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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2921 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179067
PMID:38329132
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2922 | 2025-10-06 |
The BCL-2 inhibitor APG-2575 resets tumor-associated macrophages toward the M1 phenotype, promoting a favorable response to anti-PD-1 therapy via NLRP3 activation
2024-01, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01112-y
PMID:38062129
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研究论文 | 本研究揭示BCL-2抑制剂APG-2575通过激活NLRP3信号通路将肿瘤相关巨噬细胞重编程为M1表型,从而增强抗PD-1疗法的疗效 | 首次发现APG-2575能直接结合NF-κB p65激活NLRP3信号通路,介导巨噬细胞表型转化并增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证数据有限,需进一步人体试验确认 | 探索BCL-2抑制剂与免疫检查点抑制剂联合治疗的协同作用机制 | 同系和人源化CD34+小鼠模型及患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠模型和患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2923 | 2025-10-06 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
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研究论文 | 本研究通过过表达Plk1诱导染色体不稳定性,揭示了其在乳腺癌中通过激活SASP、上调PD-L1和CD206以及诱导NF-κβ信号通路促进免疫逃逸的机制 | 首次系统阐明Plk1诱导的慢性染色体不稳定性通过多通路协同作用导致乳腺癌免疫抑制的完整机制 | 研究主要基于Her2乳腺癌模型,在其他亚型中的普适性需进一步验证 | 探究染色体不稳定性相关分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型和人类乳腺癌肿瘤 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 前病变乳腺组织和人类乳腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2924 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2023-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171417
PMID:38063198
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示痛风发作期与缓解期单核细胞和调节性T细胞的差异 | 首次在单细胞水平系统揭示痛风发作期HLA-DQA1+非经典单核细胞上调及Tregs在缓解期的关键抑制作用 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究痛风发作与缓解期间免疫细胞变化机制 | 痛风患者的免疫细胞(单核细胞亚群和调节性T细胞) | 单细胞组学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含独立验证队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2925 | 2025-10-06 |
The Novel Checkpoint Target Lymphocyte-Activation Gene 3 Is Highly Expressed in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2023-12-01, Dermatologic surgery : official publication for American Society for Dermatologic Surgery [et al.]
IF:2.5Q1
DOI:10.1097/DSS.0000000000004006
PMID:37962130
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研究论文 | 本研究首次系统分析了淋巴细胞激活基因3(LAG-3)在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式 | 首次发现LAG-3在cSCC浸润淋巴细胞中的表达高于PD-1,并量化了LAG-3 mRNA在不同类型cSCC中的差异表达 | 样本量较小(仅3个SCC肿瘤),需要更大规模研究验证 | 明确LAG-3在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 皮肤鳞状细胞癌组织样本及正常皮肤组织 | 肿瘤免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, NanoString技术 | NA | 基因表达数据, mRNA表达数据 | 3个SCC肿瘤样本及正常皮肤对照 | NanoString | 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | NanoString nCounter | NanoString nCounter基因表达分析系统 |
2926 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and bulk RNA data reveal the tumor microenvironment infiltration characteristics of disulfidptosis related genes in breast cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05109-y
PMID:37428249
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研究论文 | 本研究通过整合乳腺癌单细胞测序和bulk RNA数据,揭示了双硫死亡相关基因在肿瘤微环境中的浸润特征并构建了风险预测模型 | 首次将新发现的细胞死亡方式双硫死亡与乳腺癌免疫治疗响应相关联,并识别出TNFRSF14作为关键调控基因 | 研究基于生物信息学分析,需要进一步实验验证双硫死亡与免疫治疗协同作用的机制 | 探索双硫死亡相关基因在乳腺癌中的预后价值及其在免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者样本数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA测序, hdWGCNA, WGCNA, LASSO分析 | Cox比例风险模型, LASSO回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2927 | 2025-10-06 |
TPL2 kinase activity regulates microglial inflammatory responses and promotes neurodegeneration in tauopathy mice
2023-08-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83451
PMID:37555828
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研究论文 | 本研究探讨TPL2激酶活性在小胶质细胞炎症反应中的作用及其在神经退行性疾病中的影响 | 首次揭示TPL2激酶活性通过调节小胶质细胞活化状态促进tau蛋白病变模型中的神经退行性过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究TPL2激酶在神经炎症和神经退行性疾病中的作用机制 | 小鼠小胶质细胞、神经元及tau蛋白病变模型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2928 | 2025-10-06 |
Phylogenetic inference from single-cell RNA-seq data
2023-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39995-6
PMID:37553438
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研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据重建癌细胞系统发育关系并关联基因表达谱的方法 | 提出PhylinSic方法,首次实现从单细胞RNA测序数据同时推断系统发育关系并关联细胞表型 | NA | 重建癌症进化过程,理解肿瘤恶性特性的获得机制 | 乳腺癌肿瘤细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2929 | 2025-10-06 |
Core conserved transcriptional regulatory networks define the invasive trophoblast cell lineage
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201826
PMID:37417811
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了大鼠和人类侵袭性滋养层细胞谱系中保守的转录调控网络 | 首次在大鼠妊娠期子宫-胎盘界面生成单核ATAC-seq数据并与单细胞RNA-seq数据整合分析,发现了侵袭性滋养层细胞中保守的基因调控网络 | 对大鼠和人类调控机制异同的理解仍有限,需要进一步验证 | 研究大鼠和人类侵袭性滋养层细胞调控机制的相似性和差异性 | 大鼠妊娠期子宫-胎盘界面组织 | 单细胞组学 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组可及性数据, 转录组数据 | 妊娠期15.5天和19.5天的大鼠子宫-胎盘界面组织 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2930 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 本研究通过分析右心衰竭患者的循环炎症标志物,揭示了其独特的炎症特征并发现CD163和CXCL12可作为预后生物标志物 | 首次系统揭示右心衰竭患者特有的循环炎症特征,发现可溶性CD163和CXCL12作为新型预后生物标志物,并证实这些因子可能来源于肝脏库普弗细胞 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚不充分,需要进一步实验验证心脏-肝脏轴的具体作用机制 | 阐明右心衰竭患者的循环炎症环境特征及其与预后的关系 | 右心衰竭患者、心功能正常对照者、非典型心衰患者 | 心血管疾病研究 | 右心衰竭 | 多重蛋白检测、单细胞RNA测序、组织成像 | NA | 血液样本、基因表达数据、组织图像 | 三组患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 多重蛋白检测, 组织成像 | NA | NA |
2931 | 2025-10-06 |
Exploring Influenza A Virus-Induced Lung Injury and Immune Response Based on Humanized Lung-on-Chip
2023-08, Discovery medicine..
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335177.55
PMID:37553308
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研究论文 | 本研究通过构建人源化肺芯片模型模拟甲型流感病毒感染过程,分析外周血单核细胞的转录组特征 | 结合肺芯片模型与单细胞RNA测序技术,首次在体外真实模拟肺泡结构功能并系统研究流感病毒感染后的免疫反应机制 | 体外芯片模型可能无法完全模拟体内复杂生理环境,样本规模有限 | 系统分析甲型流感病毒感染后外周血单核细胞的转录组特征及免疫反应机制 | 肺泡上皮细胞、血管内皮细胞、肺泡巨噬细胞和外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞生物学 | 流感 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2932 | 2025-10-06 |
High EVI1 and PARP1 expression as favourable prognostic markers in high-grade serous ovarian carcinoma
2023-Jul-31, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-023-01239-6
PMID:37525239
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研究论文 | 本研究探讨EVI1和PARP1蛋白表达作为高级别浆液性卵巢癌预后标志物的价值 | 首次发现EVI1和PARP1共同高表达可识别预后特别良好的患者群体 | 研究基于回顾性队列,需要进一步验证其临床适用性 | 评估EVI1和PARP1在高级别浆液性卵巢癌中的预后意义 | 562名高级别浆液性卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 免疫组织化学染色,单细胞测序,拷贝数变异分析 | NA | 组织微阵列图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 562例高级别浆液性卵巢癌患者组织样本 | NA | 免疫组织化学,单细胞测序 | QuPath | QuPath数字半自动阳性细胞检测 |
2933 | 2025-10-06 |
The expression profiles of signature genes from CD103+LAG3+ tumour-infiltrating lymphocyte subsets predict breast cancer survival
2023-07-24, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-02960-1
PMID:37488535
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析鉴定了CD103+LAG3+肿瘤浸润淋巴细胞亚群,并开发了基于CXCL13和BIRC3基因的预后模型来预测乳腺癌患者生存 | 首次识别了CD103+LAG3+ TIL亚群并建立了基于这两个基因的预后模型,能够预测乳腺癌患者的免疫治疗反应和化疗敏感性 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测模型并探索肿瘤浸润淋巴细胞亚群在乳腺癌中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤浸润淋巴细胞亚群 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序,多重免疫组织化学,LASSO回归,Cox分析 | 预后预测模型 | 转录组数据,单细胞数据 | 训练队列1089例乳腺癌患者,验证队列3619例乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
2934 | 2025-10-06 |
Distinct Requirements for Adaptor Proteins NCK1 and NCK2 in Mammary Gland Development
2023-07-21, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09541-1
PMID:37479911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型揭示了衔接蛋白NCK1和NCK2在乳腺发育中的不同表达模式和功能需求 | 首次系统比较NCK1和NCK2在乳腺发育中的差异表达和功能,发现两者在细胞类型特异性表达和发育表型上存在显著差异 | 研究仅使用全局基因敲除模型,可能受到代偿机制影响;未深入探讨NCK蛋白在乳腺癌中的具体作用机制 | 探究NCK1和NCK2在乳腺发育过程中的表达分布和功能差异 | 小鼠乳腺组织 | 发育生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织形态数据 | 不同发育阶段(5、8、12周龄)的基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2935 | 2025-10-06 |
Gene regulatory network study of rheumatoid arthritis in single-cell chromatin landscapes of peripheral blood mononuclear cells
2023-Jul-04, Modern rheumatology
IF:1.8Q3
DOI:10.1093/mr/roac072
PMID:35796437
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研究论文 | 通过单细胞ATAC测序技术研究类风湿关节炎患者外周血单核细胞的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下利用scATAC-seq技术揭示类风湿关节炎的转录调控变异,发现10个关键转录因子及其调控的PTPRC和SPAG9基因 | 样本量较小(7例患者和7例对照),需要进一步验证和功能研究 | 发现参与类风湿关节炎发病机制的转录因子 | 类风湿关节炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 类风湿关节炎 | scATAC-seq, 定量PCR | NA | 表观基因组数据,基因表达数据 | 7例RA患者和7例健康对照的外周血单核细胞 | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
2936 | 2025-10-06 |
Pathogenic Roles of Cardiac Fibroblasts in Pediatric Dilated Cardiomyopathy
2023-07-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.029676
PMID:37345811
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研究论文 | 本研究探讨了儿童扩张型心肌病中心脏成纤维细胞的致病机制 | 首次揭示DCM心脏成纤维细胞通过体液因子和直接细胞接触损害心肌细胞功能,而非通过细胞生理行为改变 | 仅使用4个DCM患者来源的细胞系,样本量较小;研究局限于体外实验 | 阐明心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中的病理作用 | 儿童扩张型心肌病患者和健康对照的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | RNA测序,单细胞RNA测序,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据,细胞力学数据 | 4个DCM患者CF细胞系,3个健康对照CF细胞系 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
2937 | 2025-10-06 |
Phylogenomics of novel ploeotid taxa contribute to the backbone of the euglenid tree
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12973
PMID:36912454
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研究论文 | 本研究通过显微观察和单细胞转录组学对五种ploeotid类眼虫进行系统发育分析 | 建立了新的Karavia类群,发现两个未描述的ploeotid类群在系统发育树中占据关键位置 | 部分类群仍未被多基因系统发育研究采样,某些类群间关系支持度不足 | 解析ploeotid类眼虫的系统发育关系,完善眼虫类生物进化树的主干结构 | 五种ploeotid类眼虫(包括Decastava、Hemiolia、Liburna等) | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组学,光学显微镜,多基因系统发育分析 | NA | 转录组数据,显微图像 | 5种ploeotid眼虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2938 | 2025-10-06 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
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研究论文 | 本研究揭示泛素连接酶Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞功能抑制致癌物诱导的肺腺癌发生 | 首次发现Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞成熟状态和促纤维化基因特征影响肺腺癌发展 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究Siah1a/2在肺泡巨噬细胞功能调控及肺腺癌发生中的作用机制 | 肺泡巨噬细胞、肺腺癌小鼠模型、LUAD患者样本 | 癌症免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 野生型小鼠、基因敲除小鼠、LUAD患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2939 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sexual diversity in the human bladder and its prospective impacts on bladder cancer and urinary tract infection
2023-06-05, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01535-6
PMID:37277784
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类膀胱中的性别差异及其对膀胱癌和尿路感染的潜在影响 | 首次在单细胞水平系统揭示人类膀胱中不同细胞类型的性别特异性基因表达差异 | 基于已发表的单细胞RNA测序数据进行分析,样本来源和数量可能有限 | 探究膀胱相关疾病中性别差异的分子机制 | 人类正常膀胱组织细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌,尿路感染 | 单细胞RNA测序 | Monocle2, scMetabolism, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 27,437个细胞通过严格质量控制 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2940 | 2025-10-06 |
Cell-type annotation with accurate unseen cell-type identification using multiple references
2023-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011261
PMID:37379341
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研究论文 | 提出一种基于多参考数据的单细胞RNA测序数据自动注释方法mtANN,能够准确识别未见过的细胞类型 | 整合深度学习和集成学习提高预测准确性,引入考虑三个互补方面的新指标来区分未见细胞类型和共享细胞类型,并提供自适应阈值选择方法 | NA | 开发能够自动注释单细胞RNA测序数据并准确识别未见细胞类型的新方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习, 集成学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |