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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2921 | 2026-03-13 |
[Research progress of single-cell sequencing technology in liver diseases]
2023-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的进展 | 总结了单细胞测序作为一种新兴测序方法在揭示肝脏疾病复杂机制方面的应用潜力 | NA | 综述单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的应用进展 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2922 | 2026-03-13 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用,并探讨了其潜在的临床应用前景 | 系统性地回顾了scRNA-seq技术如何革新对肿瘤微环境中细胞间相互作用、通讯以及瘤内遗传异质性的理解,并展望了新的癌症治疗策略 | 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 | 理解肿瘤异质性、克隆起源、进展、干性及耐药性,并探索单细胞测序技术在肿瘤研究和临床治疗中的应用 | 肿瘤微环境中的细胞(包括肿瘤细胞和免疫细胞)及其基因表达模式 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2923 | 2026-03-13 |
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
|
综述 | 本文综述了肝癌精准治疗的研究前沿,包括新型生物标志物、影像学技术、分子靶向疗法、免疫疗法以及多组学分析等进展 | 整合了单细胞测序、基因组编辑和创新药物研发等技术创新,为肝癌生物学理解和治疗提供了新的视角和机会 | 肝癌具有高度异质性和治疗抵抗性,对疾病生物学的深入理解和新型疗法仍是未满足的医疗需求 | 探讨肝癌精准治疗的研究前沿,旨在促进早期管理、手术精准化和患者生存率的提升 | 肝细胞癌(HCC) | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、基因组编辑、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2924 | 2026-03-13 |
Ageing affects DNA methylation drift and transcriptional cell-to-cell variability in mouse muscle stem cells
2019-09-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12293-4
PMID:31554804
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析,探讨了小鼠肌肉干细胞在衰老过程中DNA甲基化漂移和转录细胞间变异性的变化 | 首次结合单细胞转录组和DNA甲基化组分析,揭示了衰老干细胞中DNA甲基化异质性与转录异质性之间的关联,并关联到DNA甲基化时钟机制 | 研究仅针对小鼠肌肉干细胞,结果可能不直接适用于其他物种或组织类型,且样本量相对有限 | 探究衰老对干细胞分子多样性的影响,特别是DNA甲基化漂移和转录变异性的关系 | 小鼠肌肉干细胞 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序, DNA甲基化测序 | NA | 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 | 未明确指定样本数量,但涉及年轻和衰老小鼠的肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞甲基化组学 | NA | NA |
| 2925 | 2026-03-12 |
PAICS mediates DNA damage and cerebellar neuronal loss in C9orf72 amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-11, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awag092
PMID:41810938
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研究论文 | 本研究揭示了PAICS在C9orf72基因突变导致的肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)中,通过介导DNA损伤和小脑神经元丢失,扮演关键致病角色 | 首次在体内证明C9orf72功能丧失导致小脑萎缩和神经元丢失,并通过单细胞转录组学发现purine生物合成基因paics的下调,进一步验证PAICS在人类ALS患者中的表达减少,以及恢复paics表达可缓解DNA损伤和神经元丢失 | 研究主要基于斑马鱼模型和人类组织样本,可能无法完全模拟人类疾病的复杂性,且治疗潜力需进一步临床验证 | 探究C9orf72基因突变在ALS/FTD中导致小脑退化的分子机制 | 斑马鱼模型、人类死后小脑组织切片、iPSC来源的运动神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞转录组学、基因敲除、免疫组织化学 | 斑马鱼模型 | 转录组数据、组织图像 | 斑马鱼大脑、人类小脑切片、iPSC衍生神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2926 | 2026-03-12 |
Nav1.5 in the dorsal root ganglion plays a crucial role in mechanical hypersensitivity
2026-Mar-11, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf438
PMID:41810945
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研究论文 | 本研究揭示了传统上被认为是心脏钠通道的Nav1.5在背根神经节的髓鞘化TrkB阳性A纤维神经元中高表达,是机械性痛觉过敏的关键调节因子 | 首次将Nav1.5(传统心脏钠通道)确定为体感系统中机械敏感性的主要决定因素,并阐明其在神经病理性痛和内脏痛模型机械性痛觉过敏中的关键作用 | NA | 探究Nav1.5在背根神经节中对机械性痛觉过敏的调控作用 | 背根神经节(DRG)中的TrkB阳性A纤维神经元 | 神经科学 | 疼痛(神经病理性痛、内脏痛) | 免疫染色、单细胞RNA测序、条件性基因敲除 | NA | 图像数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2927 | 2026-03-11 |
Osteolineage cells ablation promotes skin aging phenotypes via dysregulated bone marrow macrophages
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114888
PMID:41797915
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了骨系细胞消融如何通过改变骨髓巨噬细胞功能,导致皮肤老化表型,从而建立骨骼-免疫-皮肤轴的联系 | 首次发现骨系细胞消融通过诱导骨髓巨噬细胞功能障碍,进而引发皮肤老化,揭示了骨骼在调节外周组织老化中的因果作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;骨系细胞消融的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究骨骼在皮肤老化调控中的因果作用 | 骨系细胞、骨髓巨噬细胞、皮肤组织 | 单细胞测序 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2928 | 2026-03-11 |
Association between elevated expression of GDF15/GFRAL and sarcopenia risk
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115023
PMID:41797911
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研究论文 | 本研究探讨了GDF15及其受体GFRAL表达升高与肌少症风险之间的关联 | 首次在人群研究中揭示了GDF15/GFRAL轴与肌少症风险的关联,并发现GFRAL对女性的危害更大,同时通过动物模型单细胞测序和免疫组化提供了补充证据 | 研究为观察性关联研究,未来需要机制研究阐明其在肌少症中的具体作用 | 探究GDF15/GFRAL轴与肌少症风险的关系 | 英国白人和中国参与者,以及动物模型 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学分析 | NA | 血清水平数据,测序数据,图像数据 | 包含英国白人和中国参与者的人群队列,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2929 | 2026-03-11 |
Noncanonical function of sphingosine kinase 2 (SPHK2) sustains hepatic triglyceride homeostasis
2026-Mar-10, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70397
PMID:41804573
|
研究论文 | 本研究揭示了SPHK2通过非经典机制抑制ATGL泛素化并促进甘油三酯水解,从而减轻肝脏脂肪变性,为MASLD提供了潜在治疗靶点 | 首次阐明SPHK2的非酶催化功能在肝脏脂肪变性中的作用机制,特别是其通过稳定ATGL来调节甘油三酯水解 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究,且具体信号通路细节可能未完全阐明 | 阐明SPHK2在肝脏脂肪变性中的非经典作用机制及其对MASLD的治疗潜力 | 小鼠肝细胞、MASLD患者和小鼠的肝脏组织 | 代谢疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组测序、免疫沉淀-质谱分析、多组学整合分析 | 基因敲除和过表达小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质互作数据 | 未明确指定具体样本数量,涉及MASLD患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2930 | 2026-03-11 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals FLS2-Dependent Hypoxia Signaling and ERF13-Mediated Transcription During flg22-Triggered Immunity
2026-Mar-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516380
PMID:41802127
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了拟南芥中flg22触发的免疫反应,包括FLS2依赖的缺氧信号传导和ERF13介导的转录调控 | 首次在单细胞水平系统绘制了flg22诱导的免疫反应图谱,揭示了免疫与缺氧信号通路之间的交叉对话,并鉴定出ERF13作为平衡免疫与生长的核心调控因子 | 研究主要基于拟南芥模型,结果在其他植物物种中的普适性有待验证;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞类型的低丰度转录本 | 探究flg22触发的免疫反应在细胞类型特异性层面的调控机制 | 拟南芥(Arabidopsis)的野生型及多种突变体(fls2, ate1, prt6, zpr2, erf13, sim smr, e2fabc, cpr5) | 植物免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,遗传学分析,表型分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及拟南芥多种基因型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2931 | 2026-03-11 |
Single Cell RNA Transcriptomics of Mantle Cell Lymphoma Reveals the Presence of Treatment-Resistant Subclones at the Time of Diagnosis
2026-Mar-09, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70270
PMID:41802856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析套细胞淋巴瘤的诊断和首次复发配对样本,揭示了诊断时即存在治疗耐药亚克隆,并阐明了惰性MCL中空间限制性克隆进化驱动疾病进展的机制 | 首次在套细胞淋巴瘤中通过单细胞RNA测序结合拷贝数变异推断,证明早期复发源于诊断时已存在的治疗耐药亚克隆,并揭示了惰性MCL中不同解剖部位存在分子特征迥异的克隆进化 | 样本量有限,且主要基于转录组和拷贝数变异分析,未整合其他组学数据(如全基因组测序)以全面刻画克隆进化 | 探究套细胞淋巴瘤早期复发的克隆动力学及治疗耐药性的起源 | 套细胞淋巴瘤患者的配对肿瘤样本(诊断时和首次复发时) | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多例MCL患者的配对肿瘤样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2932 | 2026-03-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals population-based shifts in gene expression heterogeneity in an unstable, clonally derived CHO cell line
2026-Mar-09, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.88502
PMID:41803018
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了稳定与不稳定CHO细胞系在基因表达异质性方面的变化,揭示了克隆群体内异质性对细胞系稳定性的影响 | 首次在克隆来源的CHO细胞培养中,利用单细胞RNA测序技术,系统评估了基因表达异质性随时间的变化,并关联了细胞系不稳定性与代谢通路活性的改变 | 研究仅针对特定CHO细胞系和单克隆抗体表达系统,结果可能不适用于其他细胞类型或表达体系,且样本时间点有限 | 探究CHO细胞系在长期培养过程中基因表达异质性的变化,以理解细胞系不稳定性的生物学机制 | 稳定和不稳定的CHO细胞系,这些细胞系表达相同的单克隆抗体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 稳定和不稳定CHO细胞系在早期和晚期时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2933 | 2026-03-11 |
Non-Invasive Assessment of Complete Regression in Endometrial Cancer Patients Undergoing Fertility Preservation Using MRI-Based Radiomics and Immune Heterogeneity
2026-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70666
PMID:41799934
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研究论文 | 本研究开发了一种基于MRI影像组学和免疫异质性的非侵入性工具,用于预测接受生育力保留治疗的子宫内膜癌患者的完全缓解情况 | 首次将MRI影像组学特征与单细胞RNA测序、批量RNA测序的分子谱分析相结合,构建了预测完全缓解的影像组学-临床列线图,并揭示了高评分组肿瘤微环境的免疫抑制和代谢活跃特征 | 研究为回顾性设计,样本量相对有限(146例患者),需要前瞻性多中心研究进一步验证 | 开发非侵入性工具以预测子宫内膜不典型增生或早期子宫内膜癌患者接受生育力保留治疗后的完全缓解结局 | 被诊断为子宫内膜不典型增生或早期子宫内膜癌并接受生育力保留治疗的年轻女性患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | MRI影像组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习 | 机器学习模型(具体模型未明确说明),列线图 | 医学影像(MRI),基因表达数据 | 146例患者 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2934 | 2026-03-11 |
Generalized SIMEX Method: Polynomial Approximation for Extrapolation
2026-Mar, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70460
PMID:41804018
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研究论文 | 本文提出了一种广义的SIMEX方法(GSIMEX),通过使用高阶多项式函数作为外推函数来处理严重的测量误差问题 | 扩展了传统的SIMEX方法,采用高阶多项式函数来近似未知的非线性外推函数,并集成了子集选择和模型平均策略以提高估计精度 | 未在摘要中明确说明 | 解决统计分析中测量误差导致的参数估计偏差问题,特别是在误差严重的情况下 | 测量误差模型、参数估计方法 | 机器学习 | NA | 模拟外推法(SIMEX)、多项式近似、子集选择、模型平均 | 多项式回归模型 | 模拟数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2935 | 2026-03-11 |
Investigating the Role of MicroRNAs in Mesenchymal Stem Cell Osteogenic Differentiation
2026-Mar, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70724
PMID:41805079
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综述 | 本文综述了microRNAs在间充质干细胞成骨分化中的调控作用及其在骨质疏松等骨骼疾病中的临床意义 | 系统整合了miRNA调控骨重塑的分子机制与临床转化应用,并展望了单细胞RNA测序等新技术在骨再生领域的应用前景 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 | 阐明miRNA在间充质干细胞成骨分化中的调控网络及其在骨骼疾病诊疗中的应用潜力 | 间充质干细胞、成骨细胞、microRNAs | 分子生物学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2936 | 2026-03-11 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Dynamic Cellular Interactions and Molecular Mechanisms in Myocardial Infarction Recovery
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/4888573
PMID:41798077
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了心肌梗死后恢复过程中的动态细胞相互作用和分子机制 | 在单细胞分辨率下全面描绘了心肌梗死后细胞和分子动态的全景图,识别了关键细胞通信网络和调控基因,为心脏修复治疗策略提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证尚需进一步研究 | 探究心肌梗死后修复和重塑过程中的细胞异质性、时间动态及分子机制 | 心肌梗死后不同时间点的心脏组织,包括基因敲除组和健康对照组 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP, t-SNE, 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括不同时间点、基因敲除和健康对照组的心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2937 | 2026-03-11 |
Alveolar echinococcosis drives functional reprogramming of hepatic CD8+ T cells
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1747682
PMID:41798755
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研究论文 | 本研究通过建立继发性泡型包虫病小鼠模型,利用单细胞RNA测序等技术,揭示了肝脏CD8+ T细胞在感染过程中的功能重编程和谱系多样化 | 首次在泡型包虫病中系统描绘了肝脏CD8+ T细胞从急性炎症到慢性免疫调控的动态转录重编程过程,并发现了DC-T细胞相互作用的Thy1-Adgre5轴 | 研究基于小鼠模型,人体内的免疫反应可能存在差异;单细胞测序样本仅包含两个时间点 | 阐明泡型包虫病感染过程中肝脏T细胞亚群的组成变化、转录程序及其与树突状细胞的相互作用 | C57BL/6小鼠肝脏组织中的免疫细胞(特别是CD8+ T细胞和树突状细胞) | 单细胞组学 | 寄生虫感染(泡型包虫病) | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,空间成像数据 | 78,290个高质量细胞(来自感染后3天和3个月的小鼠肝脏) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2938 | 2026-03-11 |
Multimodal Spatial Transcriptomics Reveals the Developing Human Liver Niche at Single-Cell Resolution
2026, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2026.100893
PMID:41798887
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术,在单细胞分辨率下揭示了人类发育期肝脏微环境的多模态特征 | 首次在人类发育关键窗口期(第三孕期快速增长前)应用单细胞分辨率空间分子成像技术,同时结合组织学验证,解析肝脏作为主要造血器官时的独特微环境 | 研究仅基于9个FFPE样本,样本量有限;研究聚焦特定发育阶段,未覆盖完整发育轨迹 | 解析人类发育期肝脏微环境的细胞组成、空间组织和功能特征 | 人类发育期肝脏组织(第三孕期前) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析、单细胞转录组分析、多重RNA荧光单分子原位杂交 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 | 9个福尔马林固定石蜡包埋的人类发育期肝脏样本 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | 单细胞分辨率空间分子成像技术 |
| 2939 | 2026-03-11 |
Neuroimmunological Mechanisms of Xiao-Yao-San Against Chronic Stress-Induced Colorectal Cancer: A Bioinformatics and Single-Cell Sequencing Study
2026, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S567746
PMID:41798904
|
研究论文 | 本研究整合生物信息学、网络药理学和单细胞测序技术,探索中药逍遥散通过调节神经递质相关受体基因来改善慢性应激诱导的结直肠癌进展的潜在神经免疫机制 | 首次将生物信息学、网络药理学、分子对接与单细胞转录组测序相结合,系统研究中药复方逍遥散在慢性应激结直肠癌模型中的神经免疫调节机制,并识别出关键神经递质受体基因 | 研究主要基于动物模型和生物信息学预测,临床转化仍需进一步验证;单细胞测序样本量有限;网络药理学预测的靶点需要更多实验证实 | 探索逍遥散改善慢性应激诱导结直肠癌进展的神经免疫机制 | 结直肠癌患者转录组数据、逍遥散活性成分、慢性不可预知温和应激结合原位结直肠癌移植小鼠模型 | 生物信息学、单细胞测序 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、质谱分析 | 网络药理学模型、分子对接模型、动物疾病模型 | 转录组数据、质谱数据、单细胞转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者转录组数据;建立慢性应激结直肠癌小鼠模型并进行单细胞测序分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序平台 |
| 2940 | 2026-03-11 |
Mechanisms inducing differentiation of adult islet progenitor-like cells into functional islet-like organoids
2026, Frontiers in transplantation
DOI:10.3389/frtra.2026.1740314
PMID:41798991
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研究论文 | 本研究揭示了诱导成人胰岛祖样细胞分化为功能性胰岛样类器官的分子和表观遗传机制 | 首次在成人胰腺组织中鉴定出CD9+ PROCR+ RGS16+的胰岛祖样细胞亚群,并阐明了小分子ISX9通过钙依赖性染色质重塑(NFAT募集p300并置换HDAC1-3)诱导RFX6和NEUROD1表达的分化机制 | 研究基于供体组织样本,样本来源和数量可能受限;体外分化体系与体内生理环境的差异未充分探讨 | 阐明成人胰腺组织中具有再生潜能的细胞群扩增和分化为内分泌谱系的分子机制 | 成人供体胰腺组织中的胰岛祖样细胞 | 再生医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、功能测定数据 | 成人供体胰腺组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |