本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 29141 | 2024-08-09 | Characterization and generation of human definitive multipotent hematopoietic stem/progenitor cells 
          2020-Dec-01, Cell discovery
          
          IF:13.0Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41421-020-00213-6
          PMID:33298886
         | 研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,解析了人类早期造血阶段的多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)的特征,并从人类胚胎干细胞(hESCs)中生成了这些细胞 | 首次详细描述了人类早期造血过程中的分子特征,并发现了CD44在区分早期原始和确定性造血中的特异性作用 | NA | 深入理解人类早期造血过程,并为临床目的生成血液和免疫细胞提供基础 | 人类多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)及其在早期造血过程中的特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 29142 | 2024-08-09 | Evolving insights: how DNA repair pathways impact cancer evolution 
          2020-11-15, Cancer biology & medicine
          
          IF:5.6Q1
          
         | 综述 | 本文综述了DNA修复途径如何影响癌症进化的最新发现 | 利用单细胞测序等新技术深入理解癌症进化及其与DNA修复的关系 | NA | 探讨DNA修复对癌症进化的影响及其在临床治疗中的应用 | 癌症进化及其与DNA修复的关系 | NA | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 29143 | 2024-08-09 | Single-cell rna seq analysis identifies the biomarkers and differentiation of chondrocyte in human osteoarthritis 
          2020, American journal of translational research
          
          IF:1.7Q4
          
         
          
          PMID:33312370
         | 研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术识别骨关节炎中软骨细胞的生物标志物及其分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨关节炎中不同类型软骨细胞的表达谱,并预测了与软骨细胞增殖和分化紧密相关的关键基因 | NA | 识别骨关节炎中软骨细胞的潜在标志物并探索不同类型软骨细胞在骨关节炎中的功能 | 骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 480个软骨细胞样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 29144 | 2024-08-09 | Single-Cell Sequencing of Glioblastoma Reveals Central Nervous System Susceptibility to SARS-CoV-2 
          2020, Frontiers in oncology
          
          IF:3.5Q2
          
         
          DOI:10.3389/fonc.2020.566599
          PMID:33312949
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胶质母细胞瘤对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 揭示了SARS-CoV-2神经侵袭的机制,并指出了神经系统细胞对SARS-CoV-2的易感性 | NA | 探讨中枢神经系统对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及胶质母细胞瘤和正常脑组织样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 29145 | 2024-08-09 | Female reproductive tract has low concentration of SARS-CoV2 receptors 
          2020, PloS one
          
          IF:2.9Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pone.0243959
          PMID:33315943
         | 研究论文 | 研究调查了女性生殖器官中SARS-CoV2受体的表达情况 | 首次通过单细胞测序数据分析了女性生殖组织中SARS-CoV2受体的表达,发现这些组织中受体表达较低 | 研究仅限于分析已有的单细胞测序数据,未进行新的实验验证 | 探讨SARS-CoV2在女性生殖系统中的感染风险 | 女性生殖器官如子宫、子宫肌层、卵巢、输卵管和乳腺 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 涉及多个女性生殖器官的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | 
| 29146 | 2024-08-09 | Coupled co-clustering-based unsupervised transfer learning for the integrative analysis of single-cell genomic data 
          2021-07-20, Briefings in bioinformatics
          
          IF:6.8Q1
          
         
          DOI:10.1093/bib/bbaa347
          PMID:33279962
         | 研究论文 | 本文提出了一种基于耦合协同聚类的无监督迁移学习算法(coupleCoC),用于多模态单细胞基因组数据的整合分析 | coupleCoC算法基于信息理论的协同聚类框架,能够同时对细胞和基因组特征进行聚类,减少单细胞数据的噪声,并促进单细胞数据集之间的知识转移 | NA | 开发一种新的无监督迁移学习算法,用于整合分析多模态单细胞基因组数据 | 多模态单细胞基因组数据,包括单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)和单细胞甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、单细胞甲基化数据 | 协同聚类 | 基因组数据 | 涉及多种单细胞基因组数据集,包括scATAC-seq和scRNA-seq数据、单细胞甲基化和scRNA-seq数据以及来自小鼠和人类的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | 
| 29147 | 2024-08-09 | FEATS: feature selection-based clustering of single-cell RNA-seq data 
          2021-07-20, Briefings in bioinformatics
          
          IF:6.8Q1
          
         
          DOI:10.1093/bib/bbaa306
          PMID:33285568
         | 研究论文 | 本文介绍了一种基于特征选择的单细胞RNA测序数据聚类工具FEATS | FEATS采用单变量特征选择方法进行聚类,通过选择最具有信息量的特征来提高聚类性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多种单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA | 
| 29148 | 2024-08-09 | Stem cell-intrinsic mechanisms regulating adult hair follicle homeostasis 
          2021-04, Experimental dermatology
          
          IF:3.5Q1
          
         
          DOI:10.1111/exd.14251
          PMID:33278851
         | 研究论文 | 本文聚焦于成体毛囊干细胞(HFSCs)内在机制在毛囊稳态中的调节作用 | 讨论了单细胞RNA测序和活体成像等技术进步,揭示了HFSC及其前体细胞的异质性,并增进了对HFSC与微环境间交流的理解 | NA | 探讨HFSC内在机制在成体皮肤稳态中的作用 | 成体毛囊干细胞及其在毛发生长和皮肤伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序,活体成像 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 29149 | 2024-08-09 | Melatonin improves the effect of cryopreservation on human oocytes by suppressing oxidative stress and maintaining the permeability of the oolemma 
          2021-Mar, Journal of pineal research
          
          IF:8.3Q1
          
         
          DOI:10.1111/jpi.12707
          PMID:33274466
         | research paper | 本研究探讨了褪黑素(MLT)通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来改善人类卵子冷冻保存效果的作用 | 首次报道了褪黑素在人类卵子冷冻保存中的应用,通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来提高卵子的发育能力 | 研究仅限于体外成熟的卵子,未涉及体内环境的影响 | 研究褪黑素对人类卵子冷冻保存效果的影响 | 体外成熟的卵子 | NA | NA | 荧光染色、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 卵子 | 随机分为新鲜组、MLT处理冷冻保存组(MC组)和无MLT处理冷冻保存组(NC组),每组包含10 μM、100 μM、1 mM和10 mM的MLT处理子组 | NA | NA | NA | NA | 
| 29150 | 2024-08-09 | Similarities between bovine and human germline development revealed by single-cell RNA sequencing 
          2021-03, Reproduction (Cambridge, England)
          
         
          DOI:10.1530/REP-20-0313
          PMID:33275120
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序、定量实时PCR和免疫荧光分析,研究了牛和人类原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 | 揭示了牛和人类原始生殖细胞在基因表达和分化模式上的相似性 | NA | 评估牛原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 | 牛和人类的原始生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 40至90天胎龄的牛胎儿生殖腺 | NA | NA | NA | NA | 
| 29151 | 2024-08-09 | Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2 
          2021-03, Nature biotechnology
          
          IF:33.1Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41587-020-0739-1
          PMID:33288904
         | 研究论文 | 本文介绍了Slide-seqV2技术,该技术通过改进文库生成、珠子合成和阵列索引,实现了接近单细胞分辨率的高灵敏度空间转录组学分析 | Slide-seqV2的RNA捕获效率提高了约50%,接近基于液滴的单细胞RNA-seq技术的检测效率 | NA | 旨在提高空间转录组学技术的灵敏度和分辨率,以更好地理解组织形成和功能 | 研究对象包括小鼠海马体中的神经元和新生小鼠大脑皮层的时空发育 | 空间转录组学 | NA | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠海马体和新生小鼠大脑皮层的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 29152 | 2024-08-09 | Cyclophosphamide and Vinorelbine Activate Stem-Like CD8+ T Cells and Improve Anti-PD-1 Efficacy in Triple-Negative Breast Cancer 
          2021-02-01, Cancer research
          
          IF:12.5Q1
          
         
          DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1818
          PMID:33268528
         | 研究论文 | 研究通过使用三阴性乳腺癌模型,探讨了环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗对肿瘤内免疫环境的影响 | 该研究首次展示了环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗能够激活抗原呈递细胞,增加肿瘤内Tcf1干细胞样CD8 T细胞,并促进前体耗竭CD8 T细胞的增加 | 研究主要在动物模型中进行,需要进一步的临床试验验证其疗效 | 探讨环磷酰胺、检查点抑制剂和长春瑞滨联合治疗在三阴性乳腺癌中的免疫调节作用 | 三阴性乳腺癌模型中的免疫细胞和肿瘤生长 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个肿瘤内免疫细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 29153 | 2024-08-09 | Single-cell RNA-Seq revealed profound immune alteration in the peripheral blood of patients with bacterial infection 
          2021-Feb, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
          
          IF:4.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ijid.2020.11.205
          PMID:33278616
         | 研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了细菌感染患者外周血中免疫细胞的变化 | 开发了名为PBMCode的条形码分析框架,揭示了细菌感染下外周血中免疫细胞群和细胞状态的详细变化 | 需要在未来研究中进一步关注宿主对细菌感染反应的复杂性 | 更好地理解人类宿主对细菌感染的反应,以改善人类健康 | 细菌感染患者外周血中的免疫细胞 | NA | 细菌感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | 外周血单个核细胞(PBMCs) | NA | NA | NA | NA | 
| 29154 | 2024-08-09 | Gene Regulatory Network Analysis and Engineering Directs Development and Vascularization of Multilineage Human Liver Organoids 
          2021-01-20, Cell systems
          
          IF:9.0Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cels.2020.11.002
          PMID:33290741
         | 研究论文 | 本文展示了通过整合分析和工程化基因调控网络(GRNs)在多谱系人肝类器官中指导成熟和血管形态发生的方法 | 通过过表达PROX1和ATF5,结合靶向CRISPR介导的转录激活内源性CYP3A4,重新编程组织GRN,改善了原生肝功能 | NA | 研究如何通过基因调控网络的分析和工程化促进人肝类器官的发育和血管化 | 多谱系人肝类器官 | NA | NA | CRISPR | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 29155 | 2024-08-09 | Single-cell RNA sequencing of human breast tumour-infiltrating immune cells reveals a γδ T-cell subtype associated with good clinical outcome 
          2021-01, Life science alliance
          
          IF:3.3Q1
          
         
          DOI:10.26508/lsa.202000680
          PMID:33268347
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类乳腺癌肿瘤浸润性免疫细胞中的γδ T细胞亚型,发现一种与良好临床结果相关的γδ T细胞亚型 | 本研究首次在乳腺癌肿瘤中鉴定出一种与改善总体癌症生存率相关的γδ T细胞亚型 | NA | 探索γδ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在应用 | 人类乳腺癌肿瘤浸润性γδ T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 健康成人供体的外周血γδ T细胞和乳腺癌患者的肿瘤活检样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 29156 | 2024-08-09 | Analysis of canine myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) utilizing fluorescence-activated cell sorting, RNA protection mediums to yield quality RNA for single-cell RNA sequencing 
          2021-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
          
          IF:1.4Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.vetimm.2020.110144
          PMID:33278779
         | 研究论文 | 本研究通过荧光激活细胞分选(FACS)和RNA保护介质优化犬类髓源抑制细胞(MDSC)的单细胞RNA测序 | 本研究优化了MDSC的FACS分选策略,并使用了RiboLock™和RNAlater™来保护RNA质量,提高了RNA完整性,从而改善了单细胞RNA测序的数据质量 | 由于正常样本中细胞数量较少,未进行进一步的通路分析 | 优化犬类MDSC的FACS分选和RNA保护方法,以提高单细胞RNA测序的数据质量 | 犬类髓源抑制细胞(MDSC) | 数字病理学 | 口腔黑色素瘤 | 荧光激活细胞分选(FACS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 两个样本,一个来自正常犬,另一个来自未治疗的口腔黑色素瘤犬 | NA | NA | NA | NA | 
| 29157 | 2024-08-09 | Single-cell analysis reveals the purification and maturation effects of glucose starvation in hiPSC-CMs 
          2021-01-01, Biochemical and biophysical research communications
          
          IF:2.5Q3
          
         
          DOI:10.1016/j.bbrc.2020.11.076
          PMID:33279112
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了葡萄糖饥饿对人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)纯化和成熟的影响。 | 首次全面评估了葡萄糖饥饿对hiPSC-CMs转录异质性的影响,并揭示了其对心肌细胞纯化和成熟的作用。 | NA | 探讨葡萄糖饥饿处理对hiPSC-CMs纯化和成熟的影响。 | 人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 29158 | 2024-08-09 | Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data 
          2021-01, Nature protocols
          
          IF:13.1Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41596-020-00409-w
          PMID:33288955
         | 教程 | 本文介绍了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的计算分析流程 | 提供了最佳实践指南和实用指南 | NA | 为实验人员提供数据分析指南,为生物信息学家提供新计算方法的概述 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 大量单个细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 29159 | 2024-08-09 | Shifts of Immune Cell Populations Differ in Response to Different Effectors of Beige Remodeling of Adipose Tissue 
          2020-Dec-18, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.isci.2020.101765
          PMID:33294778
         | 研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,全面分析了白色脂肪组织在Adrb3和冷诱导的米色重塑过程中的细胞动态变化。 | 揭示了Adrb3和冷诱导的米色重塑过程中细胞组成和转录状态的显著变化,并发现冷刺激导致免疫细胞从髓系向淋巴系转移。 | NA | 探讨不同效应因子诱导的米色脂肪组织重塑过程中免疫细胞群的变化。 | 白色脂肪组织在Adrb3和冷诱导的米色重塑过程中的细胞动态变化。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 29160 | 2024-08-09 | Single-Cell Transcriptome Analysis Dissects the Replicating Process of Pancreatic Beta Cells in Partial Pancreatectomy Model 
          2020-Dec-18, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.isci.2020.101774
          PMID:33294783
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了部分胰腺切除模型中胰腺β细胞的复制过程的转录动态 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胰腺β细胞复制过程中的基因表达异质性和细胞周期转换 | NA | 探究成人胰腺中β细胞质量恢复的分子机制 | 胰腺β细胞的复制过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胰腺组织 | NA | NA | NA | NA |