Glucokinase activators contribute to gastrointestinal disease risks through metabolic-immune interplay in the gut-liver axis: insights from a multi-omics study
2025-Aug-01, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02571-7
PMID:40748365
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研究论文 | 本研究探讨了葡萄糖激酶激活剂（GKAs）通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的影响 | 揭示了GK-GKRP解离通过代谢-免疫互作增加IBD和MASLD风险的机制，并识别了关键介质和细胞间通讯信号 | 研究基于遗传变异作为代理，可能无法完全反映药物直接作用 | 探究两种GK激活方式对胃肠道疾病的差异化影响机制 | 葡萄糖激酶激活剂（GKAs）及其对胃肠道疾病的影响 | 代谢组学与免疫学 | 炎症性肠病（IBD）和代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 孟德尔随机化、多组学分析（包括scRNA-seq和Cellchat） | NA | 遗传变异数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA（基于公开数据库的遗传和组学数据） |
| 282 | 2025-08-02 |
Towards interpretable molecular and spatial analysis of the tumor microenvironment from digital histopathology images with HistoTME-v2
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.11.658673
PMID:40747415
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research paper | 介绍HistoTME-v2，一种基于AI的深度学习框架，用于从H&E染色的病理切片中预测肿瘤微环境（TME）的细胞类型特异性转录组特征活动 | HistoTME-v2是一种泛癌扩展模型，能够在25种实体瘤类型中预测TME的细胞类型特异性转录组特征活动，无需单个细胞的分割和分类 | 虽然HistoTME-v2在预测TME组成方面表现出高准确性，但其性能可能受到H&E图像质量和注释数据量的限制 | 开发一种成本效益高且易于解释的工具，用于从常规H&E病理切片中分析TME，促进空间生物学在常规病理工作流程中的整合 | 非小细胞肺癌及其他24种实体瘤类型的H&E染色病理切片 | digital pathology | lung cancer | deep learning, spatial transcriptomics, multiplex imaging (CODEX, IHC) | weakly supervised deep learning framework | H&E-stained whole slide images (WSI) | 内部验证：7,586 WSI, 6,901患者, 24种癌症类型；外部验证：5,657 WSI, 1,775患者, 9种癌症类型；空间分析：259 WSI, 154患者, 7种癌症类型 |
| 283 | 2025-08-01 |
Single-cell transcriptome analysis of bronchoalveolar lavage during early SARS-CoV-2 infection
2025-Jul-31, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02715-24
PMID:40742121
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析SARS-CoV-2感染早期支气管肺泡灌洗细胞的转录组变化 | 揭示了SARS-CoV-2感染早期免疫反应的转录组特征，特别是巨噬细胞亚群和树突状细胞的动态变化 | 研究仅基于非人类灵长类动物模型，结果可能不完全适用于人类 | 理解SARS-CoV-2感染早期的免疫反应机制 | 恒河猴的支气管肺泡灌洗细胞 | 生物医学研究 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 非人类灵长类动物模型 | RNA序列数据 | 恒河猴感染后0-3天的支气管肺泡灌洗细胞 |
| 284 | 2025-08-01 |
Pan-cancer Analyses Refine the Single-Cell Portrait of Tumor-Infiltrating Dendritic Cells
2025-Jul-31, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3595
PMID:40742316
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研究论文 | 通过整合33种癌症类型中超过2500个样本的单细胞RNA测序数据，建立了人类树突状细胞（DCs）的全面蓝图，揭示了肿瘤浸润DCs的异质性及其功能潜力 | 发现了肿瘤中罕见的DCs亚群（如AXL+SIGLEC6+ DCs和Langerhans细胞样DCs），并展示了它们的功能潜力及其转录组特征，同时开发了机器学习模型以指导DCs注释 | 研究主要基于计算分析，需要进一步的实验验证来确认DCs亚群的功能及其在免疫治疗中的应用潜力 | 探索肿瘤微环境中DCs的异质性及其在抗肿瘤免疫中的作用，为开发基于DCs的免疫疗法提供见解 | 肿瘤浸润的树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 超过2500个样本，涵盖33种癌症类型 |
| 285 | 2025-08-01 |
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Jul-31, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02557-5
PMID:40742465
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研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析，识别并验证了三羧酸循环相关的糖尿病肾病诊断生物标志物 | 首次将三羧酸循环相关基因作为糖尿病肾病的诊断生物标志物进行研究，并构建了诊断模型 | 研究依赖于公开数据集，未进行独立队列验证 | 探索三羧酸循环相关基因在糖尿病肾病诊断中的潜力 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单样本基因集富集分析(ssGSEA), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 基因表达数据 | GSE131882和GSE30122数据集中的样本 |
| 286 | 2025-07-31 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
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研究论文 | 通过整合转录组分析，研究结直肠癌中的干细胞景观并鉴定与干性相关的基因ENY2 | 首次通过单细胞转录组数据整合分析，鉴定出ENY2作为结直肠癌干细胞的关键标志物，并探索其在肿瘤发生和转移中的潜在作用 | 研究样本量较小（9个原发性结直肠癌样本），且ENY2在结直肠癌中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌干细胞的异质性及其潜在机制，为开发有效的治疗方法提供依据 | 结直肠癌干细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 9个原发性结直肠癌样本 |
| 287 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 288 | 2025-07-31 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 发现了一个可能通过下调SEC16B促进肺转移的新细胞亚群，并揭示了肿瘤微环境中成纤维细胞和内皮细胞在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 样本量相对较小，仅包含6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本和4个正常骨组织样本 | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移组织、正常骨组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR、Transwell实验 | hdWGCNA分析 | RNA测序数据 | 6个原发骨肉瘤样本、2个肺转移样本、4个正常骨组织样本 |
| 289 | 2025-07-31 |
Immunoregulatory Endothelial Cells Interact With T Cells After Myocardial Infarction
2025-Jul-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326145
PMID:40735785
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后心脏内皮细胞的一种新型免疫调节功能 | 发现了一种短暂出现的免疫调节内皮细胞表型(IMEC)，并阐明了其在心肌梗死后通过细胞因子介导的激活机制以及与T细胞的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需进一步验证 | 探究心肌梗死后内皮细胞的免疫调节功能 | 心肌梗死后小鼠心脏内皮细胞 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、骨髓移植和谱系追踪实验 | 内皮特异性缺失小鼠模型 | RNA测序数据、空间转录数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 |
| 290 | 2025-07-31 |
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Jul-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251360744
PMID:40735789
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，识别了桥本甲状腺炎（HT）与甲状腺癌（TC）之间的共享遗传因素 | 首次通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型，揭示了PRDX2作为HT和TC的关键保护因子及其作用机制 | 样本来源主要基于FinnGen数据库，可能无法代表所有人群 | 探究桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的遗传关联及其分子机制 | 桥本甲状腺炎和甲状腺癌患者 | 基因组学 | 甲状腺癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、机器学习分类模型 | 机器学习分类模型 | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 76,243个甲状腺细胞 |
| 291 | 2025-07-31 |
Investigation of the mechanism of Xiaoyin Jiedu Yin in the treatment of psoriasis based on bioinformatics, machine learning
2025, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2025.1623449
PMID:40735022
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研究论文 | 本研究基于生物信息学和机器学习探讨了消银解毒饮治疗银屑病的作用机制 | 首次结合网络药理学、机器学习靶点筛选和单细胞RNA测序技术，揭示了消银解毒饮通过多靶点协同作用治疗银屑病的机制，并鉴定AKR1B10为核心治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞模型，缺乏动物模型或临床试验验证 | 探究消银解毒饮治疗银屑病的药理机制 | 银屑病患者皮肤组织样本和IL-17A诱导的HaCaT细胞模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 网络药理学、机器学习靶点筛选、scRNA-seq、空间转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及银屑病患者皮肤组织和HaCaT细胞系 |
| 292 | 2025-07-31 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
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研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中cGAS和STING表达与新辅助化疗免疫疗法（NACI）疗效的相关性 | 首次揭示了cGAS和STING表达与NACI疗效的正相关性，并提出了它们作为预测生物标志物的潜力 | 样本量较小（仅38例患者），且为回顾性研究 | 探究cGAS和STING表达与HNSCC患者NACI疗效的关系 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据 | 38例HNSCC患者 |
| 293 | 2025-07-31 |
New insights into liver injury and regeneration from single-cell transcriptomics
2025, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2025-100202
PMID:40735115
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在急性肝损伤（ALI）和肝再生研究中的最新进展及其应用 | 揭示了肝损伤和再生过程中未被识别的细胞亚群，包括胎儿样和迁移性肝细胞、不同激活状态的肝星状细胞以及区域特异性的内皮细胞反应 | NA | 探讨单细胞转录组学在急性肝损伤和肝再生研究中的应用及其潜在治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞、内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 294 | 2025-07-31 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了PM2.5对幼鼠肺部不同细胞类型的转录组影响 | 首次在幼鼠模型中利用scRNA-seq技术揭示了PM2.5对不同肺部细胞类型的特异性转录组改变 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人类样本中验证 | 探究PM2.5对儿童肺部健康的细胞特异性影响及其分子机制 | 幼鼠肺部细胞 | 生物医学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), GO和KEGG富集分析, 苏木精-伊红染色 | 幼鼠PM2.5气道暴露模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 未明确说明数量的幼鼠肺部样本 |
| 295 | 2025-07-31 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
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research paper | 该研究通过分析扩张型心肌病（DCM）患者与健康对照中24个二硫键死亡相关基因（DiGs）的表达，构建了预测模型并验证了核心基因的作用 | 首次将二硫键死亡机制与DCM发病联系起来，并鉴定出ACTN4、MYH10、TLN1、DSTN和NCKAP1作为核心预测基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索二硫键死亡相关基因在扩张型心肌病中的作用机制及治疗靶点 | 扩张型心肌病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的DCM患者和健康对照样本 |
| 296 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2025-07-31 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
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研究论文 | 本研究探讨了KLF5/PI3K/AKT轴作为克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的治疗靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5在化疗耐药性中的作用，并提出了KLF5/PI3K/AKT轴作为新的治疗靶点 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的机制和潜在治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、InferCNV、差异表达基因分析、通路富集分析、细胞通讯分析、SCENIC、高通量药物筛选 | 动物模型 | RNA测序数据 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及)和动物模型 |
| 298 | 2025-07-31 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
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研究论文 | 本文开发了一种湿实验室和计算框架，用于在同一组织切片上进行空间转录组学（ST）和空间蛋白质组学（SP）的整合分析 | 首次在同一组织切片上整合ST和SP分析，实现了RNA和蛋白质表达的单细胞水平比较 | 未提及样本量是否足够大以覆盖广泛的肿瘤异质性 | 开发一种整合空间多组学数据的方法，以更深入地理解肿瘤-免疫微环境 | 人类肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学（ST）、空间蛋白质组学（SP）、H&E染色 | Weave软件 | 空间多组学数据 | NA |
| 299 | 2025-07-31 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
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研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的牛生长卵母细胞的收集和文库制备方案 | 提供了针对牛生长卵母细胞的详细scRNA-seq分析方案，有助于识别物种特异性转录特征和发育轨迹 | NA | 研究牛卵母细胞的基因表达和发育过程 | 牛生长卵母细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 300 | 2025-07-30 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
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研究论文 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌中的特征及其预后意义 | 首次在两项独立队列中通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析γδ T细胞在结直肠癌中的分布特征及其与患者生存期的关联 | 研究结果在第二队列中的HR置信区间较宽(0.50-1.33)，可能影响统计效力 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本中的γδ T细胞和αβ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(两个队列) + 62例单细胞RNA测序样本 |