单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2921	2025-03-03	Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons 2024-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00200.2023 PMID:38193160	研究论文	本文系统地描述了小鼠结肠和直肠中VGLUT2阳性的肠神经元（VGLUT2-ENs）的形态、分子和功能特征	首次通过稀疏标记、单细胞mRNA测序和钙成像技术全面表征了VGLUT2-ENs的形态、分子和功能特性	研究仅针对小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究VGLUT2阳性肠神经元的结构和功能	小鼠结肠和直肠中的VGLUT2阳性肠神经元	神经科学	NA	稀疏标记、单细胞mRNA测序（scRNA-seq）、GCaMP6f钙成像	NA	分子数据、图像数据	52个VGLUT2-ENs进行单细胞mRNA测序，215个VGLUT2-ENs进行钙成像
2922	2025-03-03	Incongruity between T cell receptor recognition of breast cancer hotspot mutations ESR1 Y537S and D538G following exogenous peptide loading versus endogenous antigen processing 2024-03, Cytotherapy IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.jcyt.2023.12.002 PMID:38231165	研究论文	本文研究了T细胞受体（TCR）工程化T细胞疗法在识别乳腺癌热点突变ESR1 Y537S和D538G时的差异，探讨了外源性肽加载与内源性抗原处理之间的不一致性	通过单细胞RNA测序和免疫肽组学分析，发现了ESR1 Y537S和D538G突变特异性T细胞克隆，并揭示了这些TCRs在识别内源性突变ESR1时的局限性	研究发现，尽管TCRs能够识别外源性加载的ESR1突变肽，但无法识别内源性表达的突变ESR1，这可能限制了TCR T疗法在乳腺癌治疗中的应用	探索TCR T疗法在乳腺癌治疗中的潜力，特别是针对ESR1 Y537S和D538G突变的特异性识别	乳腺癌患者和健康捐赠者的T细胞	免疫疗法	乳腺癌	单细胞RNA测序、免疫肽组学分析、IFN-γ ELISpot筛选	NA	RNA序列数据、肽段数据	健康捐赠者和转移性乳腺癌患者的T细胞样本
2923	2025-03-03	IL-33 potentiates histaminergic itch 2024-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.038 PMID:37984799	研究论文	本文研究了IL-33在增强组胺性瘙痒中的作用及其机制	揭示了IL-33通过肥大细胞和IL-13依赖的机制增强组胺性瘙痒，独立于感觉神经元中的IL-33信号传导	未明确IL-33在其他类型瘙痒中的作用	探讨IL-33是否能增强组胺诱导的瘙痒	小鼠和人类的皮肤样本，特别是肥大细胞	免疫学	慢性自发性荨麻疹	单细胞RNA测序、微阵列分析	条件性和全局性基因敲除小鼠	转录组数据、皮肤活检样本	包括人类和小鼠的皮肤样本，以及CSU患者和健康对照的皮肤活检样本
2924	2025-03-03	Single cell RNA-seq: a novel tool to unravel virus-host interplay 2024-Mar, Virusdisease DOI:10.1007/s13337-024-00859-w PMID:38817399	研究论文	本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在揭示病毒与宿主相互作用中的革命性作用	scRNA-seq技术通过高分辨率评估揭示细胞异质性，克服了传统测序技术只能检测细胞群体平均表达水平的不足	尽管scRNA-seq技术在病毒-宿主相互作用研究中具有潜力，但其分析方法和多组学方法的进一步发展仍需改进	研究目的是利用scRNA-seq技术深入理解病毒与宿主之间的相互作用，以促进新型抗病毒治疗策略的开发	病毒与宿主细胞的相互作用	生物信息学	病毒感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
2925	2025-03-03	Illuminating the terminal nerve: Uncovering the link between GnRH-1 neuron and olfactory development 2024-03, The Journal of comparative neurology IF:2.3Q1 DOI:10.1002/cne.25599 PMID:38488687	研究论文	本文探讨了胚胎发育过程中嗅觉基板（OP）产生的迁移神经元，特别是GnRH-1神经元与嗅觉发育之间的联系	发现了Prokr2在GnRH-1神经元形成、迁移和诱导嗅觉球（OB）形态发生的关键时期在终末神经（TN）神经元中的表达，并通过单细胞RNA测序确定了TN神经元与嗅觉神经元的不同	GnRH-1神经元与嗅觉系统之间精确的机制联系仍不明确	揭示GnRH-1神经元与嗅觉发育之间的机制联系	小鼠和人类的GnRH-1神经元及终末神经（TN）神经元	神经科学	Kallmann综合征	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
2926	2025-03-03	Application of Single Cell Gene Expression Technologies to Neurotoxicology 2024-Mar, Current opinion in toxicology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.cotox.2023.100458 PMID:38617035	研究论文	本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在神经毒理学研究中的应用	利用scRNA-seq技术测量单个细胞的转录组，揭示不同细胞类型对毒性刺激的响应	需要将毒理学数据转化为对人类健康的影响，并理解物种间的差异	研究神经毒理学中生物变化与神经元功能之间的联系	多细胞类型样本中的细胞类型及其对毒性刺激的响应	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
2927	2025-03-03	Single-Cell Transcriptomic Analysis of Salivary Gland Endothelial Cells 2024-03, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345231219987 PMID:38411696	研究论文	本文通过单细胞转录组分析研究了唾液腺内皮细胞在纤维化和再生过程中的作用	首次使用单细胞RNA测序技术分析唾液腺内皮细胞的转录组，揭示了其在纤维化和再生过程中的独特基因表达和配体-受体相互作用	研究仅针对雌性小鼠的颌下腺和舌下腺，未涉及其他性别或物种的唾液腺	研究唾液腺内皮细胞在纤维化和再生过程中的作用及其与其他细胞类型的相互作用	成年雌性小鼠的颌下腺和舌下腺内皮细胞	单细胞转录组学	唾液腺疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	成年雌性小鼠的颌下腺和舌下腺细胞
2928	2025-03-03	Multiscale differential geometry learning of networks with applications to single-cell RNA sequencing data 2024-03, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108211 PMID:38422960	研究论文	本文介绍了一种多尺度微分几何（MDG）策略，用于解决单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中的挑战	首次将多尺度微分几何应用于scRNA-seq数据分析，通过构建多尺度细胞间交互流形揭示细胞网络的复杂关系	未提及具体的数据集或实验规模，可能限制了方法的普适性验证	解决scRNA-seq数据分析中的挑战，特别是细胞类型分类	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq	多尺度微分几何（MDG）	单细胞RNA测序数据	NA
2929	2025-03-03	Molecular and Spatial Signatures of Mouse Embryonic Endothelial Cells at Single-Cell Resolution 2024-03, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323956 PMID:38348657	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多重误差稳健荧光原位杂交技术，定义了小鼠胚胎内皮细胞及其前体亚型，并分析了动脉和静脉内皮细胞的发育轨迹	首次在单细胞分辨率下提供了胚胎内皮细胞异质性的时空图谱，揭示了胚胎内皮细胞多样性来源于组织起源和血管床位置	研究主要基于小鼠胚胎，人类胚胎内皮细胞的异质性可能有所不同	研究血管系统发育过程中内皮细胞异质性的建立，特别是动脉和静脉内皮细胞的指定	小鼠胚胎内皮细胞及其前体亚型	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序, 多重误差稳健荧光原位杂交, CRISPR功能缺失实验	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	7682个E9.5至E15.5的小鼠胚胎内皮细胞, 15448个内皮细胞的空间转录组分析
2930	2025-03-02	Atlas of expression of acyl CoA binding protein/diazepam binding inhibitor (ACBP/DBI) in human and mouse 2025-Feb-26, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07447-w PMID:40011442	研究论文	本研究通过蛋白质表达谱分析，揭示了酰基辅酶A结合蛋白/地西泮结合抑制剂（ACBP/DBI）在人类和小鼠组织中的表达图谱，并探讨了其与衰老及年龄相关疾病的关系	首次系统地描绘了ACBP/DBI在人类和小鼠组织中的表达图谱，并发现其与特定细胞类型中的保守表达机制	研究主要基于转录组和蛋白质组数据，缺乏直接的实验验证	探讨ACBP/DBI在人类和小鼠组织中的表达模式及其与衰老和年龄相关疾病的关系	人类和小鼠的组织样本	生物信息学	衰老相关疾病	RNA-seq, 蛋白质组学	NA	转录组数据, 蛋白质组数据	人类和小鼠的多种组织样本
2931	2025-03-02	KRT7 promotes pancreatic cancer metastasis by remodeling the extracellular matrix niche through FGF2-fibroblast crosstalk 2025-Feb-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-84129-1 PMID:40011455	研究论文	本文研究了KRT7在胰腺导管腺癌（PDAC）肝转移中的作用及其机制	揭示了KRT7通过FGF2-成纤维细胞相互作用重塑细胞外基质微环境，促进PDAC肝转移的新机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本数量有限	探讨KRT7在PDAC肝转移中的作用及其分子机制	胰腺导管腺癌（PDAC）患者和小鼠模型	癌症研究	胰腺癌	RNA测序、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据、蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据	24个PDAC样本
2932	2025-03-02	Immunological profile of lactate metabolism-related genes in Psoriasis a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data 2025-Feb-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91237-z PMID:40011693	研究论文	本文通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，全面分析了银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学特征	首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了乳酸代谢相关基因在银屑病中的核心作用及其与免疫细胞浸润的关联	研究主要依赖于公开数据集，缺乏实验验证	探讨乳酸代谢在银屑病发病机制中的作用，并识别潜在的治疗靶点	银屑病患者和健康对照的皮肤样本	数字病理学	银屑病	RNA测序	NA	RNA测序数据	两个数据集（GSE13355, GSE109248）的合并样本
2933	2025-03-02	Immune dysregulation in COVID-19 induced ARDS in kidney transplant recipients revealed by single-cell RNA sequencing 2025-Feb-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91439-5 PMID:40011702	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）在肾移植受者中的免疫失调现象	首次使用单细胞RNA测序技术构建了COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者和非肾移植受者中的全局单细胞图谱，并揭示了关键的免疫细胞亚群及其在病理过程中的作用	研究样本量有限，且仅关注了外周血样本，未涉及其他组织或器官的免疫反应	探索肾移植受者和非肾移植受者在COVID-19诱导的ARDS中的免疫反应差异，以确定潜在的治疗靶点	肾移植受者和非肾移植受者的外周血样本	数字病理	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	108,320个细胞
2934	2025-03-02	Combining single-cell ATAC and RNA sequencing for supervised cell annotation 2025-Feb-26, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-025-06084-6 PMID:40011801	研究论文	本文探讨了结合单细胞ATAC和RNA测序数据进行监督细胞注释的方法	首次探索了在监督注释方法中结合单细胞ATAC和RNA测序数据的改进效果	在神经元细胞的注释中未观察到改进	提高单细胞分析中的细胞类型注释准确性	人类外周血单核细胞（PBMC）和阿尔茨海默病神经元细胞	单细胞分析	阿尔茨海默病	单细胞ATAC测序和RNA测序	随机森林、支持向量机、逻辑回归	单细胞测序数据	人类外周血单核细胞和阿尔茨海默病神经元细胞样本
2935	2025-03-02	Pathological and molecular insights into intravenous leiomyomatosis: an integrative multi-omics study 2025-Feb-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05919-9 PMID:40011937	研究论文	本文通过多组学方法研究静脉内平滑肌瘤病（IVL），揭示了其病理和分子变化	首次对IVL进行了全面的单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了其与子宫肌瘤的细胞组成差异及染色体10q缺失的重要性	由于IVL较为罕见，样本量有限，可能影响结果的普适性	研究IVL的病理和分子机制，以改善其诊断和治疗	IVL、子宫肌瘤和正常子宫肌层的组织样本	数字病理学	静脉内平滑肌瘤病	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、H&E染色	NA	组织样本、RNA测序数据、蛋白质组数据	8对IVL和正常子宫肌层的新鲜冷冻组织样本
2936	2025-03-02	Exploring the hepatic-ophthalmic axis through immune modulation and cellular dynamics in diabetic retinopathy and non-alcoholic fatty liver disease 2025-Feb-26, Human genomics IF:3.8Q2 DOI:10.1186/s40246-025-00730-z PMID:40011971	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索了糖尿病视网膜病变（DR）和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的免疫调节和细胞动态变化	揭示了T细胞、巨噬细胞和内皮细胞在DR和NAFLD中的关键作用，特别是CD45信号通路的重要性，为这两种疾病的治疗提供了新的视角	研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据，可能受到数据质量和样本来源的限制	阐明DR和NAFLD中不同细胞群体之间的复杂相互作用和通讯途径	糖尿病视网膜病变（DR）和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）	生物信息学	糖尿病视网膜病变, 非酒精性脂肪肝病	单细胞RNA测序, 基因表达差异分析, 伪时间分析, CellChat, GSEA, GSVA	NA	单细胞RNA测序数据	从GEO数据库中获取的PDR和NAFLD单细胞RNA测序数据
2937	2025-03-02	Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis 2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011154 PMID:40010773	研究论文	本研究探讨了5α-还原酶抑制剂（5-ARIs）使用史对转移性肾细胞癌（mRCC）患者免疫检查点抑制剂（ICIs）疗效的影响	首次通过多中心回顾性分析，揭示了5-ARIs使用史与ICIs疗效的关联，并通过单细胞RNA测序提供了免疫学机制上的新见解	研究为回顾性分析，可能存在选择偏倚，且样本量相对较小	评估5-ARIs使用史对mRCC患者ICIs疗效的影响	185名接受ICIs治疗的mRCC患者	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	Cox比例风险模型	临床数据和RNA测序数据	185名mRCC患者
2938	2025-03-02	Single-cell analysis of neoplastic plasma cells identifies myeloma pathobiology mediators and potential targets 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101925 PMID:39855192	研究论文	本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）技术，区分了单克隆/肿瘤性浆细胞与多克隆/正常浆细胞，并发现了更多在前期患者中失调的基因	结合scRNA-seq和scBCR-seq技术，首次在单细胞水平上区分了肿瘤性和正常浆细胞，并验证了MAD2L1和MAT2A作为潜在治疗靶点的有效性	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证其疗效	探索多发性骨髓瘤的病理生物学机制并识别潜在的治疗靶点	多发性骨髓瘤患者的浆细胞	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
2939	2025-03-02	Spatially resolved transcriptomics reveal the determinants of primary resistance to immunotherapy in NSCLC with mature tertiary lymphoid structures 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101934 PMID:39909044	研究论文	本文通过空间转录组学和多重免疫荧光技术，揭示了非小细胞肺癌（NSCLC）中成熟三级淋巴结构（mTLSs）与免疫检查点抑制剂（ICIs）原发性耐药的决定因素	研究发现两种不同的癌症相关成纤维细胞（CAFs）亚群在mTLSs阳性的NSCLC中介导了ICIs的原发性耐药，并提出了新的治疗靶点	研究样本量较大（n=509），但未提及是否涵盖不同亚型的NSCLC或不同阶段的疾病	揭示NSCLC中mTLSs与ICIs疗效的决定因素，并探索新的治疗靶点	非小细胞肺癌（NSCLC）患者	数字病理学	肺癌	空间转录组学，多重免疫荧光（mIF）	NA	转录组数据，免疫荧光图像	509名NSCLC患者
2940	2025-03-02	Enhanced conversion of T cells into CAR T cells by modulation of the MAPK/ERK pathway 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101970 PMID:39938523	研究论文	本文通过单细胞多组学分析，研究了T细胞在嵌合抗原受体（CAR）T细胞生成过程中的分子事件，揭示了MAPK/ERK通路在CAR T细胞生成中的作用	通过单细胞多组学分析揭示了CAR T细胞生成过程中的分子机制，特别是MAPK/ERK通路的作用	研究中使用的化学抑制剂可能对细胞有其他未知的影响，且样本来源仅限于健康供体和患者	研究CAR T细胞生成过程中的分子机制，以提高CAR T细胞的生成效率	T细胞	生物医学工程	NA	单细胞多组学分析	NA	单细胞转录组数据	健康供体和患者的T细胞