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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-04-02 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 本文提出了一种多组学单细胞测序方法,用于精确评估CRISPR编辑后疾病相关等位基因的功能效应 | 开发了一种结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞测序方法,能够直接检测疾病等位基因的功能后果 | 未明确说明样本量或实验重复次数,可能受限于编辑效率和培养条件引起的非特异性转录变化 | 旨在克服CRISPR编辑中效率低、编辑结果异质性和非特异性转录变化的限制,以识别疾病相关非编码等位基因的因果变异和功能 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因以及多重编辑 | 单细胞多组学 | 自身免疫性疾病 | CRISPR-Cas编辑,单细胞测序 | NA | 基因组DNA,转录组,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 282 | 2026-04-02 |
Robust and adaptive non-parametric tests for detecting general distributional shifts in gene expression
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101147
PMID:40902592
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研究论文 | 本文提出了一种名为QRscore的非参数框架,用于检测基因表达中的分布变化,包括均值偏移和方差偏移 | QRscore通过从负二项分布和零膨胀负二项分布中推导模型信息权重,扩展了Mann-Whitney检验,能同时检测均值和方差偏移,具有高统计功效和错误发现率控制 | NA | 开发一种强大的非参数测试方法,用于检测基因表达中的一般分布偏移 | 基因表达数据,包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非参数框架(QRscore) | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 283 | 2026-04-02 |
Chromoanagenesis in Osteosarcoma
2025-06-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060833
PMID:40563473
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综述 | 本文综述了染色体灾难性事件(chromoanagenesis)在骨肉瘤中的作用机制及其对肿瘤进展的影响 | 系统阐述了染色体碎裂和染色体再合成等关键机制如何源于复制应激和DNA修复缺陷,并推动骨肉瘤的基因组不稳定性 | 针对骨肉瘤的靶向治疗仍难以实现,且基于染色体灾难性事件的临床转化策略尚处探索阶段 | 阐明染色体灾难性事件在骨肉瘤发生发展中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 骨肉瘤(儿童和青少年中最常见的恶性骨肿瘤)及其相关的基因组重排事件 | 基因组学 | 骨肉瘤 | 下一代测序(NGS)、光学基因组图谱、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 284 | 2026-04-02 |
Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions
2025-02, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.01.001
PMID:39793777
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综述 | 本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌(NSCLC)进展及治疗影响的分子、细胞和遗传机制,并探讨了针对老年患者的未来治疗策略 | 系统性地整合了免疫衰老在NSCLC中的作用机制,并重点探讨了如何利用单细胞测序、CRISPR-Cas9等新兴技术来理解并靶向免疫衰老,以优化老年患者的免疫治疗 | 本文是一篇综述性文章,未涉及原始实验数据或具体的临床研究,主要基于现有文献进行分析和展望 | 阐明免疫衰老如何影响NSCLC的进展和治疗反应,并探索改善老年NSCLC患者治疗效果的未来方向 | 非小细胞肺癌(NSCLC),重点关注老年患者群体及其衰老的免疫系统 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序,CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2026-04-02 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analysis Provides Insights into IgA Nephropathy
2025-01-29, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15020191
PMID:40001494
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的应用进展 | 利用scRNA-seq技术揭示了IgA肾病中免疫特征的全景,包括外周血B细胞和Th细胞活化、细胞毒性T细胞耗竭、肾脏浸润细胞亚型,以及系膜细胞和内皮细胞在肾损伤早期的关键作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的进展,以理解其复杂分子机制并开发生物标志物和特异性治疗策略 | IgA肾病(IgAN) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2026-04-02 |
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335152
PMID:41325391
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了脂肪来源干细胞(ADSCs)在脂肪生成过程中的关键基因及其阶段特异性调控网络 | 整合了bulk和单细胞RNA-seq数据,识别了脂肪生成早期和晚期的阶段特异性调控基因,并构建了包含mRNA、miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络 | 研究主要基于转录组数据,未涉及蛋白质水平或功能验证,且样本来源和数量可能有限 | 探究ADSCs脂肪生成过程中的关键调控基因和阶段特异性转录调控网络 | 脂肪来源干细胞(ADSCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 287 | 2026-04-02 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据,构建了人类唐氏综合征胎儿血液的高分辨率多组学图谱 | 首次结合单细胞多组学与空间转录组学,揭示了唐氏综合征中造血干细胞被“启动”分化的分子机制,并发现了非编码元件与基因调控网络的重构 | 样本量相对较小(仅18个胎儿),且仅关注胎儿期,未涉及出生后或成人阶段的造血异常 | 理解唐氏综合征中失调的造血过程及其分子基础 | 人类胎儿肝脏和骨髓样本,包括3个二倍体和15个三倍体(唐氏综合征)胎儿 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据,ATAC-seq数据,空间转录组数据 | 18个胎儿样本(3个二倍体,15个三倍体),超过110万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression,10x Visium空间转录组技术 |
| 288 | 2026-04-02 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
|
研究论文 | 本研究揭示了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进DMG生长,并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,人类患者样本验证有限,且胆碱能神经元亚群的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、健康少突胶质前体细胞、胆碱能神经元 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 原发性患者DMG样本、DMG荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309063
PMID:39159152
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了胎儿膜-蜕膜界面在足月和早产中的细胞类型特异性贡献 | 首次在空间水平上揭示胎儿膜各层(羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和蜕膜)在足月与早产中的差异基因表达模式 | 样本量较小(13例患者),且未涉及更广泛的妊娠并发症或种族多样性 | 探究胎儿膜-蜕膜界面在足月分娩和早产中的分子机制 | 人类胎儿膜组织(包括羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和母体蜕膜) | 空间转录组学 | 早产 | 单细胞转录组学 | 分层聚类分析 | 转录组数据 | 13例患者(包括足月未临产、足月临产、早产和早产胎膜早破) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2026-04-02 |
Reprogramming the tumor microenvironment leverages CD8+ T cell responses to a shared tumor/self antigen in ovarian cancer
2023-Mar-16, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2023.02.002
PMID:36875325
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研究论文 | 本研究探讨了使用CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法,通过重编程肿瘤微环境来增强对卵巢癌共享肿瘤/自身抗原的CD8+ T细胞反应 | 揭示了在耐受性肿瘤微环境中,靶向免疫抑制性癌症相关成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用,可以诱导肿瘤/自身特异性CD8 T细胞反应,从而提高治疗效果 | 研究基于小鼠模型,结果在人类患者中的转化应用仍需进一步验证 | 研究CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法对肿瘤进展和抗肿瘤免疫的影响,特别是在耐受性肿瘤微环境中 | SV40 T抗原卵巢癌模型小鼠(包括抗原初始野生型小鼠和表达SV40 T抗原作为自身抗原的Tg转基因小鼠) | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 免疫染色,单细胞RNA测序 | NA | 图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2026-04-02 |
Senescent cancer cell vaccines induce cytotoxic T cell responses targeting primary tumors and disseminated tumor cells
2023-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005862
PMID:36792123
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研究论文 | 本文研究了衰老癌细胞疫苗通过诱导细胞毒性T细胞反应来靶向原发性肿瘤和播散性肿瘤细胞 | 利用辐射和veliparib处理诱导癌细胞衰老,将其作为疫苗或激活树突状细胞,以增强抗肿瘤免疫反应,特别是针对播散性肿瘤细胞 | 将肿瘤细胞重新注射到患者体内可能不切实际,但研究通过体外激活的树突状细胞解决了这一问题 | 开发基于衰老癌细胞的治疗性疫苗,以改善基因毒性和免疫疗法,并限制肿瘤复发或转移 | 小鼠CT26结肠癌细胞和4T1乳腺癌细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq, 流式细胞术, T细胞增殖实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2026-04-02 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
|
研究论文 | 本研究利用微生理“肿瘤芯片”平台,探究了特定巨噬细胞亚群对肿瘤行为的影响 | 开发了一种新型的3D体外模型,能够高时空分辨率地捕捉细胞间动态,并首次在TOC设备中展示了M1和M2巨噬细胞对肿瘤生长、血管生成和迁移的不同作用机制 | 研究依赖于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本类型和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类胰腺癌和结直肠癌细胞,以及M1和M2极化巨噬细胞 | 数字病理 | 胰腺癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质分析,抗体中和研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2026-04-01 |
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2650234
PMID:41913413
|
研究论文 | 本研究通过整合肿瘤和免疫细胞的转录组学数据,旨在预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 提出一个由82个基因组成的转录组特征,结合单细胞RNA测序和流式细胞术分析,识别出与原发性耐药相关的关键免疫细胞亚群 | 样本量相对有限(组织样本46例,验证队列54例),且为回顾性研究 | 预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 转移性皮肤黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 预测模型 | 转录组数据, 单细胞数据 | 组织样本:46例(发现队列)+54例(验证队列);液体活检:8例(scRNA-seq)+46例(流式细胞术) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 294 | 2026-04-01 |
Integrative bulk and single-cell transcriptome analyses reveal RNA modification-related biomarkers of spinal cord injury
2026-Jul-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00080
PMID:41914077
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 295 | 2026-04-01 |
LAMC3 promotes the development of prostate cancer via modulating the cell cycle progression
2026-May-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116544
PMID:41864013
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研究论文 | 本研究探讨了LAMC3通过调节细胞周期进程促进前列腺癌发展的分子机制 | 首次建立并验证了与衰老相关分泌表型相关的基因特征,并揭示了LAMC3通过PI3K/Akt通路调控细胞周期的新机制 | 研究主要基于体外和动物实验,临床样本验证有限,且未深入探讨LAMC3在其他癌症类型中的作用 | 阐明LAMC3在前列腺癌发病机制中的具体作用及其作为治疗靶点的潜力 | 前列腺癌患者血清样本、良性前列腺增生对照样本以及前列腺癌细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CCK-8, 集落形成, EdU检测 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 实验数据 | 多个批量RNA-seq数据集和两个单细胞RNA-seq队列,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2026-04-01 |
Repurposing Azilsartan medoxomil attenuates periodontitis by targeting SERPINB9 to promote apoptosis of IL1B+ macrophages
2026-May-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116523
PMID:41864017
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据和机器学习算法,发现SERPINB9是调控牙周炎中促炎性IL1B+巨噬细胞存活的关键因子,并筛选出阿齐沙坦酯作为其潜在抑制剂,在实验性牙周炎模型中验证了其治疗潜力 | 首次将SERPINB9鉴定为牙周炎中IL1B+巨噬细胞存活的关键调控因子,并通过药物重定位筛选发现阿齐沙坦酯可作为其抑制剂,为牙周炎提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于实验性动物模型和体外验证,临床转化效果仍需进一步人体试验证实 | 探索牙周炎中巨噬细胞存活的分子机制,并寻找新的治疗靶点和药物 | 牙周炎中的巨噬细胞,特别是IL1B+巨噬细胞亚群 | 生物信息学与计算生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,机器学习算法,药物重定位筛选 | 五种机器学习算法(未具体说明) | 单细胞转录组数据 | 多个来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 297 | 2026-04-01 |
CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy for the treatment of a patient with refractory Burkitt lymphoma after kidney transplant
2026-May, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2026.102055
PMID:41762962
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研究论文 | 本文报告了一例肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后使用环孢素A的可行性研究 | 首次在肾移植后淋巴增殖性疾病患者中,结合CD19 CAR T细胞疗法与环孢素A使用,并通过单细胞RNA测序分析其影响 | 仅为单病例报告,样本量小,需要更大规模研究验证 | 评估CD19 CAR T细胞疗法后使用环孢素A降低移植排斥风险的可行性 | 肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2026-04-01 |
Cytotoxic T cell recognition of α-synuclein drives pathogenic immune responses in multiple system atrophy
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537271123
PMID:41911451
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、流式细胞术和抗原特异性功能实验,揭示了多系统萎缩(MSA)患者外周和中枢T细胞对α-突触核蛋白的细胞毒性识别,驱动了致病性免疫反应 | 首次证明MSA患者的外周T细胞被激活并偏向细胞毒性和炎症表型,且CD4和CD8 T细胞以HLA I/II依赖方式识别α-突触核蛋白单体及原纤维,导致克隆扩增和细胞毒性特征获得 | 研究主要基于患者样本和死后脑组织,未涉及动物模型验证,且样本量相对有限,需进一步扩大以确认普遍性 | 探究多系统萎缩(MSA)中适应性免疫机制,特别是T细胞对α-突触核蛋白的识别及其在神经炎症和疾病进展中的作用 | 多系统萎缩(MSA)患者、帕金森病(PD)患者和健康对照者的外周和中枢T细胞 | 免疫学 | 多系统萎缩 | 单细胞转录组学、流式细胞术、抗原特异性功能实验 | NA | 转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | MSA患者、PD患者和健康对照者队列,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2026-04-01 |
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-Mar-31, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01105a
PMID:41778300
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研究论文 | 本研究介绍了一种可拆卸灌注芯片,用于在活体胶质母细胞瘤组织切片中进行单细胞水平的抗癌药物筛选 | 开发了一种新型微流控芯片,通过机械夹层而非化学附着的方式固定组织切片,实现了正压灌注和非破坏性组织解离,从而允许对厚组织切片进行并行培养、药物扰动以及下游单细胞RNA测序 | 这是一项概念验证工作,未来需要用于多种药物的筛选,并在更多新鲜人源胶质母细胞瘤切片上进行进一步验证 | 开发一种能够直接在人源肿瘤组织中快速、高分辨率地识别细胞类型特异性药物反应的新方法 | 人源胶质母细胞瘤手术切除的新鲜组织切片 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,荧光测定数据 | 来自人类患者和小鼠模型的胶质母细胞瘤组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 300 | 2026-04-01 |
[Preliminary study on the role of IL-1β+neutrophils in bone regulation of periodontitis mice]
2026-Mar-31, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β+中性粒细胞在小鼠牙周炎骨调节中的作用及机制 | 首次在牙周炎模型中结合单细胞转录组测序和体外共培养模型,揭示了IL-1β+中性粒细胞通过TLR4-NFκB信号通路抑制成骨分化的新机制 | 研究为初步探索,样本量较小(每组10只小鼠),且为动物模型研究,结论需在人体中进一步验证 | 探究IL-1β+中性粒细胞在牙周炎骨调节中的作用及分子机制 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠、小鼠胚胎成骨前体细胞(MC3T3-E1细胞) | NA | 牙周炎 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、免疫荧光染色、免疫组化染色、Western blotting、碱性磷酸酶染色、茜素红染色、Micro-CT | NA | 基因表达数据、图像数据、蛋白质表达数据 | 20只8周龄雄性C57BL/6J小鼠(对照组10只,牙周炎组10只) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |