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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-05-25 |
Development of an optimal protocol for molecular profiling of tumor cells in pleural effusions at single-cell level
2021-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14821
PMID:33484069
|
研究论文 | 开发一种用于胸水内肿瘤细胞单细胞水平分子谱分析的最优方案 | 通过阴性选择与微流体介电泳阵列富集浮游肿瘤细胞,并结合全基因组扩增与精确单细胞突变检测器消除扩增错误,实现了高精度体细胞突变检测 | 未明确提到局限性,但可能涉及样本量小或WGA相关错误的完全消除仍有挑战 | 开发优化方案实现胸水内浮游肿瘤细胞的单细胞测序,作为临床实验室检测方法 | 从胸水样本中分离的浮游肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、全基因组扩增、下一代测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 两个病例(Case 1和Case 2),涉及19个和20个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用磁性活化细胞分选系统进行负选,微流体介电泳阵列进行正选 |
| 282 | 2026-05-25 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic change in tumor microenvironment during pancreatic ductal adenocarcinoma malignant progression
2021-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103315
PMID:33819739
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌恶性进展过程中肿瘤微环境的动态变化 | 发现了一种新的癌症相关成纤维细胞亚型——补体分泌型CAFs,并鉴定出多种新的肿瘤浸润免疫细胞标志基因 | 样本量有限,且仅基于11个样本进行分析,可能无法完全代表肿瘤微环境的全部异质性 | 探究胰腺导管腺癌恶性进展过程中肿瘤微环境组分的动态变化 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 11个样本(4例PDAC I期、4例PDAC II期、3例PDAC III期) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 283 | 2026-05-25 |
Single-cell transcriptomics reveal the intratumoral landscape of infiltrated T-cell subpopulations in oral squamous cell carcinoma
2021-04, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12910
PMID:33513276
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示口腔鳞状细胞癌中浸润T细胞亚群的肿瘤内景观 | 首次系统描绘口腔鳞状细胞癌中14个T细胞亚群及其发育轨迹,发现TOX是T细胞功能障碍的关键调节因子,并揭示PRDM1通过结合TOX启动子基序调控其表达 | 样本量较小(仅3例患者),需更多样本验证;体外实验模型可能无法完全模拟体内微环境 | 解析口腔鳞状细胞癌肿瘤浸润T细胞的亚群组成、功能状态及分子调控机制 | 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和配对癌旁正常组织中的T细胞 | 单细胞转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例口腔鳞状细胞癌患者的11866个单T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 284 | 2026-05-25 |
Characteristics of B lymphocyte infiltration in HPV+ head and neck squamous cell carcinoma
2021-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14834
PMID:33529452
|
研究论文 | 探讨HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中B淋巴细胞浸润的特征及其与预后的关系 | 首次通过单细胞测序分析HPV阳性HNSCC中B淋巴细胞亚群的趋化因子,并揭示CD4 T淋巴细胞通过CXCL13/CXCR5轴影响B淋巴细胞及其亚群 | 样本人群主要来自公共数据库,且免疫组化和免疫荧光样本量较小 | 检测HPV相关HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润情况及其与预后的相关性 | HPV阳性与阴性头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 转录组分析、免疫组化、免疫荧光、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 124例HPV阳性及513例HPV阴性HNSCC样本(来自GEO和TCGA数据库);7例HPV阳性和13例HPV阴性HNSCC组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2026-05-25 |
Chromosome 8 gain is associated with high-grade transformation in MPNST
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146351
PMID:33591953
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研究论文 | 通过患者来源的异种移植物模型研究恶性外周神经鞘瘤中8号染色体获得与高级别转化的关联 | 首次在MPNST中鉴定出8号染色体获得是复发性基因组事件,并通过PDX、FISH和单细胞测序进行验证,发现其与软组织肉瘤的较差总生存率相关 | 未明确说明研究的局限性 | 理解MPNST的基因组异质性并建立包含该异质性的临床前模型 | NF1相关恶性外周神经鞘瘤及其患者来源的异种移植物 | 基因组学 | 神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤 | 拷贝数分析、全外显子组测序、RNA测序、FISH、单细胞测序 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 286 | 2026-05-25 |
Tristetraprolin expression by keratinocytes protects against skin carcinogenesis
2021-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.140669
PMID:33497366
|
研究论文 | 本研究揭示了角质形成细胞中三脯氨酸锌指蛋白(TTP)的表达对皮肤癌发生的保护作用 | 首次通过调控过表达和条件性敲除模型,证明TTP在皮肤化学致癌过程中是关键调控因子,并识别出Areg为TTP在角质形成细胞中的直接靶点 | 未提及具体局限性 | 探究TTP在皮肤肿瘤发生中的调控作用及机制 | 小鼠皮肤角质形成细胞及人类恶性角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 287 | 2026-05-25 |
Identification of Novel Population-Specific Cell Subsets in Chinese Ulcerative Colitis Patients Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.01.020
PMID:33545427
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序鉴定中国溃疡性结肠炎患者中新型人群特异性细胞亚群 | 首次在中文人群中通过单细胞RNA测序鉴定出两种新型浆细胞亚群,并揭示UC风险基因在免疫细胞中的表达改变具有人群中特异性 | 样本量较小,仅包括12个结肠活检样本,且主要关注成人患者,未涉及儿童或其他年龄段 | 明确中国成年溃疡性结肠炎患者结肠黏膜细胞中的关键基因、通路和细胞类型 | 中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组测序数据 | 12个结肠活检样本(来自溃疡性结肠炎患者和健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2026-05-24 |
TLR8 agonist selgantolimod regulates Kupffer cell differentiation status and impairs HBV entry into hepatocytes via an IL-6-dependent mechanism
2024-11-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331396
PMID:38697771
|
研究论文 | 研究TLR8激动剂selgantolimod通过IL-6依赖机制调节库普弗细胞分化状态并抑制HBV进入肝细胞的作用 | 首次揭示selgantolimod通过调节库普弗细胞分化状态间接抑制HBV进入肝细胞的新机制,并发现IL-6在其中起关键作用 | 未完全阐明库普弗细胞分化调控的分子机制,且未在体内模型中进行验证 | 阐明selgantolimod在肝脏微环境中诱导的转录组变化和细胞间通讯事件 | 人类肝脏中的库普弗细胞和肝细胞 | 自然语言处理 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、RNA测序数据 | 公开单细胞RNA-seq数据及HBV感染患者转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2026-05-24 |
Targeting squalene epoxidase restores anti-PD-1 efficacy in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis-induced hepatocellular carcinoma
2024-11-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331117
PMID:38744443
|
研究论文 | 本研究揭示角鲨烯环氧酶通过诱导CD8+ T细胞功能障碍和增强髓源性抑制细胞活性,促进代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝细胞癌的免疫抑制,并证明靶向SQLE可恢复抗PD-1疗效 | 首次阐明SQLE在MASH-HCC中通过胆固醇积累导致CD8+ T细胞线粒体功能障碍及MDSC激活的双重免疫抑制机制,并证实靶向SQLE可逆转抗PD-1治疗耐药 | 未明确SQLE调控胆固醇代谢的具体分子通路;动物模型可能无法完全模拟人类MASH-HCC的异质性 | 探究角鲨烯环氧酶在MASH-HCC肿瘤免疫微环境中的作用及其对抗PD-1免疫治疗的影响 | 肝细胞特异性Sqle转基因和敲除小鼠、原位及人源化小鼠模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 基因敲除/转基因小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2026-05-24 |
Spatial Transcriptomics Reveals the Temporal Architecture of the Seminiferous Epithelial Cycle and Precise Sertoli-Germ Synchronization
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620681
PMID:39554074
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研究论文 | 利用空间转录组学技术绘制小鼠精子发生过程中生精上皮周期的转录组图谱,揭示支持细胞与生殖细胞的同步化机制 | 首次通过空间转录组学RNA SeqFISH+技术精确重构生精上皮周期的时空转录模式,发现支持细胞独立维持周期性转录动态,并鉴定出内在的视黄酸循环和转录因子网络 | 研究中未提供明确的局限性说明 | 阐明生精上皮周期中转录组的时空变化及支持细胞与生殖细胞的同步化机制 | 小鼠睾丸组织中的支持细胞和生殖细胞 | 空间转录组学 | 并非专指某种疾病 | RNA SeqFISH+空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 216090个细胞,2638个基因 | NA | 空间转录组学 | RNA SeqFISH+ | RNA SeqFISH+技术用于小鼠睾丸组织的空间基因表达 profiling |
| 291 | 2025-11-03 |
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.07.010
PMID:39089570
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学方法,揭示心肌梗死中巨噬细胞不会转化为成纤维细胞,但会表达促纤维化的基质细胞蛋白 | 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术,明确证明心肌梗死中的巨噬细胞不会转分化为成纤维细胞,同时发现其表达多种促纤维化基质蛋白的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究心肌梗死中巨噬细胞是否会发生成纤维细胞转化及其在细胞外基质表达中的作用 | 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对照组和心肌梗死组小鼠的CSF1R+髓系细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2026-05-24 |
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-08-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50780-5
PMID:39138165
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研究论文 | 利用斑马鱼单细胞转录组学、谱系追踪和突变分析,揭示颅缝形成过程中调控骨形成的关键细胞转变 | 首次鉴定出颅缝中部间充质细胞亚群通过表达BMP拮抗剂(如grem1a)限制骨形成,从而确保颅缝正常形态的机制 | 未提及 | 探究颅缝在颅骨扩张过程中如何控制成骨活性以促进骨生长并防止异常骨融合 | 斑马鱼胚胎颅缝组织 | 单细胞转录组学 | 颅缝相关疾病 | 单细胞转录组测序、谱系追踪、突变分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 293 | 2026-05-24 |
Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer
2024-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51252-6
PMID:39134520
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研究论文 | 开发单细胞靶向长读长测序方法scTaILoR-seq,揭示卵巢癌转录变异 | 提出scTaILoR-seq技术,通过杂交捕获靶向一千多个基因,将每个细胞的中位数靶向转录本数提高29倍,结合长读长变异检测揭示表达SNV与可变转录结构的关联,并测量等位基因失衡 | 长读长测序通量较低且可能意外测序伪影,该方法可能仍受限于靶向基因的选择和捕获效率 | 开发并验证一种单细胞长读长靶向测序方法,用于研究RNA异构体及转录变异 | 卵巢癌细胞系和原发肿瘤样本 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 长读长测序、靶向杂交捕获 | NA | RNA序列 | 10,796个单细胞转录组(来自卵巢癌细胞系和原发肿瘤) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2026-05-24 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
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研究论文 | 通过患者来源的类器官生物库,发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调是严重克罗恩病的新机制 | 首次发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调(DNA甲基化缺失)是克罗恩病发病的新型机制,并通过类器官-淋巴细胞共培养和基因敲除小鼠模型验证了功能影响 | 未明确提及 | 研究肠上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 来自168名患者(72名CD、23名UC、73名健康对照)的312个肠上皮类器官 | 机器学习 | 克罗恩病 | DNA甲基化测序, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因编辑 | 机器学习模型 | DNA甲基化数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 168名患者的312个肠上皮类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2026-05-24 |
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331532
PMID:38816188
|
研究论文 | 本研究展示了人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植能够改善先天性巨结肠患者组织中的功能反应 | 首次证实人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞能够再定植并增加先天性巨结肠患者结肠组织的功能反应 | NA | 评估人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植对先天性巨结肠患者结肠组织的整合和功能影响 | 先天性巨结肠患者结肠组织样本,以及人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞 | 数字病理学 | 先天性巨结肠 | 单细胞RNA测序,蛋白质表达分析,钙成像,器官浴收缩性测试 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,钙成像数据 | 先天性巨结肠患者结肠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析细胞转录组特征 |
| 296 | 2026-05-24 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331773
PMID:38719336
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,揭示胆囊癌发病过程中微环境动态变化及免疫调控因子OLFM4的作用 | 首次构建胆囊疾病多病理状态单细胞图谱,发现OLFM4通过MAPK-AP1轴上调PD-L1促进免疫逃逸,提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 部分发现需进一步在更大样本及临床队列中验证,体外和体内机制研究需补充更多分子细节 | 阐明胆囊癌及良性胆囊疾病的细胞生态系统和分子特征,为癌症预防和治疗提供新靶点 | 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及癌旁正常组织的细胞 | 机器学习 | 胆囊癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 230,737个细胞,来自15例胆囊癌、4例胆囊炎、3例胆囊息肉、5例胆囊腺瘤和16例癌旁正常组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 297 | 2026-05-24 |
Transcriptomic changes associated with oral immunotherapy for food allergy
2024-03, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.14106
PMID:38520061
|
综述 | 总结口服免疫治疗对食物过敏转录组变化的研究进展 | 利用单细胞测序等新技术深入描述口服免疫治疗后的基因表达变化及其与脱敏和缓解等临床结局相关的分子特征,并鉴定了与疾病活动相关且受治疗影响的T辅助2A细胞类型 | 目前研究仍存在显著空白,需要更多关注长期和明确临床结局的免疫特征的研究,以全面理解过敏缓解的路径 | 研究口服免疫治疗对食物过敏转录组变化的影响及其与临床结局的关系 | 食物过敏患者接受口服免疫治疗后的转录组变化及免疫机制 | 机器学习 | 食物过敏 | 单细胞测序,转录组测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 298 | 2026-05-24 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人神经母细胞瘤转移性骨髓,揭示微环境重塑和转移特征 | 首次通过单细胞水平比较分析有和无转移患者的骨髓微环境,揭示免疫细胞群体重塑、基因表达重编程及预后标志物 | 未提及具体限制 | 阐明神经母细胞瘤骨髓转移的细胞和分子机制,为开发新疗法提供依据 | 神经母细胞瘤患者的转移性骨髓样本 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者样本,包括有和无转移的神经母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 299 | 2026-05-24 |
Immunological characterization and comparison of children with COVID-19 from their adult counterparts at single-cell resolution
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1358725
PMID:39148728
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较儿童与成人COVID-19患者的免疫特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较儿童和成人COVID-19患者的免疫细胞差异,揭示儿童更强的NK细胞毒性和较少的炎症反应 | 初步研究,样本量较小(15名儿童和18名成人) | 阐明儿童COVID-19患者免于重症的免疫保护机制 | COVID-19儿童和成人患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15名儿童(8名患者)和18名成人(13名患者) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 300 | 2026-05-24 |
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354926
PMID:39372399
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示重症急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 | 首次构建了重症急性胰腺炎患者外周血单核细胞的单细胞转录组图谱,并发现了一种高表达PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 | 样本量较小,仅7名未经治疗的重症急性胰腺炎患者,且健康对照数据来自公共数据库 | 了解重症急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其作用机制,并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 | 重症急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 重症急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 7名未治疗的重症急性胰腺炎患者,6名健康对照(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |