单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
281	2025-05-10	Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma 2025-May-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99017-5 PMID:40328901	research paper	该研究通过整合生物信息学和机器学习技术，识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用	首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用，并利用机器学习算法筛选关键生物标志物	研究依赖于公开数据集，未进行实验验证	阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制，识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点	头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL)	生物信息学	头颈癌, 霍奇金淋巴瘤	RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA)	LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE	RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据	NA
282	2025-05-10	Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling 2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02220-0 PMID:40329299	研究论文	研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型，揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用	首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发，并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	探索哮喘复发的细胞和分子机制，寻找预防哮喘恶化的新治疗策略	急性过敏性哮喘小鼠模型	免疫学	哮喘	单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验	小鼠模型	转录组数据、流式细胞数据	NA
283	2025-05-10	Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer 2025-May-06, Clinical epigenetics IF:4.8Q1 DOI:10.1186/s13148-025-01882-4 PMID:40329330	研究论文	研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制	揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用，并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，临床前和临床验证仍需进一步研究	评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用，寻找克服这一临床挑战的新策略	结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116，以及肿瘤组织和邻近正常组织	癌症研究	结直肠癌	生物信息学分析、代谢组学、下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Cellchat检测、Western blot	NA	基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据	结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本
284	2025-05-10	Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye 2025-May-06, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.383 PMID:40339725	研究论文	本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼病(DDE)中的作用，并研究了非诺贝特酸的治疗效果及其机制	首次揭示了cGAS-STING信号通路在DDE发病机制中的关键作用，并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路，为DDE治疗提供了新策略	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验	探究cGAS-STING信号通路在DDE中的作用及非诺贝特酸的治疗机制	糖尿病干眼病(DDE)小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞(HCE-T)	分子病理学	糖尿病干眼病	单细胞RNA测序	STZ诱导的DDE小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量，使用了GEO数据库数据和实验模型
285	2025-05-10	RNA research for drug discovery: Recent advances and critical insight 2025-May-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149342 PMID:39983851	综述	本文综述了RNA研究在药物发现领域的最新进展和关键见解	强调了RNA研究在开发新型治疗药物中的关键作用，包括ASOs、mRNA疗法和RNAi等重大发现	RNA稳定性、递送和脱靶效应等挑战仍然存在，需要持续创新和伦理考量	探讨RNA研究在药物发现中的现状和前景	RNA生物学及其在治疗应用中的复杂性	药物发现	多种疾病	高通量测序、单细胞RNA测序、表观转录组学	NA	RNA序列数据	NA
286	2025-05-10	Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1 2025-05-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151641 PMID:40203653	研究论文	本研究探讨了丙酸盐对糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗作用及其机制	发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因表达，抑制Wnt信号通路异常激活，改善糖尿病心脏纤维化	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗效果及分子机制	链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞	心血管疾病	糖尿病心肌病	单细胞RNA测序、shRNA敲低实验	小鼠糖尿病模型	RNA测序数据、生化检测数据	未明确说明小鼠数量
287	2025-05-10	Lipopolysaccharide alters cell communication at the maternal-fetal interface revealed by single-cell RNA-sequencing 2025-May-04, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143939 PMID:40328399	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了脂多糖（LPS）诱导的炎症对母胎界面细胞组成、细胞间相互作用及关键信号通路的影响	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了LPS如何改变母胎界面的细胞通讯及信号通路	研究仅关注了LPS诱导的炎症效应，未涉及其他类型细菌感染的影响	探究LPS诱导的炎症对母胎界面细胞通讯的影响	母胎界面组织中的各类细胞	单细胞测序	妊娠相关疾病	scRNA-Seq	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，涉及多种细胞类型包括子宫内膜上皮细胞、基质细胞、成纤维细胞等
288	2025-05-10	Delivery of Itgb1-siRNA by triptolide-modified and anti-Flt1 peptide-guided ionizable cationic LNPs for targeted therapy of corneal neovascularization 2025-May-03, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113811 PMID:40324532	研究论文	本研究开发了一种新型的Itgb1-siRNA载药系统，用于治疗角膜新生血管	结合了抗Flt1肽引导和雷公藤甲素修饰的可离子化阳离子脂质纳米颗粒（icLNPs），提高了靶向性和抗炎效果	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	开发一种新型、非侵入性且有效的角膜新生血管治疗方法	角膜新生血管（CoNV）	生物医学工程	眼科疾病	单细胞测序、siRNA递送系统	小鼠模型	实验数据	小鼠模型
289	2025-05-10	Single-cell RNA sequencing in the study of human retinal organoids 2025-May-02, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110417 PMID:40320034	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类视网膜类器官（ROs）研究中的应用	scRNA-seq技术能够识别不同的细胞群体、揭示发育轨迹和视网膜疾病的分子特征，为视网膜神经发生、细胞多样性及退行性疾病的病理生理学提供新见解	NA	研究视网膜发育、细胞相互作用及疾病机制	人类视网膜类器官（ROs）	digital pathology	retinal degenerative diseases	scRNA-seq	NA	RNA sequencing data	NA
290	2025-05-10	Integrative epidemiology and immunotranscriptomics uncover a risk and potential mechanism for cutaneous lymphoma unmasking or progression with dupilumab therapy 2025-May, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.028 PMID:39521279	研究论文	本研究通过流行病学和免疫转录组学方法，探讨了dupilumab治疗与皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）发生或进展的风险及潜在机制	首次结合FDA不良事件报告系统（FAERS）和大规模RNA测序数据，揭示了dupilumab可能通过IL-13受体阻断机制促进CTCL的潜在风险	研究基于FAERS数据库的回顾性分析，存在报告偏倚，且缺乏实验验证	评估dupilumab与CTCL关联的安全信号并探究其潜在机制	使用dupilumab治疗的患者及CTCL病例	免疫学与肿瘤学	皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）	RNA测序（包括bulk和单细胞RNA测序）	NA	药物不良事件报告数据、转录组数据	FAERS数据库中181,575份dupilumab相关不良事件报告（其中606例为肿瘤报告）
291	2025-05-10	Cutting-edge tools for unveiling the dynamics of plasmid-host interactions 2025-May, Trends in microbiology IF:14.0Q1 DOI:10.1016/j.tim.2024.12.013 PMID:39843314	review	本文综述了用于揭示质粒-宿主相互作用动态的前沿工具	评估了单细胞测序、荧光技术和高级Hi-C方法在质粒-宿主相互作用研究中的应用，并讨论了CRISPR-based phage engineering等新兴技术的潜力	NA	探讨质粒介导的抗生素抗性基因(ARGs)在复杂微生物组中的传播机制	质粒-宿主相互作用	微生物学	抗生素抗性	单细胞测序, 荧光技术, Hi-C, CRISPR-based phage engineering	NA	基因测序数据	NA
292	2025-05-10	Recent advances in single-cell RNA sequencing of bacteria: Techniques, challenges, and applications 2025-May, Journal of bioscience and bioengineering IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.01.008 PMID:39984340	综述	本文综述了细菌单细胞RNA测序技术的最新进展、挑战及应用	重点介绍了细菌scRNA-seq技术的创新方法及其在微生物学中的新兴应用	讨论了细菌scRNA-seq面临的技术挑战，如细菌mRNA缺乏poly-A尾和单个细菌细胞RNA含量低	总结细菌单细胞转录组学的现状和未来方向	细菌系统	微生物学	NA	scRNA-seq	NA	RNA序列数据	NA
293	2025-05-10	Identification of CACNB1 protein as an actionable therapeutic target for hepatocellular carcinoma via metabolic dysfunction analysis in liver diseases: An integrated bioinformatics and machine learning approach for precise therapy 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142315 PMID:40139615	研究论文	通过整合生物信息学和机器学习方法，识别CACNB1蛋白作为肝细胞癌的可操作治疗靶点，并研究代谢功能障碍在肝病中的作用	利用单细胞RNA测序分析NAFLD衍生的肝硬化的微环境代谢活动，开发了一种基于高斯混合模型的纤维化预测模型，并识别了CACNB1蛋白作为HCC的潜在治疗靶点	研究依赖于公开数据集，可能需要进一步实验验证	研究代谢功能障碍在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和肝细胞癌（HCC）中的作用，并开发精确治疗方法	806例NAFLD样本和267例正常肝脏样本，以及来自TCGA和GEO的HCC数据集	生物信息学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），高斯混合模型（GMM），机器学习算法	高斯混合模型（GMM）	基因表达数据	806例NAFLD样本和267例正常肝脏样本，以及多个HCC数据集
294	2025-05-10	Unveiling hypoxia-related prognostic and immunotherapeutic biomarkers in lung adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA sequencing: Including insights into PGF 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143056 PMID:40228772	research paper	通过单细胞和批量RNA测序揭示肺腺癌中与缺氧相关的预后和免疫治疗生物标志物，包括对PGF的见解	识别了与晚期肺腺癌相关的新亚型，并开发了基于缺氧相关分子簇的新型预后特征	样本量较小（15例患者），可能影响结果的普遍性	研究缺氧微环境与免疫抵抗之间的相互作用机制	肺腺癌（LUAD）患者	digital pathology	lung cancer	scRNA-seq, bulk RNA sequencing, spatial transcriptomic analysis	NA	RNA sequencing data	15例肺腺癌患者
295	2025-05-10	Endothelial-to-mesenchymal transition gene signature derived from single-cell transcriptomics of human atherosclerotic tissue associates with stable plaque histological characteristics 2025-May-01, Vascular pharmacology IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.vph.2025.107498 PMID:40318741	研究论文	通过单细胞转录组学数据识别人类动脉粥样硬化组织中内皮-间充质转化(EndoMT)的基因特征	首次利用人类斑块组织的单细胞转录组数据构建EndoMT基因特征，并验证其与稳定斑块组织学特征的关联	研究样本量有限(n=46)，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证	阐明人类动脉粥样硬化中EndoMT的分子机制	人类颈动脉斑块组织和小鼠模型	单细胞转录组学	心血管疾病	scRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	转录组数据	46例人类颈动脉scRNA-seq样本，632例bulk RNA-seq样本
296	2025-05-08	Abnormal lineage differentiation of peri-implantation aneuploid embryos revealed by single-cell RNA sequencing 2025-May, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70326 PMID:40329849	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
297	2025-05-10	Targeting VSIG4+ tissue-resident macrophages enhances T cell cytotoxicity and immunotherapy efficacy in cancer 2025-Apr-29, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.011 PMID:40339578	研究论文	本研究探讨了VSIG4+组织驻留巨噬细胞在癌症中的作用及其对T细胞细胞毒性和免疫治疗效果的增强作用	发现VSIG4过表达的TRM衍生TAM亚群在多种癌症中存在，并揭示了VSIG4通过直接或间接方式促进免疫抑制效应的机制，同时鉴定出MEF2C作为维持VSIG4表达的关键转录因子	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证	探索TRM衍生的TAM亚群在癌症中的作用及其对免疫治疗的影响	VSIG4+组织驻留巨噬细胞及其衍生的TAM亚群	肿瘤免疫学	睾丸癌、肝细胞癌、肺癌、胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、谱系追踪	NA	RNA测序数据	NA
298	2025-05-10	Lactate drives senescence-resistant lineages in hepatocellular carcinoma via histone H2B lactylation of NDRG1 2025-Apr-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217567 PMID:39978571	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序轨迹分析重建肝细胞癌（HCC）的克隆演化，揭示了LDHA-NDRG1轴在肿瘤异质性和抗衰老机制中的关键作用	揭示了LDHA介导的组蛋白H2B在NDRG1上的K58位点乳酸化修饰，这一表观遗传机制将代谢重编程与衰老逃逸联系起来	研究主要基于小鼠模型和公共数据集，需要在人类患者中进行进一步验证	探索肝细胞癌的肿瘤异质性机制并开发精准治疗策略	肝细胞癌（HCC）的克隆演化及LDHA-NDRG1轴	癌症生物学	肝细胞癌	单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析	14基因预后模型	RNA测序数据	公共HCC数据集及转移性HCC小鼠模型
299	2025-05-10	Single-Cell RNA Sequencing Outperforms Single-Nucleus RNA Sequencing in Analyzing Pancreatic Cell Diversity and Gene Expression in Goats 2025-Apr-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26083916 PMID:40332786	研究论文	本研究比较了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）在分析山羊胰腺细胞多样性和基因表达方面的效果	首次在山羊胰腺研究中比较了scRNA-seq和snRNA-seq的效果，发现scRNA-seq在检测细胞类型多样性和关键基因表达谱方面更优	研究仅使用了3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织，样本量较小	比较scRNA-seq和snRNA-seq在山羊胰腺研究中的效果	山羊胰腺组织	基因组学	NA	scRNA-seq, snRNA-seq	NA	RNA测序数据	3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织
300	2025-05-10	Personalized Stem Cell-Based Regeneration in Spinal Cord Injury Care 2025-Apr-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26083874 PMID:40332538	综述	本文探讨了干细胞工程和再生医学在脊髓损伤治疗中的新进展，特别是通过神经干细胞/祖细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞的移植	结合患者特异性变异、生物工程创新和转录组学引导的精准医学，定义了脊髓损伤治疗的新前沿	患者特异性因素如细胞衰老、遗传和表观遗传变异、损伤微环境和合并症影响干细胞疗法的疗效	探索干细胞疗法在脊髓损伤治疗中的临床应用	脊髓损伤患者	再生医学	脊髓损伤	单细胞转录组学、CRISPR介导的低免疫原性工程、生物材料递送平台	NA	NA	NA