单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-04-26 |
Male preference for TERT alterations and HBV integration in young-age HBV-related HCC: implications for sex disparity
2025-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0545
PMID:39743888
|
研究论文 | 探讨端粒酶逆转录酶（TERT）遗传改变和乙型肝炎病毒（HBV）整合在性别特异性HBV相关肝细胞癌（HCC）风险中的作用 | 揭示了TERT启动子突变和HBV-TERT整合在年轻男性HBV相关HCC中的显著优势，为性别差异提供了分子机制解释 | 研究样本量有限（310例），且主要关注HBV相关HCC，结果可能不适用于其他病因的HCC | 探索HBV相关HCC性别差异的分子机制 | 310例HBV相关HCC组织 | 分子生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据和RNA测序数据 | 310例HBV相关HCC组织 |
| 282 | 2025-04-26 |
Multimodal learning for mapping genotype-phenotype dynamics
2025-Apr, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00765-7
PMID:39875699
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研究论文 | 本文提出了一种计算整合遗传学框架，用于同时分析和解释基因型及其相关表型的高维景观 | 结合单细胞RNA测序和语言模型等先进学习方法，开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组在细胞水平上的基因型-表型关系流形 | NA | 解析基因表达与表型表现之间的动态相互作用 | 人类转录组在细胞水平上的基因型-表型关系 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 语言模型 | 转录组数据 | NA |
| 283 | 2025-04-26 |
Ozone-induced lung injury and inflammation: Pathways and therapeutic targets for pulmonary diseases caused by air pollutants
2025-Apr, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109391
PMID:40121788
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研究论文 | 探讨臭氧（O3）空气污染通过氧化特性直接导致的呼吸道上皮细胞损伤和死亡，进而引发炎症和过度反应的机制及其潜在治疗靶点 | 利用肺单细胞转录组数据绘制O3损伤感知和信号通路基因图谱，识别O3反应潜在热点 | 未明确说明样本量或具体实验设计细节 | 阐明O3诱导肺损伤和炎症的病理通路，为空气污染相关肺病寻找治疗靶点 | 臭氧暴露下的呼吸道上皮细胞及肺组织驻留细胞 | 呼吸病学 | 肺病（哮喘/肺气肿混合表型） | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 284 | 2025-04-26 |
The dynamic and diverse nature of parenchyma cells in the Arabidopsis root during secondary growth
2025-Apr, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01938-6
PMID:40140531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和谱系追踪技术，揭示了拟南芥根在次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能 | 首次结合单细胞RNA测序和谱系追踪技术，重建了拟南芥根次生生长过程中细胞类型的发育轨迹，发现了20种不同的细胞类型或状态，其中许多是先前未被描述的 | 研究仅针对拟南芥根，结果是否适用于其他植物或组织尚不清楚 | 揭示拟南芥根在次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能 | 拟南芥根的薄壁细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序分析、谱系追踪 | NA | RNA测序数据 | 93个报告基因系 |
| 285 | 2025-04-26 |
Endothelial FOSL1 drives angiotensin II-induced myocardial injury via AT1R-upregulated MYH9
2025-Apr, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01410-9
PMID:39592734
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研究论文 | 本研究探讨了血管紧张素II（Ang II）通过FOSL1/MYH9轴在心肌损伤中的作用及其分子机制 | 揭示了FOSL1通过直接结合MYH9启动子激活其转录，进而导致血管功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明Ang II诱导心肌损伤的分子机制并探索潜在治疗靶点 | 小鼠心脏内皮细胞、人脐静脉内皮细胞 | 心血管病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、双荧光素酶报告实验、染色质免疫沉淀 | 小鼠心肌缺血再灌注模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据 | 未明确说明具体样本数量，使用了小鼠模型和体外培养细胞 |
| 286 | 2025-04-26 |
Identifying reproducible transcription regulator coexpression patterns with single cell transcriptomics
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012962
PMID:40257984
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研究论文 | 利用单细胞转录组学数据识别转录调控因子共表达模式 | 通过整合大量单细胞RNA-seq数据集，构建了跨细胞类型和物种的转录调控因子共表达网络，并验证了其与ChIP-seq数据的一致性 | 研究侧重于跨生物背景的可重复性模式，可能忽略了特定背景下的信号 | 理解转录调控因子共表达模式在广泛生物背景中的一致性 | 人类和小鼠的转录调控因子及其共表达基因伙伴 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 120个人类和103个小鼠单细胞RNA-seq数据集（超过2800万个细胞） |
| 287 | 2025-04-26 |
Blood Single-Cell Transcriptomic and Proteomic Signatures of Paradoxical Eczema in Patients with Psoriasis Treated with Biologics
2025-Mar-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.153
PMID:40157420
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研究论文 | 研究探讨了生物制剂治疗银屑病时出现的矛盾性湿疹的单细胞转录组和蛋白质组特征 | 首次使用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术揭示了矛盾性湿疹的炎症特征和遗传易感性 | 样本量有限，且仅针对特定生物制剂治疗的患者 | 探索生物制剂治疗银屑病时出现的矛盾性湿疹的发病机制 | 接受生物制剂治疗的银屑病患者 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 288 | 2025-04-26 |
Distinct deregulation trends of transcriptional protein complexes in aging naive T cells
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae231
PMID:39437255
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和蛋白质相互作用网络，揭示了衰老对幼稚CD4+和CD8+ T细胞中转录蛋白复合物的不同影响 | 首次揭示了衰老对幼稚CD4+和CD8+ T细胞中转录蛋白复合物的不同调控趋势，并发现SMAD3和BCL11A复合物可作为衰老的标志物 | 研究仅关注了幼稚T细胞，未考虑其他T细胞亚群或免疫细胞类型 | 探究衰老对T细胞亚群中转录蛋白复合物的影响及其在免疫系统功能衰退中的作用 | 幼稚CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自3个不同年龄组的幼稚CD4+和CD8+ T细胞 |
| 289 | 2025-04-26 |
Single-cell transcriptome analysis reveals atypical monocytes circulating ahead of acute graft-versus-host disease clinical onset
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae229
PMID:39432735
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了急性移植物抗宿主病(aGVHD)临床发病前循环中的非典型单核细胞 | 发现aGVHD临床发病前18天外周血中存在特定的单核细胞和细胞毒性T细胞亚群，这些细胞具有特定的标志物上调 | 样本量较小，仅包括3名aGVHD患者和4名对照 | 探索aGVHD发病前的早期生物标志物 | 接受异基因造血干细胞移植(HSCT)的患者 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名aGVHD患者(发病前和发病后)和4名对照HSCT受者 |
| 290 | 2025-04-26 |
Screening and validating genes associated with cuproptosis in systemic lupus erythematosus by expression profiling combined with machine learning
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10996
PMID:39388708
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研究论文 | 通过机器学习和单细胞RNA测序技术筛选和验证与系统性红斑狼疮中铜死亡相关的基因 | 首次结合机器学习和单细胞RNA测序技术系统性研究与铜死亡相关的基因在系统性红斑狼疮中的作用 | 研究依赖于公开数据集，样本量有限，实验验证仅针对部分基因 | 识别系统性红斑狼疮中与铜死亡相关的基因，并验证其作为生物标志物的潜力 | 系统性红斑狼疮患者的外周血样本 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR | 最小绝对收缩和选择算子（LASSO）、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE） | 基因表达数据 | 两个公开数据集（GSE65391和GSE61635）及单细胞RNA测序数据（GSE162577） |
| 291 | 2025-04-26 |
Pharmacological activation of STAT1-GSDME pyroptotic circuitry reinforces epigenetic immunotherapy for hepatocellular carcinoma
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332281
PMID:39486886
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research paper | 本研究通过筛选基因组发现干扰素-γ（IFNγ）通路缺陷与免疫检查点阻断（ICB）治疗无效的肿瘤相关，并开发了一种针对肝细胞癌（HCC）的联合治疗方法 | 揭示了选择性HDAC抑制剂CXD101与ICB联合治疗通过激活STAT1-GSDME焦亡回路增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于临床前模型，临床效果需进一步验证 | 开发针对HCC患者ICB耐药的治疗策略 | 肝细胞癌（HCC）患者和ICB耐药模型 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、单细胞多组学、染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 来自pembrolizumab试验（NCT03419481）的HCC患者样本和4种ICB耐药模型 |
| 292 | 2025-04-26 |
scCrab: A Reference-Guided Cancer Cell Identification Method based on Bayesian Neural Networks
2025-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00655-6
PMID:39348073
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研究论文 | 提出了一种基于贝叶斯神经网络的参考引导癌症细胞识别方法scCrab，用于单细胞RNA测序数据中的癌症细胞识别 | 结合贝叶斯神经网络和多头自注意力机制，能够整合外部参考数据作为先验信息，提高了识别性能 | 未提及具体的数据集规模限制或计算资源需求 | 开发一种高效的癌症细胞识别计算方法，以替代耗时且重复性差的手动识别方法 | 单细胞RNA测序数据中的癌症细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 贝叶斯神经网络(BNN)与线性回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集，具体数量未提及 |
| 293 | 2025-04-26 |
When is prostate cancer really cancer?
2025-Mar-01, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djae200
PMID:39350309
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research paper | 本文探讨了前列腺癌（尤其是Grade Group 1）是否应被标记为“癌症”，并总结了国际研讨会的关键讨论点 | 挑战了传统对Grade Group 1前列腺癌的分类，提出了基于现代诊断路径和空间转录组学的新观点 | 缺乏关于患者在没有癌症诊断的情况下是否会坚持监测的数据 | 减少前列腺癌死亡率，同时最小化过度诊断和过度治疗带来的危害 | 前列腺癌（特别是Grade Group 1） | digital pathology | prostate cancer | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 294 | 2025-04-26 |
Integrating Metabolic RNA Labeling-Based Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics for Spatiotemporal Transcriptomic Analysis
2025-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401297
PMID:39390840
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研究论文 | 该论文提出了一种将基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学相结合的新方法，用于时空转录组分析 | 首次将时间分辨scRNA-seq与空间转录组学整合，用于揭示GBM中细胞间通讯对基因表达的调控 | 未提及样本量是否足够大或是否涵盖其他类型肿瘤 | 探索GBM中基因表达的时空动态调控机制 | 胶质母细胞瘤(GBM)细胞及其微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢RNA标记、时间分辨scRNA-seq(Well-TEMP-seq)、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 295 | 2025-04-26 |
Identification of novel biomarkers for atherosclerosis using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Mar, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-024-10077-w
PMID:39400603
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术识别动脉粥样硬化的新型生物标志物 | 结合单细胞RNA测序、WGCNA、差异表达分析和多种机器学习方法（LASSO和SVM-RFE）识别并验证了动脉粥样硬化的潜在诊断标志物C1QC和COL1A1 | 研究结果仍需在更大规模的临床样本中进一步验证 | 识别动脉粥样硬化的新型生物标志物以改进其诊断和治疗 | 动脉粥样硬化患者和正常人的样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组化、ELISA分析 | LASSO、SVM-RFE | RNA测序数据、免疫细胞浸润数据 | 256个差异表达基因（来自AS和正常样本）、GSE21545数据集验证、小鼠和人类样本 |
| 296 | 2025-04-26 |
Sandwich Therapy with Radionuclide Combined with Intralesional Injections Based on Differences in the Spatial Structure Components of Keloids
2025-Mar, Aesthetic plastic surgery
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00266-024-04442-y
PMID:39402198
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research paper | 该研究设计了一种基于瘢痕疙瘩空间结构成分差异的改良‘三明治’疗法，结合放射性核素和病灶内注射，以减少并发症 | 基于单细胞测序分析和病理学发现瘢痕疙瘩血管壁中高表达的基因和通路，设计出针对其空间结构差异的精准靶向疗法 | 样本量较小（40例患者，41个部位），且缺乏长期随访数据 | 开发一种减少瘢痕疙瘩治疗并发症的新方法 | 瘢痕疙瘩患者 | digital pathology | keloid | 单细胞测序分析、超声、H&E染色、CD34染色、eNOS染色 | NA | 基因表达数据、超声图像、病理切片 | 40例患者，41个瘢痕疙瘩部位 |
| 297 | 2025-04-26 |
SCG2 Mediates HNSCC Progression With CCL2/TGFβ1high M2 Macrophage Infiltration
2025-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15154
PMID:39404611
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研究论文 | 本研究揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中M2巨噬细胞极化的机制，并确定了潜在的治疗靶点 | 发现SCG2作为HNSCC中M2巨噬细胞极化的关键因子，并验证了其在肿瘤预后中的重要作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 揭示HNSCC中M2巨噬细胞极化的机制并寻找治疗靶点 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC） | 生物信息学 | 头颈癌 | 生物信息学分析、单细胞转录组测序、基因敲除、细胞共培养 | NA | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的HNSCC批量转录组数据 |
| 298 | 2025-04-26 |
Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2696-5
PMID:39422812
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了TGF-β对肌肉内脂肪沉积的特异性抑制作用 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了TGF-β信号通路在肌肉内脂肪沉积中的特异性调控作用 | 研究主要基于猪和小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究肌肉内脂肪沉积的调控机制及其在肌肉萎缩和修复中的作用 | 猪的背最长肌和肥胖小鼠模型 | 生物医学 | 肥胖相关肌肉萎缩 | 空间转录组学(ST)和单核RNA测序(single-nucleus RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 不同肌肉内脂肪含量的猪背最长肌样本和肥胖小鼠模型 |
| 299 | 2025-04-26 |
Unraveling aging from transcriptomics
2025-Mar, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.09.006
PMID:39424502
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综述 | 本文综述了转录组学技术在衰老研究中的最新进展及其在生物标志物发现、分子通路阐明和靶向治疗策略开发中的应用 | 总结了不同类型转录本（如mRNA、lncRNA、tRNA和miRNA）在衰老研究中的最新突破，并讨论了它们对未来研究的潜在影响 | NA | 阐明衰老的生物学机制及年龄相关疾病，促进健康长寿 | 衰老过程中的转录组变化 | 生物信息学 | 老年疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 300 | 2025-04-26 |
The Microscope and Beyond: Current Trends in the Characterization of Kidney Allograft Rejection From Tissue Samples
2025-Mar-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005153
PMID:39436268
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综述 | 本文综述了当前和新兴的创新工具在从组织样本中增强对肾移植排斥反应表征的潜力 | 讨论了数字病理工作流程、深度学习、多重免疫组化、单细胞转录组学和空间转录组学等新兴技术在肾移植排斥反应表征中的应用 | Banff分类法目前仍以活检为中心，主要依赖半定量组织学评分系统，缺乏可重复性和精细度 | 增强对肾移植排斥反应的表征和理解 | 肾移植排斥反应的组织样本 | 数字病理 | 肾移植排斥反应 | 多重免疫组化、单细胞转录组学、空间转录组学 | 深度学习 | 组织样本、转录组数据 | NA |