单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
281	2025-07-20	Excess pancreatic elastase alters acinar-β cell communication by impairing the mechano-signaling and the PAR2 pathways 2023-07-11, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2023.05.007 PMID:37339634	研究论文	该研究探讨了胰腺弹性蛋白酶（PE）如何通过影响机械信号和PAR2通路来改变腺泡细胞与β细胞的通讯，进而影响β细胞存活	首次发现PE在2型糖尿病患者中上调，并通过高通量筛选鉴定出telaprevir作为有效的PE抑制剂，能够提高β细胞存活率并改善葡萄糖耐量	研究主要基于体外和动物模型，尚未在人类临床试验中验证telaprevir的效果	探索PE在β细胞存活中的作用，并寻找潜在的治疗糖尿病策略	人类和啮齿动物的β细胞	糖尿病研究	2型糖尿病	高通量筛选、磷酸抗体微阵列、单细胞RNA测序	NA	分子生物学数据、基因表达数据	来自T2D患者的腺泡细胞和胰岛细胞
282	2025-07-20	p38MAPKα Stromal Reprogramming Sensitizes Metastatic Breast Cancer to Immunotherapy 2023-06-02, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0907 PMID:36883955	研究论文	本研究探讨了p38MAPKα抑制通过重编程转移性肿瘤微环境，增强乳腺癌对免疫疗法的敏感性	发现p38MAPKα抑制与OX40激动剂联合使用可协同减少转移性生长并提高生存率，同时揭示了该疗法在抗原性乳腺癌中的潜在效果	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索提高转移性乳腺癌免疫疗法效果的策略	转移性乳腺癌及其肿瘤微环境	肿瘤免疫学	乳腺癌	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	NA
283	2025-07-20	CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26 2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1 DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC PMID:36790376	研究论文	本文研究了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用促进过敏性肺部炎症消退的机制	揭示了CCL26-CXCR通路在嗜酸性过敏性肺部炎症消退中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性肺部炎症消退过程中的细胞机制	人类和小鼠的肺泡巨噬细胞(AM)亚群	免疫学	过敏性肺部疾病	质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、生物物理和免疫学分析	条件性CCL26敲除转基因小鼠	单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据	人类支气管过敏原激发样本和小鼠过敏性肺部炎症模型
284	2025-07-20	Single-cell transcriptome analysis of xenotransplanted human retinal organoids defines two migratory cell populations of nonretinal origin 2023-05-09, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2023.04.004 PMID:37163980	研究论文	通过单细胞转录组分析，研究异种移植的人类视网膜类器官中两种非视网膜来源的迁移细胞群	发现移植的视网膜类器官细胞中存在非视网膜来源的星形胶质细胞和脑/脊髓样神经前体细胞，这些细胞在培养的类器官中罕见或缺失	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探索移植的人类视网膜类器官细胞在受体视网膜中的行为及其潜在治疗应用	人类视网膜类器官细胞和光感受器缺陷小鼠	数字病理学	视网膜退行性疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	光感受器缺陷小鼠和人类视网膜类器官细胞
285	2025-07-20	Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control 2023-Mar-28, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-023-09232-5 PMID:36978008	研究论文	通过整合单细胞和批量RNA测序数据，研究肥胖SM/J小鼠中β细胞亚群的基因表达及其与血糖控制相关的遗传网络	整合单细胞和批量RNA测序数据，识别与肥胖中β细胞功能相关的新亚群和遗传通路	研究仅针对肥胖SM/J小鼠，结果可能不适用于其他模型或人类	探索β细胞异质性及其对糖尿病治疗的影响	肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞	生物信息学	糖尿病	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	NA	RNA测序数据	肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞
286	2025-07-20	Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy 2023-03-10, Skeletal muscle IF:5.3Q2 DOI:10.1186/s13395-023-00315-1 PMID:36895061	研究论文	本研究探讨了骨骼肌中细胞外囊泡（EVs）的分布和定位，以及在废用性萎缩后的变化	揭示了骨骼肌EVs的生物发生因子表达和细胞定位，并比较了废用性萎缩对EV浓度的影响	研究未明确EVs在骨骼肌适应性反应中的具体作用机制	研究骨骼肌EVs的生物发生、标记表达、细胞定位及废用性萎缩对其浓度的影响	大鼠和人类的骨骼肌及血清中的EVs	细胞生物学	骨骼肌萎缩	密度梯度超速离心、荧光相关光谱测量、qPCR、scRNA-seq、免疫组织化学、纳米颗粒追踪分析	NA	RNA测序数据、血清EV浓度数据	大鼠和人类模型
287	2025-07-20	A cellular taxonomy of the adult human spinal cord 2023-02-01, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007 PMID:36731429	研究论文	该研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，构建了成人人类脊髓的细胞分类学	首次对人类脊髓细胞进行系统分类，并揭示了运动神经元在肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的分子特征	研究样本量有限，可能无法完全代表人类脊髓细胞的多样性	揭示人类脊髓细胞的多样性和功能特征，特别是与疾病相关的分子机制	成人人类脊髓细胞	单细胞测序	肌萎缩侧索硬化症（ALS）	单核RNA测序、空间转录组学	NA	RNA测序数据	NA
288	2025-07-20	Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment 2023-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011 PMID:36309131	研究论文	本研究探讨了非连接性Claudin-1（CLDN1）作为肝细胞癌（HCC）治疗靶点的潜力，并开发了特异性单克隆抗体以抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境	首次将非连接性CLDN1作为HCC的治疗靶点进行研究，并开发了特异性单克隆抗体，展示了其在抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境方面的潜力	研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证	探索CLDN1作为HCC治疗靶点的潜力，并开发相关治疗方法	肝细胞癌（HCC）患者来源的细胞系、3D体外模型和异种移植小鼠模型	肿瘤学	肝细胞癌	单克隆抗体技术、单细胞RNA测序	患者来源的异种移植（PDX）模型	基因表达数据、肿瘤生长数据	大量患者来源的细胞系和动物模型
289	2025-07-20	Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients 2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016 PMID:36608902	研究论文	研究探讨了肠内分泌细胞（EECs）如何通过调节隐窝代谢来保护干细胞微环境，以响应营养变化	揭示了EECs在传递营养信息至干细胞微环境中的关键作用，以及其对隐窝代谢的调控机制	研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官，可能不完全反映人体内复杂生理环境	探究EECs在调节肠道干细胞微环境代谢中的作用	小鼠肠道上皮细胞和人类肠道类器官	细胞生物学	NA	间接热量测定、1H-NMR代谢组学、线粒体实时成像、Seahorse生物分析仪、10x Genomics单细胞测序	VillinCreERT2小鼠模型、NEUROG3-null人类多能干细胞衍生的肠道类器官	代谢数据、成像数据、单细胞转录组数据	NA
290	2025-07-20	A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer 2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04471-7 PMID:36376617	研究论文	本研究通过分析头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中铜死亡相关基因(CRGs)的差异表达和遗传变异，构建了预测HNSCC患者生存的CRG风险模型	首次系统评估了HNSCC中CRGs的差异表达和遗传变异，并构建了预测患者生存的CRG风险模型	研究主要基于公共数据库数据，缺乏实验验证	探索铜死亡相关基因在HNSCC中的预后价值和免疫微环境特征	头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者	肿瘤基因组学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞测序、lasso回归、Cox分析	CRG风险模型	基因表达数据、临床数据	公共数据库中的HNSCC样本
291	2025-07-20	CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis 2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202201537R PMID:36468677	研究论文	该研究探讨了CD73在胰腺炎中通过生成细胞外腺苷促进中性粒细胞介导的组织损伤的解决和抑制化生的作用	揭示了CD73通过生成细胞外腺苷在胰腺炎炎症解决中的关键作用，并提出了CD73增强剂作为潜在治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类胰腺炎中的效果尚需进一步验证	探究CD73在胰腺炎炎症解决和化生抑制中的作用机制	CD73敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠	基础医学研究	胰腺炎	免疫组织化学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、组织病理学数据	CD73敲除小鼠和野生型小鼠(具体数量未明确说明)
292	2025-07-20	The Simple prEservatioN of Single cElls method for cryopreservation enables the generation of single-cell immune profiles from whole blood 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1271800 PMID:38090590	研究论文	本文介绍了一种名为SENSE的单步冷冻保存全血方法，用于生成高质量的单细胞免疫图谱	开发了SENSE方法，简化了单细胞RNA测序前的样本处理步骤，无需特殊设备或训练有素的人员	仅在6个全血样本中进行了验证，样本量较小	开发一种简化的单细胞冷冻保存方法，促进临床转化研究	全血样本中的单细胞	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	6个全血样本，共22,353个细胞
293	2025-07-20	EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases 2023, Bioinformatics advances IF:2.4Q2 DOI:10.1093/bioadv/vbad029 PMID:36998720	研究论文	开发了一个名为EasyCellType的用户友好计算工具，用于自动比对输入标记列表与数据库，并提供图形化注释推荐	提出了一个自动化方法，结合两种统计测试（基因集富集分析和改进的Fisher精确检验），并支持自定义数据库和组织类型选择	未提及具体性能比较或在大规模数据集上的验证	简化单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释过程	单细胞RNA测序数据中的细胞标记	生物信息学	NA	scRNA-seq	NA	基因表达数据	未提及具体样本数量
294	2025-07-20	Processing and cryopreservation of human ureter tissues for single-cell and spatial transcriptomics assays 2022-12-16, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2022.101854 PMID:36595885	研究论文	本文描述了处理和冷冻保存人类输尿管组织以进行单细胞和空间转录组学测定的优化协议	优化了从输尿管组织生成、冷冻保存和解冻单细胞悬浮液的协议，以及用于空间基因表达平台的冷冻保存协议	需要参考其他文献以获取完整的协议执行细节	为单细胞RNA测序和空间转录组学提供优化的组织处理和冷冻保存方法	人类输尿管组织	生物医学工程	NA	scRNA-seq, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
295	2025-07-20	Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma 2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04073-3 PMID:35713707	研究论文	通过单细胞转录组测序揭示尤文肉瘤的异质性和发育轨迹	首次在单细胞分辨率上预测尤文肉瘤肿瘤细胞的起源，并模拟神经嵴细胞谱系分化的过程	样本量较小（仅4个尤文肉瘤组织样本），可能影响结果的普遍性	探究尤文肉瘤的异质性、发育轨迹及其潜在治疗靶点	尤文肉瘤肿瘤细胞	数字病理学	尤文肉瘤	单细胞RNA测序	K-最近邻算法, Monocle2包	RNA测序数据	4个尤文肉瘤肿瘤组织样本
296	2025-07-20	Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4 2022-11-21, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007 PMID:36347256	research paper	该研究通过小鼠遗传学和单细胞RNA测序技术，揭示了Bmp2和CXCL12/CXCR4信号在心脏发育和再生过程中对心内膜向冠状动脉分化的调控作用	发现了Bmp2和CXCL12/CXCR4信号在心脏发育和再生过程中的新作用，为心脏损伤后的血管再生提供了潜在治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探索心脏发育和再生过程中心内膜向冠状动脉分化的分子机制	小鼠心内膜细胞和冠状动脉内皮细胞	心血管生物学	心血管疾病	scRNA-seq, 小鼠遗传学	小鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个发育阶段的小鼠心脏组织
297	2025-07-20	A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine 2022-11-15, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641 PMID:36384107	research paper	研究高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应反应	揭示了高脂饮食在短时间内对肠道上皮细胞的转录组和生理指标的快速影响	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类或其他动物模型	探讨饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制	小鼠肠道上皮细胞	生理学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	小鼠模型
298	2025-07-20	ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ 2022-11, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-022-01653-6 PMID:36280724	research paper	介绍了一种名为clampFISH 2.0的新方法，用于原位快速、可扩展的RNA检测	采用倒置的padlock设计，能够高效检测多种RNA并同时指数级放大信号，同时减少了时间和成本	未明确提及具体限制	开发一种高效、低成本的原位RNA检测方法	RNA分子	分子生物学	NA	clampFISH 2.0	NA	RNA检测数据	超过100万个细胞
299	2025-07-20	Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression 2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04020-2 PMID:35523976	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了结直肠癌进展中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络	构建了癌症干细胞到侵袭性细胞的转化路径（'stem-to-invasion path'）并揭示了多层调控网络，同时发现了一种新的组合生物标志物用于评估结直肠癌患者的预后	研究结果需要在更大规模的独立数据集中进一步验证	探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的过程及其调控机制	结直肠癌中的癌症干细胞和侵袭性细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组学、生物信息学方法（聚类、伪时间分析、基因集变异分析、基因本体富集分析）	NA	单细胞转录组数据	未明确提及具体样本数量，但使用了独立的验证数据集
300	2025-07-20	The role of specialized cell cycles during erythroid lineage development: insights from single-cell RNA sequencing 2022-Aug, International journal of hematology IF:1.7Q3 DOI:10.1007/s12185-022-03406-9 PMID:35759181	综述	本文综述了早期红细胞祖细胞CFU-e向终末分化ETD转变的调控机制，重点探讨了单细胞RNA测序和流式细胞术研究的最新发现	揭示了CFU-e/ETD转变是一个快速的S期依赖性转录开关，并发现细胞周期速度和S期缩短在细胞命运决定中的新发育作用	主要基于已有研究的综述，缺乏新的实验数据验证	探讨红细胞谱系发育过程中特化细胞周期的调控机制	早期红细胞祖细胞CFU-e及其向终末分化ETD的转变过程	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	单细胞转录组数据	NA