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当前共找到 41240 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-07-03 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710915
PMID:41601694
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研究论文 | 整合单细胞和批量转录组分析揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享致病机制及预后生物标志物 | 通过整合单细胞与批量RNA测序数据，首次系统揭示乳腺癌和甲状腺癌共享的分子机制，并构建了基于101种机器学习算法的预后模型，发现SMR3B作为共享预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析，功能性验证仅在细胞水平进行，缺乏临床样本和体内实验的进一步验证 | 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制，并鉴定共同的预后生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌的共享分子特征及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2026-07-03 |
Side- and Disease-Dependent Changes in Human Aortic Valve Cell Population and Transcriptomic Heterogeneity Determined by Single-Cell RNA Sequencing
2024-12-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121623
PMID:39766890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类主动脉瓣膜细胞群体和转录组异质性在侧别和疾病依赖性上的变化 | 首次通过单细胞RNA测序独立分析纤维层和心室层的内皮细胞，发现侧别依赖的细胞亚型和转录因子（如AP-1家族）在病变中的差异表达 | 样本量较小（仅5名供体），缺乏对非编码RNA或表观遗传调控的深入分析 | 探究钙化性主动脉瓣疾病在纤维层优先发展的细胞和分子机制 | 人类主动脉瓣膜的纤维层和心室层内皮细胞、间质细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名供体的主动脉瓣膜样本，包含82,356个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 283 | 2026-07-03 |
Optimizing CAR-T cell Culture: Differential effects of IL-2, IL-12, and IL-21 on CAR-T cells
2024-12, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2024.156758
PMID:39299100
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research paper | 研究了IL-2、IL-12和IL-21对CAR-T细胞培养的影响，发现IL-21可防止细胞衰老和耗竭 | 首次通过scRNA-seq系统比较三种细胞因子对CAR-T细胞转录组、表观遗传、代谢及衰老状态的不同影响，揭示IL-21的独特保护作用 | 未提及具体样本量和体内验证实验 | 优化CAR-T细胞培养条件，确定最有效的细胞因子组合 | 经不同细胞因子(IL-2、IL-12、IL-21)和抗原处理的CAR-T细胞 | machine learning, 数字病理学 | 血液恶性肿瘤， 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 284 | 2026-07-03 |
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0500OC
PMID:38626356
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研究论文 | 利用新型多层网络分析方法整合COPD患者肺组织的mRNA、microRNA和甲基化组数据，揭示了与临床特征相关的分子异质性 | 首次采用多层网络模型整合多组学数据识别COPD患者亚群，并结合空间转录组学验证不同亚群的小气道分子差异 | 样本仅限于既往吸烟的COPD患者，可能无法代表所有COPD亚型；需在更大独立队列中验证结果 | 通过无偏整合多组学数据揭示COPD的分子异质性及其与临床特征的关系 | 135名既往吸烟的COPD患者的肺组织样本 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | mRNA测序、microRNA测序、甲基化测序、空间转录组学 | 多层网络优化、机器学习分类器 | 基因表达、microRNA表达、甲基化数据、空间转录组学数据 | 135名COPD患者（主队列）及独立验证队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 285 | 2026-07-03 |
SpottedPy quantifies relationships between spatial transcriptomic hotspots and uncovers environmental cues of epithelial-mesenchymal plasticity in breast cancer
2024-11-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03428-y
PMID:39529126
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研究论文 | SpottedPy量化空间转录组热点关系并揭示乳腺癌上皮-间质可塑性的环境线索 | 开发了Python包SpottedPy，用于识别肿瘤热点并绘制癌症生态系统内的空间相互作用，为探索组织内异质性提供了灵活的工具 | 未提及 | 量化空间转录组热点关系并揭示肿瘤微环境动态 | 乳腺癌肿瘤热点及上皮-间质可塑性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 286 | 2026-07-03 |
IAMSAM: image-based analysis of molecular signatures using the Segment Anything Model
2024-11-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03380-x
PMID:39529142
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研究论文 | IAMSAM是一个基于网页的工具，利用Segment Anything Model分析空间转录组学数据，专注于形态学特征 | 首次将Segment Anything Model应用于空间转录组学图像分割，实现基于形态学特征的半自动感兴趣区域选择，并整合下游分析功能 | 未提及 | 开发用户友好的工具，用于空间转录组学数据的形态学特征分析和解释 | 空间转录组学数据中的组织图像和基因表达信息 | 计算机视觉,数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | Segment Anything Model（SAM） | 图像,基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 287 | 2026-07-03 |
Adenine base editors induce off-target structure variations in mouse embryos and primary human T cells
2024-11-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03434-0
PMID:39529170
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞RNA-seq分析，探讨了腺嘌呤碱基编辑器在小鼠胚胎和原代人T细胞中诱导脱靶结构变异的情况 | 首次发现腺嘌呤碱基编辑器在小鼠胚胎和原代人T细胞中诱导脱靶结构变异，且脱靶现象在多种细胞类型中普遍存在 | 未对脱靶结构变异的具体分子机制进行深入探讨，且高保真ABE变体的长期安全性仍需进一步验证 | 评估CRISPR/Cas9、腺嘌呤碱基编辑器和胞嘧啶碱基编辑器在基因编辑中的脱靶结构变异风险 | 小鼠胚胎和原代人T细胞 | 机器学习 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据，转录组数据 | 涉及小鼠胚胎和原代人T细胞，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA-seq，Illumina NovaSeq全基因组测序 |
| 288 | 2026-07-03 |
scDOT: optimal transport for mapping senescent cells in spatial transcriptomics
2024-11-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03426-0
PMID:39516853
|
研究论文 | scDOT利用最优传输将空间转录组数据和单细胞RNA测序数据结合，以构建单细胞分辨率的空间图谱并识别衰老细胞 | 提出scDOT方法，整合最优传输与表达解卷积技术，学习细胞与空间点之间的非线性耦合，用于推断细胞位置 | 未明确提及 | 提高空间转录组数据的单细胞分辨率，识别衰老细胞及其空间组织 | 肺空间转录组数据中的衰老细胞及其邻近细胞 | 计算机视觉 | 肺部疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 最优传输模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2026-07-03 |
GraphPCA: a fast and interpretable dimension reduction algorithm for spatial transcriptomics data
2024-11-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03429-x
PMID:39511664
|
研究论文 | 提出GraphPCA算法，一种用于空间转录组数据快速可解释降维的准线性方法 | 结合图正则化和主成分分析，开发出可解释且高效的准线性降维算法 | 未明确说明局限 | 解决空间转录组数据高维度和噪声问题，提升下游分析性能 | 模拟和多种平台生成的多分辨率空间转录组数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图正则化PCA | 基因表达数据 | 模拟及多平台多分辨率空间转录组数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2026-07-03 |
Genomic insights into the contribution of de novo lipogenesis to intramuscular fat deposition in chicken
2024-11, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.003
PMID:38065407
|
研究论文 | 通过基因组学揭示从头脂肪生成对鸡肌内脂肪沉积的贡献 | 首次通过大规模基因组分析和单细胞RNA测序证实从头脂肪生成是鸡肌内脂肪沉积的重要途径，并鉴定FASN基因为关键调控基因 | 样本仅限于特定品种和性别，可能不能代表所有鸡品种；肌内脂肪沉积的完整调控机制仍有待进一步阐明 | 阐明鸡肌内脂肪沉积的调控机制，为改善鸡肉品质提供策略 | 516只黄羽鸡和3只63日龄雌性JXY鸡的胸肌组织 | 基因组学 | NA | 全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序、13C同位素示踪 | NA | 基因组序列、转录组数据、同位素示踪数据 | 516只鸡（全基因组重测序）、3只鸡（单细胞RNA测序）、JXY鸡不同发育阶段胸肌组织（转录组测序） | Illumina | 全基因组测序、单细胞RNA测序、转录组测序 | Illumina NovaSeq | 全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序 |
| 291 | 2026-07-03 |
Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing
2024-10, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13663
PMID:38770541
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research paper | 利用单细胞RNA测序揭示慢性淋巴细胞白血病罕见亚群动力学及其驱动耐药性的分子特征 | 首次在治疗前阶段追踪到高基因组复杂度的耐药细胞亚群，并通过单细胞RNA测序表征其B细胞去分化特征 | 仅基于单一患者样本，结论普适性需更大规模队列验证 | 早期识别耐药癌细胞并解析其克隆演化与分子机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者疾病进展与治疗反应过程中细胞亚群动态 | 单细胞基因组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序， 批量基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例慢性淋巴细胞白血病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2026-07-03 |
Autoimmunity Against Surfactant Protein B Is Associated with Pneumonitis During Checkpoint Blockade
2024-10-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202311-2136OC
PMID:38626354
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研究论文 | 发现针对表面活性蛋白B的自身免疫与免疫检查点抑制剂相关肺炎有关 | 首次揭示表面活性蛋白B特异性自身抗体和CD4 T细胞共同存在与免疫检查点抑制剂诱发肺炎的相关性，并提出治疗前抗体水平可能作为预测风险标志物 | 未说明样本量大小及因果关系直接证据，仅提示相关性 | 探讨自身抗体和自身反应性T细胞在免疫检查点抑制剂相关肺炎发展中的作用 | 非小细胞肺癌患者和黑色素瘤患者的血液样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于外周血T细胞分析 |
| 293 | 2026-07-03 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Repair Features of Human Umbilical Cord Mesenchymal Stromal Cells
2024-09-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202310-1975OC
PMID:38564376
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人脐带间充质基质细胞的修复特征 | 首次通过单细胞RNA测序识别出脐带间充质基质细胞中具有不同治疗潜力的亚群，发现祖细胞样亚群而非成纤维细胞样亚群能改善实验性支气管肺发育不良的肺功能，并鉴定出主要组织相容性复合体I类作为非治疗性细胞的分子标志物 | 研究仅基于5名供体的脐带间充质基质细胞，样本量有限，且实验仅在动物模型中进行，结果向临床转化的可行性需进一步验证 | 探究单细胞水平上脐带间充质基质细胞的转录组特征与其治疗潜力之间的关系 | 人脐带间充质基质细胞和人新生儿真皮成纤维细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名足月供体的脐带间充质基质细胞和对照人新生儿真皮成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2026-07-03 |
Single-Cell Profiling Reveals Immune Aberrations in Progressive Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-08-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0979OC
PMID:38717443
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示特发性肺纤维化中外周免疫系统的变化 | 首次在高分辨率下系统描绘稳定性和进展性IPF中外周免疫系统变化图谱，发现经典单核细胞和调节性T细胞的预后预测性增加，并揭示肺-血免疫招募轴 | 样本量有限（38个PBMC样本），验证队列规模较小，未完全校正混杂因素 | 研究特发性肺纤维化中外周血免疫系统在稳定和进展状态下的变化 | 特发性肺纤维化患者和对照个体的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 38份PBMC样本，来自25名IPF患者和13名匹配对照个体，共149,564个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 5'单细胞RNA测序 |
| 295 | 2026-07-03 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
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研究论文 | 引入CPA-Perturb-seq，结合多重扰动筛选与单细胞RNA测序，研究42种CPA调控因子如何影响polyA位点选择 | 开发了CPA-Perturb-seq多重扰动筛选方法，结合3'端单细胞RNA测序实现全转录组polyA位点使用的推断，并训练了深度神经网络APARENT-Perturb来预测串联polyA位点使用 | 未提及明显限制，但可能局限于已知CPA调控因子及体外细胞模型 | 探究剪切和多聚腺苷酸化（CPA）调控因子如何控制polyA位点选择 | 42种CPA调控因子及其对polyA位点使用的影响 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 涉及42种CPA调控因子的多重扰动筛选数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,多重扰动筛选 | 10x Chromium | 基于3'端单细胞RNA测序的多重扰动筛选平台 |
| 296 | 2026-07-03 |
Single-cell profiling reveals immune aberrations in progressive idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-29, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.04.29.23289296
PMID:37163015
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序揭示了特发性肺纤维化（IPF）患者在稳定期和进展期的外周免疫系统变化图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描述IPF患者外周血免疫细胞群的变化，特别是发现经典单核细胞和调节性T细胞（Tregs）增加与疾病进展和预后相关，并揭示了肺-血免疫招募轴 | 摘要未明确提及局限性，但可能包括样本量较小或验证队列有限 | 绘制IPF患者稳定期和进展期的外周免疫系统变化图谱 | 特发性肺纤维化（IPF）患者和对照组的外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞生物信息学 | 特发性肺纤维化（IPF） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 25名IPF患者和13名匹配对照组，共38个PBMC样本，获得149,564个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 10x Chromium | 10x Chromium 5' 单细胞RNA测序 |
| 297 | 2026-07-02 |
Reprogramming macrophage mechanosensation via TRPV4 modulating mechano-immunotherapy controls fibrotic encapsulation of biomaterial implants
2026-Dec, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.06.020
PMID:42381969
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研究论文 | 通过药理手段干扰巨噬细胞机械感应，控制生物材料植入物周围的纤维化封装，提出“机械免疫疗法”新概念 | 首次提出通过药物干扰巨噬细胞机械感应（机械免疫疗法）控制生物材料植入物纤维化，并发现治疗效果依赖于高机械感应输入而非单纯药物浓度 | 仅基于模型小分子RN-1734在体外和动物模型中的验证，尚未在人类或更复杂生理环境中验证 | 探索通过药理调控巨噬细胞机械感应来控制植入物周围纤维化的可行性和机制 | J774.a2巨噬细胞、GelMA水凝胶、电纺支架、小鼠植入模型 | 数字病理学 | 纤维化疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 组织-植入物界面的空间转录组分析 |
| 298 | 2026-07-02 |
Time-dependent gene expression patterns in epidermal wound healing: Mechanistic insights into Cayratia japonica hydrogel intervention after anal fistula surgery
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121924
PMID:42208705
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研究论文 | 研究乌蔹莓水凝胶在肛瘘术后促进伤口愈合的时间依赖性基因表达模式及其分子机制 | 首次整合时间序列多组学分析、临床试验和体外实验，揭示乌蔹莓水凝胶通过BMP4蛋白结合Luteolin 7-glucuronide促进成纤维细胞增殖的阶段特异性分子程序 | 未明确提及，从内容推断可能为样本量有限(81例)及依赖公共数据集 | 探究乌蔹莓水凝胶促进肛瘘术后伤口愈合的分子机制及临床疗效 | 肛瘘术后伤口愈合过程中的人类皮肤和肛周组织样本 | 机器学习 | 肛瘘术后伤口 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, UPLC-ESI-Q-TOF-MS/MS, 分子对接, 时间序列聚类, WGCNA | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 质谱数据 | 81例患者临床试验；2个公开转录组数据集(GSE28914, GSE241132) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2026-07-02 |
Isomucronulatol 7-O-glucoside attenuates post-AMI monocyte/macrophage cardiac recruitment via HIF-1α/THBS1-mediated immunometabolic adhesion
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121972
PMID:42250831
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研究论文 | 揭示异荭草素-7-O-葡萄糖苷通过HIF-1α/THBS1介导的免疫代谢粘附轴减轻急性心肌梗死后单核/巨噬细胞心脏募集的作用机制 | 首次阐明HIF-1α/THBS1轴在急性心肌梗死后单核/巨噬细胞心脏募集中的免疫代谢粘附作用，并发现异荭草素-7-O-葡萄糖苷可直接结合HIF-1α，抑制该轴激活 | NA | 阐明急性心肌梗死后单核/巨噬细胞早期心脏募集和粘附的机制，并鉴定异荭草素-7-O-葡萄糖苷的分子靶点及治疗作用 | 急性心肌梗死小鼠模型及ST段抬高型心肌梗死患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、表面等离子共振 | NA | 单细胞转录组数据 | STEMI患者心脏动脉血样及AMI小鼠心脏免疫细胞样本，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 300 | 2026-07-02 |
Ophiopogon japonicus alleviates pulmonary fibrosis through modulation of HIF1A/TUBB3 axis-associated M2 macrophage polarization and arginine metabolic alterations
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122015
PMID:42285238
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研究论文 | 麦冬通过调控HIF1A/TUBB3轴相关的M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢改变减轻肺纤维化 | 首次整合多组学分析（转录组学、代谢组学、单细胞转录组学）与虚拟敲除分析，阐明麦冬通过HIF1A/TUBB3轴调节M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢改善肺纤维化的机制 | 机制研究主要基于小鼠模型和体外实验，缺乏临床验证，且候选活性成分Ophiopogonin D的体内作用仍需进一步确认 | 评估麦冬水提物对肺纤维化的保护作用并探讨其抗纤维化机制与HIF1A/TUBB3轴及精氨酸代谢的关系 | C57BL/6小鼠（BLM诱导肺纤维化模型） | 数字病理学 | 肺纤维化 | UHPLC-Q Exactive Orbitrap-HRMS, RNA-seq, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 质谱数据, 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 影像数据（micro-CT） | 小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | NA |