单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28258 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-05-26 |
Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19
2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000190
PMID:40406392
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了一名康复的COVID-19孕妇的外周血单个核细胞的免疫反应 | 首次在单细胞分辨率下描绘了COVID-19康复孕妇的PBMCs免疫基因表达图谱，并发现CD16阳性单核细胞和MAIT细胞在母体免疫反应中的关键作用 | 研究样本量较小（仅1名患者），且缺乏纵向数据跟踪 | 探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制 | 孕妇外周血单个核细胞（PBMCs） | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1名COVID-19康复孕妇的PBMCs样本，与公开数据集中的健康孕妇对照进行比较 |
| 282 | 2025-05-25 |
NR2F2 and its contribution to lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111814
PMID:40262715
|
研究论文 | 探讨NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用及其与肿瘤干细胞特性的关系 | 首次将NR2F2与口腔鳞状细胞癌的淋巴结转移联系起来，并揭示其在肿瘤干细胞亚群中的关键作用 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩大 | 研究NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的分子机制 | 口腔鳞状细胞癌患者样本、肿瘤细胞系和动物模型 | 肿瘤生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、Western blot、功能实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据 | 未明确说明患者样本数量，包含细胞系和动物模型 |
| 283 | 2025-05-25 |
Atlas of temporal molecular pathological alterations after traumatic brain injury based on RNA-Seq
2025-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115270
PMID:40268159
|
研究论文 | 该研究通过RNA测序技术，系统描绘了创伤性脑损伤（TBI）后不同时间点的分子病理变化图谱 | 首次利用RNA-seq和WGCNA方法，全面揭示了TBI进展过程中时间依赖性的分子病理变化，并重点分析了细胞焦亡在神经炎症过程中的关键作用 | 研究仅使用了C57/BL6小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究 | 揭示创伤性脑损伤后时间依赖性的分子病理变化机制 | C57/BL6小鼠脑组织 | 生物信息学 | 创伤性脑损伤 | RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光 | WGCNA, Mfuzz | RNA测序数据 | C57/BL6小鼠在10个时间点（0h至7d）的脑组织样本 |
| 284 | 2025-05-25 |
Unraveling the immune activation mechanisms of DAMPs in coronary artery disease through transcriptomic and single-cell analyses
2025-Jul, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156952
PMID:40306092
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞分析探讨了损伤相关分子模式（DAMPs）在冠状动脉疾病（CAD）中触发免疫激活的机制 | 揭示了P2RY14和IFIH1基因在CAD中的显著表达差异及其在免疫反应和炎症过程中的潜在作用，以及单细胞分析中免疫细胞的独特聚类模式 | NA | 探究DAMPs在CAD中触发免疫激活的机制 | 冠状动脉疾病（CAD）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 来自GSE202625、GSE242046和GSE159677数据集的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 |
| 285 | 2025-05-25 |
Unveiling the spatiotemporal strategies of plants in response to biotic and abiotic stresses:A comprehensive review
2025-Jul, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109967
PMID:40315636
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术在研究植物应对生物和非生物胁迫的细胞水平响应中的应用 | 首次全面探讨了scRNA-seq和ST技术在植物环境胁迫响应研究中的应用，填补了先前综述的空白 | 植物组织解离的挑战限制了单细胞技术在植物研究中的广泛应用 | 揭示植物在细胞水平上应对环境胁迫的时空策略 | 植物细胞和组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA |
| 286 | 2025-05-25 |
Apocrine Gland Damage and the Release of Specific Keratins in Early Stage Indicate the Crucial Involvement of Apocrine Glands in Hidradenitis Suppurativa
2025-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.021
PMID:39547394
|
research paper | 本研究探讨了顶泌汗腺在化脓性汗腺炎（HS）发病机制中的潜在作用，通过免疫组织化学和单细胞测序技术分析了HS患者和健康对照组的非病变皮肤和早期病变皮肤 | 首次报道了顶泌汗腺在HS早期病变中的损伤及释放特定角蛋白的现象，揭示了顶泌汗腺在HS发病机制中的关键作用 | 样本量较小（HS患者n=12，健康对照n=8），且仅针对早期病变进行研究 | 探讨顶泌汗腺在化脓性汗腺炎发病机制中的作用 | 化脓性汗腺炎患者和健康对照组的非病变皮肤和早期病变皮肤 | 皮肤病学 | 化脓性汗腺炎 | 免疫组织化学，单细胞测序 | NA | 组织样本，血清样本 | HS患者n=12（组织样本），n=20（血清样本）；健康对照n=8 |
| 287 | 2025-05-25 |
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.016
PMID:39709141
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示晚期肝细胞癌患者对atezolizumab联合bevacizumab治疗的两种不同反应模式 | 首次利用单细胞RNA测序技术定义了晚期肝细胞癌对atezo+bev治疗的两种分子亚型（免疫活性型和血管生成驱动型）以及耐药性的主要特征 | 研究样本量相对有限（共422例），且为回顾性分析 | 探索atezo+bev联合治疗晚期肝细胞癌的临床获益与耐药性的细胞学机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 422例RNA测序样本（其中atezo+bev治疗组317例，atezolizumab单药组47例，sorafenib组58例） |
| 288 | 2025-01-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Age-Related Changes in Epidermal Cell Populations and Interactions
2025-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.12.013
PMID:39756533
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2025-05-25 |
Transcriptional reprogramming triggered by neonatal UV radiation or Lkb1 loss prevents BRAFV600E-induced growth arrest in melanocytes
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03339-7
PMID:40057604
|
研究论文 | 该研究揭示了新生儿UV辐射或Lkb1缺失通过触发转录重编程阻止BRAFV600E诱导的生长停滞，从而促进黑色素瘤发展的机制 | 发现了独立于痣进展的BRAF突变黑色素瘤发展新机制，并识别出潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明UVB引发的新生儿特异性黑色素瘤与BRAF相关的生长停滞机制 | 黑色素细胞和黑色素瘤 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、基因组分析 | 小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量（包含小鼠模型和人类临床数据） |
| 290 | 2025-05-25 |
Single-cell multiome reveals root hair-specific responses to salt stress
2025-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70160
PMID:40269556
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术，研究非结球白菜根尖在盐胁迫下的转录和染色质可及性变化，揭示盐胁迫对根毛分化和铁转运的影响 | 首次构建了非结球白菜根尖在正常和盐胁迫条件下的单细胞转录和染色质可及性图谱，揭示了盐胁迫如何影响根毛分化和铁转运 | 研究仅针对非结球白菜，未验证其他作物中的普适性 | 探究植物对盐胁迫的响应机制，为培育耐盐作物提供理论依据 | 非结球白菜根尖细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量，但涉及正常和盐胁迫条件下的非结球白菜根尖细胞 |
| 291 | 2025-05-25 |
GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data
2025-Jun, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110283
PMID:40311462
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序数据和深度学习技术，识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点 | 开发了一个结合自编码器、分类器和判别器的深度学习框架，分析免疫细胞中的基因表达，包括传统方法常忽略的细微遗传变异 | 研究主要关注外周血单个核细胞，可能未涵盖所有相关细胞类型或组织 | 识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 对抗自编码器(AAE) | 基因表达数据 | NA |
| 292 | 2025-05-25 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-May-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
|
research paper | 该研究通过工程化病毒蛋白激活STAT5，以增强T细胞功能并防止其耗竭 | 利用工程化的疱疹病毒蛋白TIP招募LCK激酶直接激活STAT蛋白，实现细胞因子非依赖的T细胞功能维持 | 研究主要针对STAT5激活，未全面评估其他STAT蛋白的影响 | 探索通过重编程信号通路增强T细胞在实体瘤中的持久性和功能 | T细胞（特别是CD8+ T细胞）和STAT5信号通路 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量（体外和体内T细胞实验） |
| 293 | 2025-05-25 |
M-band wavelet-based multi-view clustering of cells
2025-May-23, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013060
PMID:40408513
|
研究论文 | 本文提出了一种基于M波段小波的单细胞RNA测序数据多视图聚类方法（WMC） | 首次将M波段小波分析与UMAP结合应用于scRNA-seq数据，能够发现稀有细胞类型并进行缺失细胞类型的可视化 | 方法在scRNA-seq数据中的应用尚未广为人知，可能缺乏与其他方法的广泛比较 | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法以提高细胞类型鉴别的分辨率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, M-band小波分析, UMAP | 多视图聚类 | 基因表达数据 | 一组单细胞测序数据集（具体数量未提及） |
| 294 | 2025-05-25 |
Association of DNA damage response signals and oxidative stress status with nivolumab efficacy in patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-May-23, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03032-2
PMID:40410274
|
research paper | 研究DNA损伤反应信号和氧化应激状态与头颈鳞状细胞癌患者对nivolumab疗效的关联 | 首次在头颈鳞状细胞癌患者中，通过外周血单核细胞检测DNA损伤反应信号和氧化应激状态，探索其与免疫检查点抑制剂疗效的相关性 | 样本量较小（50例患者），需要进一步验证 | 探索DNA损伤反应信号和氧化应激状态作为预测头颈鳞状细胞癌患者对nivolumab疗效的生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 26名健康对照和50名复发/转移性头颈鳞状细胞癌患者 |
| 295 | 2025-05-25 |
Angiopoietin-TIE2 feedforward circuit promotes PIK3CA-driven venous malformations
2025-May-23, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00655-9
PMID:40410415
|
研究论文 | 本文揭示了静脉畸形（VMs）中PI3Kα-TIE2信号环路的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 发现了PI3K-FOXO1-ANGPT-TIE2信号环路在PIK3CA相关静脉畸形中的核心驱动作用，并验证了TIE2作为治疗靶点的有效性 | mTOR阻断对晚期静脉畸形的治疗效果有限 | 探究PIK3CA突变导致的静脉畸形的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | PIK3CA突变导致的静脉畸形 | 血管生物学 | 静脉畸形 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类静脉畸形样本 |
| 296 | 2025-05-25 |
Confronting the challenge of cell segmentation in spatial transcriptomics
2025-May-23, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02717-z
PMID:40410420
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2025-05-25 |
Integrated analyses reveal CXCL11 as an inhibitor in ovarian cancer and its facilitation of an M1 macrophage switch via the JAK2/STAT1 pathway
2025-May-22, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114900
PMID:40409100
|
研究论文 | 本文通过整合分析揭示了CXCL11在卵巢癌中的抑制作用及其通过JAK2/STAT1通路促进M1巨噬细胞极化的机制 | 首次系统性地鉴定了M1巨噬细胞相关分子在卵巢癌中的预后意义，并发现CXCL11作为核心生物标志物具有双重功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验，缺乏体内实验验证 | 深入理解M1样肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌中的积极作用并寻找可靠的疾病进展风险分层生物标志物 | 卵巢癌(OC)及其肿瘤微环境中的M1样肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量转录组数据分析、生物信息学分析、体外功能实验 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 298 | 2025-05-25 |
Eleutheroside A inhibits PI3K/AKT1/mTOR-mediated glycolysis in MDSCs to alleviate their immunosuppressive function in gastric cancer
2025-May-22, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114907
PMID:40409102
|
研究论文 | 研究探讨了刺五加苷A（EA）通过抑制PI3K/AKT1/mTOR信号通路和HIF-1α介导的糖酵解，减轻髓源性抑制细胞（MDSCs）在胃癌中的免疫抑制功能 | 首次揭示EA通过调控PI3K/AKT1/mTOR信号通路和糖酵解影响MDSCs的免疫抑制功能，为胃癌免疫治疗提供新策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证EA的疗效和安全性 | 探究EA对胃癌免疫微环境中MDSCs免疫抑制功能的调控机制 | 胃癌小鼠模型、MDSCs、CD4+/CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 流式细胞术、免疫荧光、bulk RNA-seq、scRNA-seq、网络药理学分析、分子对接、表面等离子共振（SPR）、Seahorse能量代谢分析 | 皮下胃癌小鼠模型 | RNA测序数据、蛋白质互作数据、分子对接数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了TCGA数据库和两个scRNA-seq数据集（GSE183904和GSE150290） |
| 299 | 2025-05-25 |
Spatial multiomics decipher fibroblast-macrophage dynamics in systemic sclerosis
2025-May-22, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.025
PMID:40410053
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了系统性硬化症中成纤维细胞与巨噬细胞的动态相互作用 | 首次系统性描绘了系统性硬化症皮肤组织中成纤维细胞与巨噬细胞的空间调控网络，并发现ACKR3在肌成纤维细胞前体中的选择性表达机制 | 样本量相对有限（14例皮肤活检），且部分发现仅在动物模型中验证 | 解析系统性硬化症的纤维化微环境形成机制 | 系统性硬化症患者皮肤组织、小鼠模型和驯鹿伤口愈合模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 空间转录组学（10× Visium平台）、Stereo-seq转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 空间多组学数据、单细胞RNA测序数据 | 14例皮肤活检（10例患者+4例对照） |
| 300 | 2025-05-25 |
Combining spatial transcriptomics and ECM imaging in 3D for mapping cellular interactions in the tumor microenvironment
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101261
PMID:40220761
|
research paper | 该研究结合空间转录组学和ECM成像技术，在3D环境下绘制肿瘤微环境中的细胞相互作用 | 首次将3D空间转录组学与ECM成像技术整合，系统量化了细胞邻域中的分子状态、细胞间相互作用及ECM重塑 | 研究仅基于一例临床肺癌样本，样本量有限 | 探索肿瘤微环境中细胞间及细胞与ECM的相互作用，以指导微环境靶向治疗 | 临床肺癌样本中的恶性与非恶性细胞及ECM | digital pathology | lung cancer | 空间转录组学（ST）、ECM成像 | NA | 3D组织切片数据 | 一例临床肺癌样本 |