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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-05-17 |
Circulating monocytes upregulate CD52 and sustain innate immune function in cirrhosis unless acute decompensation emerges
2025-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.031
PMID:39818234
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同阶段肝硬化患者循环单核细胞的异质性,发现CD52在先天免疫功能中的关键作用 | 首次在单细胞水平上描述CD52在肝硬化不同阶段循环单核细胞中的表达变化,并揭示CD52稳定化可增强单核细胞抗感染功能 | 未在急性失代偿患者中深入验证CD52的机制,且缺乏体内功能验证 | 阐明肝硬化不同阶段循环单核细胞状态的异质性,以及CD52在先天免疫麻痹中的功能和潜在治疗意义 | 健康个体和不同阶段肝硬化患者的循环单核细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和各阶段肝硬化患者的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 282 | 2026-05-17 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
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研究论文 | 利用超声遗传学技术构建EchoBack-CAR T细胞,通过聚焦超声刺激实现CAR的持续表达,用于实体肿瘤治疗 | 首次设计超声响应型EchoBack-CAR T细胞,利用超灵敏热休克启动子和CAR信号正反馈回路实现长效表达,并通过聚焦超声刺激精准调控 | 未提及 | 开发一种通用、高效且安全的实体肿瘤治疗策略 | EchoBack-CAR T细胞及其靶向GD2或PSMA的变体 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 283 | 2026-05-17 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
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研究论文 | 本文通过开发一种特异性删除Rorc基因顺式调控元件的小鼠,发现RORγt阳性树突状细胞对于口服抗原诱导外周调节性T细胞是必需的,而ILC3则无此作用 | 首次通过基因编辑手段特异性缺失RORγt阳性树突状细胞,明确区分了其在pTreg诱导中的独特作用,并发现RORγt DC与ILC3共享淋巴样起源 | 未明确指出局限性 | 阐明RORγt抗原呈递细胞在外周调节性T细胞诱导及口服耐受维持中的作用 | RORγt阳性树突状细胞和3型固有淋巴样细胞 | 机器学习和数字病理不适用,应归类为免疫学或细胞生物学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 基因修饰小鼠模型,具体数目未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台,具体配置未详述 |
| 284 | 2026-05-17 |
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403195R
PMID:40322970
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研究论文 | 通过血浆脂质代谢物分析和PBMCs转录组测序,揭示脂质介质与DNA损伤通路在SARS-CoV-2感染严重程度中的相关性 | 首次系统揭示花生四烯酸(AA)和二十碳五烯酸(EPA)等促炎脂质介质与WHO疾病严重程度评分的正相关关系,并发现EPA水平与高评分患者细胞周期和DNA损伤通路的激活相关 | 样本量较小(10例感染和10例未感染患者),需要更大样本验证;鼻拭子scRNA-seq数据集为已有公开数据,可能未完全匹配本研究的患者群体 | 探究遗传因素和脂质代谢物与重型SARS-CoV-2感染之间的关联机制 | COVID-19患者和健康对照者的血浆、PBMCs和鼻拭子样本 | 自然语言处理 | 呼吸道病毒感染 | bulk RNA-seq、总脂肪酸面板分析、Mann-Whitney U检验、Ontology/KEGG/Reactome通路分析 | NA | 基因表达数据、脂质代谢物数据 | 10例感染和10例未感染患者用于RNA-seq和脂质分析;58例健康与COVID-19参与者用于鼻拭子基因表达研究 | NA | bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2026-05-17 |
Regulation of RNA polymerase II transcription through re-initiation and bursting
2025-May-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2025.04.011
PMID:40378829
|
综述 | 综述了RNA聚合酶II通过再起始和爆发式转录调控的最新研究进展 | 整合活细胞成像和单细胞转录组学数据,提出RNAPII再起始和爆发式转录作为基因调控的普遍现象,并聚焦于分子机制和未解问题 | 未提供具体实验数据,主要基于现有文献总结,可能忽略某些研究细节 | 探讨RNAPII爆发式转录的调控策略及其在健康和疾病中的意义 | 真核细胞中RNA聚合酶II的转录调控过程 | 自然语言处理 | NA | 活细胞成像、单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2026-05-17 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2025-05, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
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研究论文 | 该研究探讨了血管紧张素转换酶依赖性肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中导致线粒体膜破坏、活性氧过度生成和CTP:磷酸乙醇胺胞苷酰转移酶下调的作用 | 首次揭示了ACE依赖性肾内AngII通过破坏线粒体膜稳态和下调PCYT2导致糖尿病肾小管损伤的新机制,为ACEI联合治疗提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;仅部分改善效果,未完全逆转损伤 | 探究ACE依赖性肾内AngII在糖尿病肾小管病变中对线粒体膜稳态和ROS生成的影响 | 高脂饮食/链脲佐菌素诱导的2型糖尿病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病, 肾小管病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 小鼠模型,具体数量未在标题和摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于肾小管单细胞RNA测序分析PCYT2富集 |
| 287 | 2026-05-17 |
scPharm: Identifying Pharmacological Subpopulations of Single Cells for Precision Medicine in Cancers
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412419
PMID:39560158
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研究论文 | 介绍scPharm计算框架,整合药理图谱与单细胞RNA测序数据,识别肿瘤内药物敏感性亚群并优化个性化治疗 | 首次提出通过标准化富集分数将药物反应基因列表与细胞身份基因分布关联,实现单细胞分辨率的药物亚群识别,并预测联合用药策略与毒性评估 | 仅依赖基因集富集分析评估相关性,可能忽略非编码RNA或表观遗传调控对药物反应的影响 | 为癌症精准医学提供单细胞分辨率的治疗异质性解析方法 | 人乳腺癌组织(ER阳性/HER2阳性)、人PC9细胞(经埃罗替尼处理)、小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌,肺癌 | 单细胞RNA测序 | scPharm计算框架(基于基因集富集分析) | 基因表达数据 | 人乳腺癌组织(具体样本量未提及)、人PC9细胞系、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2026-05-17 |
H. Pylori-Facilitated TERT/Wnt/β-Catenin Triggers Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia and Oxyntic Atrophy
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401227
PMID:39587848
|
研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过CagA蛋白破坏TERT与E3连接酶SYVN1的相互作用,上调TERT水平并激活Wnt/β-Catenin通路,从而诱导主细胞去分化和痉挛性多肽表达化生及胃底腺萎缩的机制 | 首次阐明CagA通过干扰TERT与新型E3连接酶SYVN1的结合来上调TERT蛋白丰度,并证实TERT/Wnt/β-Catenin通路在幽门螺杆菌诱导的SPEM中的关键作用 | 未提及具体局限 | 探究幽门螺杆菌诱导胃黏膜痉挛性多肽表达化生和胃底腺萎缩的分子机制 | 感染cagA阳性幽门螺杆菌的胃黏膜主细胞 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 289 | 2026-05-17 |
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402132
PMID:39661721
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研究论文 | 提出了单细胞布尔网络推断和控制框架BENEIN,用于识别细胞分化轨迹中的主调控因子,并验证了其通过抑制MYB、HDAC2和FOXA2诱导结直肠癌细胞向正常样肠细胞逆转的能力 | 首次将布尔网络控制理论应用于单细胞转录组数据,系统识别分化轨迹中的主调控因子,并实现癌症逆转 | 方法的普适性需在更多组织类型和癌症类型中验证,且实验验证仅限于结直肠癌模型 | 开发计算框架以识别细胞分化轨迹中的主调控因子,并探索通过调控这些因子实现癌症逆转的可能性 | 人小肠单细胞转录组数据及结直肠癌细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 基因表达数据 | 人小肠单细胞转录组数据(样本量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2026-05-17 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
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研究论文 | 通过广义二元协方差分解从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 提出一种新的统计方法广义二元协方差分解(GBCD),能够在强肿瘤间异质性背景下将转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关的共享成分,优于现有方法 | 主要依赖胰腺导管腺癌数据验证,方法在其他癌症类型中的通用性尚需进一步评估 | 开发一种统计方法来解析单细胞RNA测序数据中肿瘤转录异质性的可解释成分 | 胰腺导管腺癌肿瘤样本的转录组数据 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 291 | 2026-05-17 |
Refining breast cancer genetic risk and biology through multi-ancestry fine-mapping analyses of 192 risk regions
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02031-y
PMID:39753771
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研究论文 | 通过多祖先精细定位分析192个风险区域,细化乳腺癌遗传风险与生物学机制 | 首次对已知乳腺癌风险位点进行大规模多祖先精细定位,识别332个独立关联信号(其中131个为新发现),并将50个信号的可信因果变异缩小至单个变异,结合功能基因组学数据鉴定195个潜在易感基因 | 未提及具体局限性 | 精细定位所有已知乳腺癌遗传风险位点,识别因果变异和靶基因 | 女性乳腺癌病例和对照 | 机器学习 | 乳腺癌 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 172,737例女性乳腺癌病例和242,009例对照 | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2026-05-17 |
Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02022-z
PMID:39753770
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研究论文 | 通过分析6321名日本个体的全基因组测序数据,系统评估了血液DNA病毒组(内源性HHV-6和指环病毒)与自身免疫性疾病及COVID-19的关联 | 首次在人群尺度上系统揭示内源性HHV-6B整合与系统性红斑狼疮及肺泡蛋白沉积症的因果关系,并通过GWAS和长读长测序精确定位整合位点 | 研究人群仅限于日本个体,可能限制结论的普适性;未对病毒组与疾病间的因果机制进行深入验证 | 探究人类血液DNA病毒组(内源性HHV-6和指环病毒)与自身免疫性疾病及COVID-19的病理关联 | 6321名日本个体的全基因组测序数据,包括自身免疫性疾病(银屑病、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、肺泡蛋白沉积症、多发性硬化)和COVID-19患者及健康对照 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病、COVID-19 | 全基因组测序、长读长测序、单细胞RNA测序、GWAS、表位作图 | NA | DNA序列、单细胞转录组 | 6321名日本个体 | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2026-05-17 |
The proteomic landscape and temporal dynamics of mammalian gastruloid development
2024-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.609098
PMID:39282277
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研究论文 | 通过定量蛋白质组学分析人类和小鼠原肠胚模型在四个关键分化阶段的蛋白质景观与动态变化,揭示早期哺乳动物发育中翻译与翻译后调控的物种特异性特征 | 首次系统描绘哺乳动物原肠胚发育的蛋白质组学景观,整合蛋白质组、磷酸化组与转录组数据揭示翻译与翻译后调控的物种差异,并鉴定先天性疾病的保守蛋白网络 | 未明确说明局限性 | 利用定量蛋白质组学技术解析哺乳动物原肠胚发育过程中的蛋白质动态变化与调控机制 | 人类和小鼠的原肠胚模型(包括naïve ESC、primed ESC、早期原肠胚、晚期原肠胚) | 蛋白质组学 | 先天性遗传病 | 定量蛋白质组学、RNA-seq、磷酸化位点分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、磷酸化数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2026-05-17 |
Targeting EFHD2 inhibits interferon-γ signaling and ameliorates non-alcoholic steatohepatitis
2024-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.04.009
PMID:38670321
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研究论文 | 研究EFHD2在非酒精性脂肪性肝炎中的作用机制及靶向治疗效果 | 首次发现EFHD2是免疫细胞特异性分子,通过与YWHAZ相互作用介导IFNγR2膜转位,驱动干扰素-γ信号过度激活,促进NASH炎症;设计靶向EFHD2的钉肽展示治疗潜力 | 机制研究主要基于小鼠模型,人类NASH患者样本验证有限;钉肽的临床安全性及长期效果未评估 | 探究EFHD2在NASH发病中的免疫调控作用及其作为治疗靶点的可行性 | NASH患者肝脏样本、两种饮食诱导的NASH小鼠模型、髓系特异性EFHD2敲除小鼠 | 机器学习 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序、双重免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像 | NASH患者肝脏样本和两种不同饮食诱导的小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 295 | 2026-05-17 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
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研究论文 | 通过空间转录组学数据与分支生命周期的关联,发现肾单位祖细胞在Wnt、Hippo-Yap、视黄酸等通路中节律性交替更新与分化相,并与肾脏分支形态发生同步 | 首次揭示肾单位祖细胞节律性交替更新与分化相,并证明其与分支形态发生同步的机制,通过时空转录组学整合发现Wnt/β-catenin与YAP激活的时间重叠信号转换 | 主要在人和小鼠类器官模型中验证,未在完整发育肾中直接验证节律性信号的时间模式,且信号通路的相互作用细节尚需进一步阐明 | 解析肾单位祖细胞更新与分化平衡的时空调控机制及其与分支形态发生的同步性 | 小鼠发育肾和人干细胞来源的肾单位祖细胞类器官 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠发育肾样本和人干细胞来源类器官样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析小鼠肾组织切片 |
| 296 | 2026-05-17 |
Treatment with an antigen-specific dual microparticle system reverses advanced multiple sclerosis in mice
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205417119
PMID:36256820
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研究论文 | 一种抗原特异性双微颗粒系统可逆转小鼠晚期多发性硬化症的瘫痪症状 | 开发了一种抗原特异性双微颗粒(dMP)系统,能在不使用广谱免疫抑制剂的情况下逆转晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠的瘫痪,并利用单细胞RNA测序揭示了其通过影响MHC II抗原呈递通路发挥作用的机制 | 治疗效果在B细胞缺失时减弱,提示B细胞在此疗法中的关键作用,但具体机制尚需进一步探究 | 研究抗原特异性双微颗粒系统治疗晚期多发性硬化症的疗效及其作用机制 | 晚期实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型 | 深度学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 晚期EAE小鼠,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 用于单细胞RNA测序分析树突状细胞、巨噬细胞、B细胞、小胶质细胞等 |
| 297 | 2026-05-17 |
CoSpar identifies early cell fate biases from single-cell transcriptomic and lineage information
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01209-1
PMID:35190690
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研究论文 | CoSpar是一种利用单细胞转录组和谱系信息识别早期细胞命运偏向的鲁棒计算方法 | 通过相干稀疏优化(CoSpar)方法,在谱系数据严重降采样和分散的情况下仍能稳健推断细胞动态,并发现了先前未检测到的早期命运偏向预测因子 | 未提及具体限制 | 开发稳健计算方法从整合单细胞转录组与谱系跟踪的数据中推断细胞动态 | 造血、重编程和定向分化过程中的细胞动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | 稀疏优化模型 | 单细胞转录组数据、谱系数据 | 造血、重编程和定向分化数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 298 | 2026-05-17 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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研究报告 | 通过纵向分析一名重症COVID-19患者的血浆蛋白质组和外周血单细胞转录组,揭示了从重症到康复过程中的关键生物学变化 | 首次结合无偏倚血浆蛋白质组学和单细胞转录组学纵向追踪COVID-19患者从重症到完全康复的生物学动态,特别是发现了一类具有高度干扰素应答和降低TNF-α信号的单核细胞亚群在康复后消失 | 仅基于单一个案报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 | 阐明COVID-19患者从重症到完全康复过程中的关键生物学动态 | 一名接受恢复期血浆输注的重症COVID-19患者 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 蛋白质组学和转录组学数据 | 1例重症COVID-19患者 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于外周血单细胞转录组分析 |
| 299 | 2026-05-16 |
Single-cell transcriptomic atlas of shrimp hepatopancreas reveals an endoplasmic reticulum stress-dependent immune response to Vibrio parahaemolyticus infection
2026-Jul, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111364
PMID:42000089
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研究论文 | 利用单细胞核测序构建南美白对虾肝胰腺细胞图谱,揭示其应对副溶血弧菌感染的内质网应激依赖性免疫反应 | 首次通过snRNA-Seq构建虾类肝胰腺的细胞图谱,发现内质网应激在甲壳动物抗菌免疫中的关键作用,为跨物种免疫调控的进化保守性提供了新证据 | 未涉及 | 探索甲壳动物先天免疫的细胞和分子机制,特别是肝胰腺应对细菌感染的反应 | 南美白对虾肝胰腺细胞 | 机器学习 | 感染性疾病 | snRNA-Seq, Western blot, 免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 超过20,000个高质量细胞 | NA | 单细胞核测序 | NA | NA |
| 300 | 2026-05-16 |
Targeting HIF-1α promotes ferroptosis and boosts antitumor immunity in MSS colorectal cancer
2026-Jun, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104151
PMID:41945999
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研究论文 | 靶向HIF-1α促进铁死亡并增强微卫星稳定结直肠癌的抗肿瘤免疫 | 揭示了HIF-1α在RSL3耐药MSS结直肠癌细胞中的关键作用,以及联合靶向HIF-1α和铁死亡诱导剂可增强抗PD1治疗效果的新策略 | 主要为体内小鼠模型和体外细胞实验,未来需在更接近人类肿瘤的模型或临床试验中验证 | 探索靶向HIF-1α促进铁死亡并增强MSS结直肠癌免疫治疗的可行性 | MSS结直肠癌细胞系(包括RSL3耐药株)、小鼠CT26同源移植模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序,染色质免疫沉淀(ChIP) | NA | 基因表达数据 | 细胞系及小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |