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当前共找到 33643 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-12-03 |
Integrated multi-omics of mitophagy-related molecular subtype characterization and biomarker identification in sepsis
2025-Dec-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30153-8
PMID:41326582
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别并验证了与线粒体自噬相关的关键基因作为脓毒症诊断和分子分型的生物标志物 | 首次系统性地识别并验证了线粒体自噬相关基因（MAG）在脓毒症诊断、分子分型和免疫调节中的关键作用，并提供了NUP93促进线粒体自噬的功能性证据 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内实验验证和临床样本的直接验证 | 识别脓毒症的线粒体自噬相关分子亚型并发现诊断生物标志物 | 脓毒症患者和LPS刺激的RAW264.7细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 批量转录组测序、单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量，但使用了多个批量转录组数据集和单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2025-12-03 |
Hypergraph-driven spatial multimodal fusion for precise domain delineation and tumor microenvironment decoding
2025-Dec-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09312-0
PMID:41326702
|
研究论文 | 提出了一种名为HAST的超图驱动空间多模态融合工具，用于精确划分空间域和解码肿瘤微环境 | 通过整合基因表达、空间坐标和组织学特征构建局部超图，有效建模多对多的空间关系，并利用超图卷积网络结合自监督对比学习来融合多视图信息 | 未在摘要中明确说明 | 精确划分空间域并解码肿瘤微环境 | 肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 超图卷积网络 | 基因表达数据、空间坐标、组织学特征 | 多个数据集（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 283 | 2025-12-03 |
Comprehensive bulk and single-cell RNA sequencing uncovers senescence-associated biomarkers in therapeutic mesenchymal stem cells
2025-Dec-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30633-x
PMID:41326705
|
研究论文 | 本研究结合形态学、分子和转录组学分析，深入表征了犬间充质干细胞在衰老过程中的变化，并通过bulk和单细胞RNA测序发现了衰老相关的生物标志物 | 首次在犬模型（与人类衰老特征相似）中，结合bulk RNA测序和单细胞RNA测序全面分析间充质干细胞的衰老过程，并发现了衰老亚群的异质性分布 | 研究基于体外传代模型，可能无法完全模拟体内衰老的复杂性；样本量相对较小 | 研究间充质干细胞在衰老过程中的转录组变化，寻找衰老相关的生物标志物，以提高细胞治疗的质量控制 | 犬间充质干细胞（早期传代P2和晚期传代P6） | 数字病理学 | 老年疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早期传代（P2）和晚期传代（P6）犬间充质干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 284 | 2025-12-03 |
Next-generation method for preparing plant cells for single-cell RNA sequencing
2025-Dec-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02940-8
PMID:41326821
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2025-12-03 |
Multimodal foundation transformer models for multiscale genomics
2025-Dec-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02918-6
PMID:41326819
|
综述 | 本文探讨了基于Transformer的模型在分析和整合多尺度生物数据方面的最新进展，并提出了一个模块化的“超级Transformer”架构设计 | 将Transformer模型分为三个层级进行系统分类，并提出了利用交叉注意力机制整合异质模态的模块化“超级Transformer”架构 | 本文为综述性文章，未涉及具体实验验证，主要讨论模型架构和挑战 | 为多尺度、多模态基因组学研究提供Transformer模型的资源与路线图 | 基因组序列、单细胞转录组学和空间数据 | 机器学习 | NA | NA | Transformer, 大型语言模型 | 基因组序列, 单细胞转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 286 | 2025-12-03 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2025-Dec-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12370-7
PMID:41326993
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研究论文 | 本研究开发了一种基于甘露醇的低盐缓冲液（PBS-M），用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 | 首次提出使用甘露醇补充的低盐磷酸盐缓冲液（PBS-M）来解决海洋生物细胞因高盐度环境与scRNA-seq兼容性差的问题，显著提高了数据质量和细胞状态检测能力 | 目前仅在两种海鞘物种中进行了验证，尚未在其他海洋生物中广泛测试 | 改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序技术兼容性和数据质量 | 海鞘（Ciona robusta）血细胞及其他海鞘物种细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及至少两种海鞘物种的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 287 | 2025-12-03 |
Leveraging two novel droplet-based single-cell RNA Sequencing platforms: a comparative study with 10x genomics
2025-Dec-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12355-6
PMID:41327014
|
研究论文 | 本文对SeekOne和MobiDrop两种新型液滴式单细胞RNA测序平台与10x Genomics商业平台进行了比较研究 | 首次独立比较两种新兴液滴式单细胞RNA测序平台与行业标准10x Genomics平台的性能表现 | 研究仅基于特定样本类型，可能未涵盖所有生物对象或实验条件 | 评估不同单细胞RNA测序平台的性能，以确定最适合研究各种生物对象和实现特定实验目标的平台 | 不同复杂度和质量的细胞悬浮液样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多种类型样本 | 10x Genomics, SeekOne, MobiDrop | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SeekOne平台, MobiDrop平台 | 液滴式高通量单细胞RNA测序平台 |
| 288 | 2025-12-03 |
IL-15 signaling via cis- and trans-presentation to progenitor-exhausted CD8+ T cells enhances radio-immunotherapy efficacy in ESCC
2025-Dec-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03881-2
PMID:41327181
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-15在食管鳞状细胞癌（ESCC）放疗联合免疫治疗中的作用，发现其通过顺式和反式呈递增强前体耗竭CD8+ T细胞功能，并可作为预测治疗反应的生物标志物 | 揭示了IL-15在ESCC肿瘤微环境中通过空间邻近性激活前体耗竭CD8+ T细胞的新机制，并首次提出IL-15水平可作为放疗联合免疫治疗的预测性生物标志物 | 研究样本量有限，且主要基于观察性临床队列和临床前小鼠模型，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索IL-15在食管鳞状细胞癌放疗联合免疫治疗中的作用机制，并评估其作为预测性生物标志物的潜力 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者及临床前小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | ELISA、流式细胞术、单细胞RNA测序、空间分析 | NA | 血液和组织样本、单细胞RNA测序数据、空间分析数据 | ESCC患者临床队列及临床前小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2025-12-03 |
Three-Year Follow-Up of Neoadjuvant Tislelizumab with Chemotherapy in Locally Advanced Gastric and Gastroesophageal Junction Adenocarcinoma: Revealing Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Corresponding to PD-1 Blockade Efficacy
2025-Dec-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508433
PMID:41327861
|
研究论文 | 本研究报道了局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗方案治疗的三年随访数据，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响 | 首次在局部晚期胃癌新辅助免疫治疗背景下，通过单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定并验证了三种癌症相关成纤维细胞表型，特别是发现炎症性CAFs与免疫治疗疗效负相关 | 研究为单臂II期临床试验，样本量较小（49例患者），且单细胞测序仅来自7例患者，需要更大规模随机对照试验验证 | 评估新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗在局部晚期胃癌中的长期疗效，并探索癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响机制 | 局部晚期胃癌和胃食管结合部腺癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床随访数据 | 49例患者（其中7例进行了单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2025-12-03 |
FOXA1 Upregulates HILPDA to Enhance Lipid Droplet Accumulation and Anoikis Resistance in Lung Adenocarcinoma
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502184RR
PMID:41246996
|
研究论文 | 本研究揭示了FOXA1通过转录激活HILPDA促进脂滴积累，从而导致肺腺癌细胞失巢凋亡抵抗和转移的分子机制 | 首次阐明FOXA1/HILPDA轴通过调控脂滴积累影响肺腺癌失巢凋亡抵抗的新机制，并发现HILPDA可作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于A549细胞系和动物模型，缺乏临床样本验证；机制研究尚未涉及其他可能的下游通路 | 探究HILPDA在肺腺癌失巢凋亡抵抗中的作用机制及其上游调控因子 | 肺腺癌细胞系（A549及其失巢凋亡抵抗亚型A549-AR）、裸鼠移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测、Western blot、免疫荧光、油红O染色 | 细胞模型、动物模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 未明确样本数量，使用A549细胞系及建立的A549-AR细胞亚型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2025-12-03 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's disease (AD)
2025-Nov-29, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00875-x
PMID:41318546
|
研究论文 | 本研究通过多区域空间转录组学分析，揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在AD患者中同时进行多区域空间转录组学与Aβ免疫荧光染色匹配分析，揭示了区域特异性细胞类型和分子机制差异 | 样本量较小（仅2名患者），且仅针对Braak III和Thal 4阶段的AD患者，限制了结果的普适性 | 探究AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异及其分子机制 | 两名Braak III和Thal 4阶段AD患者的四个脑区组织：内嗅皮层、枕颞皮层、背外侧前额叶皮层和纹状皮层 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 2名AD患者的4个脑区组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 292 | 2025-12-03 |
Identification of marginal zone B cells cells in head and neck cancer with immunomodulatory characteristics
2025-Nov-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.070
PMID:41325834
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术，在头颈鳞状细胞癌患者中鉴定出具有免疫调节特性的边缘区B细胞亚群，并探讨其在肿瘤发生和预后中的作用 | 首次将边缘区B细胞与头颈鳞状细胞癌的肿瘤发展和预后联系起来，揭示了肿瘤相关MZB的缺氧应激和病毒相关特征基因，并发现MZB-2亚群在早期HNSCC中与良好预后相关 | 研究未明确MZB在晚期疾病中预后关联缺失的具体机制，且免疫抑制基因特征并非MZB独有，表明其并非纯粹的调节性B细胞表型 | 验证头颈鳞状细胞癌中边缘区B细胞的存在，并研究其在肿瘤发生和预后中的可能作用 | 头颈鳞状细胞癌患者和健康供体的肿瘤组织、血液样本以及B淋巴细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 118名头颈鳞状细胞癌患者和6名健康供体 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 293 | 2025-12-03 |
BMP4 cocktail promotes utricular progenitor reprogramming and vestibular functional recovery in adult mice
2025-Nov-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.065
PMID:41325835
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研究论文 | 本研究探讨了BMP4在小鼠耳毒性损伤后促进前庭毛细胞重编程和功能恢复的作用 | 发现BMP4通过c-Fos激活增强非毛细胞重编程，并与Notch抑制和Wnt通路激活协同促进毛细胞再生 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 研究BMP4在前庭毛细胞再生中的作用机制 | 成年小鼠的前庭毛细胞和非毛细胞 | 数字病理学 | 前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, CUT&Tag测序 | NA | 测序数据, 图像数据 | 使用野生型和转基因小鼠（包括Notch1flox/flox, Pou4f3+/DTR等品系） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, CUT&Tag | NA | NA |
| 294 | 2025-12-03 |
A unique microglia subset associated with aggressive α-synucleinopathy uncovered in a rapidly progressive multiple system atrophy cerebellar type model
2025-Nov-29, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107206
PMID:41325908
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研究论文 | 本研究通过建立一种快速进展的多系统萎缩小脑型小鼠模型，发现并描述了一种与侵袭性α-突触核蛋白病相关的独特小胶质细胞亚群 | 首次在MSA-C模型中鉴定出一个表达Tlr2、Tgm2、Msr1等基因的独特促炎性小胶质细胞亚群，该亚群位于磷酸化α-突触核蛋白聚集物附近，且不同于已知的保护性疾病相关小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本仅来自6例尸检病例，样本量有限；CSF1R抑制剂BLZ945的干预效果可能具有模型特异性 | 探究多系统萎缩小脑型的病理机制，特别是小胶质细胞在疾病进展中的作用 | Tet-Off诱导的MSA-C小鼠模型（少突胶质细胞特异性过表达人A53T α-突触核蛋白）以及6例人类MSA-C尸检病例 | 神经科学，单细胞组学 | 多系统萎缩，α-突触核蛋白病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，动物行为学分析 | 转基因小鼠模型（Tet-Off系统） | 单细胞转录组数据，组织病理学图像，行为学数据 | 转基因小鼠模型（具体数量未明确说明）及6例人类MSA-C尸检病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2025-12-03 |
Single-cell insights into tumor microenvironment heterogeneity and plasticity: transforming precision therapy in gastrointestinal cancers
2025-Nov-28, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03567-5
PMID:41316282
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示胃肠道癌症肿瘤微环境异质性和可塑性方面的最新发现，并讨论了其对克服治疗耐药性和改善临床结果的启示 | 利用单细胞测序技术以前所未有的分辨率解析胃肠道癌症肿瘤微环境的细胞多样性和相互作用网络，揭示了驱动治疗耐药和肿瘤复发的未知细胞亚型和复杂通讯网络 | NA | 总结和讨论单细胞测序在胃肠道癌症肿瘤微环境研究中的最新发现，以重塑对肿瘤生物学的理解，并推动精准治疗的发展 | 胃肠道癌症（如胃癌、结直肠癌等）的肿瘤微环境，包括癌细胞、癌症干细胞、癌症相关成纤维细胞、免疫细胞、内皮细胞及细胞外基质 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2025-12-03 |
Single cell RNA-seq analysis associates Osm signaling in macrophages with osteogenic differentiation during heterotopic ossification
2025-Nov-28, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06435-2
PMID:41316383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析，揭示了巨噬细胞中Osm信号在异位骨化过程中与间充质祖细胞成骨分化的关联 | 发现巨噬细胞来源的Osm与异常软骨祖细胞分化相关，并识别Spi1作为早期巨噬细胞激活和Osm表达的新调控因子 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证，且单细胞测序技术可能受样本处理偏差影响 | 探究创伤诱导异位骨化中局部炎症微环境与间充质祖细胞成骨分化的关系 | 创伤诱导异位骨化小鼠模型中的间充质祖细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 异位骨化 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 297 | 2025-12-03 |
Exploring the impact of endocrine-disrupting chemicals on erectile dysfunction through network toxicology and machine learning
2025-Nov-28, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-025-01033-8
PMID:41316467
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研究论文 | 本研究利用网络毒理学和机器学习方法，探索了内分泌干扰物对勃起功能障碍的影响机制 | 首次结合网络毒理学、单细胞测序和机器学习算法，系统性地识别了EDCs诱导ED的核心靶点CTNNB1和HIF1A，并通过分子对接验证了其结合亲和力 | 研究主要基于计算和体外模拟，缺乏临床或动物实验验证，且EDCs的具体暴露剂量和体内效应未充分探讨 | 阐明内分泌干扰物导致勃起功能障碍的分子机制和核心靶点 | 内分泌干扰物与勃起功能障碍相关的潜在靶点和信号通路 | 机器学习 | 勃起功能障碍 | 单细胞测序、网络毒理学、机器学习算法、分子对接 | 未指定具体模型，使用了三种机器学习算法 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2025-12-03 |
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-Induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Nov-28, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101690
PMID:41320155
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研究论文 | 本研究探讨雄激素如何通过调节2型先天淋巴细胞（ILC2s）影响幽门螺杆菌感染引起的胃部炎症，揭示其在性别差异中的作用 | 首次发现雄激素通过调控ILC2s活性来保护免受幽门螺杆菌诱导的胃部炎症，并阐明ILC2s作为性别差异的关键调节因子 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 探究雄激素对幽门螺杆菌感染引起的胃部炎症反应的影响及其在性别差异中的作用 | 雄性和雌性小鼠，以及ILC2s和T细胞缺陷小鼠模型 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性和雌性小鼠，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2025-12-03 |
FX-Cell: a method for single-cell RNA sequencing on difficult-to-digest and cryopreserved plant samples
2025-Nov-27, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02900-2
PMID:41310055
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FX-Cell的方法及其衍生版本，用于在难以消化和冷冻保存的植物样本上进行单细胞RNA测序 | 通过优化固定缓冲液并减少RNA降解，该方法能在高温下实现高效的细胞壁消化，并在长期-80°C储存后仍保持高质量单细胞，避免了使用不能代表可翻译信使RNA池的细胞核 | NA | 解决植物单细胞RNA测序中因组织难以消化和野外样本处理延迟带来的挑战 | 水稻分蘖节、野生稻根茎和玉米冠根等植物样本 | 植物单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-12-03 |
A Metastasis-Competent CAF Subpopulation Defined by MFAP5⁷THY1⁷ Co-expression Drives Prostate Cancer Metastasis via EMT Activation
2025-Nov-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并功能验证了一个由MFAP5⁺THY1⁺共表达定义的、具有转移能力的癌症相关成纤维细胞亚群，该亚群通过激活AKT/EMT通路驱动前列腺癌转移 | 首次通过单细胞RNA测序整合分析，在前列腺癌中鉴定出一个由MFAP5和THY1共表达定义的、具有转移能力的CAF亚群，并揭示了其通过分泌MFAP5激活AKT/EMT通路促进转移的机制 | 需要多中心队列进一步验证其临床独立性 | 识别并功能表征前列腺癌中具有转移能力的CAF亚群，并评估其作为预测转移进展的生物标志物潜力 | 前列腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 14个前列腺癌标本中的1,214个CAFs, 78个前列腺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |