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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-10-05 |
mcRigor: a statistical method to enhance the rigor of metacell partitioning in single-cell data analysis
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63626-5
PMID:41022768
|
研究论文 | 提出一种统计方法mcRigor来增强单细胞数据分析中元细胞分区的严谨性 | 开发了基于特征相关性的统计量来测量元细胞异质性，并采用双重置换方案推导其零分布 | NA | 提高单细胞数据分析中元细胞分区的可靠性 | 单细胞RNA-seq和多组学(RNA+ATAC)数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学分析 | 统计方法 | 单细胞基因表达数据, 表观基因组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell multi-omics | NA | NA |
| 282 | 2025-10-05 |
The pericardium forms as a distinct structure during heart formation
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63599-5
PMID:41022776
|
研究论文 | 本研究揭示了心包膜起源于侧板中胚层中独立于经典心区的特定间皮祖细胞 | 首次发现心包膜形成是独立于心脏形成的自主过程，并鉴定出保守的间皮祖细胞谱系 | 主要基于斑马鱼模型，哺乳动物验证相对有限 | 解析心包膜的发育起源和形成机制 | 斑马鱼胚胎、哺乳动物（大鼠）心包组织 | 发育生物学 | 小儿扩张型心肌病 | 单细胞转录组测序, 光片成像, 机器学习细胞追踪 | 机器学习辅助细胞追踪 | 基因表达数据, 成像数据 | 斑马鱼胚胎发育过程, 新生大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-10-05 |
Dynamic cell fate plasticity and tissue reintegration drive functional adult synovial joint regeneration after complete resection
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63596-8
PMID:41022785
|
研究论文 | 本研究通过建立成年斑马鱼全关节切除模型，揭示了成年哺乳动物滑膜关节的功能性再生机制 | 首次发现成年脊椎动物骨骼中存在的多能神经嵴衍生细胞群体能够驱动完整滑膜关节的功能性再生 | 研究基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索成年脊椎动物滑膜关节再生的分子和细胞机制 | 成年斑马鱼的滑膜关节组织 | 发育生物学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序, 克隆谱系追踪, 显微CT, 组织学分析, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 284 | 2025-10-05 |
Neuron-reactive KIR+CD8+ T cells display an encephalitogenic transcriptional program in autoimmune encephalitis
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63573-1
PMID:41022795
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了神经元反应性KIR+CD8+ T细胞在自身免疫性脑炎中的致病机制 | 首次在抗Ri脑炎患者中鉴定出具有脑炎致病潜能的神经元反应性KIR+CD8+ T细胞，并发现其转录谱特征 | 样本量较小（7名患者和3名对照），且仅在一名患者脑部病灶中验证了TOX表达 | 探究自身免疫性脑炎中神经元反应性CD8 T细胞的致病机制 | 抗Ri脑炎患者和健康对照者的CD8 T细胞 | 单细胞基因组学 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序，人类诱导多能干细胞分化神经元 | NA | 单细胞转录组数据 | 7名抗Ri脑炎患者和3名年龄匹配的对照，另加6名健康供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2025-10-05 |
Contractile fibroblasts form a transient niche for the branching mammary epithelium
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63612-x
PMID:41022819
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了青春期小鼠乳腺中特化的收缩性成纤维细胞亚群在乳腺上皮分支发育中形成短暂生态位的机制 | 首次发现并表征了专门定位在生长乳腺上皮尖端周围的收缩性成纤维细胞亚群，这些细胞从周围脂肪垫基质中的前脂肪细胞招募而来，形成短暂发育生态位 | 研究仅限于小鼠青春期乳腺发育模型，人类或其他哺乳动物中的相关性尚待验证 | 探索乳腺发育过程中成纤维细胞亚型的功能特性和谱系关系 | 青春期小鼠乳腺成纤维细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，空间定位，功能分析，体内谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 286 | 2025-10-05 |
BLVRA promotes glioblastoma progression by regulating fatty acid metabolism
2025-Sep-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-19026-2
PMID:41023045
|
研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞RNA测序数据，首次发现BLVRA作为胶质母细胞瘤脂肪酸代谢的关键调控因子和预后生物标志物 | 首次确立BLVRA在胶质母细胞瘤脂肪酸代谢中的核心调控作用，揭示了其在维持代谢稳态和支持肿瘤生长中的双重功能 | 脂肪酸代谢调控机制尚未完全阐明 | 探究胶质母细胞瘤中脂肪酸代谢的调控机制及其与肿瘤进展的关系 | 胶质母细胞瘤组织和细胞系 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，体外功能验证 | 十种机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 287 | 2025-10-05 |
Integrated multi omics and machine learning reveal mitochondrial immunometabolic networks in sepsis associated encephalopathy
2025-Sep-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18650-2
PMID:41023055
|
研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法揭示脓毒症相关脑病中线粒体免疫代谢网络的作用机制 | 首次整合多转录组和单细胞测序数据集系统分析SAE脑组织中线粒体相关差异表达基因，并利用机器学习鉴定出三个核心生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限 | 探讨脓毒症相关脑病的发病机制，特别关注线粒体功能与免疫代谢的相互作用 | 脓毒症相关脑病患者脑组织样本 | 机器学习 | 脓毒症相关脑病 | 转录组测序, 单细胞测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个转录组和单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-10-05 |
Identification of biomarkers and mechanisms associated with palmitoylation in acute kidney injury using transcriptome and single cell data
2025-Sep-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-19191-4
PMID:41023305
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞数据分析鉴定与急性肾损伤中棕榈酰化相关的生物标志物及其机制 | 首次结合棕榈酰化相关基因、机器学习方法和单细胞测序技术系统研究急性肾损伤的生物标志物和细胞机制 | NA | 识别与棕榈酰化相关的急性肾损伤生物标志物并探索其生物学机制 | 急性肾损伤患者样本数据 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting | 机器学习, ROC分析, 伪时序分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 数据集GSE139061、GSE30718和GSE174220 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 289 | 2025-10-05 |
Benchmarking multi-slice integration and downstream applications in spatial transcriptomics data analysis
2025-Sep-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03796-z
PMID:41024097
|
研究论文 | 本研究提出了一个全面的基准测试框架，用于评估空间转录组学中多切片整合方法的性能 | 首次系统性地评估了12种多切片整合方法在19个不同数据集上的表现，并建立了从上游到下游的完整分析流程 | 方法性能高度依赖于应用场景、数据集大小和技术平台，存在数据依赖性差异 | 评估空间转录组学中多切片整合方法的可靠性和下游应用效果 | 12种多切片整合方法和19个不同的空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 空间基因表达数据 | 19个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2025-10-05 |
Microglia networks within the tapestry of alzheimer's disease through spatial transcriptomics
2025-Sep-29, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00897-y
PMID:41024223
|
综述 | 通过空间转录组学技术探讨阿尔茨海默病中小胶质细胞网络的作用机制 | 整合成像和测序为基础的空间转录组学方法，揭示小胶质细胞在淀粉样斑块微环境中的区域异质性和功能多样性 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有研究进行整合分析 | 理解阿尔茨海默病发病机制中的细胞间相互作用和微环境影响 | 阿尔茨海默病患者脑组织和小鼠模型中的小胶质细胞、星形胶质细胞、神经元和少突胶质细胞 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 291 | 2025-10-05 |
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-Sep-27, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
DOI:10.1016/j.jormas.2025.102582
PMID:41022354
|
研究论文 | 本研究开发并验证了基于NOTCH相关基因的头颈鳞状细胞癌预后预测模型 | 首次构建NOTCH评分系统用于HNSCC预后预测，并揭示其与肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 | 开发头颈鳞状细胞癌的预后预测模型并探索其临床意义 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化，LASSO回归，ROC分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据，临床数据 | 头颈鳞状细胞癌患者队列（训练集和验证集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2025-10-05 |
A Multi-Layered Atlas of Spatial Regulatory Programs and Therapeutic Vulnerabilities in Glioblastoma
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.27.674707
PMID:41040398
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研究论文 | 本研究构建了一个整合多层次的胶质母细胞瘤空间调控图谱，将转录因子和通路活性推断与配体/受体及药物靶点映射相结合 | 开发了整合STAN和SPAN的计算框架，首次在系统水平上解析胶质母细胞瘤空间异质性的调控逻辑与治疗脆弱性关联 | 研究仅基于26个肿瘤样本，样本量相对有限，需要更大规模验证 | 解析胶质母细胞瘤空间异质性的系统调控逻辑并识别治疗脆弱性 | 26个胶质母细胞瘤肿瘤样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | STAN, SPAN | 空间转录组数据 | 26个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 293 | 2025-10-05 |
Decoding Gujin Luyan Xuming decoction: How ancient wisdom meets modern science in promoting angiogenesis to ameliorate cerebral infarction
2025-Sep-26, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120652
PMID:41016542
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研究论文 | 本研究解析了古今录验续命汤通过RAB11A调控Wnt5a/β-catenin信号通路促进脑梗死血管新生的分子机制 | 首次结合网络药理学、RNA测序和单细胞测序技术系统阐明古今录验续命汤治疗脑梗死的作用靶点RAB11A及其分子机制 | 分子机制尚未完全阐明，需要进一步研究验证 | 阐明古今录验续命汤促进脑梗死后血管新生的分子机制 | 脑梗死模型动物和细胞 | 生物信息学 | 脑梗死 | HPLC-MS/MS, RNA-seq, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 使用公共数据集GSE137482和GSE225948 | NA | RNA测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 294 | 2025-10-05 |
Super-Resolved Spatial Transcriptomics Reveals Early Changes in RNA Localization in the 5xFAD Hippocampus
2025-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678295
PMID:41040317
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研究论文 | 本研究利用超分辨率空间转录组技术揭示了5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠海马区RNA定位的早期变化 | 首次在阿尔茨海默病早期病理出现前，通过超分辨率空间转录组技术发现RNA空间定位紊乱是疾病的早期分子特征 | 研究仅限于5xFAD小鼠模型，且仅分析了101个基因的空间分布 | 探究阿尔茨海默病早期阶段RNA空间定位的变化特征 | 4周龄5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型小鼠的海马组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | Expansion Sequencing (ExSeq), 空间RNA速度分析 | NA | 空间转录组数据 | 5xFAD和野生型小鼠海马组织 | NA | 空间转录组学 | NA | Expansion Sequencing (ExSeq) 超分辨率技术 |
| 295 | 2025-10-05 |
Inflammatory macrophages drive smooth muscle dedifferentiation via YAP signaling in murine deep vein thrombosis
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678378
PMID:41040135
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研究论文 | 本研究揭示了炎症巨噬细胞通过YAP信号通路驱动平滑肌细胞去分化在深静脉血栓形成中的机制 | 首次发现炎症巨噬细胞通过抑制Hippo通路效应因子YAP驱动平滑肌细胞去分化在深静脉血栓早期发病中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究深静脉血栓形成中平滑肌细胞表型变化的分子机制 | 小鼠深静脉血栓模型中的静脉平滑肌细胞和炎症巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 深静脉血栓 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, Western blotting, qRT-PCR, 功能分析 | 小鼠深静脉血栓停滞模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 雄性和雌性小鼠的静脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2025-10-05 |
Peripheral nerve-targeting and pain-promoting transcriptomic signatures in early Guillain-Barré syndrome
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678413
PMID:41040175
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示早期吉兰-巴雷综合征中免疫细胞与周围神经系统相互作用的分子机制 | 首次在AIDP变异型GBS患者中结合单细胞和bulk RNA测序分析，发现特定白细胞亚群与周围神经细胞相互作用的分子机制 | 研究样本量有限，仅针对早期未治疗的AIDP变异型患者，需要进一步功能验证 | 阐明吉兰-巴雷综合征早期自身免疫损伤的驱动机制 | 早期未治疗的AIDP变异型GBS患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 吉兰-巴雷综合征 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 早期未治疗AIDP变异型GBS患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2025-10-05 |
Dual-patterned pluripotent stem cells self-organize into a human embryo model with extended anterior-posterior patterning
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.25.678678
PMID:41040184
|
研究论文 | 本研究通过双模式预分化人类多能干细胞，开发出具有前后轴模式化特征的人类胚胎模型 | 首次通过混合前后轴预分化干细胞实现自组织形成具有完整前后轴特征的人类胚胎模型 | 缺乏脊索结构和完整的背腹极性 | 建立更完善的人类胚胎发育模型以研究体轴形成机制 | 人类多能干细胞(hPSCs) | 发育生物学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 人类胚胎模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 298 | 2025-10-05 |
Mapping disease critical spatially variable gene programs by integrating spatial transcriptomics with human genetics
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678397
PMID:41040309
|
研究论文 | 开发了一种名为Spacelink的统一框架，通过整合空间转录组学与人类遗传学数据来识别与疾病相关的空间可变基因程序 | 提出自适应混合数据驱动空间核模型，在整体组织和细胞类型分辨率下建模基因空间变异性，并引入有效空间变异性(ESV)指标 | NA | 解码连接组织架构与疾病遗传学的空间可变基因程序 | 人类健康组织(大脑皮层、淋巴结、肝脏)、小鼠器官发生图谱、阿尔茨海默病患者样本 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病,自闭症谱系障碍,复杂疾病 | 空间转录组学,遗传学分析 | 自适应混合空间核模型 | 空间基因表达数据,遗传数据 | 3个健康人类组织,32个阿尔茨海默病样本,8个小鼠发育阶段 | 10x Genomics,Nanostring | 空间转录组学 | 10x Visium,CosMx,Stereo-seq | Visium空间基因表达平台,CosMx空间分子成像仪,Stereo-seq空间转录组技术 |
| 299 | 2025-10-05 |
Regional Signaling Controls Stem Cell-Mediated Regeneration in an Invertebrate Chordate
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.25.678506
PMID:41040342
|
研究论文 | 本研究通过比较海鞘再生与非再生片段，揭示了区域特异性信号如何调控干细胞介导的再生过程 | 首次在海鞘模型中系统比较再生与非再生环境的转录动态和信号差异，发现再生能力不仅取决于干细胞数量，更关键的是区域特异性信号调控 | 研究局限于单一无脊椎脊索动物模型，结论在其他系统中的普适性有待验证 | 探究局部信号如何调控干细胞在损伤后的激活和再生过程 | 海鞘（无脊椎脊索动物）的再生与非再生身体片段 | 发育生物学 | 组织损伤与再生 | 流式细胞术, scRNA-seq, 移植实验, 命运图谱 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 海鞘再生与非再生片段对比样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-10-05 |
HEIST: A Graph Foundation Model for Spatial Transcriptomics and Proteomics Data
2025-Sep-25, ArXiv
PMID:41040798
|
研究论文 | 提出HEIST分层图变换器基础模型，用于空间转录组学和蛋白质组学数据分析 | 首次将组织建模为分层图结构，通过跨层级消息传递实现空间信息和细胞内基因共表达网络的联合建模，能够泛化到未见过的数据类型 | 未在文中明确说明具体限制 | 开发能够同时利用空间信息和细胞内分子程序的基础模型 | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | 分层图变换器 | 空间坐标，基因表达，蛋白质计数 | 2230万个细胞，来自15个器官的124个组织 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |