单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41079 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-06-26
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2026-Jun, NAR cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过纵向研究揭示早期NDMA暴露通过持续干扰素信号和克隆扩增促进DNA甲基化损伤诱导的肝癌发生 首次在体内证明早期生命阶段的急性NDMA暴露可通过持续的DNA损伤信号、慢性干扰素激活和克隆扩增共同驱动MGMT依赖性肝癌发生,并定义了机制性生物标志物和潜在干预靶点 研究仅在小鼠模型中进行,人类外推到肝癌发生过程仍需验证;NDMA暴露剂量和时间窗口可能不完全模拟真实人类暴露场景 阐明早期环境诱变剂暴露如何促进潜伏性肝肿瘤发生的分子机制 野生型和MGMT缺陷小鼠的肝脏组织 机器学习 肝癌 转录组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织病理学 NA 转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据、组织病理图像 小鼠在出生后第8天和第15天腹腔注射NDMA,随访至暴露后10个月 NA 空间转录组学 NA NA
282 2026-06-26
Incorporating WGCNA and Machine Learning to Identify ADAP2 as a Critical Efferocytosis-Related Gene in Sepsis
2026-Jun-01, Pathogens (Basel, Switzerland)
research paper 整合WGCNA与机器学习方法识别ADAP2为脓毒症中关键胞葬作用相关基因 首次通过整合WGCNA与五种共识机器学习算法,从多维度转录组数据中筛选并验证ADAP2作为脓毒症核心胞葬相关基因,并揭示其在单核/巨噬细胞亚群中的动态表达模式 需要进行前瞻性验证和功能研究以确认临床价值 识别脓毒症中具有预后价值的胞葬作用相关生物标志物 脓毒症患者的全转录组数据和单细胞RNA-seq数据,以及脓毒症患者外周血单核细胞和盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症小鼠 machine learning sepsis RNA-seq, qPCR, single-cell RNA-seq WGCNA, consensus machine learning algorithms 转录组数据(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) 两个独立队列(GSE205672和GSE133822)及两个单细胞数据集(GSE167363和GSE175453) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
283 2026-06-26
Genetically Informed Single-Cell Analysis Reveals PLXND1 as a Cell-Type-Specific Molecular Switch in MASLD
2026-May-30, Metabolites IF:3.4Q2
研究论文 整合遗传因果性与单细胞转录组学,揭示PLXND1在MASLD中作为细胞类型特异性分子开关 首次将孟德尔随机化与单细胞eQTL相结合,建立多组学因果框架,发现PLXND1在不同免疫细胞类型中具有相反的功能效应,并通过多维度验证其作为分子开关的作用 未明确说明研究的局限性 建立整合遗传因果性与细胞类型特异性组织功能紊乱的框架,揭示MASLD多组学因果架构 MASLD患者的多组学数据、人类肝脏单细胞转录组数据、高脂饮食诱导的小鼠模型 机器学习和计算生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 孟德尔随机化、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、表观遗传数据、代谢数据 大规模eQTL和pQTL数据集、14种免疫谱系的单细胞数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
284 2026-06-26
A clinically relevant SLC2A1-associated malignant epithelial cell state predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-May-29, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 通过整合多组学分析,识别肺腺癌中与不良预后和免疫治疗反应相关的恶性上皮细胞状态,并构建风险评分模型 首次利用Scissor算法从单细胞转录组数据中鉴定与预后相关的恶性上皮细胞状态,并基于此建立风险评分模型SERS,关联免疫治疗反应 文中未明确提及研究限制 阐明肺腺癌中驱动不良预后和免疫治疗耐药的恶性上皮细胞状态,并提供生物标志物 肺腺癌患者的肿瘤组织样本 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组分析、Scissor算法 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据 多个独立队列,包括免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
285 2026-06-26
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology IF:5.2Q1
综述 综述了单细胞RNA测序技术在真菌感染研究中的应用,包括关键发现、宿主-真菌病原体相互作用机制、当前局限和未来方向 首次系统综述了单细胞RNA测序这一新兴技术在真菌感染领域的研究进展,强调了其在解析宿主-真菌相互作用动态变化中的潜力 单细胞RNA测序在真菌感染研究中仍存在技术挑战和应用差距,论文未提供具体解决方案 促进单细胞技术在真菌感染研究中的广泛应用 真菌病原体与宿主之间的相互作用 自然语言处理 真菌感染 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
286 2026-06-26
Highly Constrained Kinetic Models for Single-Cell Gene Expression Analysis
2026-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究提出了一个高度约束的动力学模型,用于整合和分析单细胞基因表达数据,包括稳态和时间分辨数据 首次将单细胞RNA测序和高分辨率成像数据整合到统一动力学模型中,发现三态模型相较于传统双态模型的优势,并识别出广泛保守的无量纲量 未提及该方法在不同生物系统或更大规模数据集上的验证,以及模型参数估计的潜在不确定性 构建一个能够整合多种数据类型、模拟基因转录随机过程的动力学模型,以揭示基因表达动态和机制 单细胞基因表达动力学模型,适用于多种基因和转录因子 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单分子追踪 三态动力学模型 图像、时间序列数据 未明确提及样本数量,使用多个基因和数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
287 2026-06-26
Targeting Osteoporosis-Osteoarthritis Comorbidity: Multi-Omics Identification of SON and Exploration of Therapeutic Agents
2026-May-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 采用多组学方法识别骨质疏松症与骨关节炎共病的关键基因SON,并探索潜在治疗药物尼洛替尼 首次通过WGCNA、孟德尔随机化和单细胞测序多方法联合验证,确认SON蛋白是OP与OA共病的关键链接分子和潜在治疗靶点 需要进一步的功能研究证实SON的因果作用,且相关体外实验仍有待深入开展 探索骨质疏松症与骨关节炎共病的共享分子通路及潜在治疗靶点 骨质疏松症与骨关节炎共病患者 机器学习 骨质疏松症,骨关节炎 NA NA 基因表达数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
288 2026-06-26
CCR5 and CD74 are potential therapeutic targets for necroinflammation in preclinical cholesterol crystal embolism
2026-May-27, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示胆固醇晶体栓塞模型中肾脏细胞变化,并发现CCR5和CD74作为坏死性炎症的潜在治疗靶点 首次构建胆固醇晶体栓塞肾脏的单细胞图谱,并鉴定CCR5和CD74信号通路在血管损伤和急性肾损伤中的关键作用 研究基于小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证靶点的有效性和安全性 探索胆固醇晶体栓塞导致急性肾损伤的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 C57BL/6J小鼠胆固醇晶体栓塞模型及人类肾活检样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 小鼠模型(C57BL/6J)及人类肾活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
289 2026-06-26
Genomic instability drives POSTN+ myofibroblasts via STING-WNT axis to promote immunosuppression and PARPi resistance in ovarian cancer
2026-May-27, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组学和表观基因组学,揭示了基因组不稳定性通过STING-WNT轴驱动POSTN+肌成纤维细胞促进免疫抑制和PARP抑制剂耐药性的机制 首次阐明肿瘤内在基因组不稳定性通过STING-WNT信号轴指导基质重编程,将基因组不稳定性驱动的免疫激活转化为免疫抑制,并鉴定POSTN为基质特异性免疫检查点 研究主要基于临床样本和动物模型,POSTN阻断治疗的长期效果和临床转化潜力需进一步验证 探究肿瘤内在基因组不稳定性如何通过基质重编程促进免疫抑制和PARPi耐药 高级别浆液性卵巢癌患者样本、卵巢癌和乳腺癌模型 数字病理学 卵巢癌 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学 NA 单细胞测序数据 高级别浆液性卵巢癌患者样本 10x Genomics 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序及单细胞表观基因组测序
290 2026-06-26
Spatially-Resolved Multiomic Atlas of Leiomyosarcoma Identifies Two Clinically Relevant Epigenetically-Driven Cell States
2026-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过对未经治疗的平滑肌肉瘤进行单细胞多组学测序,识别出两种表观遗传驱动的细胞状态及其临床意义 首次在单细胞水平上揭示平滑肌肉瘤中存在两种先前未知且表观遗传学不同的细胞状态,并发现NFI和AP-1转录因子在其中的调控作用,以及空间转录组学揭示的肿瘤免疫微环境差异 未提及研究的具体局限性 从转录组和表观基因组层面理解平滑肌肉瘤的细胞异质性和分子基础 未经治疗的原发性平滑肌肉瘤组织 数字病理学 平滑肌肉瘤 单细胞多组学测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 128个平滑肌肉瘤样本的328个组织芯 10x Genomics 单细胞多组学、空间转录组学 10x Chromium单细胞多组学、10x Visium空间转录组学 10x Chromium单细胞多组学测序、10x Visium空间转录组学分析
291 2026-06-26
Neutrophil extracellular traps in post-traumatic urethral microenvironment promote hypertrophic urethral stricture via the TLR9/NF-kB/Smad3/IL-8 axis
2026-May-24, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了创伤后尿道微环境中中性粒细胞胞外陷阱通过TLR9/NF-kB/Smad3/IL-8轴促进肥厚性尿道狭窄的机制 首次通过单细胞RNA测序构建创伤后尿道微环境细胞图谱,发现NETs通过TLR9/NF-κB/Smad3通路激活尿道成纤维细胞并形成正反馈环路,提出靶向NETs的治疗策略 主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证有限,且NETs抑制剂DNase I和AT791的长期疗效和安全性需进一步评估 探究NETs介导尿道纤维化的机制并开发靶向治疗策略 创伤后尿道狭窄组织中的中性粒细胞胞外陷阱(NETs)、尿道成纤维细胞、TLR9信号通路 数字病理学 尿道狭窄 单细胞RNA测序、免疫组化、ELISA、细胞共培养 NA 基因表达数据、组织切片图像 新西兰兔尿道组织样本;临床患者组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'平台
292 2026-06-26
Osteopontin-driven TGF-β1 signaling via integrin αvβ3-NF-κB axis impairs NK cell function in head and neck squamous cell carcinoma
2026-May-24, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
research paper 本研究探讨了骨桥蛋白(OPN)通过整合素αvβ3-NF-κB轴驱动TGF-β1信号传导,从而损害头颈部鳞状细胞癌中自然杀伤细胞功能的分子机制 首次揭示OPN-整合素αvβ3/NF-κB信号轴通过诱导TGF-β1分泌抑制NK细胞功能,提出该轴作为头颈部鳞状细胞癌免疫逃逸的新机制及潜在治疗靶点 未提及 阐明头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中自然杀伤细胞功能障碍的分子机制 头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤组织和细胞系 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 多重免疫组化 NA 基因表达数据, 图像 患者队列和细胞系,样本量未具体说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
293 2026-06-26
Dual orexin receptor antagonism with lemborexant enhances microglial clearance of β-amyloid in mice
2026-May-22, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 研究发现FDA批准的双重食欲素受体拮抗剂lemborexant通过增强小胶质细胞对β-淀粉样蛋白的清除,改善PSAPP小鼠的淀粉样蛋白病理 首次证明FDA批准的食欲素受体双重拮抗剂乐布瑞克生(lemborexant)不仅能改善睡眠,还可通过增强小胶质细胞吞噬功能减缓β-淀粉样蛋白沉积,作用机制区别于传统抗组胺类助眠药 研究仅在PSAPP小鼠模型中进行,尚未验证在人类阿尔茨海默病中的效果及安全性;微胶质细胞耗竭实验可能影响其他脑免疫功能 比较FDA批准的食欲素受体双重拮抗剂乐布瑞克生与抗组胺药多塞平对β-淀粉样蛋白病理和小胶质细胞反应的影响 PSAPP转基因小鼠(淀粉样前体蛋白/早老素1双转基因) 机器学习和数字病理学(含单细胞转录组分析) 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 免疫组化, 共聚焦显微镜, 脑电图/肌电图多导睡眠监测 NA 单细胞转录组数据, 图像数据, 电生理数据 PSAPP小鼠,具体数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
294 2026-06-26
Genetic and epidemiological analyses of alcohol consumption patterns and age-related macular degeneration risk among current drinkers: a role for TNFRSF10A
2026-May-22, Journal of global health IF:4.5Q1
研究论文 通过流行病学和遗传学方法分析当前饮酒者中饮酒模式与年龄相关性黄斑变性(AMD)风险之间的关联,并揭示TNFRSF10A基因的作用 结合非线性Cox比例风险模型、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序数据,首次发现TNFRSF10A基因座与饮酒及AMD风险共享遗传基础,并提示内皮细胞中该基因的表达可能在AMD组织中富集 研究结果存在残留混杂的可能性,且酒精对健康的风险已明确,因此不应解读为支持饮酒预防AMD的证据 探讨当前饮酒者中饮酒模式与AMD风险之间的关联及潜在因果机制 欧洲血统的当前饮酒者,包括UK Biobank的433,353名参与者及FinnGen研究的474,181名参与者 自然语言处理 年龄相关性黄斑变性 RNA-seq NA 图像 440,052名参与者(平均年龄56.7岁,女性占53.7%) NA 单细胞RNA测序 NA 使用公开的人类视网膜和视网膜色素上皮/脉络膜组织的单细胞RNA测序数据
295 2026-06-26
Functional Heterogeneity of Hepatitis B Virus-Specific CD8+ T Cells Mediates the Clinical Outcomes of Infection
2026-May-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 该研究探讨了乙型肝炎病毒特异性CD8+ T细胞的功能异质性如何介导感染的临床结局 首次通过单细胞测序和功能分类揭示了HBV特异性CD8+ T细胞中IFNγ+/mTGFβ+比例与病毒清除的关联,并基于TCR亲和力解释了功能差异 NA 明确HBV特异性CD8+ T细胞是处于耗竭状态还是源自初始T细胞库的不完全应答 乙型肝炎病毒(HBV)核心18-27表位特异性CD8+ T细胞 NA 乙型肝炎 单细胞测序 NA 序列数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
296 2026-06-26
Single-cell transcriptomics-informed induced pluripotent stem cells differentiation to tenogenic lineage
2026-May-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 基于单细胞转录组学指导诱导多能干细胞向腱系分化 利用单细胞RNA测序和信号通路分析,基于化学限定培养基和小分子实现人诱导多能干细胞逐步分化至腱节阶段,并通过WNT抑制剂消除神经旁靶细胞并提高诱导效率 未明确提及体内分化效率验证及长期稳定性的研究 探索从体节阶段到腱节阶段的分化调控,开发基于细胞治疗肌腱疾病的策略 人类诱导多能干细胞(hiPSCs) 数字病理学 肌腱疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
297 2026-06-26
Epithelial CD155-TIGIT/CD226 signaling links CD8⁺ T-cell exhaustion to frequent exacerbations in COPD
2026-May-21, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究探讨了COPD中上皮细胞CD155与TIGIT/CD226信号通路对CD8⁺ T细胞耗竭及频繁加重的影响 首次揭示TIGIT-CD155/CD226免疫检查点通路在COPD频繁加重患者中诱导CD8⁺ T细胞耗竭,并通过敲低TIGIT展示了耗竭表型的可逆性 作为横断面观察研究,样本量有限,且主要基于公开的scRNA-seq数据和体外功能实验,需进一步验证因果关系 明确TIGIT通路活化是否导致COPD中CD8⁺ T细胞耗竭及频繁加重易感性 COPD患者和健康对照者的外周血、支气管肺泡灌洗液及肺组织样本 机器学习和数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、功能分析 NA 单细胞转录组数据、外周血、肺泡灌洗液及肺组织样本 公开scRNA-seq数据及COPD患者和健康对照者的外周血、BALF和肺组织样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
298 2026-06-26
[Multi-omics integration deciphers immune-metabolic heterogeneity in colorectal cancer: a prognostic model and therapeutic strategies targeting ANGPTL4/FABP4/RBP7]
2026-May-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
研究论文 整合多组学数据解析结直肠癌免疫代谢异质性,构建基于ANGPTL4/FABP4/RBP7的预后模型及治疗策略 首次通过多组学整合揭示结直肠癌免疫微环境亚型代谢异质性,并构建融合ANGPTL4/FABP4/RBP7的预后模型,结合分子对接和动力学模拟验证靶点结合稳定性 仅使用TCGA和GEO两个公共队列数据(各568例),缺乏独立外部验证;功能验证主要依赖生信分析和qPCR/IHC实验,未进行体内动物模型验证 探索结直肠癌肿瘤免疫微环境异质性及其导致的治疗耐药,开发预测治疗效果的预后模型 1136例结直肠癌样本(TCGA队列568例,GEO队列568例) 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 LASSO-Cox回归 转录组数据, 体细胞突变数据, 单细胞RNA测序数据 1136例结直肠癌样本(TCGA 568例,GEO 568例) Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq, 10x Chromium TCGA和GEO队列使用Illumina平台进行转录组测序,单细胞RNA-seq使用10x Chromium平台
299 2026-06-26
Single-cell analysis reveals that NRG1/3-ERBB4 signaling affects metabolic reprogramming and immune escape in Wilms tumor
2026-May-20, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了NRG1/3-ERBB4信号通路在肾母细胞瘤中影响代谢重编程和免疫逃逸的机制 整合单细胞RNA测序与转录组数据,首次鉴定出NRG1/3-ERBB4信号通路在肾母细胞瘤代谢重编程和免疫逃逸中的作用,并构建了包含八个预后基因的风险分层模型 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体外或体内实验验证,且样本量有限 表征肾母细胞瘤的肿瘤微环境并识别预后基因以改进治疗策略 肾母细胞瘤患者的配对肿瘤和正常组织 数字病理学 肾母细胞瘤 单细胞RNA测序 深度学习图神经网络 单细胞RNA测序数据、转录组数据 未明确说明样本数量,但涉及配对肿瘤和正常组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
300 2026-06-26
MICA and CYTH4 as immunological biomarkers of intracranial aneurysm: a study integrating RNA sequencing, single-cell sequencing and Mendelian randomization
2026-May-19, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究整合RNA测序、单细胞测序和孟德尔随机化分析,确定MICA和CYTH4为颅内动脉瘤的免疫学生物标志物 首次结合RNA测序、单细胞测序和孟德尔随机化分析,鉴定出MICA和CYTH4作为颅内动脉瘤破裂的免疫相关生物标志物,并通过分子生物学实验验证其功能 样本量有限,且主要基于公开数据集,缺乏大规模临床验证,其因果关系需要进一步体外和体内实验证实 探索颅内动脉瘤发生和破裂的分子机制,寻找预测性生物标志物 颅内动脉瘤患者和非动脉瘤对照样本 机器学习 脑血管疾病 RNA测序, 单细胞测序, 孟德尔随机化分析 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 34个非颅内动脉瘤样本和93个颅内动脉瘤样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
回到顶部