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当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 2941 - 2960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 2941 | 2026-02-05 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619991
PMID:39484401
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了小鼠跟腱成熟过程中肌腱干细胞/祖细胞的分子特征，并鉴定了新的表面抗原标记物CD55和CD248 | 首次结合单细胞RNA测序与单核RNA及ATAC测序分析，识别出CD55和CD248作为TSPCs的新表面抗原标记物，并验证了其功能特性 | 研究仅基于小鼠模型，样本量有限（2周和6周龄），且未在人类组织或更广泛的年龄范围进行验证 | 探索肌腱干细胞/祖细胞的分子特征，以改善肌腱损伤后的功能恢复 | 小鼠跟腱细胞，特别是肌腱干细胞/祖细胞 | 单细胞组学 | 肌腱和韧带损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 2周和6周龄小鼠的跟腱细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 2942 | 2026-02-05 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-05-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
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研究论文 | 本研究通过工程化改造疱疹病毒蛋白TIP，使其能够招募LCK激酶直接激活T细胞中的STAT5蛋白，从而在无细胞因子的情况下维持CD8+ T细胞的存活和功能，并增强其在实体瘤中的抗肿瘤效果 | 首次利用工程化的病毒蛋白TIP作为平台，强制招募LCK激酶至STAT蛋白，实现了细胞因子非依赖性的靶向STAT激活，并重编程了T细胞内的信号通路 | 研究主要基于体外和动物模型，其临床转化效果和长期安全性尚未在人体中得到验证 | 旨在克服T细胞疗法中因JAK-STAT信号失调导致的功能受损问题，增强T细胞在实体瘤中的持久性和功能性 | 工程化病毒蛋白TIP、LCK激酶、STAT5蛋白、CD8+ T细胞、实体瘤模型 | 免疫工程、合成生物学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质工程、体内肿瘤模型 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 2943 | 2026-02-05 |
A comprehensive analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq unveils B cell immune suppression in the AAV-loaded brain
2025-Mar-05, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09609-6
PMID:40044925
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，结合孟德尔随机化分析，揭示了XBP1蛋白通过MDK-NCL配体-受体对及相关基因介导大脑中B细胞免疫抑制的潜在机制 | 首次利用scRNA-seq和RNA-seq数据结合孟德尔随机化分析，识别出XBP1在AAV载体诱导的大脑B细胞免疫抑制中的关键作用，并揭示了MDK-NCL配体-受体对的介导途径 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏体内或体外实验验证，且免疫抑制机制的具体调控网络和通路仍需进一步探索 | 探究AAV载体在大脑中引发的免疫反应，特别是B细胞免疫抑制的机制，以优化脑部基因治疗策略 | AAV载体处理的大脑组织，重点关注免疫细胞（如B细胞、小胶质细胞）及其转录组变化 | 生物信息学 | 神经疾病 | scRNA-seq, RNA-seq, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2944 | 2026-02-05 |
A Temporal and Spatial Atlas of Adaptive Immune Responses in the Lymph Node Following Viral Infection
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.635509
PMID:39975238
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为AIR-SPACE的整合方法，结合高分辨率空间转录组学与配对的高保真长读长T/B细胞受体测序，用于解析病毒感染后淋巴结内适应性免疫应答的时空动态 | 开发了AIR-SPACE这一创新方法，首次实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库，并构建了病毒感染后淋巴结适应性免疫应答的全面时空图谱 | 研究目前仅应用于小鼠模型和痘苗病毒感染场景，尚未在人类样本或其他病原体感染中得到验证 | 解析病毒感染后淋巴结内适应性免疫应答的时空动态和组织结构 | 小鼠腘窝淋巴结在痘苗病毒感染后的适应性免疫细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学，长读长测序，T/B细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据，受体序列数据 | 五个不同时间点的小鼠腘窝淋巴结样本 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 2945 | 2026-02-05 |
Frizzled5 controls murine intestinal epithelial cell plasticity through organization of chromatin accessibility
2025-02-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.10.021
PMID:39579769
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研究论文 | 本研究揭示了Frizzled5（Fzd5）作为Wnt通路受体，通过调控染色质可及性来控制小鼠肠道上皮细胞的可塑性，影响干细胞自我更新和谱系生成 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，阐明Fzd5通过组织染色质可及性来调控肠道上皮细胞命运，特别是在干细胞和祖细胞中 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本或临床验证，且机制细节仍需进一步探索 | 探究Fzd5在肠道上皮细胞可塑性中的调控作用 | 小鼠肠道上皮细胞，包括Lgr5标记的肠道干细胞和Krt19标记的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2946 | 2026-02-05 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌的RNA-seq数据，探讨HPV整合对临床预后的影响，并识别相关生物标志物 | 首次基于RNA特征（如HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例）对HPV整合阳性患者进行分类，并揭示其与较差临床结局的关联 | 研究主要依赖RNA数据，DNA整合事件仅来自部分队列，可能未全面覆盖所有整合模式 | 探究HPV整合在头颈癌中的致癌机制及其与临床预后的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 261个HPV相关HNSCC样本（包括bulk和单细胞RNA-seq）及102名HPV阳性参与者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2947 | 2026-02-05 |
The role of mitophagy-related genes in prognosis and immunotherapy of cutaneous melanoma: a comprehensive analysis based on single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Jan-11, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09593-x
PMID:39799269
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，阐明了线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫治疗中的作用，并开发了一个预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，构建了一个基于线粒体自噬相关基因的皮肤黑色素瘤预后模型，并揭示了其与免疫微环境及治疗响应的关联 | 研究依赖于公开数据库数据，未进行大规模独立临床队列验证，且模型在外部验证中的泛化能力有待进一步确认 | 阐明线粒体自噬相关基因在皮肤黑色素瘤中的作用，并开发预后预测模型 | 皮肤黑色素瘤患者的数据及细胞系 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | 多种机器学习算法（包括但不限于ssGSEA, WGCNA） | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据，临床数据 | 未明确指定样本数量，但使用了公开数据库中的皮肤黑色素瘤数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2948 | 2026-02-05 |
A novel tumor-progressing fibroblast signature derived from single-cell RNA sequencing enables prognostic stratification and reveals RNF11 as a functional regulator in bladder cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1722809
PMID:41624768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱癌中的癌症相关成纤维细胞，构建了一个基于四个基因的肿瘤进展成纤维细胞风险评分模型，用于预后分层，并验证了RNF11在膀胱癌进展中的功能调节作用 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组学数据，构建了一个新的CAF相关预后模型（TPFR），并首次在膀胱癌中功能验证了RNF11作为肿瘤进展调节因子的作用 | 研究样本量相对有限（单细胞数据来自8名患者），且模型验证主要依赖于回顾性队列，需要在前瞻性临床队列中进一步验证 | 开发一个基于癌症相关成纤维细胞分子特征的预后分层模型，以改善膀胱癌患者的风险预测和精准医疗策略 | 膀胱癌患者、膀胱癌细胞系（T24和5637） | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、shRNA敲低、增殖/迁移/侵袭实验、转录组分析 | 非负矩阵分解共识聚类、LASSO-Cox回归、逐步选择模型 | 单细胞RNA测序数据、批量转录组数据 | 单细胞数据：8名BLCA患者；训练队列：359个TCGA-BLCA样本；验证队列：476个E-MTAB-4321样本；细胞实验：T24和5637膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2949 | 2026-02-05 |
Single-cell transcriptomics reveals mechanisms of Galt gene editing-induced liver injury involving HGF-VEGF-mediated intercellular signaling in mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1729321
PMID:41624789
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研究论文 | 本研究通过构建Galt基因编辑小鼠模型，利用单细胞转录组学揭示了Galt基因编辑诱导肝损伤的分子机制，涉及HGF-VEGF介导的细胞间信号传导 | 首次结合CRISPR/Cas9基因编辑技术与单细胞转录组学分析，系统阐明了Galt基因缺陷通过HGF和VEGF信号通路增强导致肝细胞水肿和肝损伤的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本或临床环境中验证，且机制研究仍处于探索阶段，需要进一步功能实验确认 | 阐明Galt基因编辑诱导肝损伤的分子机制，为半乳糖血症的发病机制提供新见解 | Galt基因编辑小鼠（GAL小鼠）模型 | 单细胞转录组学 | 半乳糖血症 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞RNA-seq，qRT-PCR，Western blotting，H&E染色 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据，基因表达数据，组织病理学图像 | 未明确指定样本数量，但基于GAL小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2950 | 2026-02-05 |
Adiponectin receptor T-cadherin emerges as a novel regulator of adipose stem cell quiescence and adipogenesis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1734183
PMID:41624791
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析揭示了T-cadherin在脂肪干细胞静息和脂肪生成中的调控作用 | 首次将T-cadherin鉴定为脂肪干细胞中一个具有干细胞特性的独特亚群的调控因子，并阐明其通过DPP4维持干细胞状态的新机制 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证T-cadherin的功能；样本来源仅限于人类皮下脂肪组织 | 探究脂肪组织细胞和间充质干细胞的异质性，特别是T-cadherin在脂肪干细胞静息和脂肪生成中的调控作用 | 人类皮下脂肪组织来源的间充质干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 慢病毒转导, 长期活细胞成像, 脂肪生成分化实验 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确样本数量的人类皮下脂肪组织来源MSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2951 | 2026-02-05 |
Commentary: Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1697007
PMID:41624841
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2952 | 2026-02-05 |
Unveiling the IL-1β/CXCL2 axis: a shared therapeutic target in periodontitis and inflammatory bowel disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728773
PMID:41624856
|
研究论文 | 本研究通过整合牙周炎和炎症性肠病的转录组数据，揭示了IL-1β/CXCL2轴作为两种疾病共有的炎症治疗靶点 | 首次整合牙周炎和炎症性肠病的批量与单细胞RNA-seq数据，识别出跨疾病的髓系细胞为中心的IL-1β/趋化因子炎症程序，并验证了IL-1β-CXCL2通路作为潜在治疗靶点 | 功能阻断研究尚未进行，需要进一步实验验证治疗因果关系 | 揭示牙周炎与炎症性肠病之间共享的细胞和分子机制，以寻找共同的治疗靶点 | 牙周炎患者和炎症性肠病患者的转录组数据，以及双炎症啮齿动物模型 | 生物信息学 | 牙周炎和炎症性肠病 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 两个牙周炎队列（GSE16134和GSE10334），18个炎症性肠病样本的51,322个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2953 | 2026-02-05 |
Commentary: Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1752400
PMID:41624851
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2954 | 2026-02-05 |
Decoding thymic development: a single-cell atlas of tree shrew immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689906
PMID:41624883
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了树鼩出生后胸腺发育的全面细胞图谱，揭示了其免疫系统在物种间的保守性与特异性 | 首次通过单细胞RNA测序构建树鼩胸腺发育的细胞图谱，并识别出如ZNF683基因在CD8aa细胞发育后期表达等物种特异性变异 | 研究主要关注胸腺细胞，可能未全面覆盖树鼩整个免疫系统的复杂性；样本年龄范围可能限制了对发育全阶段的理解 | 解析树鼩作为临床前哺乳动物模型的免疫系统，特别是胸腺发育过程 | 树鼩的出生后胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及年轻和年老树鼩的胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2955 | 2026-02-05 |
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns of vulnerability to pathology in a transgenic α-synucleinopathy model
2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.31.606032
PMID:39372781
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研究论文 | 本研究利用成像空间转录组学技术，结合免疫荧光分析，在转基因α-突触核蛋白病小鼠模型中揭示了特定神经元亚型对病理的易感性及其分子机制 | 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合，在同一组织切片中识别出易受α-突触核蛋白磷酸化病理影响的神经元亚型，并揭示了相关转录调控机制 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类疾病的所有特征，且样本量未明确说明 | 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白病理选择性易感性的分子基础 | 转基因过表达人类α-突触核蛋白的小鼠模型中的皮层和海马神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 成像空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2956 | 2026-02-05 |
Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer
2024-06-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278565.123
PMID:38777607
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研究论文 | 本研究利用ATAC-seq和RNA-seq数据，通过机器学习方法识别了胃癌中驱动间质和纤维化调控程序的关键转录因子，特别是RUNX/AP-1的激活 | 开发了一种基于ATAC-seq数据的机器学习方法，首次系统性地确定了胃癌中间质和上皮状态的转录因子驱动者，并揭示了拷贝数变异如何影响这些转录因子的失调 | NA | 探究胃癌中间质表型的调控机制，识别驱动胃癌异质性和进展的关键转录因子 | 胃癌细胞系和原发性肿瘤样本 | 机器学习 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq | 机器学习方法 | 基因组和转录组数据 | NA | NA | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2957 | 2026-02-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scSNViz的R语言工具集，用于可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | scSNViz是首个提供3D sceSNV可视化功能、兼容主流scRNA-seq处理工具（如Seurat、SingleR、scType）并支持轨迹推断（如Slingshot）的综合性工具集，填补了单细胞水平遗传变异分析工具的空缺 | 工具依赖于R环境，可能对非编程用户有一定学习曲线，且未提及处理大规模数据时的性能优化 | 开发一个用户友好的工具集，以可视化和分析单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异，促进对细胞异质性、克隆进化和基因表达调控的理解 | 单细胞RNA测序数据中的细胞特异性表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2958 | 2026-02-05 |
β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice
2024-Mar, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894
PMID:38311286
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研究论文 | 本研究探讨了Jagged1在肥胖小鼠胰岛Notch信号通路中的作用及其对胰岛素分泌缺陷的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和遗传学模型，揭示了β细胞Jagged1在肥胖诱导的Notch信号激活中的充分性而非必要性 | 遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的主要来源，限制了靶向β细胞Jagged1的治疗潜力 | 研究肥胖小鼠中β细胞Jagged1表达是否决定Notch信号异常及胰岛素分泌缺陷 | 高脂饮食或瘦素受体缺陷小鼠、2型糖尿病患者胰岛、诱导性β细胞特异性Jagged1转基因和功能缺失小鼠 | 糖尿病研究 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、葡萄糖耐量测试、葡萄糖刺激胰岛素分泌测定 | 转基因小鼠模型、功能缺失模型 | 基因表达数据、生理功能数据 | 未明确样本数量，但涉及多种小鼠模型和人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2959 | 2026-02-05 |
Spatially distinct molecular patterns of gene expression in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Nov-17, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02572-6
PMID:37978501
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了特发性肺纤维化（IPF）肺部不同病理区域（如正常外观肺实质、过渡区和致密纤维化区）在基因表达上的空间特异性分子模式 | 首次在IPF中应用空间转录组学平台（GeoMx Nanostring Digital Spatial Profiling）对FFPE组织进行高分辨率空间分析，比较了不同病理区域的转录组差异，并发现了组织学正常外观区域已存在显著的转录组改变 | 研究样本量相对有限（32例IPF和12例对照），且为横断面研究，无法确定观察到的转录组变化与疾病进展的因果关系 | 阐明IPF肺部不同病理区域之间的转录组差异，以理解纤维化肺病的分布和程度，并识别潜在的治疗靶点 | 特发性肺纤维化（IPF）患者和对照者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 32例IPF患者和12例对照者，共鉴定出231个感兴趣区域（ROIs） | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx Nanostring Digital Spatial Profiling平台，用于FFPE组织的空间转录组分析 |
| 2960 | 2026-02-05 |
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00785-7
PMID:37079217
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研究论文 | 本研究通过生物材料纤维化模型开发了体内衰老特征，并利用迁移学习识别了跨物种和多种病理中的衰老细胞异质性及其在血管化和基质生产中的作用 | 开发了体内来源的衰老特征（SenSig），并应用迁移学习在多种病理的单细胞RNA测序数据中识别衰老细胞，揭示了IL34-CSF1R-TGFβR信号轴介导的衰老细胞与髓系细胞间的串扰 | NA | 识别体内衰老细胞的表型异质性及其在组织修复和病理过程中的作用 | 小鼠和人类单细胞RNA测序数据集，涵盖多种病理状态 | 数字病理学 | 组织纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 迁移学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |