单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-06-20 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-10, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
|
研究论文 | 整合批量与单细胞RNA-seq数据，揭示膀胱癌细胞分化相关亚型并构建评分系统 | 首次识别膀胱癌细胞分化相关分子亚型并构建CDR评分系统，发现ANXA5作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性信息 | 探索膀胱癌细胞分化相关基因的分子亚型及其预后意义，并建立评分系统 | 膀胱癌细胞分化相关基因、膀胱癌患者样本 | 机器学习和数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、Lasso回归、Cox回归 | WGCNA、Lasso、Cox回归模型 | 基因表达数据（批量与单细胞RNA-seq） | 两个GEO单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2026-06-20 |
Unlocking reproducible transcriptomic signatures for acute myeloid leukaemia: Integration, classification and drug repurposing
2024-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70085
PMID:39267259
|
研究论文 | 通过整合34个数据集（包括单细胞RNA测序数据）识别急性髓系白血病（AML）相关基因签名，结合XGBoost模型进行亚型分类和药物重定位，并构建了CSAMLdb数据库平台 | 首次整合多组公开数据集（含scRNA-seq）系统性筛选出191个低变异高一致性的AML特征基因，并开发了结合XGBoost和自定义框架的亚型分类方法，同时通过药物重定位发现solasonine对高危患者潜在疗效 | 未明确说明研究局限性 | 解决AML转录组研究的异质性问题，通过数据整合和机器学习方法实现可重复的分子分型和药物重定位 | 急性髓系白血病患者转录组数据（包含34个数据集，26个对照组、6个预后数据集和2个scRNA-seq数据集） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接 | XGBoost | 转录组数据 | 34个数据集（含26个对照组、6个预后数据集和2个单细胞RNA测序数据集） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2026-06-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of MYH11+ tumour-associated fibroblasts between left-sided and right-sided colorectal cancer
2024-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70102
PMID:39294858
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示左右侧结直肠癌中MYH11+肿瘤相关成纤维细胞的异质性 | 首次发现MYH11+癌相关成纤维细胞亚群在左侧结直肠癌中富集，并揭示其通过与巨噬细胞相互作用促进肿瘤迁移，为左右侧结直肠癌异质性提供新见解 | NA | 探讨左右侧结直肠癌中免疫和基质细胞的异质性特征及差异 | 12例左侧结直肠癌和10例右侧结直肠癌患者的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22例患者（12例左侧结直肠癌，10例右侧结直肠癌） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 284 | 2026-06-20 |
Cross-modal integration of bulk RNA-seq and single-cell RNA sequencing data to reveal T-cell exhaustion in colorectal cancer
2024-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70101
PMID:39344205
|
研究论文 | 提出DeepTEX，一种整合bulk RNA-seq和单细胞RNA测序数据的多组学深度学习方法，揭示结直肠癌中T细胞耗竭的异质性 | 首次通过跨模态知识蒸馏和域适应模型整合不同组学数据，预测T细胞耗竭异质性并识别关键功能通路和基因 | 未提及局限性 | 探究结直肠癌中T细胞耗竭的异质性及潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者的T细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | DeepTEX（域适应模型和跨模态知识蒸馏模型） | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2026-06-20 |
Transcriptional analysis of primary ciliary dyskinesia airway cells reveals a dedicated cilia glutathione pathway
2024-07-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.180198
PMID:39042459
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、蛋白质组学和高级显微镜技术，分析原发性纤毛运动障碍患者的呼吸道上皮细胞，揭示了一个专门的纤毛谷胱甘肽通路 | 首次发现纤毛GSTA2通路对正常纤毛运动至关重要，并揭示了PCD患者与杂合母亲及健康个体之间独特的转录组特征 | NA | 探究原发性纤毛运动障碍的分子机制及其对多纤毛细胞的影响 | 原发性纤毛运动障碍患者、其杂合母亲和健康个体的原代培养上皮细胞，以及来自PCD患者的诱导多能干细胞 | 数字病理学 | 原发性纤毛运动障碍 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 高级显微镜, 免疫金标记 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 显微镜图像 | PCD患者、杂合母亲和健康个体的原代细胞，以及一名PCD患者的iPSCs（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells
2024-06-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009
PMID:38795702
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 287 | 2026-06-20 |
Single-cell and genome-wide Mendelian randomization identifies causative genes for gout
2024-06-03, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03348-z
PMID:38831441
|
研究论文 | 结合单细胞转录组学和全基因组孟德尔随机化分析，鉴定与痛风相关的致病基因 | 首次整合单细胞转录组学、全基因组关联研究、表达数量性状位点和甲基化数量性状位点数据，利用孟德尔随机化方法揭示蛋白质与痛风的因果关系 | 未明确提及，但可能包括样本量有限或验证不足等常见局限 | 研究痛风疾病中基因表达调控机制并阐明其发病机制 | 痛风相关的基因、甲基化位点和蛋白质 | 机器学习 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、全基因组关联研究、孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2026-06-20 |
Targeting pathogenic fibroblast-like synoviocyte subsets in rheumatoid arthritis
2024-05-23, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03343-4
PMID:38783357
|
综述 | 本文综述了类风湿关节炎中致病性成纤维样滑膜细胞亚群及其作为治疗靶点的潜力 | 系统总结了近年通过单细胞RNA测序等高通量技术鉴定的RA中致病性FLS亚群及其特征，并探讨了靶向这些亚群的新策略 | 目前尚无FLS特异性靶向疗法应用于RA临床管理，且直接靶向通用成纤维细胞标志物可能引起伤口愈合减慢或纤维化等副作用 | 探讨RA中致病性FLS亚群的特征及其分化机制，为开发新型FLS靶向策略提供见解 | 类风湿关节炎患者发炎滑膜中的成纤维样滑膜细胞致病性亚群 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 289 | 2026-06-20 |
Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation
2024-05-13, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03328-3
PMID:38741149
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，构建了结合铜凋亡相关基因与铁死亡相关基因的新型特征基因，用于探索骨关节炎的发病机制 | 首次将铜凋亡相关基因与铁死亡相关基因结合构建骨关节炎的新型特征基因签名，并整合单细胞RNA-seq数据分析细胞分布 | 未提供 | 探索骨关节炎的发病机制并辅助其治疗 | 骨关节炎 | 机器学习 | 骨关节炎 | 生物信息学分析， 单细胞RNA-seq | 机器学习方法 | 基因表达数据， 单细胞RNA-seq数据 | GSE82107数据集 | 未提供 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未提供 | 未提供 |
| 290 | 2026-06-20 |
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
2024-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02972-1
PMID:38760586
|
研究论文 | 通过多组学分析，研究了接受猪心脏异种移植的人类患者的分子反应 | 首次在人类接受猪心脏异种移植后，通过多组学（转录组、脂质组、蛋白质组和代谢组）分析，揭示了早期分子和免疫反应的差异 | 仅涉及两例患者，样本量小，且观察时间短，难以推广至更广泛人群 | 深入了解异种移植后的分子景观，特别是早期免疫和代谢反应 | 接受10基因编辑猪心脏异种移植的两名人类患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂质组学, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 血液样本, 组织样本 | 2名人类患者（1男1女），每6小时采集血液样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂质组学, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 291 | 2026-06-20 |
SOCS3 regulates pathological retinal angiogenesis through modulating SPP1 expression in microglia and macrophages
2024-05-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.025
PMID:38504518
|
研究论文 | 本研究揭示了SOCS3通过调节微胶质细胞和巨噬细胞中SPP1的表达来调控病理性视网膜血管生成 | 首次发现SOCS3/STAT3/SPP1轴在病理性视网膜血管生成中的关键调控作用，并鉴定出表达Spp1的微胶质细胞和巨噬细胞亚群 | 未提供具体局限性信息 | 探究髓系细胞中SOCS3缺失对眼部新生血管形成过程中微胶质细胞和巨噬细胞积累的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠血管生成模型中的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2026-06-20 |
Envelope protein-specific B cell receptors direct lentiviral vector tropism in vivo
2024-05-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.002
PMID:38449314
|
研究论文 | 研究发现慢病毒载体经不同假型包膜蛋白修饰后，通过B细胞受体（BCR）介导的方式特异性地转导不同的脾脏B细胞亚群 | 首次揭示假型慢病毒载体可通过与包膜蛋白特异性结合的B细胞受体进入B细胞，实现亚群选择性的基因递送，并激活转导B细胞的增殖与分化 | NA | 探究慢病毒载体经系统给药后脾脏B细胞转导的机制及不同假型对B细胞亚群的选择性 | 慢病毒载体、脾脏B细胞、B细胞受体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 293 | 2026-06-20 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveal the significant role of macrophages in lupus nephritis
2024-04-12, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03311-y
PMID:38610007
|
研究论文 | 通过整合单细胞及批量转录组数据，揭示巨噬细胞在狼疮肾炎中的重要作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据分析狼疮肾炎中巨噬细胞的表型转变（从炎症巡逻型到吞噬型再到抗原提呈型），并发现LGALS9基因在巨噬细胞中的显著上调及其促炎作用，为治疗提供潜在靶点 | 仅基于公共数据集中LN样本与正常肾组织的转录组数据，且LGALS9功能研究仅限于THP-1细胞系，未在体内动物模型中验证 | 识别狼疮肾炎中异常的免疫细胞组分和信号通路，寻找潜在治疗靶点 | 狼疮肾炎组织样本和正常肾组织 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 慢病毒介导过表达 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 狼疮肾炎组织样本与正常肾组织（具体数量未在摘要中说明） | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2026-06-20 |
SORC: an integrated spatial omics resource in cancer
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad820
PMID:37811897
|
研究论文 | 开发了一个整合的癌症空间组学资源SORC，用于可视化和分析癌症空间转录组数据 | 首次构建了涵盖17种癌症类型、269个切片共计722,899个点的综合空间组学资源，并整合了匹配的单细胞RNA-seq数据，提供五大分析模块 | 未明确提及局限性 | 提供一个全面的空间解析癌症细胞图谱，增强对肿瘤微环境的理解 | 17种癌症类型的空间转录组数据集，包括722,899个点、269个切片，以及匹配的334,379个单细胞和46种细胞类型 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 269个切片、722,899个点、334,379个单细胞、46种细胞类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 295 | 2026-06-20 |
CellSTAR: a comprehensive resource for single-cell transcriptomic annotation
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad874
PMID:37855686
|
研究论文 | CellSTAR是一个全面的单细胞转录组注释资源数据库，整合了 expertly 注释的参考数据和数万个标记基因，用于细胞类型注释 | 首次提供涵盖数百种细胞类型的综合专家注释参考数据，并整合了参考数据和标记基因的集体考量 | 无可用信息 | 开发一个全面的单细胞转录组注释资源数据库，支持细胞类型注释和细胞异质性研究 | 单细胞转录组数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | 无可用信息 | 单细胞转录组测序 | NA | 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2026-06-20 |
CellCommuNet: an atlas of cell-cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse tissues in normal and disease states
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad906
PMID:37850657
|
research paper | CellCommuNet是一个综合性数据资源，用于探索人类和小鼠组织在正常和疾病状态下单细胞RNA测序数据中的细胞间通信网络 | 首次构建了包含376个单数据集和118个疾病与正常样本比较数据集的细胞间通信网络图谱，提供交互式图形展示和差异分析功能 | NA | 建立全面的细胞间通信网络数据库，促进生物学研究 | 人类和小鼠组织在正常和疾病状态下的单细胞RNA测序数据 | machine learning | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 376个单数据集和118个比较数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2026-06-20 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
|
研究论文 | 本研究探讨CD73产生的胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤消退并抑制化生的作用 | 首次证明CD73缺失会加剧胰腺炎严重程度，并揭示通过清除中性粒细胞可减轻化生和急性胰腺炎，为CD73增强剂作为治疗策略提供新依据 | 研究主要基于小鼠模型，未在人胰腺炎样本中进行验证；且未深入探讨腺苷受体亚型的具体机制 | 阐明CD73产生的胞外腺苷在胰腺炎炎症消退和组织损伤修复中的关键作用 | CD73敲除和野生型C57BL/6小鼠的胰腺组织及浸润免疫细胞 | 机器学习 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及CD73敲除和野生型小鼠，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 298 | 2026-06-20 |
Comparative single-cell transcriptomic analysis reveals differences in signaling pathways in gonadal primordial germ cells between chicken (Gallus gallus) and zebra finch (Taeniopygia guttata)
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201569R
PMID:36520042
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较鸡和斑胸草雀生殖腺原始生殖细胞中的信号通路差异 | 首次进行跨物种鸟类单细胞转录组分析，揭示了鸡形目和雀形目之间生殖细胞发育的信号通路差异 | NA | 探究鸡和斑胸草雀生殖腺原始生殖细胞及周围细胞的物种特异性特征 | 鸡和斑胸草雀的生殖腺原始生殖细胞及周围体细胞 | 机器学习和基因组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2026-06-20 |
A single-cell transcriptomic atlas characterizes cell types and their molecular features in yak ovarian cortex
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201176RR
PMID:36527406
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建牦牛卵巢皮层的细胞图谱，表征细胞类型及其分子特征 | 首次构建了牦牛卵巢皮层的单细胞转录组图谱，并鉴定出八种主要细胞类型及其标志基因 | 未提供样本量信息，且仅对卵母细胞进行了亚型分类，其他细胞类型的异质性有待进一步探索 | 揭示牦牛卵巢皮层的细胞组成和分子特征，为理解雌性生殖生物学提供见解 | 牦牛卵巢皮层组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2026-06-19 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals a baicalein-responsive 10-gene signature for non-small cell lung cancer
2026-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102853
PMID:42251782
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析揭示了黄芩素应答的10基因签名用于非小细胞肺癌 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、批量转录组学、空间转录组学、机器学习和体外实验，系统鉴定非小细胞肺癌中黄芩素应答基因，并建立了高诊断准确性的10基因签名，通过分子对接和动力学模拟验证了黄芩素与关键靶蛋白的结合稳定性 | 研究主要基于公开数据和体外实验，缺乏体内动物模型和临床试验验证，且黄芩素的具体作用机制仍需进一步深入探究 | 识别非小细胞肺癌中黄芩素应答基因并建立诊断签名 | 非小细胞肺癌细胞系（PC-9和A549细胞）及肿瘤微环境中的不同细胞类型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型（用于选择基因签名） | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量，但使用了公开数据集及体外实验中的PC-9和A549细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |