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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2901 - 2920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2901 | 2025-07-25 |
LineGRN: a line graph neural network for gene regulatory network inference
2025-Jul-23, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3591840
PMID:40699953
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research paper | 提出了一种名为LineGRN的新型线图神经网络框架，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 通过准确建模基因对之间的邻域关系，LineGRN有效保留了拓扑结构中的相互作用信号，并通过线图转换产生了高节点度主导的局部网络拓扑，实现了更高效的信息传播 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种新的计算方法来更准确地推断基因调控网络 | 基因调控网络（GRNs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 线图神经网络（LineGRN） | scRNA-seq数据 | 未明确提及具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 2902 | 2025-07-25 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-Jul-23, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现IGFBP2表达下调导致子宫内膜上皮细胞衰老，进而探讨了IGFBP2在薄型子宫内膜中的作用及其潜在治疗价值 | 首次揭示IGFBP2下调通过PI3K/AKT信号通路介导子宫内膜上皮细胞衰老的分子机制，并证明外源性IGFBP2蛋白具有优于已知抗衰老药物Dasatinib的治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未进行临床验证 | 阐明薄型子宫内膜的发病机制并探索潜在治疗靶点 | 子宫内膜上皮细胞（原代细胞和Ishikawa细胞系）和薄型子宫内膜小鼠模型 | 生殖医学 | 薄型子宫内膜 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2903 | 2025-07-25 |
Transcription factors TCF4 and KLF4 respectively control the development of the DC2A and DC2B lineages
2025-Jul-23, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02208-5
PMID:40702338
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术揭示了转录因子TCF4和KLF4分别控制DC2A和DC2B谱系发育的分子机制 | 首次明确了Klf4表达可将cDC谱系与pDC谱系清晰区分，并定义了两个pre-DC2亚群及其分化调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类DC细胞谱系是否遵循相同机制仍需验证 | 阐明常规树突状细胞(cDCs)异质性群体的发育调控机制 | 小鼠常规树突状细胞(cDCs)及其前体细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序、转录因子命运示踪模型、条件性敲除模型、过继转移 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量（小鼠细胞） | NA | NA | NA | NA |
| 2904 | 2025-07-25 |
Probability of stealth multiplets in sample-multiplexing for droplet-based single-cell analysis
2025-Jul-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11835-z
PMID:40702454
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研究论文 | 本文研究了基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的多重捕获问题，特别是样本多重化scRNA-seq（mx-scRNA-seq）中的隐蔽多重捕获（stealth multiplets）概率 | 提出了隐蔽多重捕获的概念，并开发了一个理论模型来预测其概率，揭示了部分隐蔽多重捕获对数据集的影响 | 模型假设可能简化了实际情况，且仅针对特定类型的mx-scRNA-seq数据进行了验证 | 评估mx-scRNA-seq中隐蔽多重捕获的概率及其对数据完整性的影响 | 基于液滴的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, mx-scRNA-seq | 理论模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2905 | 2025-07-25 |
Molecular mechanism of potently neutralizing human monoclonal antibodies against severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Jul-22, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00533-25
PMID:40539781
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研究论文 | 本文研究了针对严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)的高效中和人源单克隆抗体的分子机制 | 首次从SFTS幸存者中通过单细胞RNA-seq获得多种单克隆抗体，并发现SD4、SD12和SD22具有高中和活性，其中SD4和SD22对不同病毒基因型表现出32-83 pM的强效中和能力 | 研究主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发针对SFTSV的有效治疗性抗体 | 严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)及其糖蛋白Gn | 分子生物学 | 严重发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA-seq, X射线晶体学 | NA | 分子结构数据 | 多种从SFTS幸存者获得的单克隆抗体 | NA | NA | NA | NA |
| 2906 | 2025-07-25 |
Integrative causal and single-cell analyses reveal genes responsive to endocrine disruptors driving human male infertility
2025-Jul-22, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118709
PMID:40700968
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研究论文 | 本研究通过整合因果分析和单细胞分析，揭示了内分泌干扰物（EDCs）响应基因与男性不育的关联 | 首次系统性识别EDCs相关基因，并通过Mendelian随机化和共定位分析验证其与男性不育的因果关系，结合单细胞RNA测序揭示这些基因在生殖细胞中的表达模式 | 研究主要基于已有数据库和大规模数据集，缺乏实验验证部分基因功能的具体机制 | 探究内分泌干扰物导致男性不育的分子机制 | 人类睾丸组织及与男性不育相关的基因 | 生物医学 | 男性不育 | Mendelian随机化分析、共定位分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、GWAS数据、单细胞RNA测序数据 | 大规模cis-eQTL和GWAS数据集及人类睾丸组织单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2907 | 2025-07-25 |
Differential molecular signatures in response to CD19-CAR T cell therapy compared with conventional pharmacotherapy in systemic lupus erythematosus
2025-Jul-22, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.2132
PMID:40701862
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研究论文 | 比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮(SLE)中的分子特征差异 | 首次揭示了CD19-CAR T细胞疗法在SLE中诱导的独特分子特征，包括补体激活和I型干扰素反应的显著抑制，以及脂质代谢途径的上调 | 样本量较小(7例接受CAR-T治疗的患者)，且为观察性研究 | 比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在SLE中的生物学效应差异 | 系统性红斑狼疮患者 | 免疫治疗 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，全血转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 7例接受CD19-CAR T治疗的患者，30例标准药物治疗后缓解的患者，31例接受利妥昔单抗、贝利尤单抗或环磷酰胺治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 2908 | 2025-07-25 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Jul-22, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
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研究论文 | 本研究通过高深度长读长单细胞RNA测序技术，系统表征了人类结直肠癌中全长RNA异构体的多样性及其剪接变化 | 首次在单细胞分辨率下全面解析结直肠癌中全长转录本变异，揭示了癌症细胞转录复杂性的增加、3'-UTR缩短及内含子保留减少等新特征，并发现iCMS3亚型具有更高的剪接因子活性和更显著的3'-UTR缩短 | 样本量相对较小（仅12例CRC患者），且仅关注结直肠上皮细胞 | 探究结直肠癌中RNA剪接失调的分子机制及其在肿瘤发生中的作用 | 结直肠癌患者的结直肠上皮细胞 | 基因组学 | 结直肠癌 | 高深度长读长单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 12例CRC患者的结直肠上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2909 | 2025-07-25 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Jul-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
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研究论文 | 通过单细胞和空间多组学技术研究机械应力驱动的杨树木材异质性发育 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术，揭示了正常木材和张力木材中纤维细胞的同一性和发育异质性 | 研究主要集中于杨树，结果在其他树种中的普适性需要进一步验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞和分子机制 | 杨树正常木材、张力木材和对侧木材 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢组数据、磷酸化蛋白质组数据 | 三种不同发育状态的杨树木材组织(正常、张力、对侧) | NA | NA | NA | NA |
| 2910 | 2025-07-25 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses
2025-Jul-19, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10836-1
PMID:40682700
|
综述 | 本文系统综述了2017年至2024年间在水稻中进行的单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究，重点关注水稻对环境胁迫的响应 | 填补了水稻单细胞RNA测序研究综述的空白，并强调了scRNA-seq技术在水稻研究中的最新进展和应用 | 仅涵盖2017至2024年间的研究，可能未包括最新的研究成果 | 探讨scRNA-seq技术在水稻研究中的应用及其对作物改良策略的贡献 | 水稻（Oryza sativa）的不同组织（根、叶、花和种子）及其对环境胁迫的响应 | 植物生物学 | NA | scRNA-seq, ATCT-seq, snRNA-seq, Stereo-seq | NA | 转录组数据 | 涵盖2017至2024年间的水稻scRNA-seq研究 | NA | NA | NA | NA |
| 2911 | 2025-07-25 |
Sceptic: pseudotime analysis for time-series single-cell sequencing and imaging data
2025-Jul-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03679-3
PMID:40676652
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研究论文 | 提出了一种名为Sceptic的支持向量机模型，用于监督性伪时间分析，以提高单细胞数据的时间顺序预测准确性 | Sceptic模型在预测能力上显著优于现有方法，并且能够应用于多种单细胞数据类型，包括单核图像数据 | 未明确提及具体局限性，但可能包括对新数据类型的适应性和计算效率问题 | 提高单细胞伪时间嵌入的预测准确性，并扩展其应用范围至多种单细胞数据类型 | 时间序列单细胞RNA测序数据、scATAC-seq数据和显微镜图像数据 | 生物信息学 | NA | 支持向量机(SVM) | SVM | 单细胞RNA测序数据、scATAC-seq数据、显微镜图像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2912 | 2025-07-25 |
EDNRB2 regulates fate, migration, and maturation of hair cell precursors in regenerating avian auditory epithelium explants
2025-Jul-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502713122
PMID:40627393
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研究论文 | 本研究揭示了EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中对前体细胞命运、迁移和成熟的关键调控作用 | 首次发现EDNRB2信号通路在鸟类毛细胞再生过程中调控前体细胞命运决定、迁移和成熟的关键作用 | 研究仅基于体外鸡基底乳头培养模型，未验证在体情况 | 阐明EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生中的具体作用机制 | 鸡基底乳头的支持细胞和毛细胞前体细胞 | 听觉再生生物学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序、RNA测序、药理学抑制、组织学评估 | 鸡基底乳头外植体培养模型 | 基因表达数据、组织学图像数据 | 未明确说明具体样本数量（鸡基底乳头外植体） | NA | NA | NA | NA |
| 2913 | 2025-07-25 |
Phenotypic heterogeneity and plasticity in colorectal cancer metastasis
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100881
PMID:40393458
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌（CRC）中表型异质性和可塑性在肿瘤进展、转移和治疗抵抗中的关键作用 | 通过单细胞多组学和空间转录组学数据揭示了具有再生和炎症表型的癌细胞状态，并鉴定了AP-1和NF-κB作为关键调控因子 | 研究中发现的调控因子和外在信号驱动表型异质性的具体机制仍需进一步验证 | 揭示结直肠癌转移中表型异质性和可塑性的调控机制 | 结直肠癌患者的原发性和转移性肿瘤样本 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组学数据 | 结直肠癌患者的原发性和转移性肿瘤样本（具体数量未提及） | NA | NA | NA | NA |
| 2914 | 2025-07-25 |
SpaLinker identifies phenotype-associated spatial tumor microenvironment features by integrating bulk and spatial sequencing data
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100893
PMID:40480216
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研究论文 | 介绍了一种名为SpaLinker的创新集成框架，用于通过整合大量和空间测序数据来识别与表型相关的空间肿瘤微环境特征 | SpaLinker利用空间转录组学数据在分子、细胞和组织结构水平上解析空间分辨的肿瘤微环境，并通过整合大量RNA测序数据评估空间定义特征的预后意义 | 由于空间测序样本的临床注释稀缺，定量关联空间分辨特征与临床表型仍具挑战性 | 提高空间测序技术的临床实用性，识别与表型相关的空间肿瘤微环境特征 | 肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 泛癌 | 空间转录组学（ST）、RNA-seq | NA | 空间测序数据、RNA测序数据 | 多种肿瘤ST数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2915 | 2025-07-25 |
Integrin β1 activity controls colony morphology during human pluripotent stem cell state transitions
2025-Jul-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102538
PMID:40541174
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研究论文 | 研究整合素β1在调控人类诱导多能干细胞（hiPSC）从初始态到启动态转变过程中对集落形态的影响 | 揭示了整合素β1在调控多能干细胞状态转变中的新作用，并展示了整合素抑制剂如何帮助在体外精确调控hiPSC的功能和特性 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境的影响 | 探究整合素β1在调控人类诱导多能干细胞状态转变中的作用 | 人类诱导多能干细胞（hiPSC） | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2916 | 2025-07-25 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 介绍了一个名为spRefine的深度学习框架，利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补 | spRefine是一个无需参考框架的深度学习模型，能够联合去噪和插补空间转录组数据，并提高数据整合的鲁棒性 | 未明确提及具体限制 | 克服空间转录组数据的高噪声和缺失基因测量问题，提高数据质量和分析准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 基因组语言模型 | 深度学习框架 | 空间转录组数据 | 不同规模的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 2917 | 2025-07-25 |
PROFET Predicts Continuous Gene Expression Dynamics from scRNA-seq Data to Elucidate Heterogeneity of Cancer Treatment Responses
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.662030
PMID:40631077
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研究论文 | 开发了一个名为PROFET的计算框架，用于从稀疏采样的单细胞RNA测序数据中重建连续的、非线性的单细胞基因表达轨迹 | PROFET采用了一种新颖的Lipschitz正则化梯度流方法和神经力匹配技术，首次实现了从静态快照数据中推断连续的单细胞表达轨迹 | 方法在合成数据上开发，虽然在小鼠和人类数据集上进行了验证，但可能仍需更多真实世界数据的进一步验证 | 研究旨在解决单细胞RNA测序无法追踪连续基因表达动态变化的问题，并解析癌症治疗反应中的异质性 | 激素受体阳性乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂palbociclib的治疗反应 | 计算生物学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, 神经力匹配 | PROFET框架(基于Lipschitz正则化梯度流和神经力匹配) | 单细胞RNA测序数据 | 合成数据、小鼠和人类数据集(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
| 2918 | 2025-07-25 |
HMBOX1 reverses autophagy mediated 5-fluorouracil resistance through promoting HACE1-induced ubiquitination and degradation of ATG5 in colorectal cancer
2025-07, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2477443
PMID:40126194
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子HMBOX1通过促进HACE1诱导的ATG5泛素化和降解，逆转自噬介导的5-氟尿嘧啶耐药性，从而增强结直肠癌对化疗的敏感性 | 首次发现HMBOX1通过调控HACE1介导的ATG5泛素化降解途径抑制自噬，进而逆转5-FU耐药性 | 研究主要基于体外实验和临床样本分析，缺乏动物模型验证 | 探索结直肠癌化疗耐药性的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞及患者组织样本 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化、质谱蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 结直肠癌耐药细胞系及患者组织样本（具体数量未明确说明） | NA | NA | NA | NA |
| 2919 | 2025-07-25 |
M2 Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Reprogram Immature Neutrophils into Anxa1hi Neutrophils to Enhance Inflamed Bone Regeneration
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416159
PMID:40277454
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研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞来源的细胞外囊泡（M2-EVs）在减轻牙周炎引起的骨丢失中的关键作用，并发现了一种具有修复特性的Anxa1中性粒细胞亚群 | 发现了M2-EVs通过干扰中性粒细胞成熟轨迹，促进Anxa1修复亚群的分化，从而增强炎症骨再生 | 未明确M2-EVs的具体作用机制及Anxa1中性粒细胞亚群在其他炎症模型中的适用性 | 探究M2巨噬细胞与中性粒细胞的相互作用对炎症骨再生的影响 | 牙周组织中的M2巨噬细胞和中性粒细胞 | 免疫学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2920 | 2025-07-25 |
Gas Bubbles from Biodegradable Magnesium Implants Convey Mechanical Cues and Promote Immune Cell Stimulation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503123
PMID:40349156
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研究论文 | 研究生物可降解镁植入物产生的气泡对周围组织和细胞行为的影响 | 揭示了镁植入物降解产生的气泡通过机械和炎症途径影响组织愈合的复杂局部反应 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究镁植入物降解产生的气泡对周围组织和细胞行为的生物学影响 | 大鼠的软组织和免疫细胞 | 生物医学工程 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |