单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 2901 - 2920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2901 | 2026-02-05 |
PRDX6 as a Ferroptosis-Related Hub Gene in the Entorhinal Cortex of Alzheimer's Disease: A Multidimensional Bioinformatics and Experimental Validation Study
2026-Feb-04, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02482-4
PMID:41634496
|
研究论文 | 本研究通过多维生物信息学分析和实验验证，识别了PRDX6作为阿尔茨海默病内嗅皮层中与铁死亡相关的枢纽基因，并评估了其诊断和治疗潜力 | 首次将PRDX6确立为连接铁死亡、免疫细胞动态和AD神经病理学的关键介导因子，为AD诊断和治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型，需要进一步在体内模型和临床样本中进行验证 | 识别并验证阿尔茨海默病内嗅皮层中与铁死亡相关的枢纽基因，探索其诊断和治疗潜力 | 阿尔茨海默病患者的内嗅皮层组织、Aβ诱导的U251星形胶质细胞模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、Western blot、机器学习 | LASSO、随机森林 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个GEO数据集（GSE138852、GSE5281、GSE48350、GSE118553） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2902 | 2026-02-05 |
Landscape of microRNA and target expression variation and covariation in single mouse embryonic stem cells
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279914.124
PMID:41526192
|
研究论文 | 本研究通过遗传扰动和多组学方法，系统探讨了小鼠胚胎干细胞中microRNA的替代功能及其对靶基因表达变异和共变的影响 | 首次在单细胞水平上提供了microRNA动力学的全局视图，揭示了microRNA形成四个不同的共表达组，并发现某些microRNA如miR-182具有相反功能 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞，未在其他细胞类型或生物体中验证，且依赖于遗传删除特定microRNA的方法 | 系统研究microRNA在小鼠胚胎干细胞中的替代功能，包括对靶基因表达变异和共变的影响 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）中的microRNA及其靶基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq、转录抑制 | NA | RNA序列数据 | 单细胞水平的小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2903 | 2026-02-05 |
scSHEFT enables multiomics label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq through dual alignment
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280410.125
PMID:41558828
|
研究论文 | 本文提出了一种新的标签转移工具scSHEFT，用于从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据转移多组学标签 | scSHEFT通过同时考虑基因表达计数数据、峰值计数数据和基因活性分数作为输入，并采用双重对齐策略来桥接异质特征之间的差距 | NA | 开发一种能够从scRNA-seq数据向scATAC-seq数据有效转移多组学标签的工具 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达计数数据, 峰值计数数据, 基因活性分数 | 七个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2904 | 2026-02-05 |
Genetic insights into therapeutic targets for gestational diabetes mellitus: a multi-omics analysis
2026-Feb-03, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05053-x
PMID:41632246
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别了妊娠期糖尿病的遗传支持药物靶点 | 结合cis-eQTL、全基因组关联数据、MR、SMR、共定位分析、cis-pQTL MR和scRNA-seq，系统识别GDM的因果基因和细胞类型特异性表达 | 未明确提及样本量或数据来源的具体限制 | 识别妊娠期糖尿病的遗传支持药物靶点，为基于机制的疗法和精准预防策略提供基础 | 妊娠期糖尿病（GDM） | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病 | 全基因组关联研究、Mendelian randomization、单细胞RNA测序 | Mendelian randomization、SMR、共定位分析 | 遗传数据、表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2905 | 2026-02-05 |
Decoding cytokine networks in ulcerative colitis to identify pathogenic mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adt0986
PMID:41632832
|
研究论文 | 本文通过系统免疫学建模分析溃疡性结肠炎的单细胞转录组数据，构建了复杂的细胞因子信号网络，以揭示疾病发病机制和潜在治疗靶点 | 利用单细胞转录组数据构建细胞因子信号网络，识别了治疗初治患者特有的细胞因子子网络、疾病状态中交互模式改变的细胞因子，以及JAK家族介导的细胞因子-细胞因子相互作用，特别是将TL1A定位为TNF和IL-23A的上游调节因子 | 研究基于体外验证（结肠上皮类器官和固有淋巴样细胞共培养），可能未完全模拟体内复杂环境，且样本来源和数量可能限制普遍性 | 解码溃疡性结肠炎中的细胞因子网络，以识别致病机制和治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本，包括治疗初治和治疗暴露患者 | 系统免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学 | 系统免疫学建模 | 单细胞转录组数据 | 来自溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2906 | 2026-02-05 |
The fetal trophoblast cell marker HLA-G activates a type I interferon response in primary NK cells through the receptor KIR2DL4
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adv2400
PMID:41632833
|
研究论文 | 本研究揭示了胎儿滋养层细胞表达的HLA-G通过受体KIR2DL4激活原代NK细胞中的I型干扰素反应，并探讨其在早期妊娠中的作用 | 发现HLA-G通过非经典途径选择性诱导I型干扰素刺激基因（ISGs）的转录，并揭示了KIR2DL4胞质尾端与JAK1结合的新机制 | 研究主要基于体外实验，体内验证和临床相关性需进一步探索 | 探究HLA-G在早期妊娠中如何调节NK细胞的免疫反应 | 原代NK细胞和早期妊娠母胎界面的细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2907 | 2026-02-05 |
Happening in the Prostate Tumor Microenvironment: Ion Channels and Extrachromosomal DNA Driving Phenotypic Plasticity
2026-Feb-03, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70139
PMID:41632930
|
综述 | 本文综述了离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中的关键作用，探讨了它们如何驱动肿瘤可塑性、耐药性和疾病进展 | 整合了离子通道生物学和染色体外DNA动力学，并利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了它们在肿瘤和基质细胞群中的表达谱，揭示了新的治疗靶点 | 本文是一篇综述，主要基于现有证据和公开数据集的分析，缺乏原创性的实验验证 | 探讨离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤可塑性、耐药性和疾病进展中的作用机制 | 前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开的单细胞RNA测序数据集（原发性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2908 | 2026-02-05 |
YAP1-driven tumor-like cancer-associated fibroblasts modulate biomechanics of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-03, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02346-z
PMID:41634388
|
研究论文 | 本研究揭示了YAP1驱动的肿瘤样癌症相关成纤维细胞（tCAFs）在调控胰腺导管腺癌（PDAC）生物力学特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出与高YAP1活性相关的tCAFs亚群，并阐明YAP1介导mCAFs向tCAFs转化及细胞外基质重塑的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；YAP1抑制剂与吉西他滨联合疗法的长期疗效和安全性需进一步评估 | 探究YAP1如何通过调控CAFs亚群促进PDAC基质重塑和疾病进展 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的癌症相关成纤维细胞（CAFs）亚群、细胞外基质（ECM）和肿瘤生物力学特性 | 单细胞组学与肿瘤微环境 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、磁共振弹性成像（MRE） | KPC小鼠模型 | 单细胞转录组数据、生物力学成像数据 | PDAC患者和小鼠模型的样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2909 | 2026-02-05 |
Effector Functions of Conventional and Unconventional Mycobacterium tuberculosis (Mtb)-Specific T Cells
2026-Feb-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041829
PMID:41184129
|
综述 | 本文综述了传统与非传统结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能及其在免疫防御和免疫病理中的作用 | 整合了单细胞和空间转录组学的最新发现，揭示了T细胞亚群的异质性、功能可塑性和空间区隔化，并强调了肺实质组织驻留记忆T细胞作为保护性免疫关键预测因子的新认识 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行总结，未提出新的实验数据或验证性研究 | 阐明结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能，并探讨其对疫苗设计策略的启示 | 结核分枝杆菌特异性T细胞，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞和非传统T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2910 | 2026-02-05 |
Single-Cell Analysis, Spatial Transcriptomics and Molecular Docking Unveil Potential Therapeutic Targets for Carotid Atherosclerosis
2026-02-02, Balkan medical journal
IF:1.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、空间转录组学和分子对接分析，揭示了颈动脉粥样硬化的细胞亚群、相互作用及潜在治疗靶点 | 整合单细胞测序、空间转录组学和分子对接技术，首次系统解析颈动脉粥样硬化的细胞异质性及区域特异性表达模式 | 研究基于公共数据库的测序数据，缺乏实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 解析颈动脉粥样硬化的细胞亚群功能与相互作用，发现潜在治疗靶点 | 颈动脉粥样硬化相关的细胞亚群，包括巨噬细胞、内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，空间转录组学，分子对接 | NA | 单细胞测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2911 | 2026-02-05 |
Neoplastic Immune Mimicry Potentiates Breast Tumor Progression
2026-Feb-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0985
PMID:41129726
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过去分化程序表达白细胞表面受体蛋白，即“免疫模拟”，从而增强肿瘤进展和耐药性 | 首次在乳腺癌中发现并命名了“免疫模拟”现象，即肿瘤细胞表达白细胞表面受体，并证明其与疾病侵袭性和治疗抵抗相关 | 研究主要基于公共数据集和实验模型，临床样本验证有限，且具体分子机制尚未完全阐明 | 探究乳腺癌细胞去分化过程中的免疫模拟现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌肿瘤样本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织病理学图像 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、组织病理学标本、乳腺癌细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2912 | 2026-02-05 |
CHIP ahoy: charting a decade of discovery in clonal hematopoiesis
2026-Feb-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283896
PMID:40905074
|
综述 | 本文回顾了过去十年在克隆性造血（CH）研究领域的发现进展，重点介绍了测序技术、风险因素、临床意义及管理策略的演变 | 系统性地总结了从被动观察到主动干预的范式转变，并强调了新兴临床试验框架中风险分层、去中心化模型和新型终点的应用 | 作为一篇综述文章，未报告原始研究数据，其结论基于对现有文献的整合与分析 | 回顾克隆性造血领域的十年研究进展，并展望其早期检测、精准治疗和预防的未来方向 | 克隆性造血（CH）及其与髓系恶性肿瘤、心血管疾病和实体瘤治疗的相关性 | NA | 髓系恶性肿瘤, 心血管疾病 | 下一代测序, 单细胞测序 | 计算模型 | 基因组测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2913 | 2026-02-05 |
Distinct Roles of IL-4, IL-13, and IL-22 in Human Skin Barrier Dysfunction and Atopic Dermatitis
2026-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70060
PMID:40985485
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学、RNA测序和蛋白质组学等方法，揭示了IL-4、IL-13和IL-22在人类皮肤屏障功能障碍和特应性皮炎中的不同作用 | 首次在具有完整屏障和免疫细胞的生物稳定化人类皮肤模型中，系统比较了IL-4、IL-13和IL-22对皮肤屏障功能的独特影响，并揭示了它们之间的免疫交叉调控机制 | 研究主要基于离体皮肤模型，虽然比重建角质形成细胞更接近真实情况，但仍可能与体内环境存在差异 | 阐明IL-4、IL-13和IL-22在特应性皮炎皮肤屏障功能障碍中的具体作用和相互关系 | 人类皮肤组织（包括AD病变和非病变皮肤）、离体生物稳定化人类皮肤模型、dupilumab治疗的AD患者皮肤活检样本 | 空间转录组学 | 特应性皮炎 | 空间转录组学、RNA测序、非靶向蛋白质组学、电阻抗光谱法 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、电生理数据 | AD患者皮肤样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2914 | 2026-02-05 |
A Comprehensive Analysis of Type I Interferon Risk Gene Signatures in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70211
PMID:41635152
|
研究论文 | 本研究全面分析了系统性红斑狼疮中I型干扰素风险基因特征，识别了四个因果基因并揭示了IFI44L低甲基化的表观遗传驱动作用 | 首次通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序和外部队列验证，确定了HERC5、IFIT3、IFI44L和IFI6作为SLE的因果I型干扰素风险基因，并发现IFI44L低甲基化是I型干扰素通路激活的关键表观遗传驱动因素 | 研究主要基于FinnGen队列和外部验证数据，样本多样性可能有限，且未深入探讨这些基因在SLE不同亚型或病程阶段中的动态变化 | 全面表征系统性红斑狼疮中I型干扰素风险基因特征，探索其与疾病风险的因果关系及临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者（705例病例）及健康对照（385,509例对照）的遗传和表达数据，以及单细胞RNA测序数据中的外周血单个核细胞和单核细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析、线性回归模型 | 单变量和多变量线性回归模型 | 基因表达数据、遗传数据、表观遗传数据 | 705例SLE病例和385,509例对照（FinnGen队列），外加单细胞RNA测序和外部验证队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2915 | 2026-02-05 |
Targeting PKMYT1 enhances antitumor immune responses to PD-L1 blockade in castration-resistant prostate cancer
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013247
PMID:41617394
|
研究论文 | 本研究揭示了PKMYT1在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中作为肿瘤进展和免疫逃逸的关键双重调节因子，并证明靶向PKMYT1可增强抗PD-L1免疫治疗的疗效 | 首次将PKMYT1鉴定为CRPC中调节肿瘤免疫微环境的关键靶点，并阐明其通过激活cGAS-STING通路和干扰素信号来增强抗肿瘤免疫应答的机制 | 研究主要基于临床前模型（细胞系和小鼠模型），尚未在人体临床试验中得到验证 | 克服CRPC对免疫治疗的耐药性，开发新的联合治疗策略 | 去势抵抗性前列腺癌（CRPC） | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 公共数据库中的前列腺癌样本、临床前列腺癌标本队列、前列腺癌细胞系、同基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2916 | 2026-02-05 |
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
2026-Jan-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013304
PMID:41611243
|
研究论文 | 本研究探讨了手术诱导的髓源性抑制细胞（sx-MDSCs）通过PI3K-γ信号通路抑制自然杀伤细胞活性并促进术后转移的机制，并提出了PI3K-γ抑制剂作为潜在治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序和功能筛选，揭示了手术诱导的MDSCs中PI3K-γ信号通路的激活及其在术后免疫抑制和转移中的关键作用，并验证了PI3K-γ抑制剂在临床前模型中的治疗效果 | 研究样本量有限（n=55），且临床前模型结果需进一步在更大规模临床试验中验证 | 旨在功能表征手术诱导的MDSCs，并探索减轻其免疫抑制作用的潜在治疗策略 | 癌症患者（n=55）的手术样本和临床前小鼠模型 | 数字病理学 | 癌症 | 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序, 小分子筛选 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 55名癌症患者的手术样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2917 | 2026-02-05 |
Cellular and molecular mechanisms of nasolacrimal duct obstruction: New insights into CD4+ T cell-MIF-fibroblast pathways
2026-Jan-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.060
PMID:41611124
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鼻泪管阻塞(NLDO)的细胞转录组图谱，并阐明了以巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)为中心的CD4+ T细胞-成纤维细胞通路在纤维化过程中的关键作用 | 首次在NLDO中应用单细胞RNA测序技术，识别了CD4+ T细胞通过MIF激活成纤维细胞并形成自持性反馈循环的新机制 | 样本量较小（4例用于单细胞测序，13例用于功能验证），且仅针对绝经后女性患者，可能限制结果的普适性 | 阐明鼻泪管阻塞的免疫调控机制，特别是纤维化过程的细胞和分子基础 | 鼻泪管阻塞患者的鼻泪管组织、体液样本 | 数字病理学 | 鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例患者用于单细胞RNA测序（67,658个细胞），13例患者用于组织学和体外功能实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2918 | 2026-02-05 |
Developmental single-cell atlas of coronary vessel growth and cardiomyocyte interaction in zebrafish
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205065
PMID:41531417
|
研究论文 | 本研究结合高分辨率成像与单细胞RNA测序技术，系统描绘了斑马鱼冠状动脉血管发育的细胞与分子图谱，揭示了血管与心肌细胞相互作用的动态过程 | 首次构建斑马鱼冠状动脉发育的单细胞时空图谱，定义了四个发育阶段里程碑，并发现血管支架引导心肌细胞生长的新机制 | 研究局限于斑马鱼模型，哺乳动物冠状动脉发育可能存在物种特异性差异 | 解析冠状动脉血管发育的细胞分子机制及其与心肌细胞生长的协同关系 | 斑马鱼心脏发育过程中的冠状动脉血管网络与心室细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、高分辨率成像、遗传操作技术 | NA | 单细胞转录组数据、显微图像数据 | 37,554个心室细胞，涵盖7-30mm体长范围的发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2919 | 2026-02-05 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
|
综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用及其对显微镜、成像、药物发现和合成生物学等领域的影响 | 系统性地探讨了AI在单细胞分辨率图像分析、复杂生物数据模式识别、细胞行为建模以及蛋白质结构预测等方面的创新应用，并强调了AI工具民主化的未来方向 | NA | 探索人工智能在细胞生物学中的变革性作用及其对基础研究和治疗应用的潜在推动 | 细胞生物学中的复杂生物数据，包括细胞图像、单细胞转录组学数据、蛋白质结构和细胞行为 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 图像、生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2920 | 2026-02-05 |
S2potAE: multimodal spatial spot autoencoder integrating image and transcriptomic features for deconvolution
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag020
PMID:41619214
|
研究论文 | 本文提出了一种名为S2potAE的多模态空间点自编码器框架，通过整合基因表达数据、空间坐标和组织学图像的形态特征，用于精确的空间转录组学点水平反卷积 | S2potAE创新性地采用多级特征聚合策略，结合基于图的空间编码器和组织学图像的感知嵌入，并引入辅助病理分类任务以增强生物相关性和模型可解释性 | NA | 解决空间转录组学中由于粒度差异、批次效应和空间异质性导致的细胞类型比例准确确定难题 | 人类乳腺癌、小鼠大脑前部和人类背外侧前额叶皮层的模拟与真实数据集 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 自编码器 | 基因表达数据、空间坐标、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |