单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 29281 - 29300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 29281 | 2024-08-09 |
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.588041
PMID:33195248
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法DiffGE，利用网络熵来测量不同细胞类型间基因组的表达动态，并识别高度差异的基因组 | 采用网络熵作为测量工具，以识别不同细胞类型间高度差异的基因组 | NA | 揭示特定细胞类型间的转录差异 | 单细胞转录组数据中的差异基因组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 29282 | 2024-08-09 |
Vertebrate Sensory Ganglia: Common and Divergent Features of the Transcriptional Programs Generating Their Functional Specialization
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.587699
PMID:33195244
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研究论文 | 本文总结了脊椎动物头部感觉神经节的普遍解剖结构、功能和神经多样性，并概述了控制感觉系统发育中神经发生和神经元分化的转录网络的当前知识，特别关注头部感觉神经节，强调其发育的特定方面并与躯干感觉神经节进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术，近期研究在大多数感觉神经节的神经元多样性表征方面取得了显著进展 | 目前对不同头部感觉神经节胚胎发育的分子机制的理解仍然有限 | 探讨脊椎动物感觉神经节的转录程序及其功能特化的共同和差异特征 | 脊椎动物的感觉神经节及其相关的神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 29283 | 2024-08-09 |
Evaluating single-cell cluster stability using the Jaccard similarity index
2021-08-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa956
PMID:33165513
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研究论文 | 本文介绍了一套工具，通过子采样方法评估单细胞聚类的稳定性，以指导参数选择和辅助生物学解释 | 提出了使用Jaccard相似性指数来评估单细胞聚类稳定性的方法，并开发了相应的R包和Snakemake工作流程 | 未提及 | 旨在提高单细胞RNA测序实验中聚类结果的稳定性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29284 | 2024-08-09 |
CellTalkDB: a manually curated database of ligand-receptor interactions in humans and mice
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa269
PMID:33147626
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellTalkDB的手动 curated 数据库，该数据库包含了人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | CellTalkDB数据库不仅包含了2033对小鼠的配体-受体相互作用，还额外包含了377对人类的配体-受体相互作用，相比于现有的SingleCellSignalR资源，提供了更全面的数据 | NA | 构建一个全面的手动 curated 数据库，以帮助进一步推断和理解基于配体-受体相互作用的细胞间通信 | 人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据库 | 3398对人类配体-受体相互作用和2033对小鼠配体-受体相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 29285 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of murine mural cells reveals cellular heterogeneity
2021-Jul, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1823-2
PMID:33165809
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞数据集GSE109774，展示了小鼠壁细胞（MCs）的转录异质性 | 首次详细研究了壁细胞的转录异质性，并通过重新聚类识别了五个不同的亚群 | NA | 揭示壁细胞的转录异质性及其在组织中的分布和相互作用 | 小鼠壁细胞（MCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开数据集GSE109774 | NA | NA | NA | NA |
| 29286 | 2024-08-09 |
The Whey Acidic Protein WFDC12 Is Specifically Expressed in Terminally Differentiated Keratinocytes and Regulates Epidermal Serine Protease Activity
2021-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.09.025
PMID:33157095
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研究论文 | 本研究探讨了WFDC12蛋白在表皮角质形成细胞终末分化中的表达及其对表皮丝氨酸蛋白酶活性的调控作用 | 首次发现WFDC12在表皮角质形成细胞终末分化阶段的特异性表达，并揭示了其在调控角质层蛋白酶活性中的作用 | NA | 研究WFDC蛋白家族成员在表皮稳态中的作用 | WFDC12蛋白在人类表皮中的表达及其功能 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，免疫金-电子显微镜 | NA | RNA | 涉及银屑病、特应性皮炎、Darier病和Netherton综合征患者的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29287 | 2024-08-09 |
Targeting fibroblast growth factor 23-responsive pathways uncovers controlling genes in kidney mineral metabolism
2021-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.10.024
PMID:33159963
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研究论文 | 本研究通过基因阵列和单细胞RNA测序技术，探索了FGF23响应途径中的调控基因，特别是在肾脏矿物质代谢中的作用 | 发现HBEGF作为FGF23下游调控基因的新角色，并通过靶向共同信号途径发挥作用 | NA | 识别可作为控制FGF23介导的矿物质代谢目标的新基因 | FGF23响应途径中的调控基因及肾脏矿物质代谢 | NA | NA | 基因阵列，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 野生型小鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29288 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of cardiac progenitors reveals functional subpopulations and their cooperative crosstalk in cardiac repair
2021-02, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00788-6
PMID:33159668
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29289 | 2024-08-09 |
Clonal Hematopoiesis-Driver DNMT3A Mutations Alter Immune Cells in Heart Failure
2021-01-22, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317104
PMID:33155517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在人类中定义了由DNMT3A克隆性造血驱动突变介导的炎症免疫细胞亚群 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨DNMT3A突变在慢性心力衰竭患者中对免疫细胞的影响 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者和4名无DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者 | NA | NA | NA | NA |
| 29290 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell RNA sequencing identifies immunotherapy persister cells following PD-1 blockade
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135038
PMID:33151910
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研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术，在PD-1阻断治疗的小鼠肿瘤球体中识别出免疫治疗持久细胞（IPCs） | 首次通过动态单细胞RNA测序技术识别出PD-1阻断后的免疫治疗持久细胞，并揭示了其特征和潜在的治疗靶点 | 研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示PD-1阻断治疗中免疫逃逸的基本机制，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠肿瘤球体中的免疫治疗持久细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肿瘤球体 | NA | NA | NA | NA |
| 29291 | 2024-08-09 |
GRNdb: decoding the gene regulatory networks in diverse human and mouse conditions
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa995
PMID:33151298
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研究论文 | 本文介绍了GRNdb数据库，该数据库系统预测了人类和小鼠在184种不同生理和病理条件下涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本的基因调控网络（GRNs），并提供了一个用户友好的平台用于搜索、比较、浏览、可视化和下载相关信息。 | GRNdb是首个提供全面的人类和小鼠在单细胞水平上不同正常组织和疾病基因调控网络信息的数据库。 | NA | 开发一个全面的数据库，用于解析在多种条件下基因表达调控的功能和机制。 | 人类和小鼠的基因调控网络及其在不同生理和病理条件下的变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29292 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Plants: Advances and Challenges
2021-01-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.10.012
PMID:33152518
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在植物科学中的应用进展和面临的挑战 | scRNA-seq技术能够以前所未有的分辨率和规模研究植物发育和生理，揭示细胞间的异质性 | 植物科学中单细胞转录组分析仍处于早期阶段，有许多挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在植物研究中的应用，并提出未来研究方向 | 使用拟南芥根模型进行的研究，以及新的单细胞分析工具 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29293 | 2024-08-09 |
Enhanced Efficacy of Simultaneous PD-1 and PD-L1 Immune Checkpoint Blockade in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2021-01-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1674
PMID:33158814
|
research paper | 本研究通过免疫功能和单细胞RNA测序转录组分析，探讨了双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的作用机制 | 首次揭示了双特异性抗体诱导NK细胞和部分CD8 T细胞状态转变，增强免疫检查点阻断疗法在高度浆液性卵巢癌中的疗效 | NA | 研究双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的免疫治疗效果及其作用机制 | 高度浆液性卵巢癌的肿瘤细胞与免疫细胞共培养模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29294 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals Clonal Architecture of Myeloid Cancers
2021-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2020-163
PMID:33158845
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了髓系癌症的克隆结构 | 首次使用单细胞测序技术来解析髓系癌症的克隆结构 | NA | 探究髓系癌症的克隆结构 | 急性髓系白血病的克隆结构 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 29295 | 2024-08-09 |
Chitinase 3-like 1 and neurofilament light chain in CSF and CNS atrophy in MS
2021-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000906
PMID:33172960
|
研究论文 | 研究脑脊液中神经丝轻链（NfL）和新兴标记物壳多糖酶3样蛋白1（CHI3L1）与多发性硬化症（MS）患者脑和脊髓萎缩的横断面关联 | 首次探讨了CHI3L1和NfL在MS患者脑脊液中的水平与脑和脊髓萎缩的关系，并评估了CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 研究为单中心研究，样本量有限，可能影响结果的普遍性 | 探讨CHI3L1和NfL在MS患者中的表达与脑和脊髓萎缩的关系，以及CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 多发性硬化症患者（复发缓解型MS和进行性MS）及健康对照组的脑脊液中NfL和CHI3L1水平 | NA | 多发性硬化症 | MRI | NA | 脑脊液 | 131名MS患者（42名复发缓解型MS和89名进行性MS）及42名匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 29296 | 2024-08-09 |
CaMKIIα-Positive Interneurons Identified via a microRNA-Based Viral Gene Targeting Strategy
2020-12-09, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2570-19.2020
PMID:33158963
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研究论文 | 本文介绍了一种基于microRNA的病毒基因靶向策略，用于识别表达CaMKIIα的阳性中间神经元 | 提出了一种新的病毒基因表达策略，使用microRNA引导的神经元标签（mAGNET）来靶向具有特定microRNA表达的细胞 | NA | 研究大脑细胞中基因表达的多样性，并探索基因表达与生理特性之间的关系 | 表达CaMKIIα的中间神经元及其生理特性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性和雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 29297 | 2024-08-09 |
Optimized Langendorff perfusion system for cardiomyocyte isolation in adult mouse heart
2020-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15773
PMID:33147379
|
research paper | 本文介绍了一种优化的Langendorff灌流系统，用于从成年小鼠心脏中分离心肌细胞 | 提出了一个简化和标准化的操作协议，利用重力作为灌流压力，并引入了新的去泡方法和消化终止标准 | NA | 改进Langendorff灌流系统，以提高心肌细胞的活性和纯度，满足单细胞测序技术的要求 | 成年小鼠心脏中的心肌细胞 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | 多次自然重力沉降后获得稳定的心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29298 | 2024-08-09 |
Toward a Consensus View of Mammalian Adipocyte Stem and Progenitor Cell Heterogeneity
2020-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.09.007
PMID:33148396
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综述 | 本文综述了关于哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞异质性的当前知识 | 利用单细胞转录组学技术，提供了对不同哺乳动物脂肪库中ASPCs细胞复杂性的新见解 | ASPCs的分子异质性和功能多样性仍未完全理解 | 探讨哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞的异质性 | 脂肪干细胞和前体细胞（ASPCs）及其在脂肪组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 29299 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of single-cell RNA sequencing data from healthy human marrow hematopoietic cells
2020-Nov-10, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-020-05357-y
PMID:33168060
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体的391个骨髓CD34+细胞，以揭示造血过程中的转录异质性和动态变化 | 首次综合分析了健康人骨髓造血细胞的单细胞RNA测序数据，并结合长非编码RNA表达和染色质可及性测序数据，揭示了造血细胞分化过程中的基因表达调控模式 | NA | 探究造血过程中的转录异质性和动态变化 | 健康人骨髓中的CD34+造血干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 391个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29300 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis demonstrates inter-patient and intra-tumor heterogeneity in primary and metastatic lung adenocarcinoma
2020-11-10, Aging
DOI:10.18632/aging.103945
PMID:33170151
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研究论文 | 本研究通过分析来自GSE123902和GSE131907数据集的50个原发性和转移性肺腺癌样本的单细胞转录组数据，揭示了患者间和肿瘤内异质性的景观 | 研究展示了单细胞转录组分析在揭示肺腺癌原发和转移组织中与肿瘤进展、化疗抵抗和代谢相关的通路调控异质性方面的创新应用 | NA | 确定原发性和转移性肺腺癌中患者间和肿瘤内异质性的景观 | 原发性和转移性肺腺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 50个原发性和转移性肺腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |