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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 2901 - 2920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2901 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and immunophenotyping uncover chronic inflammation-induced immune adaptations favoring dysplasia development in patients at risk of colitis-associated cancer
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf184
PMID:41081629
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫表型分析，揭示了慢性炎症诱导的免疫适应如何促进炎症性肠病患者中结肠炎相关癌症的发育 | 结合GeoMx数字空间分析和成像质谱流式技术，首次在组织学未发炎的结肠中识别出代谢和应激反应通路上调，以及CD8+上皮内T细胞减少与癌症风险的关联 | 样本量较小（发现队列11例，验证队列最多18例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 确定慢性炎症诱导的免疫细胞重编程在炎症性肠病患者中促进结肠炎相关癌症发展的机制 | 结肠炎相关癌症患者、散发性结直肠癌患者、有或无发育不良的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 结肠炎相关癌症 | 空间转录组学、成像质谱流式、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、成像质谱数据、组织图像 | 发现队列11例（CAC和SCRC患者），验证队列包括CAC患者10例、SCRC患者14例，以及IBD患者有发育不良6例、无发育不良18例 | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式 | GeoMx | GeoMx数字空间分析 |
| 2902 | 2026-02-13 |
Exploring the regulatory mechanisms of paraptosis-related prognostic genes in gastric cancer using single-cell sequencing and transcriptome analysis
2025-Oct-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-20037-2
PMID:41094022
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析，探索了胃癌中类凋亡相关基因的调控机制及其预后价值 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA转录组数据结合，系统性地鉴定了胃癌中8个与类凋亡相关的预后基因，并构建了有效的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证，且未进行深入的体外或体内功能实验验证 | 探究类凋亡相关基因在胃癌中的功能、预后意义及对肿瘤微环境的影响，为临床预后评估和治疗策略提供新见解 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 回归分析模型，风险预测模型，列线图 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 未明确具体样本数量，数据来源于公共数据库（TCGA等） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2903 | 2026-02-13 |
ER-phagy Activation by AMFR Attenuates Cardiac Fibrosis Post-Myocardial Infarction via mTORC1 Pathway
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504552
PMID:40673870
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研究论文 | 本研究探讨了自分泌运动因子受体（AMFR）通过激活内质网选择性自噬（ER-phagy）抑制心肌梗死后心脏纤维化的机制 | 首次揭示了AMFR通过催化FAM134B的K27和K33连接泛素化来增强ER-phagy活性，进而抑制mTORC1通路，从而减轻心脏纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中进行验证 | 探究ER-phagy在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其调控机制 | 小鼠心脏组织、心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2904 | 2026-02-13 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity in Differentiation Trajectory and Tumor Microenvironment Leading to More Aggressive Phenotypes of Papillary Thyroid Cancer in Children and Young Adult Patients
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417672
PMID:40719066
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌的异质性、分化轨迹及肿瘤微环境特征，并指出其更具侵袭性的表型 | 首次在儿童及年轻成人PTC患者中通过单细胞RNA测序系统描绘了肿瘤生态系统异质性，发现其缺乏成人患者中存在的'温和状态'恶性甲状腺细胞群，并揭示了emCAFs_LAMP5在促进肿瘤血管生成和转移中的关键作用 | 样本量相对较小（11例患者），且研究为观察性，需要更大规模队列和功能实验验证 | 阐明儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌的肿瘤生态系统异质性及其与临床侵袭性的关系 | 11例儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌患者的肿瘤及癌旁组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者（儿童及年轻成人）的肿瘤及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2905 | 2026-02-13 |
Crosstalk between the microbiota and intestinal dendritic cells in IBD
2025-Sep-30, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-025-01062-9
PMID:41028655
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综述 | 本文综述了肠道常规树突状细胞（cDCs）在炎症性肠病（IBD）中的功能，以及微生物群对cDC生物学的影响 | 总结了单细胞测序技术如何帮助定义cDCs及其亚群，并探讨了微生物群在IBD背景下对cDC功能的影响 | cDCs在IBD中的确切作用仍不明确，特别是微生物群如何影响其功能 | 理解cDCs在肠道和IBD中的功能，以及微生物群在cDC生物学中的作用，以开发新的IBD治疗策略 | 肠道常规树突状细胞（cDCs）和肠道微生物群 | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2906 | 2026-02-13 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
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研究论文 | 本研究首次通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络与多尺度转录组学数据，全面绘制了食管鳞状细胞癌微环境的代谢图谱 | 首次在ESCC微环境中全面映射代谢景观，基于代谢状态组成识别了与预后相关的独特亚型 | 研究主要基于转录组数据，缺乏直接的代谢物验证实验 | 探索ESCC微环境中代谢状态与患者预后的关系 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞，以及两个独立队列（n=79和119） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2907 | 2026-02-13 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 结合单细胞基因表达和可及染色质谱分析，识别了激活干细胞中的转录异质性，并发现了一组在损伤前就表观遗传学上准备就绪的静息细胞 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2908 | 2026-02-13 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面分析了气液界面培养对人类肺类器官上皮细胞分化的影响 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统揭示了气液界面培养如何通过调控特定信号通路促进纤毛细胞分化 | 研究仅基于体外类器官模型，未在体内验证；样本量相对有限 | 识别影响上皮细胞分化的关键因素，以开发体外呼吸模型 | 人类肺类器官中的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2909 | 2026-02-13 |
Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400269
PMID:39404059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，建立了透镜诱导型近视（LIM）及电针（EA）干预下豚鼠视网膜细胞的完整图谱，并揭示了EA通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的潜在机制 | 首次在单细胞水平上建立了LIM和EA干预下豚鼠视网膜的综合图谱，并发现了EA通过上调视锥细胞和Müller胶质细胞中线粒体呼吸链相关基因（如COX3、ND4、ND2）的表达来改善视网膜线粒体功能，从而减缓近视进展 | 研究仅在豚鼠模型中进行，结果是否适用于人类近视尚需进一步验证；研究主要基于基因表达分析，功能验证实验相对有限 | 探索电针（EA）减缓实验性近视进展的潜在分子机制 | 透镜诱导型近视（LIM）的豚鼠模型 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及LIM和EA处理的豚鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2910 | 2026-02-13 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
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研究论文 | 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞分化，揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程，系统解析了年龄和基质硬度对肌肉干细胞分化的协同影响，并发现TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的特异性激活 | 研究主要基于体外模型和动物实验，人类肌肉组织的直接证据尚不充分；BAPN治疗的长期效果和副作用未深入评估 | 阐明年龄相关ECM硬化导致肌肉干细胞功能障碍的分子机制 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老肌肉干细胞在软/硬基质上的四组对比实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2911 | 2026-02-13 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612751
PMID:39314376
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和流式细胞术，验证了骨髓中中央骨髓和骨内膜两个空间区室在炎症扰动下的特异性变化，揭示了I型干扰素反应如何影响间充质基质细胞的炎症表型，从而调节局部单核细胞动态 | 开发了一种可重复识别小鼠骨髓中7个关键中央骨髓和骨内膜群体的组合方法，并首次系统展示了不同扰动对骨髓区室的特异性影响，特别是I型干扰素反应在炎症中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类骨髓区室的直接应用尚未验证；方法可能受技术限制，如单细胞测序的覆盖深度和流式细胞术的标记特异性 | 探究骨髓空间区室化在炎症和肿瘤响应中的重要性，开发分子和功能表征方法 | 小鼠骨髓中的造血干细胞和祖细胞（HSPC）以及基质细胞，特别是中央骨髓和骨内膜区室 | 单细胞组学 | 炎症相关疾病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 跨多个小鼠品系的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2912 | 2026-02-13 |
Activation of cGAS/STING Drives Inflammation and Cellular Senescence of Macrophages in Ovarian Endometrioma Induced by Endometriotic Cyst Fluid
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300711
PMID:38864247
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研究论文 | 本研究探讨了卵巢子宫内膜异位囊肿液通过激活cGAS/STING通路驱动巨噬细胞炎症和细胞衰老的机制，并验证了STING抑制剂H-151的治疗潜力 | 首次整合临床样本、单细胞测序及体内外模型，揭示OE液通过cGAS/STING通路导致卵巢功能下降的具体机制，并发现STING抑制剂H-151能有效缓解相关病理变化 | 未明确说明样本量大小或具体实验模型细节，机制研究可能仍需进一步验证 | 探究卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其分子机制 | 卵巢子宫内膜异位囊肿液、巨噬细胞、卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜异位症 | 单细胞测序、生物信息学分析、体内外实验模型 | NA | 测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2913 | 2026-02-13 |
Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400056
PMID:38977414
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综述 | 本文综述了癌症类器官作为三维培养技术在癌症研究中的应用、优势、局限性和前景 | 介绍了四种主要癌症类器官类型，并讨论了单细胞RNA测序在探索癌症类器官中的最新应用 | 讨论了癌症类器官模型的局限性，包括其在模拟复杂肿瘤微环境方面的挑战 | 推动基础癌症研究向临床肿瘤治疗的转化，提高肿瘤药物开发成功率 | 癌症类器官模型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2914 | 2026-02-13 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400120
PMID:38864263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面描述了雷公藤甲素诱导小鼠肾毒性的转录组图谱和细胞组成 | 首次在单细胞分辨率下系统解析雷公藤甲素诱导肾毒性的机制，揭示了肾单位上皮细胞的异质性反应、血管功能破坏以及免疫细胞损伤等新发现 | 研究仅基于小鼠模型，未在人体中进行验证；样本量相对有限；机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明雷公藤甲素诱导肾毒性的分子机制和细胞类型特异性反应 | 小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 肾毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和雷公藤甲素处理组小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2915 | 2026-02-13 |
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00484-9
PMID:38326887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了套细胞淋巴瘤中HSP90-MYC-CDK9网络是治疗耐药性的主要驱动力 | 首次在套细胞淋巴瘤中通过单细胞RNA测序分析揭示了从BTKi到CAR-T疗法的序贯耐药机制，并识别出HSP90AB1和CDK9作为早期驱动因子 | 样本量相对较小（25名患者的66个样本），且为观察性研究，需要进一步功能验证和临床试验确认 | 剖析套细胞淋巴瘤对BTKi和CAR-T疗法序贯耐药的潜在机制 | 套细胞淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 25名患者的66个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2916 | 2026-02-13 |
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0091135
PMID:38505815
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综述 | 本文综述了空间转录组学中深度学习模型的应用，探讨了现有工具、挑战及未来方向 | 深入探讨深度学习在空间转录组学数据分析中的新兴应用，包括对齐、空间重建和空间聚类等前沿模型 | 深度学习模型在空间转录组学分析中仍处于早期阶段，应用范围有限且未充分探索 | 综述空间转录组学数据分析的现有工具，特别关注深度学习方法的进展与潜力 | 空间转录组学数据，包括基因表达谱和组织结构信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 多模态数据（包括组织学图像、计数矩阵等） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2917 | 2026-02-13 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和RT-qPCR技术，发现体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNA表达，与体内E13.5或更晚的性原细胞不同 | 首次揭示体外分化的mPGCLCs在特定时间点未激活piRNA通路，挑战了先前关于其作为研究胎儿piRNA通路模型的假设 | 研究仅针对第6天的mPGCLCs，未涵盖更长时间点的分化过程，且未深入探讨piRNA缺失的具体分子机制 | 评估体外分化的小鼠原始生殖细胞样细胞是否具备功能性piRNA通路，以验证其作为研究模型的适用性 | 小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）及其分化过程中的piRNA通路 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个第6天mPGCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 小RNA-seq | NA | NA |
| 2918 | 2026-02-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25607-2
PMID:34489460
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血液阶段从增殖型'细长体'向传播型'粗短体'的发育过程，重构了细胞周期进展和发育群体感应 | 首次通过单细胞转录组学在体外模型中系统解析了布氏锥虫异步发育过程中的转录动态和调控因子，并定位了粗短体细胞周期退出的精确阶段 | 研究基于体外诱导分化模型，可能无法完全模拟宿主体内的自然发育环境 | 解析布氏锥虫血液阶段发育分化的转录调控机制和细胞周期动态 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei） | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 8,599个寄生虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2919 | 2026-02-13 |
Application of single-cell transcriptomics to kinetoplastid research
2021-09, Parasitology
IF:2.1Q2
DOI:10.1017/S003118202100041X
PMID:33678213
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的应用，包括技术选择、样本制备和数据分析挑战 | 首次系统性地总结了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的潜力，并提供了实验设计和数据分析的实用指导 | 主要基于现有文献综述，缺乏原创实验数据，且技术应用仍处于早期阶段 | 探讨单细胞转录组学技术在动质体寄生虫研究中的应用潜力和方法学 | 动质体寄生虫（包括利什曼原虫、锥虫等）及其宿主相互作用 | 单细胞组学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2920 | 2026-02-12 |
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114397
PMID:41660258
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，开发了一个基于细胞死亡基因的共识诊断分类器，用于颈动脉狭窄的早期检测 | 首次整合了内部RNA-seq队列与八个公共数据集，结合十种机器学习算法构建了105个模型配置，并识别出IRF1、FYCO1和FDFT1组成的诊断签名，通过单细胞测序和功能实验验证了FYCO1的下调及其在自噬和炎症信号中的作用 | 研究依赖于多个公共数据集，可能存在批次效应或数据异质性，且样本量相对有限（共696个样本），需要进一步在独立队列中验证MLDS的临床适用性 | 开发一种分子工具以改善颈动脉狭窄的早期诊断 | 颈动脉狭窄患者样本及相关分子数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 | 逻辑回归, 共识机器学习（结合十种算法） | RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验验证数据 | 696个样本（整合一个内部队列和八个公共数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学（未明确指定，但涉及单细胞分析） | NA | NA |