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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2941 - 2960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2941 | 2025-10-06 |
Analysis of immunogenic cell death in atherosclerosis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110130
PMID:37075670
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研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据分析动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡 | 首次在动脉粥样硬化中系统研究免疫原性细胞死亡的作用机制，并识别出8个关键基因作为潜在药物靶点 | 研究数据均来自公共数据库，缺乏实验验证 | 探究免疫原性细胞死亡在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 颈动脉粥样硬化斑块细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, KEGG富集分析, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA, 随机森林 | 随机森林, 共识聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2942 | 2025-10-06 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血流型和前循环型细胞周期 | 无需细胞分选或同步化即可获得高分辨率细胞周期调控转录组，并开发了适用于冷冻保存样品的单细胞转录组分析方案 | 研究基于非同步化细胞群体，可能影响细胞周期阶段分辨的精确性 | 解析布氏锥虫不同生命周期形式的细胞周期调控机制 | 布氏锥虫血流型和前循环型 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞转录组学 | 周期性伪时间推断 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2943 | 2025-10-06 |
Single-cell multiomic analysis identifies a HOX-PBX gene network regulating the survival of lymphangioleiomyomatosis cells
2023-05-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8549
PMID:37163604
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析发现HOX-PBX基因网络调控淋巴管平滑肌瘤病细胞存活机制 | 首次在肺LAM细胞中发现子宫特异性HOX-PBX转录程序的激活，并证实HOXD11-PBX1二聚化是细胞存活的关键调控机制 | NA | 探索淋巴管平滑肌瘤病的发病机制并寻找新的治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病肺组织细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2944 | 2025-10-06 |
Distinct Th17 effector cytokines differentially promote microglial and blood-brain barrier inflammatory responses during post-infectious encephalitis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532135
PMID:37215000
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了A组链球菌感染后Th17效应细胞因子如何差异调节小胶质细胞和血脑屏障的炎症反应 | 首次在单细胞水平揭示IL-17A而非GM-CSF在GAS感染后脑炎中的关键作用，并发现小胶质细胞来源的趋化因子在患者血清中升高 | 研究主要基于小鼠疾病模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究Th17效应细胞因子在感染后脑炎中对小胶质细胞和血脑屏障炎症反应的调控机制 | 小鼠疾病模型、内皮细胞、小胶质细胞、Th17淋巴细胞 | 神经免疫学 | 感染后脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 中和抗体实验 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2945 | 2025-10-06 |
Integrative Proteomics and N-Glycoproteomics Analyses of Rheumatoid Arthritis Synovium Reveal Immune-Associated Glycopeptides
2023-05, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2023.100540
PMID:37019382
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和N-糖基化蛋白质组学分析类风湿关节炎滑膜组织，揭示免疫相关糖肽特征 | 首次系统描绘类风湿关节炎滑膜组织的N-糖基化蛋白质组图谱，发现特定糖基化位点与免疫细胞浸润的显著相关性 | 样本量未明确说明，分析主要基于生物信息学预测需要实验验证 | 探究类风湿关节炎滑膜组织中蛋白质N-糖基化的特征及其与免疫反应的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织样本 | 蛋白质组学 | 类风湿关节炎 | N-糖基化蛋白质组学，生物信息学分析，单细胞转录组数据整合 | NA | 蛋白质组数据，糖基化肽段数据，转录组数据 | NA | NA | 蛋白质组学，糖基化分析，单细胞RNA-seq | DNASTAR | NA |
| 2946 | 2025-10-06 |
Interference of sympathetic overactivation restores limbal stem/progenitor cells function and accelerates corneal epithelial wound healing in diabetic mice
2023-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114523
PMID:36931034
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病角膜病变中交感神经过度激活通过NE-Adrb2-Shh信号通路损害角膜缘干/祖细胞功能和角膜上皮再生的机制 | 首次发现交感神经过度激活在糖尿病角膜病变中的作用机制，并证实通过干扰该通路可恢复角膜缘干/祖细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探究糖尿病角膜病变中角膜缘干/祖细胞功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠和人类角膜组织 | 眼科疾病研究 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞测序, RT-PCR, 化学遗传学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像 | 糖尿病小鼠模型和人类角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2947 | 2025-10-06 |
Cardiovascular utility of single cell RNA-Seq
2023-05-01, Current opinion in cardiology
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/HCO.0000000000001014
PMID:36728943
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病领域的应用现状与未来前景 | 系统总结了单细胞RNA测序在心脏病学中的创新应用，并展望了在心脏电生理学和心脏肿瘤学等新兴领域的潜在价值 | 当前研究主要集中于结构性或动脉粥样硬化性心脏病，其他心脏疾病领域的研究相对有限 | 探讨单细胞RNA测序技术在心血管疾病诊断、风险分层和治疗靶点发现中的应用潜力 | 心血管疾病相关细胞类型和分子机制 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2948 | 2025-10-06 |
An artificial neural network model to diagnose non-obstructive azoospermia based on RNA-binding protein-related genes
2023-04-24, Aging
DOI:10.18632/aging.204674
PMID:37116198
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研究论文 | 开发基于RNA结合蛋白相关基因的人工神经网络模型用于诊断非梗阻性无精子症 | 首次基于RNA结合蛋白DDX20和NCBP2构建人工神经网络诊断模型，并在多个独立队列中进行验证 | 样本量相对有限，需要在更大规模队列中进一步验证模型的泛化能力 | 研究RNA结合蛋白在非梗阻性无精子症中的功能及诊断价值 | 睾丸组织样本（包括对照和NOA患者） | 机器学习 | 男性不育症 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，机器学习算法 | 人工神经网络，逻辑回归，随机森林，LASSO，SVM-RFE，Boruta | 基因表达数据，转录组数据 | 训练队列58例（对照11，NOA47），验证队列包括3个公共数据集和44例本地医院样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2949 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic atlas of lung microvascular regeneration after targeted endothelial cell ablation
2023-04-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80900
PMID:37078698
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺微血管再生机制 | 首次发现表达apelin的新型gCap内皮干细胞群在肺微血管再生中的关键作用 | 研究基于转基因小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证 | 阐明肺微血管再生的分子机制 | 肺内皮细胞 | 单细胞生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因小鼠肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2950 | 2025-10-06 |
Neutrophilic granulocyte-derived B-cell activating factor supports B cells in skin lesions in hidradenitis suppurativa
2023-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.10.034
PMID:36481267
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的B细胞活化因子在化脓性汗腺炎皮肤病变中支持B/浆细胞存续的机制 | 首次发现中性粒细胞是HS病变中BAFF的主要生产者，并阐明G-CSF和细菌产物共同刺激BAFF分泌的机制 | 研究样本来源有限，机制研究主要基于体外实验 | 阐明HS病变中支持B/浆细胞存续的介质及其作用机制 | HS患者皮肤样本、血浆、培养的皮肤活检样本、角质形成细胞、真皮成纤维细胞、中性粒细胞、单核细胞和B细胞 | 免疫学 | 化脓性汗腺炎 | mRNA测序, 定量PCR, 流式细胞术, 免疫组织荧光, 系统生物学分析 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 多个HS患者队列和对照队列的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2951 | 2025-10-06 |
A proteo-transcriptomic map of non-alcoholic fatty liver disease signatures
2023-04, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00775-1
PMID:37037945
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和转录组学整合分析，绘制了非酒精性脂肪肝疾病进展的分子特征图谱 | 首次提供了NAFLD进展过程中蛋白质组与转录组整合的详细图谱，并通过单细胞RNA测序解析了肝脏细胞类型对蛋白质组变化的贡献 | 样本量相对有限（306例患者），且为多中心研究可能存在技术批次效应 | 揭示NAFLD向肝硬化进展过程中循环蛋白质的系统性变化机制 | 306例经组织学特征明确的NAFLD患者 | 生物医学 | 非酒精性脂肪肝 | 蛋白质组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 逻辑回归 | 逻辑回归 | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 306例NAFLD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2952 | 2025-10-06 |
RevGel-seq: instrument-free single-cell RNA sequencing using a reversible hydrogel for cell-specific barcoding
2023-03-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-31915-y
PMID:36964177
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研究论文 | 介绍了一种基于可逆水凝胶技术的单细胞RNA测序方法RevGel-seq，无需专用仪器即可实现细胞特异性条形码标记 | 开发了无需微流控设备或液滴系统的单细胞RNA测序技术，通过可逆水凝胶固定细胞-磁珠复合物，提供实验设计的灵活性和样品处理的时间自由度 | 当前凝胶化设备的标准分析范围在10,000个输入细胞水平，可能限制更高通量应用 | 开发无需专用仪器的单细胞RNA测序技术 | 外周血单个核细胞(PBMC)、胰腺胰岛细胞、心肌细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 标准分析约10,000个细胞，展示了PBMC、胰岛细胞和心肌细胞的应用 | NA | 单细胞RNA-seq | RevGel-seq | 基于可逆水凝胶的单细胞条形码技术，无需微流控或液滴系统 |
| 2953 | 2025-10-06 |
Cancer stem cells: Recent insights and therapies
2023-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115441
PMID:36720355
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综述 | 本文综述了癌症干细胞的最新研究进展及其治疗策略 | 整合单细胞测序和空间转录组分析技术研究癌症干细胞，并总结靶向消除癌症干细胞的治疗策略 | NA | 探讨癌症干细胞在癌症生物学中的基础作用及治疗应用 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2954 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics in Kidney Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3179-9_17
PMID:37423994
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研究论文 | 详细介绍空间转录组测序技术在肾脏组织中的应用方法 | 整合组织学与RNA测序，在完整组织空间背景下解析转录组表达 | NA | 开发和应用空间转录组测序技术于肾脏组织研究 | 小鼠和人类肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据，H&E图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Tissue Optimization, Visium Spatial Gene Expression | Visium空间组织优化协议和Visium空间基因表达协议 |
| 2955 | 2025-10-06 |
A single-cell RNA sequencing atlas of circulating leukocytes from healthy and osteosarcoma affected dogs
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162700
PMID:37275879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了健康犬和骨肉瘤患犬循环白细胞图谱，并分析骨肉瘤对免疫细胞转录组的影响 | 首次构建犬类循环白细胞的单细胞RNA测序图谱，揭示了CD4 T细胞亚型的显著异质性，并发现骨肉瘤患犬中髓源性抑制细胞比例增加 | 样本量相对有限（健康犬7只，骨肉瘤患犬10只），且受犬类特异性试剂限制 | 深入表征犬类免疫细胞异质性，建立转化医学相关的动物模型 | 健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17只犬（7只健康犬，10只骨肉瘤患犬） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2956 | 2025-10-06 |
The integrated single-cell analysis developed a lactate metabolism-driven signature to improve outcomes and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1154410
PMID:37033259
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了乳酸代谢驱动的特征模型，用于改善肺腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 首次利用单细胞RNA测序分析结合乳酸代谢相关基因构建预后模型，并验证了AHSA1基因在肺腺癌中的作用 | 需要更多外部数据集验证模型的普适性，实验验证仅限于AHSA1基因 | 构建基于乳酸代谢相关基因的预后模型，改善肺腺癌患者的治疗结果和免疫治疗效果 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, AUCell算法, 相关性分析, Cox回归, Lasso回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 多个外部独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2957 | 2025-10-06 |
A novel liver zonation phenotype-associated molecular classification of hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140201
PMID:36936935
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研究论文 | 基于肝分区特征建立了一种新的肝细胞癌分子分型系统 | 首次鉴定94个人类肝细胞特异性分区标志物，并基于这些标志物将肝细胞癌分为三个具有不同预后和免疫特征的亚型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索肝细胞癌的肝分区特征并建立新的分子分型系统 | 肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序，微阵列分析 | 非负矩阵分解共识聚类 | 基因表达数据 | 训练集616例HCC样本，验证集285例HCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq，微阵列 | NA | NA |
| 2958 | 2025-10-06 |
Omnibus and robust deconvolution scheme for bulk RNA sequencing data integrating multiple single-cell reference sets and prior biological knowledge
2022-09-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac563
PMID:35980155
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研究论文 | 提出一种整合多个单细胞参考集和先验生物知识的稳健反卷积算法InteRD，用于从批量RNA测序数据推断细胞类型比例 | 开发了带惩罚回归和新评估标准的反卷积算法，能有效整合多个单细胞数据集并利用先验生物信息进行校准 | 算法性能仍依赖于外部数据源的质量和先验信息的准确性 | 开发更准确和稳健的细胞类型反卷积方法 | 批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 惩罚回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2959 | 2025-10-06 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 开发了一个增强的单细胞RNA测序分析工作流程，用于研究冠状动脉疾病的细胞相互作用和潜在药物靶点 | 整合了自动化细胞标记、伪时序排序、配体-受体评估和药物-基因相互作用分析的用户友好型工作流程，并开发了交互式网络应用PlaqView | 基于已发表的单细胞数据集进行二次分析，需要进一步实验验证 | 开发单细胞RNA测序分析工作流程以研究动脉粥样硬化斑块微环境和发现潜在治疗方法 | 人类冠状动脉单细胞数据集中的细胞类型，特别是平滑肌细胞来源的成纤维样细胞 | 单细胞分析 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析，配体-受体相互作用分析 | 单细胞RNA测序数据 | 基于Wirka等人先前发表的人类冠状动脉单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2960 | 2025-10-06 |
A joint deep learning model enables simultaneous batch effect correction, denoising, and clustering in single-cell transcriptomics
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271874.120
PMID:34035047
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研究论文 | 提出一种联合深度学习模型CarDEC，可同时实现单细胞转录组数据的批次效应校正、去噪和聚类 | 首次在基因表达空间和嵌入空间同时校正批次效应，且能同时进行去噪和聚类分析 | 未提及模型在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 开发单细胞RNA-seq数据分析方法，解决批次效应问题 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |